Naegleria gruberi: NAEGRDRAFT_79010
Help
Entry
NAEGRDRAFT_79010 CDS
T01241
Name
(RefSeq) coronin
Organism
ngr
Naegleria gruberi
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Gelsolin
VHP
WD40_4
DUF1899
WD40
ANAPC4_WD40
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8860027
NCBI-ProteinID:
XP_002679446
JGI:
Naegr1_79010
UniProt:
D2V8K4
LinkDB
All DBs
AA seq
1886 aa
AA seq
DB search
MSGFSSQSIQASLVRPSKYRHLNGFETKSERYENINVGYGQKLSNTLKTNGSIYALPFNV
TGGTLSFKYLNDYGRWDEKLQNYGIIKAHKGRLSDFDISPFRNRDHLVTVSNSDNIIRYW
KLPTNNNDNDNNSNDISSSNITSTNTSNINGNNTIYRTYEEMDCDLELNDTNNTKSTISR
ISFNPLVDNSLVSIQGDLIHFWDVEKKKILNSIQNLPNPSISSKTLPTVESLGWNEYGNL
FICGTNDRSIRIYDIRLSSNYSNNNNNNNNQSNNQQICITEGHSSMKPFQTLYCENMYIC
SVGFSKNGGRELAMYDIRKDLKCLQRISIDNGGSVLTPFYDSDIKLLYLVGRGDGNIRFY
ELEGGIMHYLNDYNCQSTSASVDWLPKWKLNVNNFELAKFLRLTNEKTIETLSMRVSRKS
NIEQYFQEDIFPDTWNGQPIYNNTNQWLNTIINNNTTSINNNTIQSNINNSNGNGNENLN
ENELLQTRPTMSLKPSDKISIYDVPISEGGKIRPSTTNLSKLHSSSSLNSIENTPTTTLD
TPTTITNYNTNEQVDDEFKDLNENQQFDDNEEEEEELITINTNHHHHHHHHHEHNHNNFN
DLNDIDSLMSPTEATSKSISIGLVSSLGKNVALASAHIPWYKRITMGMGYYLGMAMFLIF
KFTFISIPVWVYRKSTGYTPPPIKERFEQVPVIKVIKKPSRKVSSNINSSTSVKRNIVGG
GANTNNNNTDNNNITPTTPNDYIKSSVSNTSLSLTPQTPSGSGNNLIISDPLASESSRLL
SREYGRIIMEEYIGKLTKEDIFPKRAHDKDTNLKQVLEIDVVDLKKGLTHVLIWVKGRKK
SRATLAPLYWTSLNHNDCFILDCGKICYIYNGQYSNKLCRAKALDISQMIKYKERGGDCQ
VVIIDGIDYSNNGNNSNNNSNNNDMTPLYKKQVLQFWKELGLTSENEFCELLNIHFPKKE
DSSSSSNNNVLNRLKLTDKSKFTSKDELNDDLYQQFNDLGQRLYKLNSEIFEELPLKIEL
NETQDEYIERISPYMLSVIKLNQIPGGEIVNLKELENLLNNEKNLIDPNKVSEITQPSHH
VLHSDQCYIFESLFTNEVFFWSGKQSNLNIRKWGIAIAKKLAQYRSLNNNPFSLKNPILQ
RFKSILNNSINITINGSNSINGNQLPNNRKYLSSITRVIEEGEHSIYKQKFSDYPGMLMI
QTQSQESRGNVAEKKKQSKINFLELLKSKNNLKEELKSNSQKQFIDPTLVTTIYSSKIRM
WRVSDFQKIPYQHLGHFFTGDAFIILFTYTKIEGGKSFHKLFFWQGRDIKKKDKGTSAYK
TVEINEMIDEGVVENQIRVVQDKEPKLFLDLFKFNPNSMEESTTIENDKHYKKVPYFIHK
GKYRPSVLESFEKANKLSSIIGNISNNNNNGNINPKSSPLPKLNISNNTNDNNNTNNTTT
TTPTTPTISNDEEMNLAPVKLFTSINGNLDENEKFSPQILQFQTEMIERIISKNIKLEYL
KSYDFRNGILCETDDLHPNYLNPFNLIIFSNLNFNVYLNRIELNKEIEQDDLKTIIYYGK
YCKESDKKFIENNVLNLFNNNNIITINGNNQELLENVFTKEIDPTFEYFISRFNNYLNTF
EFKNNYNISFYNINDHSGEFTLNRLDPFGEIDLSSSQAFILDCLDLEGKIYVWIGMLCNI
ETKKFALSTTIQYYYTWKSQTCNDEFYKKKPQNDDMDDFDPSKFLQKSDEQSLLVIQEME
EPQEFTKHFISWSINSTSFKVRFKQLQDPNLISKGFVKTPRTPRRSNINVQISKHEKNLF
EHSSSIFEIEHCSNVLQLYNKLFTHKTYSYAILTSGANIPEGIDKSKLESYLSNEEFQKV
FGMDKKKFATLQNWKQTSLKKEKNLF
NT seq
5661 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaggtttttcatcacaatctattcaagcatcacttgttagaccatccaaatataga
catttaaatggatttgaaactaaaagtgagagatatgaaaatattaatgttggttatggt
caaaaattaagtaatacattaaaaaccaatggttcaatctatgcattaccatttaatgta
acaggtggtactttatcatttaaatatttaaatgattatggtagatgggatgaaaaatta
caaaattatggaattattaaggctcacaagggaagattatcagattttgatatttcccct
tttagaaatagagatcatttagtaactgtttctaattctgataatattattagatattgg
aaattacctacaaataataatgataatgataataatagcaatgatatttcttcttctaat
attacttctactaatacttccaatataaatggtaataatactatatatagaacctatgaa
gaaatggattgtgatttggaattaaatgatacaaataatacaaaatcaactattagtaga
atatcatttaatccacttgttgataattcacttgttagtattcaaggagatttaatccat
ttttgggatgttgaaaaaaagaaaattttaaattcaattcaaaatttaccaaatccatca
atttctagtaaaacattaccaacagttgaaagtttaggatggaatgaatatggtaattta
tttatatgtggtacaaatgatcgttccattagaatttatgatattagattatcttccaat
tatagtaataataataataataataataatcaatctaataatcaacaaatatgtataact
gaaggacattcaagtatgaaaccatttcaaacattatattgtgaaaatatgtatatatgt
agtgttggattttctaaaaatggaggtagagaattagccatgtatgatattagaaaagat
ttgaaatgtttacaaagaatttccattgataatggtggttcagttttaacaccattttat
gattcagatattaaattactatatttagtaggtagaggagatggtaatattagattttat
gaattagaaggtggtattatgcattatttaaatgattataattgtcaatctacatctgca
tctgttgattggttaccaaaatggaaattaaatgttaataattttgaattggctaaattt
ttaagattaacaaatgaaaaaacaattgaaactctttcaatgagagtttctagaaaatca
aatattgaacaatattttcaagaagatatatttccagatacttggaatggtcaacctatt
tataataatactaatcaatggttaaatactattattaataataatactacttctattaat
aataatactatacaaagtaatattaataatagtaatggtaatggtaatgaaaatttgaat
gaaaatgaattattacaaactagaccaaccatgtcattaaaaccatctgataaaatatct
atctatgatgtacctattagtgaaggtggtaaaattagaccatccactactaatttaagt
aaattacattcatcatcatctttaaatagtattgaaaatactccaactactacattagat
accccaactactattacaaattataatacaaatgaacaagttgatgatgaatttaaagat
ttaaatgaaaatcaacaatttgatgacaatgaagaagaagaagaagaattaattaccatt
aatacaaatcatcatcatcaccatcatcatcatcatgaacataatcataataattttaat
gatttaaatgatatagattcattaatgtcaccaacagaagcaacttccaaatccatttcc
attggattagtttctagtttaggtaaaaatgtagcacttgcatcagctcatattccatgg
tataaaagaattacaatgggaatgggttattatttaggaatggcaatgtttttaatattt
aaatttacattcatttcaatacctgtttgggtttatcgtaaatctactggttacactcct
ccacctattaaggaacgtttcgaacaagtacctgttattaaggttattaagaaaccttca
agaaaagtttcatcaaatatcaattcttctacaagtgttaaacgtaatattgttggtggt
ggtgctaatactaataataataatactgataataataatataacacctactacaccaaat
gattatattaaatcatcagtatctaatacatcattatcattaactccacaaactccaagt
ggtagcggcaataatttaatcatttcagatccacttgcaagtgaatcaagtcgattacta
tcacgtgaatatggtagaattattatggaagaatatattggtaaattaactaaagaagat
atatttcctaaaagagcacatgataaagataccaatctaaaacaagttcttgaaattgat
gtagttgacttgaaaaaaggtctcactcatgtactaatttgggtaaaaggacgtaaaaaa
tcgagagcaacacttgcaccactttattggacaagtttaaatcataatgattgtttcatt
ttggattgtggtaaaatttgttacatttacaatggacaatattctaacaaattatgtaga
gctaaagcattagatatttcacaaatgattaaatataaggaaagaggtggtgattgtcaa
gttgtaattattgatggtattgattattctaataatggaaataattctaataataattct
aataacaatgacatgacaccattatataaaaaacaagtattacaattttggaaagaatta
ggattaacaagtgaaaatgaattttgtgaattattaaatattcactttcctaaaaaggaa
gattctagtagtagtagtaataataatgtattaaacagattaaaattaacagataaatct
aaatttacatcaaaagatgaattaaatgatgatttatatcaacaatttaatgatttaggt
caaagattatataaattaaattcagaaatctttgaagaacttccactaaaaatagaatta
aatgaaacacaagatgaatacatagaaagaatatcaccatatatgttaagtgttataaaa
ttaaatcaaataccaggtggtgaaattgtaaatttaaaagaattagaaaatttattaaat
aatgaaaagaatttaattgatccaaataaggtatcagaaattacacaaccatcacatcat
gttttacattctgatcaatgttacatttttgaaagtttatttacaaatgaagttttcttt
tggagtggaaaacaaagtaatttaaatattagaaaatggggaattgctattgctaaaaaa
ttagcacaatatagatctttaaataataatccattttcattgaaaaatccaattttacaa
cgttttaaatctattttaaataattctattaatattactataaatggaagtaattctata
aatggaaatcaattacctaataatagaaaatatttatcatccattacacgtgttatagaa
gaaggtgaacattctatttataaacaaaaatttagtgattatccaggaatgttaatgatt
caaacacaatcacaagaatcacgtggaaatgttgcagaaaaaaagaaacaatcaaaaatt
aattttttagaattattaaaatctaaaaataatttaaaagaagaattaaaatctaattca
caaaaacaatttattgatccaactttagtaactaccatatatagtagtaaaattagaatg
tggagagtgagtgattttcaaaaaataccatatcaacatttaggtcatttctttacaggt
gatgcatttattattttatttacctatacaaaaatagaaggtggtaaatctttccataaa
ttattcttttggcaaggaagagatattaaaaagaaagataaaggaacatctgcatataaa
actgttgaaattaatgaaatgattgatgaaggtgttgtagaaaatcaaattagagttgta
caagataaggaacctaaactatttttagatttatttaaatttaacccaaatagtatggaa
gagagtactactattgaaaatgataaacattataagaaggtaccttattttattcataag
ggtaaatatagaccttctgttttggaatcttttgaaaaggctaacaaattatcttctatt
attggtaatatttctaataataataataatggaaatattaatccaaaatcatcaccatta
ccaaaattaaatatttctaataatacaaatgataataataatacaaataataccactaca
actacaccaacaacacctacaatttcaaatgatgaagaaatgaatcttgcacctgttaaa
ttatttacttccataaatggaaatttagatgaaaatgaaaaattttcacctcaaatttta
caattccaaacagaaatgattgaaagaataatttctaaaaatataaaattagaatattta
aaatcctatgattttagaaatggaattttatgtgaaactgatgatttacatccaaattat
ttaaatccatttaatttaataattttttcaaatttaaattttaatgtttatttaaataga
attgaactaaataaggaaattgaacaagatgatttaaaaactattatttattatggaaaa
tattgtaaagaatctgataagaaatttattgaaaataatgttttaaatttatttaataat
aataatataattactataaatggaaataatcaagaattattagaaaatgtatttactaag
gaaattgatccaacatttgaatattttatttctagatttaataattatttaaatactttt
gaatttaaaaataattataatatttccttttataatattaatgatcattcaggtgaattt
actttaaatagattggatccatttggtgaaattgatttatcttcttcacaagcctttatt
ttagattgtcttgatttagaaggtaaaatctatgtttggattggaatgttatgtaatatt
gaaacaaagaaatttgcactttcaactaccattcaatattactatacatggaaatcacaa
acttgtaatgatgaattttataagaagaaacctcaaaatgatgacatggatgattttgat
ccaagtaaatttttacaaaaatcagatgaacaatcattacttgtcattcaagaaatggaa
gaaccacaagaatttacaaaacatttcatttcatggtcaattaattcaacttcattcaaa
gttagatttaaacaattacaagatccaaatttaatttcaaagggttttgttaaaacacca
agaactccaagaagatcaaatattaatgttcaaatttctaaacatgaaaagaatttattt
gaacattcttcatccatttttgaaattgaacattgttcaaatgttttacaattatataac
aaattatttactcacaaaacttatagttatgcaattttaacaagtggtgcaaatattcca
gaaggtattgataaatctaaattagaatcttatttatcaaatgaagaattccaaaaagta
tttggaatggataaaaagaaatttgctactttacaaaattggaaacaaacctctttgaaa
aaggaaaagaatttattttaa
DBGET
integrated database retrieval system