Nitrosomonas sp. AL212: NAL212_0065
Help
Entry
NAL212_0065 CDS
T01443
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase domain protein
Organism
nit
Nitrosomonas sp. AL212
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
ResIII
Helicase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ28013
UniProt:
F0TCW5
LinkDB
All DBs
Position
pNAL21201:complement(65985..69602)
Genome browser
AA seq
1205 aa
AA seq
DB search
MPRLDENRLEVAKSIQAKLAQENLLTPSQARSFVRCLQMTWDVEIIRWEDQDSSMQLSSA
YNLIHVAGIFKDVEGVNSFNSVQCYRRAAEQLEWLTRADDKLKNEVPISLLAGAAYQLGS
LPAMAKGLLKQIQSDDAGWRLFCLFLQADFDGVIETALTFWKRSPELTEKKASSQILNGD
EEDAVSWYVTVELIRTIGLIAFSLRSGHQGRLEKALEKLNAIQRMATRNLNSEMSLLITM
LSEVANEFNNASIYKSINKLAKLDPTKTSKLNTLARRQYHIGRGVLWPSQLAGIERLLEQ
SSFALCTPTGSGKTLVANLALIKELLLMDGDPLIAPLAIYLVPSRALAGEVESKLNREMG
NEFIITGLYGGNDWGVTDYWLNADRPTVLIATVEKADALMRYLNPIIIPRLKLIIIDEAH
QIVPDDPTYAAKNFAKHSDRSIRLESFVSRILVQSPNIARMALTAVAGGAAGPVARWIES
REDAHPVGLNYRSTRQVIGILETRSGSAPKLNLDFMNGAPLSVVGRDDSPYLNLRIQAMP
QLPVIMRNSLNRYNQLEILWTAMHFRRGGRRILISLTQVPEQTMKWYCEVLSLKAWAEIT
TFEPPKKNNLHEFFDETMATCVDYCGENSYEVKLLKFGIATNHGQMPQRLRLLMTNLIER
GICSITIATATLTEGVNLPFDIIFLPQLRRQSFDPDKEILVNVPLSTSEFRNLSGRAGRP
GAARSMEGLTLIALPQVPSTTANGTKNIQIRQIRDLKKDYINLRERLVAEEKVSGAINSP
LALLIHTLFLKARASGLVEDEGGFLDWLDRISPSDISDNAATGHRSETAQLADTLDELDG
LLLSAIEEIHRMDMGEIDVKNIEESLKGLWAKTFSAYAAVQELWMENAFIKRGKAIIETI
YPDPDERKRLYQYGFPPYLGRRFEGIFDPIKETIMTANRYGAFSIQKRCDIFEALAELIS
DDRGYGFSVRESEVAKKVLNNWRTVLNWWLNNSEVDGPQPDELREWQRFVSENLEFRLGV
IVGAVIARSWADGANELLAIPSLEEWKKTTGLPWFGFWIRELLRWGTHDPFVAFALSQGI
AKTRPFALSRKSEFLEWLENNYEELDEEDLIDPQLFLQWQKSLPKRKRPEPKKTIYQAEL
TGTDGKLGQYNVVPVHNEGIVIWLDPAGYELARSNVAEGNDHVFSHKSDFKMTIANGSVT
VTKIF
NT seq
3618 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgagactcgatgagaatcgcctggaggtagccaaatctattcaagctaagttagct
caggaaaatttgctaactccttctcaagctcgatctttcgtgagatgtctccaaatgact
tgggatgtagaaataattcggtgggaagatcaagattcctcaatgcaattatcgagtgct
tataatttaattcatgtagctgggatttttaaagatgttgagggagttaattcgtttaat
tcagttcaatgctatcgaagggccgcagaacaacttgaatggctgactcgtgccgatgat
aaactaaaaaatgaagtgccaataagccttcttgcaggagcagcgtatcaacttggaagt
ctacctgcgatggccaaaggattgttaaaacaaatccaatcagatgatgctggttggcga
ttgttttgcttattcttacaagctgattttgatggtgtaattgaaactgctttaaccttc
tggaagagatcacctgaattaactgaaaagaaagcatcatctcaaatattaaacggtgat
gaggaggatgccgtttcttggtatgtcaccgtagaactaattcgaactattgggcttatt
gccttctcgctgagaagtggtcaccaaggtcgattagaaaaggcattagaaaagcttaat
gcgatacagcgcatggcaacaagaaatcttaatagcgaaatgtcactattgataacaatg
ctaagtgaagtcgccaatgaattcaataatgcttccatctacaaatctattaataaactt
gctaaattagaccctacaaaaacgagtaagttaaatacactagcgaggcgccagtatcat
attggtcgcggtgttctctggccatctcagcttgctggtatcgaacgattgctagaacaa
tcatcttttgccctatgtacccctactggttcagggaaaacattggttgccaatcttgct
ctaataaaagaattgttattaatggatggtgatcctctaatagctcctttagccatttat
ttggttccatcgagagctttagcaggtgaagttgaatcaaaacttaatcgcgaaatgggt
aatgaatttataattacaggcctttatggtggtaatgattggggagttacggattattgg
ctgaacgcagatcgacccacggttctcattgcgactgttgaaaaagctgatgcgttgatg
cgatatctgaacccgattattattccgcgcctaaaactcattatcattgatgaagcgcat
caaatcgtccctgatgatcctacatatgctgcaaaaaactttgctaagcattctgatcgt
tccattcgattggaaagttttgtgtcaagaatactcgttcaatcgccaaatatagcacgg
atggctttaacggctgtcgcaggaggagctgcgggccccgttgcgcggtggattgaatca
agagaagacgcgcacccagttggcttgaattatcgaagtactcgccaagttataggtatc
ttggaaacaagatctggatcagctcctaagttaaatcttgattttatgaacggagcgcct
ctttctgttgttggtagagacgactcgccgtaccttaatctcagaatacaagcaatgcct
caattgccagtaattatgcgaaatagtttaaatcgttacaatcaattagaaattctctgg
acagccatgcactttcgacgtggcgggcgtcgcattttaatttcacttacacaagttcca
gagcaaacgatgaaatggtattgcgaagttctttcgttaaaggcatgggcagaaattaca
accttcgaaccgccaaaaaaaaataatttacatgaattctttgacgaaacgatggcaact
tgcgttgattattgcggagagaattcatacgaagtgaaattacttaaatttggtatagca
acaaaccatggtcaaatgccacaaagacttcgtcttttgatgacaaatttaattgaaaga
ggaatttgctccatcacaattgccacggctacattaacagaaggtgttaacctacctttt
gacatcattttcttgcctcaactacgacgacaatcatttgatccagataaggaaatattg
gttaatgtgccgttatcaacatcagaatttagaaacctttctggtcgagcgggaaggcca
ggcgctgctcgttccatggagggattaactctaattgcattgcctcaggtaccttcaaca
acagcaaacggtacaaaaaacatccaaataagacagatacgggacttaaaaaaagactat
ataaatctcagagaaaggcttgttgcggaggaaaaagttagcggggctataaatagcccg
ttagctttgcttatacatactctttttcttaaagcccgcgctagcggtctggtggaggat
gaaggaggctttttagattggcttgatagaatttccccaagtgacatttctgataacgct
gctacaggacatagatctgaaactgctcagcttgctgatacgctagatgagcttgatggc
ttgcttctaagcgccattgaagaaattcatcgtatggatatgggcgagattgatgtgaaa
aacattgaggaatctctgaaaggcctttgggcaaaaacattttctgcatatgccgcagta
caagaactgtggatggaaaatgcgtttataaaacgaggaaaggccatcattgagacgatt
tatcctgatccagatgaacgtaaacgcttatatcaatatggattccctccctatttgggg
aggcgctttgaaggtatatttgatcccataaaagaaaccataatgacggctaataggtat
ggcgctttttctattcagaaacgctgtgatatctttgaagcattagcagaattgatcagt
gatgatagaggttatggtttttccgtacgagaatcagaagttgcaaaaaaagtgcttaac
aattggaggactgttcttaattggtggcttaataactcagaagttgatggtccacagcca
gatgaacttcgggaatggcaacgttttgtttcggaaaatctagagtttcggctaggtgtt
atagtaggagctgtgattgcaagatcttgggcagatggtgcaaatgaactcttagcaata
cccagtttagaagagtggaaaaagacaacaggtttgccatggtttggcttctggattcgt
gaattactgaggtggggtacacatgatccttttgtcgctttcgcactttctcaaggtatt
gcaaaaactaggccattcgctttgagtcgcaaatcagaatttcttgagtggcttgaaaat
aattatgaagaattagatgaagaagacttgattgacccgcagctttttcttcaatggcaa
aagagtcttccaaaaagaaagcggcctgagcctaaaaaaactatatatcaggcagaacta
actggtactgatggaaagttgggacaatacaatgttgtgcccgtacataacgagggtatc
gtaatttggcttgatccagccggttatgagcttgcaaggtcaaatgtagctgaagggaat
gatcatgtattttcgcataagtcagattttaaaatgactatcgcaaatggctcagtaact
gttacaaaaattttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
