Paraglaciecola sp. T6c: Patl_2246
Help
Entry
Patl_2246 CDS
T00372
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase
Organism
pat
Paraglaciecola sp. T6c
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_8
MASE11
PAS_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG40764
UniProt:
A0A9J9BAB6
LinkDB
All DBs
Position
2726999..2729290
Genome browser
AA seq
763 aa
AA seq
DB search
MSFIARLKLQLKDYFYLQDDYSPLARVEAWRISSLRIMLVSILLLCSVFVIQSAWQSVTE
KIAYVIPMSLTFYIALTAMLFISRRHYYLSSCGLIGLIVLAAISFNATQNNQTLSMLGPV
VMYSTPFVAFILLGWKAGLFCIFLNFLPLYILINQISLADYFTPFPVLKHANYYLHVILF
VFTNICIPLAIARASIAAKRGNQFNIERNQILTSQNQLYHALFVDAQTAKIIVDNKRNII
EANDAAISLLRNNLPKQFIGERVDSIFPELSEQNDKLVVNRTLGAKMKVLELSAQSINDE
LHTLITIQDVSAKALLHKTLAVQTQARQRQKLYDENIGLPNRQWLENKLSANAAQFNTVI
SLCAIRINNAHFIEQKYGFLYLPKVLKRLSTILSEQIGDRSCIAVLDKHSLGFAISILDD
AIIKSAMQQVVSTLPRSIVFDDISIHVDCKAGVATHQIDEDVSQLINNALHAVTDNDAVI
NYYETGSQQRFIEHQEISILLNEALSNDELYVDYQPKVRGDGTIIGMEALLRWNSPIIGG
VSPGVFIPIAEQSGLVLRLTRWLVNHVCMQIRQWEDEGLDIVPVAINISGPDLDQPDFKK
YLINCVVEQNIKPHFIELELTESAKTRNIPDAIATVQYLASFGFCITLDDFGVGYSGLSK
LTNFPVQRVKIDRQFITNIQSDAKNAQVVEAIVAMCKVFKIDVLAEGVEDLREVDCLLEM
GCKSFQGFAFARPMSRQNIAKLIDKTQMPNVKLPLQRKNMINN
NT seq
2292 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctttcatcgctcgccttaagttacaacttaaagattatttctatctacaagatgac
tactcccccttagccagagtcgaagcttggcgcataagctcgctccgcatcatgctcgtt
tcgattttactcttgtgttctgtgtttgtaattcaaagcgcctggcaaagtgtgacagaa
aaaatagcctatgttatccccatgtccctcaccttttatattgcattgaccgctatgctt
ttcatctcccgccgtcactattacttgagttcttgtggtttgattggcttaatagtgttg
gcagcaatcagtttcaacgccacccagaacaatcaaaccttatctatgctcggccctgtc
gtcatgtactctacgccatttgttgcttttattttattaggctggaaggcgggattgttt
tgtatttttctaaactttttaccactgtatattttaataaaccagatttcattagcagat
tatttcaccccttttccagtactaaaacatgctaattattacttgcatgtcatcttgttc
gtttttaccaatatttgtattccgttggccatcgctcgagcgagtatcgcagcaaagcga
ggtaaccaatttaacattgagcgtaatcaaatactcactagccaaaaccagttatatcac
gctctttttgtcgatgctcagaccgcgaaaatcatcgttgataacaaaagaaatattatt
gaagccaacgacgctgctatctctcttttgcgcaacaatttgcctaaacagtttatagga
gaacgagtcgacagcatttttccggaattatcagaacaaaatgacaaactagttgttaat
cgtactttaggcgcaaaaatgaaagtactcgaattgagtgctcagtcgataaacgatgag
ttacacaccttgataacgattcaagatgtaagtgctaaagcattacttcacaagactttg
gcggtgcaaacccaagcaagacaacgccagaagctatatgacgagaacattggcttgccg
aaccgacaatggttagaaaataaactttcagccaatgcggcgcaattcaatactgtcatt
tcgttatgtgcgattagaataaacaatgctcactttattgaacaaaaatacggtttctta
tatttgccaaaagtgcttaaaagactatcaacgatattaagtgagcaaataggtgatcgt
agttgtattgcagtacttgataaacacagtttaggttttgcgatttccattctggatgat
gcaatcatcaaaagtgcaatgcagcaagtggtttcaacactccctagaagtatagtgttt
gatgatatctccatacacgttgattgtaaggctggggtagctactcatcaaatagacgaa
gatgtaagccagttaatcaataacgcgctgcatgcggtgacagataatgacgcggtgata
aactattatgaaactggcagccaacagcgcttcattgaacatcaggaaatcagtatttta
cttaatgaagcgctatcgaacgacgaattatacgtggattaccagcctaaagtgcgcggc
gatggcaccatcattggtatggaagcgctgctgaggtggaattcccccatcattggtggc
gtatccccaggggtatttattcctatcgctgagcagtctggtttagtgttgcgactcacc
cgttggttagtcaaccacgtatgcatgcagataaggcaatgggaagacgaagggctggat
attgtgcctgttgcgattaatatttcgggccccgacctagatcagcctgattttaaaaag
tacctaattaattgtgtggttgaacagaacatcaaacctcacttcatcgagcttgaattg
actgagtcggccaaaacccgaaatatccccgacgccattgccacagtgcaatatttagca
agctttggattctgtatcaccttagatgactttggtgtgggctactctggcttatctaaa
ctaaccaacttcccagtacaaagagtaaaaatagaccgccagtttattactaatattcaa
agtgacgctaaaaatgcacaagttgtcgaagctattgtggccatgtgtaaggtgtttaag
attgatgtattagctgaaggcgttgaagacctacgagaagtagactgcctattagaaatg
gggtgtaaaagttttcaaggtttcgctttcgcccgaccaatgagcagacagaacatcgca
aaattgatagacaagacgcaaatgccaaacgtaaagctgccattacaacgtaaaaatatg
attaacaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
