KEGG   Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1: MSC_0512
Entry
MSC_0512          CDS       T00161                                 
Symbol
recD
Name
(GenBank) Exodeoxyribonuclease V alpha subunit
  KO
K03581  exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
mmy  Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC PG1
Pathway
mmy03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmy00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    MSC_0512 (recD)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mmy03400]
    MSC_0512 (recD)
Enzymes [BR:mmy01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     MSC_0512 (recD)
DNA repair and recombination proteins [BR:mmy03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     MSC_0512 (recD)
SSDB
Motif
Pfam: AAA_19 AAA_30 Viral_helicase1 UvrD_C_2 AAA_11 SH3_13 SLFN-g3_helicase AAA_22 AAA AAA_12 T2SSE nSTAND3 DEAD NTPase_1 Helicase_RecD AAA_28 AAA_18 AAA_29 RsgA_GTPase ResIII NACHT AAA_16 cobW AAA_17 ABC_tran AAA_14
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAE77140
UniProt: Q6MT96
LinkDB
Position
583601..585796
AA seq 731 aa
MEHIMEEQIKIRGYLSKFLYKSDSWALAIFTSENNSNKTIKIKGEISDLKPKILYELIGK
QTSHIKYGTSFEVSSFTLASINTEQQIINFLKSDVFPGIGNLTASKIAKLYSKNFIQEIL
NNKEQFFQIKDISKDKLELIYNKIKQINEQNFLRIEFINHNLNLKILDKLKKFTDDENEI
KQILTNNWFEFSFKHELGLMQDIDKIFLHFNNNDINNLTRISYWHLYACNEILFNLGDSY
TYKNYLFKKVSDLIKINDLDLLNNGLDYAIKNELLVLKNEKIYTYESFNDELVISEVLVN
NHLKTNDIDDNLLTSYINQIQLNTQIKDFKYDKDQVLALKNFIKHKISIITGGPGTGKTT
IIKAIVELFKKVYHSSNYAICTPTGRAAAKIRENFTESHATTIHKLLGYEKDNKFSVNKY
HPLDYDLLILDESSMIDARLFSQFLSSINNAKKIVLIGDVDQLASVGYGNVFYDIINSKI
ICTTNLINIHRQSFNNGIIDLAYMIKNDNLDLNKLQNLDNVEFFFNKDKQACLEYLKTVY
SKTINQTKSIQVISPVYADILGIENLNNFIQYNFNQNILDTNNVYDRLRFRYAVNDKVMY
LKNDSELNLSNGDIGYICQINKNNNKFNSAIINFNNNLFEFTSEQFDEINLSYCCSVHKT
QGSEYDQVILVLQDTLFSSFLSKKLLYTAITRAKKQLIVIGDFDLFIKASKKNARIRKTT
LVEHILNKLNN
NT seq 2196 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttggaacatattatggaagaacaaataaaaatcagaggttatttatctaagtttttatac
aaatcagattcttgagctttagctatttttacaagtgaaaataattctaataaaactata
aaaattaaaggtgaaattagtgatttaaaaccaaaaattttatatgaattaataggaaaa
caaacaagtcatattaaatatggaacaagttttgaagtaagtagttttactttagcaagt
attaatacagaacaacaaattattaactttttaaaatctgatgtttttccaggaattggt
aatttaacagctagtaaaatagctaaactttattcaaaaaactttatacaagaaatttta
aataataaagaacagttttttcaaatcaaagatattagtaaagataaattagaattaatt
tataataaaatcaaacaaattaatgaacaaaactttttaagaattgaatttattaatcat
aatttaaacttaaaaatactagataaactaaaaaagtttactgatgatgaaaatgaaata
aaacaaattctaactaataattggtttgaatttagttttaaacatgaacttggtttaatg
caagatattgataagatatttttacattttaataataatgatattaataatttaactaga
attagttattgacatttatatgcttgtaatgagattttatttaatttaggagatagttat
acttataaaaactacttatttaaaaaagtttctgatttaataaaaattaatgatttagac
ttattaaataatggtttagattatgctattaaaaatgaattattagttttaaaaaatgaa
aagatttatacttatgaatcatttaatgatgaattagtaattagtgaagttttagttaat
aatcatttaaagactaatgatattgatgataatttattaactagttatattaatcaaatt
caactaaatacacaaattaaagattttaaatatgacaaagatcaagttttagctttaaaa
aactttattaaacataaaatcagtattataactggaggacctggaactggtaaaacaaca
attattaaagcaatagttgagttgtttaaaaaagtttatcattctagtaattatgcaatt
tgtacaccaactggaagagcagctgcaaaaattagagaaaactttacagaaagtcatgca
acaactattcataaacttttaggttatgaaaaagacaataaatttagtgttaataaatat
catccactagattatgatttattaatacttgatgaatcttcaatgatcgatgctcgctta
ttttctcagtttttatcttcaataaataatgctaaaaaaattgttttgattggtgatgtt
gatcagttagcaagtgttgggtatggaaatgttttttatgatattattaattccaaaatt
atttgtactactaatttaataaacattcatcgtcaaagttttaataatggaattattgat
ctagcttatatgataaaaaatgataatttagatctaaacaaattacaaaacttagataat
gtagagtttttctttaataaagataaacaagcttgtttagagtatttaaaaacagtttat
agtaaaactattaatcaaactaaaagtattcaagtgatttctccagtttatgctgatatt
ttaggaattgaaaatttaaataattttattcaatataactttaatcaaaatattttagat
actaataatgtttatgatagattaagatttagatatgctgtcaatgataaagttatgtat
ttaaaaaatgatagtgaattaaatttatcaaatggtgatattggatatatttgtcaaatt
aataaaaataataataaatttaattcagctattattaactttaataacaacttgtttgaa
tttacaagtgaacaatttgatgaaattaatttaagttattgttgtagtgtacataaaact
caaggtagtgaatatgatcaagtaattttagttttacaagatactttatttagtagtttt
ttaagtaaaaaacttttatatacagctattactagagcaaaaaaacaactaatagtaatt
ggtgattttgacttgtttataaaagcaagtaaaaaaaatgcaagaattagaaaaactact
ttagttgaacatattttaaataaattaaataattag

DBGET integrated database retrieval system