Mesomycoplasma neurolyticum: NCTC10166_00806
Help
Entry
NCTC10166_00806 CDS
T06888
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III polC-type
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mnu
Mesomycoplasma neurolyticum
Pathway
mnu03030
DNA replication
mnu03430
Mismatch repair
mnu03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mnu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
NCTC10166_00806 (polC)
03430 Mismatch repair
NCTC10166_00806 (polC)
03440 Homologous recombination
NCTC10166_00806 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mnu03032
]
NCTC10166_00806 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mnu03400
]
NCTC10166_00806 (polC)
Enzymes [BR:
mnu01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
NCTC10166_00806 (polC)
DNA replication proteins [BR:
mnu03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
NCTC10166_00806 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mnu03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
NCTC10166_00806 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
RNase_H_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEU59820
UniProt:
A0A449A6A7
LinkDB
All DBs
Position
1:942733..947043
Genome browser
AA seq
1436 aa
AA seq
DB search
MDIGFKKFCLEINFEYTKEFEKVSVKEVKKENDIYIVFLKFNQLLDIFLFKKFYFKVRQH
TNIHFEIYIELFDDSKKNIYIQNYFDFAYLLATEKEFNFLENKKNIFENDKLIIFFDSIL
EENNFIQSKDKVLFYLKQWGFNKLVVETKINTKNDQKKIEEKKNIELQEQKIQEKLQHQT
SSSNNYENKKNFFNSYNKYNSFVELEIEEVYTTDEINVSLKGEIFKKETKETKSGLWITI
MSITNYVEAVKIKIFSRTDAEKNKVNSFKIGDKIIAQGILENDDFTKSKILNSKNITVLN
IKDEIPQDLETNKRVEFYAKTNMSTMDGLANIEQYVKRAEEFGHQAIGIADLNSVQNFPK
FYDVSKKFKVKPIYGSSFNALNSDLSAIINSDDRNLASSRYIIFDLETTGLTAKFHEIIE
FGAVILENKKLVETIQFFIKPTKPIPKQITDLTNITNEDVENAISQEEGIKKIREILSSG
IAVAHNAFQFDINVVNEKIYAFNLEELKTPVIDTLVLNHILFPNRKRNDLENIAQKLNIN
FDSTLNHRADYDAKILAQIWLVYLEQLEKNNVFTGKDLAQFTYPTIFSHYSKNDRNEMSI
YVKNQKGLKELFKLISLSSIDNFYGGPKLFIDKLPKSENLFFASGSTTSRIIHKLIYGTT
KSLIDEIKYYDVIFIPPPRAFSHLVKRQIITLNNVKKALKNLIENAKKLNKIVIAISDCK
YLDVKDKIFHEIYINAKGLGGLRHYLYDRRDKDPDYPLQNYLSTTEMYKEFQFVGDVKII
EEIVVTNSAILANQIQPVEVIKKDLYSPTFDNSKENLKQLVYKTARNIYGETLPQIVEER
LAKELVPIMEHGFHVVYWISHKLVSKAKNDGHLVGSRGSVGSSLVATMAGITEVNPLVPH
YICKKCKFSEFFEDGTYQSGFDLPDKNCPNCSTALTKEGQTILFETFLGFNADKVPDIDL
NFSGEYQPILQEEIKKMFGENKAFKAGTVLSNKEKTIYGYIKSHLEITNKTLSPEFMDFL
SKKASGTKRTTGQHPGGVIIIPKEYDIEDFTPINYPANDTSSNWKTTHFDYDALHDNLLK
LDILGHDDPTAIEMLEKLTNIKASDIPTSDPKIVSLFSSTEALGIKPSDIFNETTGAMGI
PEFGTSFVRGMLKSAKVNSFADLVAISGLSHGTDVWTNNADRLIKELKLSFRDIVSCRDD
IMVFLIQKGIKPYLAFQITENVRKGKSVSPENEKILRDNQIPEWYIESMKKIKYLFPKAH
AVAYVMMAWRIAYFKLYHPLEYYATYFTTRADVIDIETLISGEEFVANRINELNKKKNNA
KGAELKVKEKELIPILLIAKEMFARGYKVENVSLKNSKAKTWIINHDNKSLIPPFISIDG
LGEVVATTLEKERNEKFFTSIQDLKKRVSLNKTLFEKLVEMKVIENLKESDQFALF
NT seq
4311 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatataggttttaaaaaattttgtttagaaataaattttgaatatacaaaagaattt
gaaaaagttagtgttaaagaagtaaaaaaagaaaatgatatttatattgtatttttaaaa
tttaatcaattattagatatttttttatttaaaaaattttattttaaagttagacaacat
accaatatacattttgaaatttatattgaactttttgatgattctaaaaaaaatatttat
attcaaaattattttgattttgcatatcttttagcaacagaaaaagaatttaacttttta
gaaaataaaaaaaatatttttgaaaatgataaattaattattttttttgattctatttta
gaagaaaataatttcatccaatcaaaagacaaggttttattttatctaaagcaatgaggt
tttaataaattagttgttgaaacaaaaattaatactaaaaatgatcaaaaaaaaatagaa
gaaaagaaaaatattgaactgcaagaacaaaaaatacaagaaaaattgcaacatcaaact
tctagctcaaacaactatgaaaataaaaaaaatttttttaatagttataataaatataat
tcatttgttgaactagaaattgaagaagtttatacaactgatgagattaatgtttcttta
aaaggagaaatttttaagaaagaaacaaaagagacaaaatccggtttatgaataactatt
atgtctatcaccaattacgttgaagctgtaaaaattaaaattttttctagaacagatgct
gaaaaaaataaagttaatagttttaaaattggggataaaattattgctcaaggaatttta
gaaaatgatgattttaccaaaagtaaaattttaaattctaaaaatattactgttttaaat
attaaagatgaaattccacaagatcttgaaacaaataaaagagttgaattttatgctaaa
acaaacatgtcaactatggatggtttagctaatattgaacaatatgtaaaaagagctgaa
gaatttggacatcaagctattggaattgctgatttaaattctgttcaaaattttcctaaa
ttttatgatgtaagtaaaaaattcaaagttaaacctatttatggttcatcatttaatgct
ttaaatagtgatttaagtgcaattataaattcagatgatagaaatttagcatcttcaaga
tatattatttttgacttggaaacaacaggtttaactgctaaattccatgaaataattgaa
tttggtgcagttattttagaaaataaaaaactagttgaaacaattcaattttttatcaaa
cccaccaaaccaataccaaaacaaattactgatcttacgaatattacaaatgaagatgta
gaaaatgctatttcacaagaagaaggaattaaaaaaattagagaaatattatctagtggg
atagctgttgcacataatgcttttcaatttgatatcaatgtagtaaatgaaaaaatttat
gcttttaatttagaagaattaaaaactcctgtaattgacacattagttttaaatcatatt
ttatttccaaatagaaaacgtaatgacttagaaaatatagctcaaaaattaaatataaat
tttgattcaactttaaaccatagagctgactatgacgctaaaattcttgcccaaatttga
ctagtttatttagaacaattagaaaaaaacaatgtttttacaggtaaagatttagcacaa
ttcacttatcctacaattttttcacattattcaaaaaatgatcgaaatgaaatgtcaatt
tatgttaaaaatcaaaaaggtttaaaagaattgtttaaattaatttctttatcatctatt
gacaatttttatgggggtccaaaattatttattgataagttacctaaaagtgaaaattta
ttttttgcttcaggttcaactacatcaagaataatccataaattaatttatggaacaacc
aaaagtttaattgatgaaataaaatattatgatgttatttttattccaccgcctcgcgct
tttagccatcttgtaaaaagacaaattataactttgaataatgttaaaaaagcactaaaa
aatttaattgaaaatgctaaaaaattaaacaaaatagttatagctatttctgactgtaaa
tatttagatgtaaaagataaaatttttcatgaaatatatataaatgctaaaggtttaggt
ggtttgagacactatttatatgatagaagagacaaagatccagattatccattacaaaat
tatttgtctactactgaaatgtataaagaatttcaatttgttggtgatgtaaaaattatt
gaagaaatcgttgttactaattcagcaattttagctaatcaaatacaacctgttgaagtt
attaaaaaagatttatattcaccaacatttgacaattctaaagaaaatttaaaacaatta
gtatataaaactgcaagaaatatttatggtgaaactcttccacaaattgttgaagaaaga
ctcgcaaaagaacttgtgccaattatggagcatggttttcatgttgtatattgaataagc
cataagttagtttcaaaagctaaaaatgatggtcatcttgttggttcaagaggttctgtt
ggttcatcattagttgcaactatggcaggtataactgaggtaaatcccttagttccacat
tacatttgtaaaaaatgtaagttttcagaattttttgaagatggaacatatcagtcaggt
tttgatcttccagataaaaactgtcctaactgtagtacagctttaactaaagaaggacaa
actattttgtttgaaacttttttaggatttaatgcagacaaagttcctgatattgatttg
aatttttcaggggaatatcaacctattttacaagaagagattaaaaaaatgtttggtgaa
aacaaagcttttaaagctggtactgttttaagtaataaagagaaaactatttatggatac
atcaaaagtcatttagaaattacaaataaaacattgtcaccagaatttatggatttttta
tctaaaaaagcaagtggaaccaaaagaacaacaggacaacacccaggtggtgttattatc
ataccaaaagaatatgatatagaagattttacacctatcaattatccagcaaatgataca
tcttcaaattgaaaaacaactcattttgattatgatgcattgcatgataatttacttaaa
ttagatattcttggacatgatgatccaactgcgatagaaatgttagaaaaattaactaat
attaaagctagtgacatcccaacttctgatcctaaaattgtttctttattttcttcaact
gaagcattaggaattaaaccaagtgatatttttaatgaaacaacaggagcaatgggaatt
cctgaatttgggacatcatttgtaagaggaatgttaaaaagcgcaaaagttaatagcttt
gctgatttagttgcaatttcaggattgtcacatggaacagatgtgtgaactaataacgct
gatcgtttaattaaagaattaaaattgtcttttagagatattgtttcttgtcgtgatgat
attatggtttttttaattcaaaaaggaattaaaccatacttagcttttcaaattacagaa
aatgtaagaaaaggtaaatctgtaagtccagaaaatgaaaaaattttaagagataatcaa
atcccagagtgatatatagaatcaatgaaaaaaattaaatatttatttcctaaagcacat
gctgtagcttatgttatgatggcatgaagaattgcttattttaagttatatcatccgtta
gaatattatgcaacttattttacaactcgagcagatgtaattgatattgaaacacttatt
tctggagaagaatttgttgctaacagaataaatgaacttaataagaaaaaaaataatgct
aaaggtgctgaattaaaggtaaaagaaaaagaattgattcctattttattaatagcaaaa
gaaatgttcgcaaggggttataaagttgaaaatgttagcttaaaaaattctaaagctaaa
acatgaattattaatcatgataataaatcattaattcctccatttatttctattgatggt
ttaggagaagttgtggctacgactttagaaaaagaaagaaatgaaaagttttttacatca
attcaagatcttaaaaaacgtgtttctttaaataaaacattatttgaaaaattagtagaa
atgaaagttatagaaaatttaaaagaaagtgatcaatttgcattgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system