Methanobrevibacter smithii: Msm_1570
Help
Entry
Msm_1570 CDS
T00539
Name
(GenBank) cell wall biosynthesis protein, MurD-like peptide ligase family
KO
K23393
lipid II isoglutaminyl synthase (glutamine-hydrolysing) [EC:
6.3.5.13
]
Organism
msi
Methanobrevibacter smithii
Pathway
msi01100
Metabolic pathways
Brite
Enzymes [BR:
msi01000
]
6. Ligases
6.3 Forming carbon-nitrogen bonds
6.3.5 Carbon-nitrogen ligases with glutamine as amido-N-donor
6.3.5.13 lipid II isoglutaminyl synthase (glutamine-hydrolysing)
Msm_1570
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Mur_ligase_M
DUF6834_C
DUF6033
HGTP_anticodon
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ87775
UniProt:
A5UNJ7
LinkDB
All DBs
Position
1613524..1614951
Genome browser
AA seq
475 aa
AA seq
DB search
MGVKIRFNVAKFGAKVASQVSKFGFGSGNNLPGYVFYKIAGKEALKDLAHEMSIGPILIT
GTNGKTTTTTLLIKLLSADTKIRKSFESNTIHAITTGILKGDGDLGVFEYGIRNKSYGIP
DTVQRLIDPVGVVYTTISREHSQVAGVKNPFEEYVDAKSLLSQGMTRGVVISNADDPVTA
NIACNKRNDLHVNFYGLAIDSINDIFESDSPNCPRCGKKLEYSQKFLNHRGIYSCCCGFK
RHEPNVKLIGADFKPDNWDLTIEGNLYNYTNNKDISFEVSINVPPFGFHNIYNTLASICT
YATFTPKIDNIENTIKEVFNNLDMSFIPPGRFEVVKLNDKYVGLGQGDNGDAAKINALFM
NQYIDGPLEFIYTTPDENEEEIFEDHLEVIKNLNPDHMIVVPGRKSIEKAKEYYNIISEE
YDNADFYPLSYDKMDERIRKLVDLAETSDYNYVIMTGCGEEQEMWENIKQKLINK
NT seq
1428 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtgttaaaattcgttttaatgtagctaagtttggagctaaggtagcttctcaggta
tctaaatttggatttggaagtggtaataatcttccgggatatgttttttataagattgct
ggaaaggaagcactaaaagatttggctcatgaaatgagtattggacctattttaatcaca
ggaaccaacggaaaaactactacaacaactcttttaattaaattgctttctgctgatacg
aaaatcagaaaaagctttgaaagcaatactattcatgcaataactacaggtattttaaaa
ggtgatggggatcttggtgtttttgaatatggaatcagaaataagagctatggaattccg
gacactgttcagagacttattgatcctgtaggtgttgtttatacaacaatttcacgtgaa
cattcacaggtagcaggtgttaaaaatccctttgaggaatatgtagatgccaaatctcta
ctttcacagggtatgactcggggagttgttatttctaatgcagatgatcctgtaacagca
aatattgcttgcaataaacgaaatgacctgcatgttaatttttatggattggccattgat
agtattaatgatattttcgaatcagacagtccaaattgtccaaggtgtggcaaaaagctt
gaatattctcaaaaattcttgaatcacagaggaatttacagttgctgctgcggttttaaa
cgccatgaacctaatgttaaattgattggtgctgactttaagcctgataattgggatttg
acaattgaaggaaatttatataattatacaaacaataaggatatttcatttgaagtaagt
ataaatgttcctccattcggattccataatatttacaacacattggcttccatttgcaca
tatgctacttttactccaaaaatagacaatattgaaaatactattaaagaggttttcaat
aatttggacatgtcttttattcctcctggaagatttgaagtagttaaattaaatgacaaa
tatgttggtttgggacagggagataatggtgatgcagctaaaatcaatgcattatttatg
aatcagtatattgacggtcctttagaatttatttacacaactcctgatgaaaatgaggaa
gaaatatttgaagaccatctggaagttattaaaaatttaaatcctgaccatatgattgtt
gttcccggaagaaaatccattgaaaaagctaaggaatattataacataatatctgaagaa
tatgataatgctgatttttatccattaagctatgataaaatggatgaaaggattagaaaa
ctggtggatttggctgaaacttcagattataattatgtgattatgacaggctgcggtgaa
gagcaggaaatgtgggaaaatataaaacaaaaattaatcaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
