KEGG   Paenibacillus durus: PDUR_27180
Entry
PDUR_27180        CDS       T03297                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
pdu  Paenibacillus durus
Pathway
pdu02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pdu00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    PDUR_27180
SSDB
Motif
Pfam: Y_Y_Y PKD_4 PKD DUF4397
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIQ15137
UniProt: A0A089HVL3
LinkDB
Position
complement(5890162..5895039)
AA seq 1625 aa
MRKRKSSKRLSFLVSMMLMVQVLFPALNVFAAETNNNVLPPSNLSYQLLTPTDVKLTWSS
VFGATGYKVYEITDGQLIERGTMTTTSFTINGLPEGSYTYVVSTLSPDGESGPCAPITVN
ITYPDMTAPTLTYTIQNGNDIVLSWTTSAYAQSYNLYQVQADGQRTLIKSQATHTYTVVN
APMGTATYAVSAANSAFGESPLSAPVDVNVVLPVMAAPGNFTFSLANVNDINLKWNAVSY
ATNYKIYQIQADGQKVLKSTVTGTTVSFTNQEAGEYVYEVYSYSSRFGESAEGSRLTVTV
GDVTMTAPGNLTYKLQNVNDVVLTWSTVSNATGYKIYQLIDGQLVLKSTVTGTAVTYTNQ
PAGDYHYEVHSYSDRFGESAEGSQVSVTLSSVTMEPPAAVNYTLKNVNDVVLTWETSANA
SSYKVYQIIDGQKVLKSTVTGTTVTYTNQPQGNYTYEVHSFSTRFGESAEGSQVSVTLSS
VTMEPPAAVNYTLKNVNDVVLTWETSANASSYKVYQIINGQKVLKSTVTGTTVTYTNQPQ
GNYTYEVHSFSTRFGESAEGTQVSFTLIFPTMEPPANLIQTIKNATDFSLTWAASDYATS
YKVYQIVDGQKVLKSTVSGLTVTYTGMPPGDYTYEVHSVSTRFGESSEGSRITVTLSGQT
LQAPTNPTYTITNGNDITLKWTAANYATSYRIYQIIDGQKVLKSTATGSSVIYRDQPEGT
LVYEINSVSTIFGESPEAAEVTISLIYPTLAAPGNLAYKIQNGNDVVLTWGAVTYANSYK
VYELVDGQKVLKNTVTSLTATQTKVQEGDHTYIVKAVSSRFGESPEGGQVTLTILPSIMQ
APGNFTKSIVNGNDISLKWNTATYATAYNLYKVVDGQEVLVRSQTGTAVTLTNQPEGEYN
FVVRSYSDRFGESAEGSELSFTLVWPVMQAPSGFKQSITNGNDITLRWDATTYASGYKLY
QVIDGQEVLKKTQTGTAVTFTNQPEGDYAYVVRSYSDRFGESAEGGELQFTLTWPVVQPP
VLAGAVFNANNITLSWQSVTWANEYHVYDVTGGDRQLIYKGTALSYKVYNLSEESHSYEV
TAYSTRFGESAPSNRVSKTIVFPVMQPPVASINLLSDTSARISWNFVTYANGYNIYELID
GKPVLLTQNLNNLSFTVSDLSYKDHEYYVTSYSNSFGESEPSNTVIAKLIIDTEAPVTKA
EAPAGWTNLSQIISLSATDNETGVANTFYSLNDGEYTAGASVTVDKEGVNKVSFYSVDKV
GNTEAPQTIYVKIDQTLPNTKVSDIPEWIKQTDVLTLTATDNLSGIAKTFYSINGSDYNE
GNSITVDNEGINKISYYSVDQAGNKEAAHTVEVKLDKTAPVTTADAPAAWTKGDVTVQLT
AADTLSGVAKTFYSIDGSAYVKGSTFTVSDEGIHKVAFYSTDMAGNIEAANKVEVKIDRT
APVVTMDLSKEAEAGATLQLNYSATDALSGVVSEKMTVSSPDGAAEQVVTNGSEIVFDKP
GVYTVTVTVTDGVGLSTTLQKQFTVYLPASITVTPNIIKGNKGVFTVRVDLPNGYNSQGF
DLNTATVNGVKALNSNNGYYQQAKLGQFKFERSDFDWTGSEVTLHFRGYVNGILVIGEKV
VKIQK
NT seq 4878 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagaaaacgtaaatcctccaaaagactttctttcctggtttcgatgatgcttatggtc
caggtcttgtttcccgctctaaatgtgtttgcggctgagacaaacaataacgtgctgcct
ccaagcaatctttcctatcagctcctgacaccaaccgatgtcaagctgacatggagctcc
gtgtttggggctactggttataaggtgtatgagattacggatggccaactgatcgagcgg
gggacaatgacaacgacctcctttaccattaacggtcttccggaaggttcatatacttat
gtggtttcaaccttaagtccggacggagagtcagggccctgcgcgccaatcacggtgaat
atcacctatcccgacatgacggcgccaaccttgacttacacgattcaaaacggcaacgat
attgtcctgagctggaccacttctgcgtatgcccaaagttacaatctttatcaagttcaa
gctgatggacaaagaaccttgataaaatcccaggcaacacatacatatacagtcgtcaat
gctccaatgggaacagctacgtacgcggttagtgcggcgaattccgcctttggtgaatct
cctctatccgcacctgtcgacgttaatgtcgtccttccagtcatggccgctccaggcaac
ttcacgtttagcctggcgaacgtcaacgacatcaacctgaaatggaatgcagtcagttac
gccacgaactataaaatctatcaaatccaagctgacggtcaaaaagtattaaaaagcacg
gtaaccggtacaaccgtctcctttaccaatcaagaggctggagaatatgtatatgaggta
tattcctacagcagtcgttttggcgaatcggcggaaggaagccgtttaacggtaactgtc
ggggatgtcactatgacggcacccggcaatctaacttataaactgcaaaacgtcaacgac
gtggttttaacatggagtaccgtttcaaatgctacaggctataaaatctatcagctcatc
gacgggcagctcgtactgaaaagcacggtaaccggaacagctgtcacctatacgaaccaa
ccggccggggattaccactatgaggtacattcctatagtgaccgtttcggggaatcggcg
gaaggcagccaggtttcagttactctgagctccgtaaccatggagccgcctgccgctgtt
aactatacgctcaaaaacgttaatgatgtggtcctgacctgggagacttcggcaaacgcc
agcagttacaaagtctatcaaattattgacggacaaaaagtattgaaaagcacggtaacc
ggcactactgtcacttacactaatcagccgcaagggaattatacgtatgaagttcattcc
ttctctacccgtttcggggaatcagcggaaggaagtcaggtttcagttactctgagctcc
gtaacaatggagccgccggccgctgttaactatacgctcaaaaacgttaatgatgtggtc
ctgacctgggagacttcggcaaacgccagcagttacaaagtctatcaaattattaacgga
caaaaagtattgaaaagcacggtaaccggcactactgtcacttacaccaatcagccgcaa
gggaattatacgtatgaagttcattccttctctacccggttcggggaatcggcggaagga
acccaggtttcctttacgctcatttttccgaccatggagccgccggccaatctgatccaa
acgattaaaaatgcgaccgatttttctttgacttgggctgcatccgactatgcgacaagc
tataaggtttaccagatcgtggatggtcaaaaagtgcttaaaagtacggtaagcggctta
accgttacgtataccggcatgccgccgggtgattacacgtatgaagttcattcggtttca
acccgttttggcgagtcgtcggaaggcagccggattacggtaacgctgagtggtcaaacg
ctgcaagctccgacaaacccgacctacaccataacgaacggtaatgatatcactttaaaa
tggacggcggcgaattacgcaacgagctatagaatctatcaaatcattgatggacaaaag
gttctgaaaagtacggcaaccggcagttccgtgatttatagagaccagccggaaggcacc
ttggtttatgagatcaactctgtttccacgatctttggcgagtcaccggaagcagctgaa
gtcacgatttcgctgatttatcctacattggccgccccgggtaatctggcatataaaatc
cagaatggaaacgacgtcgtgttaacttggggagctgtaacctacgcgaactcttataaa
gtctatgagcttgtcgacggacagaaagttctaaagaatacggtaacaagtctgactgca
acacagacgaaggtacaggaaggtgatcacacctatatcgtaaaagccgtaagcagccgt
ttcggagaatcacccgaaggaggtcaggtgaccttaacgatccttccttcaattatgcag
gcaccgggtaattttacgaaaagtattgtgaacggaaatgacatttccttgaaatggaat
accgctacctacgcaacggcttataatctttacaaggttgttgacggacaggaagtgttg
gtgagatcgcagaccggaacagctgtcacactcacgaaccagccggagggcgagtacaac
tttgtggtacgctcctacagtgaccgcttcggagaatcggcagaaggcagcgagcttagc
ttcacgttggtctggccggtcatgcaagcgccgagcggctttaagcaaagtattacgaac
ggaaatgacattaccttgagatgggatgccactacctatgcttcgggctataagttgtat
caagtgattgacggacaagaagttctgaaaaaaactcaaaccggaacggccgttacgttt
acgaaccagccagagggcgattacgcttatgttgttcgctcctacagcgatcgtttcgga
gaatcggcagaaggcggcgagctccagttcacgttgacctggccagtggttcagcctcca
gtcctggcaggggccgtatttaatgccaacaatattacgctttcttggcagtcggtcact
tgggcaaacgaatatcatgtttacgatgtgactggcggtgaccggcagttaatctataag
ggaacggctttaagctacaaagtgtataacctttcagaggaatcgcattcgtatgaagtg
actgcgtacagcactcggtttggagagtctgctccttcgaatcgagtatccaagacgatt
gttttcccggtcatgcagcctccggttgcctccattaatttgttaagcgacacgagtgcc
cggatttcctggaatttcgtcacctacgcgaacggctataacatatatgaactcattgac
ggcaaaccggttttgctgacgcaaaacctaaacaacttgtctttcacggtttcggatttg
tcctataaggatcatgaatactatgtgacatcgtacagcaactcgtttggtgaatcggaa
ccgtcaaacaccgttatcgccaagcttattatcgatacggaagcaccggtgacgaaagca
gaagcacccgccggttggacgaacctgagccagattatctccttatcggcaacagataac
gaaacgggagtcgcgaacacgttctattctctgaacgatggcgagtatacggcgggagct
tctgtaacggtggacaaagaaggtgtaaataaagtttccttctactcagtggataaagta
ggcaatacggaagcaccgcagacgatttacgttaagattgatcaaaccttgccaaacacc
aaggtaagtgacatcccggaatggattaagcaaacggatgtactgacattgactgcaaca
gacaatctcagcgggatagccaaaacgttctactcgatcaacggatccgattataacgaa
ggcaattcgattacggtagacaacgaaggtattaacaaaatcagttactactcggttgac
caagcgggtaataaggaagcggcacacacagtcgaagtgaagctcgacaagacagcaccc
gtgaccactgctgacgctcctgcagcctggacgaaaggagatgtgaccgtccaattaacc
gcagcggatactcttagcggcgtagccaaaacgttctattcgatcgacggctcggcatat
gtcaagggaagcacgttcacggtcagtgatgaagggatccacaaggttgctttctattcg
accgatatggccggcaacatcgaggctgcgaataaggtcgaggtgaaaatcgatagaact
gcgccggtcgtcacgatggatcttagcaaagaggctgaggccggagcgacgctacagttg
aactactcggcaaccgatgctctttcaggtgtagtatccgagaagatgacggtttccagt
ccggatggagcggcggaacaggtcgtaacgaatggcagcgaaattgtattcgacaaaccg
ggagtttacactgttacggttaccgttacagatggtgtagggctgagcacgacattgcaa
aaacagtttacggtttaccttccagcttccataacggtgactcctaatattatcaagggc
aataaaggcgtgtttactgttcgtgtagacttgccgaatggatacaacagtcagggattc
gatctgaataccgctaccgtaaatggtgtgaaggcccttaacagtaataatggctattac
cagcaggcaaagctcggccaattcaaattcgaacgttccgattttgattggacgggttca
gaggttactttgcactttagaggatatgtcaacggtatactggtgatcggtgaaaaggta
gttaaaatccagaaataa

DBGET integrated database retrieval system