Metamycoplasma phocicerebrale: DMC14_000810
Help
Entry
DMC14_000810 CDS
T06657
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
mphc
Metamycoplasma phocicerebrale
Pathway
mphc03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mphc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
DMC14_000810 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
mphc03021
]
DMC14_000810 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mphc03400
]
DMC14_000810 (rpoC)
Enzymes [BR:
mphc01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
DMC14_000810 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
mphc03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
DMC14_000810 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mphc03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
DMC14_000810 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Apocytochr_F_C
Zn-ribbon_8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZZ65333
UniProt:
A0A3T0TTG9
LinkDB
All DBs
Position
complement(66546..70979)
Genome browser
AA seq
1477 aa
AA seq
DB search
MKNNLKYDLLDESKIAKISLSLATPEDVESWSHGEVTKPETINYKSYKPERGGLFDEIIF
GPMIDYRCPVCGHKWKKINEGSYCTRTELCKQEKVQILPKIARRNHMGHIKLNSPVVHFW
YFKVDHSILYKLLGLRISSNSYSKIVRREELENLIYYKNHIVVEDGGLKSLPKNLIIEIN
DAGVIYKEALEELLTRFDPNKKEDKEAYEDIQDTINELVEKATSKIGQEYGIDFYELNEV
IEHYSDAKIMTGALAIEYLLKKLDLQAEKLYVSNQIKELNEQEAKNPDKFATTTKQTREK
LYKRLQVINAFIESKQSPTNMLIYNLPVIPADLRPLIQLDGGRHSTSDINELYRRVIIRN
NRLQQWQEKDAPRLVIQNELRMIQEAVDALIDNQRRTPNPVLSKDNRPFKSISDALTGKK
GRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLKMHQCGIPREMAAKLFEPWIIARLIEKEVATTIK
NAKKIIEDQNPIIWPHVAEAIKGRLVLLNRAPTLHRLSIQAFEPVLVRGKAIRLHPLVCT
PFNADFDGDQMAVHVPISEQALLESRELMLANKNILGPKDGEPIINPSQDMILGLYYLTL
EDKNAKGEGRVFDNLDHLLRALETKTVGLHSRVALPAEEVKSSKVFSYHDTDKQLYVIST
VGKFIFNNVFPKDFPFIFDNKVTKAINLEEYKKQFNEKYVVEAGTNIPEYVKKLETQEAF
NKKNIAKTIRYMFDNYVSTISIADVASVIDKINDIDDGDIVVEFLKLKTYKGQPLDKSHA
DLLSEFTIEEKKKIMDSDEQRANDKLIPLSAKEKAHLLDTVWFKYTNIVASILDNIKQLG
FDYSTTSGISISFSDILETHKKKEYIAEGDEYISKLKEFYNLGYITDDDRYSLTIKKWAE
IKEDIQEELETIIKENPRNPIITMINSGARGNIANYVQLAGMRGLMANNTKTTKADAKND
RVVRSTVEVPVKSSFIEGLTAFEFYSSTHGARKGLTDTALNTAKSGYLTRRLVDVAQNIV
VREENCGSEYGYIAKNIIDTKNNQIIVSLKERIVGRFSNKPIYDKNGILICDRNALITNK
IAQKIIDSGIEEVEIRSILGCNTRNGVCKMCFGNDLATNRVVNIGEAVGIIAAQSIGEPG
TQLTMRTFHTGGVAGVEDITGGFTRLIELIDAHEQPWGKQATISPYQGRISNIEKQEDKE
NNYTITIETLNNENEIVKKQVSVETNKKLRVEKGQEVRIGQKLSEGPIVLKELLALTDVI
TVQNYLLKEIQRIYRIQGIAISDKYIEIIIRQMMSKVVISDPGESKFFAGAIVDIFDYQE
ENAQLLSENKKPAFGNVVIKGAKQVPLLSDSFLSAASYQETSKILVNSAISSRIDNLSGL
KENIILGKKIPSGTALNTFEEHSKYDIKPSIKYFTNFEESEELEESNIDEENVIDIDALT
QEYIEDSQHIKEIEDEENDLLYEEEFDAEDIKDNFEE
NT seq
4434 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacaatttaaaatatgatctattagatgaatcaaaaattgcaaaaatttcctta
tctttagcaacccctgaagatgttgaaagttgatcacatggagaagtaactaaaccagaa
actattaactataaatcatataagccagaacgtggtggtttgtttgatgaaattattttt
ggaccaatgatagattatcgttgtcctgtttgtggtcataaatgaaaaaaaattaatgaa
ggttcatattgtacaagaactgaattatgtaaacaagaaaaagtacaaattttacctaaa
atagctcgtagaaatcacatgggtcatattaaattaaatagtcctgttgttcatttttga
tattttaaagtagatcattcaattttatataaattactaggtttaagaatttcaagcaat
tcatatagtaaaatagttcgtcgtgaggaattagagaatttaatttattataaaaaccat
attgttgtcgaagacggaggcttaaagtctttacctaaaaatttaattattgaaattaat
gatgctggtgttatctataaagaagctttagaagaattattaactcgttttgatccaaac
aaaaaagaagataaagaagcgtatgaagatattcaagacacaataaatgaattggtcgaa
aaagctacttcaaaaattggtcaggaatatggtattgacttttatgaattaaatgaagtt
atagagcattattcagatgctaaaattatgactggcgctttagctattgaatatttatta
aaaaaactagatttacaagcggaaaaattatatgtttctaatcaaattaaagaattaaat
gaacaagaagcaaaaaacccagataaatttgcaacaaccacaaaacaaacaagagaaaaa
ttatataaaagattgcaagttattaatgctttcatagaatcaaaacaatctcctacaaat
atgttaatttataacttgcctgtaattccggcggatttaaggcctttaattcaattagat
ggtggtagacattcaacatcagatattaatgagttatatcgtagagtaattattagaaat
aatcgtttacaacaatgacaagaaaaagatgctcctagactagttattcaaaatgaattg
cgtatgatccaagaagcagtagatgctttaattgataatcaaagaagaacaccaaatcct
gttttatcaaaagacaatagaccatttaaatctatatctgatgctttaactggtaaaaaa
ggtcgttttagacaaaaccttttaggaaaacgtgttgattattctggtcgttcagttata
gttgttggtccgagtttaaaaatgcatcaatgtggaattcctcgtgagatggctgctaaa
ttatttgaaccatgaataatagctcgtttaatagaaaaagaagtagctacaactattaaa
aatgctaaaaaaataattgaagaccaaaaccctattatttgacctcatgtagctgaagct
ataaaaggaagattagttttattaaatcgtgctcctaccctacaccgtttatcaattcaa
gcctttgaaccagtattagttcgtggaaaagctataagattacatccattagtatgtact
ccttttaacgctgacttcgatggtgaccaaatggctgttcatgtgcctatttctgaacaa
gctttattagaaagccgtgaattaatgcttgctaataaaaatattttaggtcctaaagat
ggtgaacctattatcaatccttcacaagatatgatacttggtttatattatttaacttta
gaagataaaaacgctaaaggcgaaggaagggttttcgataatttagatcacttattacgt
gcattagaaaccaaaacagttggtttacattctcgtgttgctttaccagccgaagaagta
aagagttcaaaagtattttcatatcacgataccgataaacaactatatgttatttctaca
gtaggtaaattcatttttaataatgtttttccaaaagattttccatttatttttgataat
aaagtaacaaaagcaattaaccttgaggaatacaaaaaacaatttaatgaaaaatatgta
gttgaggctggaacaaatattcctgaatatgttaaaaaactagaaactcaagaagctttc
aacaagaaaaatattgccaaaaccattcgttatatgtttgataattatgtttctacaatt
agcattgctgatgttgcaagtgtaatagataaaattaatgatattgatgatggcgatata
gtagttgaatttttaaaactaaaaacttataaagggcaacctttagataaatcacatgcc
gatttattatctgaatttacaatagaagaaaagaaaaaaataatggattcagatgagcaa
agagcaaatgataaattaatacctttaagtgccaaagaaaaagcgcatttattagataca
gtttgatttaaatatacaaatattgttgcttctattcttgataatataaaacaattagga
tttgattattcaactacttctggaatttcaatttcattttcagatattcttgaaactcat
aagaaaaaagaatatatagccgaaggtgatgaatatattagtaagttaaaagaattctat
aatttgggttatataactgatgatgatagatattcattaactataaaaaaatgagctgaa
attaaggaagatatacaagaagaattagaaacaataataaaagaaaatccaagaaaccca
attattacaatgattaattcaggagctcgtggtaatattgctaactatgttcaactagca
ggcatgcggggattaatggctaacaataccaaaaccactaaggctgatgctaaaaatgac
cgtgttgttcgttcaacagttgaagttccggttaaatcatcatttatcgaagggttaaca
gcttttgaattttattcatcaacccacggtgctagaaaaggtcttacagatactgctctt
aacactgctaaatcaggttatttaacaagacgtttagtggatgttgctcaaaatatagta
gttagagaagaaaattgtggttctgaatatggatatatagcaaaaaatattattgatact
aaaaacaatcaaataattgtgtcattaaaagaaagaattgtaggccgtttttcaaacaaa
ccaatttatgataaaaatggtattttgatttgtgatagaaatgctttaataacaaataaa
atagctcaaaaaataattgactctggtattgaagaagtggaaataagatctattcttgga
tgtaacacacgtaatggcgtatgcaaaatgtgttttggaaatgacttagctacaaaccgt
gttgttaacataggagaagcggtaggaataatagcagctcaatctataggagaacctggt
actcaattaacaatgcgtacatttcataccggtggggttgcaggcgtcgaagatataact
ggtggttttactcgtttgattgaattaattgatgcccatgaacaaccatgaggcaaacaa
gcaactatttcgccttatcaaggtagaatttcgaatatagaaaaacaagaagataaagaa
aacaattatactattactatcgaaaccttaaacaatgaaaatgaaattgttaaaaagcaa
gtttcagtagaaactaataaaaagttaagagttgaaaaaggccaagaagtaagaataggt
caaaagttatcagaaggtcctattgttcttaaagaattgttagcattaactgatgttata
acagttcaaaattatttattaaaagaaattcaaagaatttatcgtattcaaggtattgct
attagtgataaatacattgaaattattattagacaaatgatgtctaaggttgtaattagt
gacccaggagaatctaaattctttgccggagctatagttgatatttttgattatcaagaa
gaaaatgcccaattattatcagaaaacaaaaaaccagcttttggtaacgttgtaattaag
ggggctaaacaagtgcctttattgtcagattcatttttatcagcagcttcatatcaagaa
acttcaaaaattttagttaattctgctatatcatctagaattgataatttaagtggatta
aaagaaaatattattcttggtaaaaaaataccttcaggaacagcattaaacacttttgaa
gaacattcgaaatatgatattaaaccttctattaaatattttacaaactttgaagaatca
gaagaactagaagaatcaaatattgatgaagaaaatgttattgatatagatgcattaact
caagaatatatcgaagattctcaacacataaaagaaattgaagatgaagaaaatgatcta
ttatatgaagaagaatttgatgcagaagatatcaaagataactttgaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
