Pedobacter sp. PACM 27299: AQ505_00025 Help Entry AQ505_00025       CDS       T04140                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K21573   TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC Organism pep  Pedobacter sp. PACM 27299 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:pep00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:pep02000]     AQ505_00025 Transporters [BR:pep02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    AQ505_00025 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TonB_dep_Rec CarbopepD_reg_2 Plug CarboxypepD_reg Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ALL04016 UniProt:  A0A0P0NB58 LinkDB All DBs Position complement(9583..12720) Genome browser AA seq 1045 aa AA seqDB search MKKLLQSLFILIFIAGSAIAQDRTVTGTVTDKSDGKPLPGVTVRIVGGKGGTQTGANGKY SVTAPSSATLEFSYLGYETVTRPIPGSGVINVTLAEDGKDLNEVVVVGYGTQVRKDITGS VGSVKGEAIKNLASPSFDKQLAGQVTGVQVTNTSGVLGQPARIRIRGTNSISSNGDPLYV VDGVPYIAGDQGVITPYNPLGDINPNDIESYDVLKDGAATAIYGSRAANGVILITTKRGK TGAAKISYDSWFALATASKRFSLLNAEQFVEIANEKLHNIGETDDYAVLEKNPDGSIVNT NWQDQIFRTGFQQNHALSVSGATEKTNYYVSLGFADLKGTTISNAQRKYNFRTKLEQKAF NDYLTLGVNTSVSYTFNQGLNTGEGSSALSGNIASAIRALPNVRVKNPDGTYNVDFENNV LGEGANLTSIDDFYPNVSYILANNIYQSQGLNLTGNAFARLKLAEGLTATTQIGINHLNV EDYQYWNPLHGDGKGRNGIVSQYMQPTFRYNWQNFLSYSKVFGDHKLDVVGGMEIQKTKA RYILASGTGISNPYFGTSGNIISDTFQNQFFGGGNTPTGYTSVFGRLSYSYMDKYLLSAS LRNDRISSLPIGHQSALLPGASVGWRISKESFFANAEGLSFINDLKIRGGYAKVGNTDIG AFPYAGLYGPVQYGLNSGLGYARLGNPDLRFETSKKMDIGLDASMFNNRIQLGVDYFKND IDNLILNSPTPSSLGVPNNSISTNVGKMTNKGWEFSVSSLNIKNDNFSWNTSLNLSFIKN EVLALSNNNAPLINTYNITKVGSSIGEFYGYESIGVNSANGNPLWKNHNGEIIQGDITSG KYFYYNDGNPGDLTRAAAALTETDKRSFGNANPTWFGGLNNTFTYKQFDLGIMLTFSGGN KVYNYTKQEALSNQKFLNNGVEILERWTTPGQLTDVPKLVYGKDNFILLSGNLNSRFLEN ASFLRAQNLSLGYTVPADLVKKLNINNLRFYVQVQNAFVISGYSGLDPELATSYSTNSSQ NRAPGVDFNTNPVPRTYTFGINLGF NT seq 3138 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaaaaacttttacaaagtttgttcattctgatttttatcgcaggctctgcgattgct caggatcggacagttactggtacagttacagacaagtcggatggtaaaccactaccggga gtaactgtaagaattgttggaggcaaaggtggcacacaaactggtgctaatggtaaatat tcagttaccgctccttcatccgcgacattagaattctcttatctaggatatgaaacagtt acaagaccaattccagggtctggagtaattaacgtgactttagctgaagatggcaaggac ctaaatgaggttgttgtggttggttatggaactcaggtaaggaaagacattacaggatcc gttgggtcagtaaagggtgaggctattaaaaacctagcaagtccaagttttgacaagcaa ttagctggtcaggtaactggggttcaggtgactaacaccagtggtgttttaggtcagcca gcacgtattcgtattcgtggaacgaactctatttcaagtaatggagatcctctttatgta gttgatggggttccttatatcgctggagatcaaggagtaatcactccgtataatccactg ggtgatatcaatcctaatgacattgaaagttatgatgtcttgaaggatggagccgctaca gctatttatggttcaagagcagctaatggtgtaattttaattaccaccaaaagaggtaaa accggtgctgcaaaaatttcttatgattcttggtttgcgcttgctacagcatcaaaaagg tttagcttattgaatgcagagcaattcgttgaaattgcaaatgagaaattacacaacatt ggcgaaactgatgattatgctgttttagagaaaaatccagatggatctatcgtgaacaca aattggcaggatcagattttcagaactggatttcaacaaaaccatgcattatctgtaagt ggtgcaactgaaaaaacaaattactacgtgtctttaggctttgctgatttgaaaggaaca accattagtaatgcacagcgtaagtataacttccgtactaaattagaacaaaaagcattt aatgactaccttactttaggggtaaatacgtctgtatcttatactttcaatcaaggatta aacacaggtgaaggatcttctgccttatcaggaaacattgcttctgcaattagagcatta ccaaatgttcgtgttaaaaatccagatggaacgtataatgttgatttcgaaaataacgtt ttaggtgaaggagcgaatctaacgtcgattgatgatttttatcctaacgtttcttatatc ttagcgaataatatctatcagtcacaaggattgaaccttacgggtaatgcttttgcaaga cttaaattagccgaaggcttaaccgcgactacacaaatcggtatcaatcaccttaatgtg gaagattaccaatattggaatccacttcacggtgatggaaaaggacgtaatggtatcgta agtcaatacatgcaacctactttcagatacaactggcaaaactttttaagctattctaaa gtttttggagatcataaacttgatgttgtaggtggtatggaaattcagaaaaccaaagca agatatatccttgcatctggaactggaatttcaaatccttattttggaacaagtgggaac attatttcggataccttccaaaaccaattctttggtggtggtaataccccaacaggttac acctcagtattcggaagattaagttattcttacatggataaatacttactttctgcatca ctaagaaatgataggatctcttctttaccaatcggtcatcaaagtgctcttttaccaggt gcctctgttggatggagaatttcgaaagaaagtttctttgcgaatgctgaaggactttca ttcattaatgatttaaaaataagaggtggttacgcaaaagtaggtaatacagatattggt gcgtttccatatgcaggtctatacggaccagttcaatatggtttaaatagtggattagga tatgctagattaggtaatccggatttgcgttttgaaaccagtaaaaaaatggatattggt ttagacgcttctatgtttaataacagaatccagcttggtgttgattacttcaagaatgat attgataatttaattcttaattcaccaactccttcttcattaggtgttcctaataatagc atctccactaacgttggaaaaatgacgaataaaggatgggagttctccgtaagcagtctg aacattaaaaacgataatttctcatggaataccagtttgaacctaagttttattaaaaac gaagttctggctttatcaaacaataatgcaccattgattaatacttataacattactaaa gtaggttcttcaattggtgagttttatggttatgagtctattggagtgaactctgcaaat ggaaatccattgtggaaaaatcataatggtgaaattatccaaggtgatatcacaagtggt aagtatttttattataatgatggtaaccctggtgacttgactagagcggctgcagcactt acagaaactgataaaagatcttttggtaatgcaaatcctacctggtttggtggtttgaat aatacattcacctataaacaatttgatctaggtattatgttaaccttctctggaggtaat aaagtgtataactacactaaacaagaagcacttagtaatcagaagttcctaaataatggt gtggagattttagaaagatggactactccaggacaacttacagatgttccaaaattggta tacggaaaagataactttatcctattatcaggaaatcttaacagccgtttccttgagaat gctagcttcttgagagcgcagaatctttccttaggttatacagtgcctgctgacttggtg aagaaactaaacattaacaaccttaggttctatgttcaggttcaaaatgcatttgttatt tcgggatattcaggtcttgatccagaattggctacaagctactctacaaactcaagccag aatagagctccaggagttgattttaataccaatcctgtgccacgtacatatacgttcgga attaacttaggcttctaa

DBGET integrated database retrieval system