Plasmodium falciparum HB3: PFHG_05165
Help
Entry
PFHG_05165 CDS
T01052
Name
(Broad) hypothetical protein similar to DNA mismatch repair enzyme
KO
K08735
DNA mismatch repair protein MSH2
Organism
pfh
Plasmodium falciparum HB3
Pathway
pfh03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
PFHG_05165
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pfh03400
]
PFHG_05165
DNA repair and recombination proteins [BR:
pfh03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
PFHG_05165
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_IV
MutS_II
Motif
LinkDB
All DBs
AA seq
811 aa
AA seq
DB search
MENHEVEEVNEDQILCLYIDTKKYQKSLGVCFYNYLKYEFLMTEFIDNGHFTALESLFIQ
KRPHKCFFNSTNDLVDDERLLNLFKICNVQAIPLEKKKYDATNLKDELKLIISHNDDVRN
YDKHLELENACKCLMVLINYLKLKENQDIHNQCKINIHNMDLYMRLDKAAISALNILPNK
KNIHSYNNNTSLLKFLDKCNTTIGSKKLVSWLTQPLTNVAEINKRLNIVEFFIKEDDARN
VIFCNYLKRIPELDKLNHYLKEINQNNEIRVNSKYNEEMILKDIVKMYYSILDFKQIYFT
LKPIQGKNKETIDEIIINPLRDILNKFSKLLDMIEITIDLEEVQENKVYLISTSFDNELE
IIANEKNALMKKIKKHKDDVEKDIFADKYDRTYKRANREDIRLVDCNTNVFLFRVTKKDC
GLVQQDKKKYMTVRMNKNEFLFTTNTLKNLCKQYDHCLNIYNTLQSEIINKTICAVSTYT
PVIEKFIDLVSTLDVLISFSVVCHNSPFPYVRPVIVDHGENVIMRKSRHPLLELQYNLNN
FIPNDIHMNKKNSRLIIVTGPNMGGKSTYIRQTAIICILAQIGMFVPCDFCEVPIFTQIM
CRVGASDFQLKGISTFLSEMIEAAAIVKNADQNSFIIVDELGRGTSTYEGLGISWSIGKY
ILDNIKCFCLFATHFHEMSNIAYQCEGVINRHVETTIDKEKKKICFLYEIKDGASNKSYG
VNVAEIAKLPKEVIQKAYEKVEELESAENKYYLKEKLNIDTSASADENYKMKISNYMKIK
DEIHYLFSSTNENEFMERFVSKKNYLKELAI
NT seq
2436 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatcatgaggtagaggaagttaatgaggatcaaatattatgcttatacatagat
acgaaaaaatatcagaaaagtttaggtgtatgtttttataattatttaaaatatgaattt
ttaatgacagaatttattgataatggacattttacagctttagaatctttattcatacag
aaaagaccacataagtgttttttcaatagtactaatgatttagttgatgatgaaagactt
ttaaatttgtttaaaatttgtaatgttcaagctattcctttggaaaagaaaaagtatgat
gcaacaaatttaaaagatgaattaaagctaattatatctcataatgatgatgtaagaaat
tatgataaacatttagaattagaaaatgcatgtaaatgtttaatggttttaattaattat
ttaaaactaaaagaaaatcaagatatacataatcaatgtaaaattaatatacataatatg
gatttatatatgagattagataaagcagctattagtgcattaaatatccttccaaataaa
aagaatatacatagttataataataatacaagtttattgaaatttttagataaatgtaat
actacgataggttccaaaaaattagtatcatggttaacacaaccattaactaatgttgca
gaaataaataaaagattaaatattgttgaatttttcataaaagaagatgatgctcgtaat
gttattttttgtaattatttaaaaaggataccagaattagataaacttaatcattattta
aaagaaataaatcaaaataatgaaattcgagtaaattctaaatataatgaagaaatgatt
ttaaaggatattgtaaaaatgtattattctattttagattttaaacaaatttactttact
ttaaaacctattcaaggaaaaaacaaagaaactatagacgaaatcattataaatccttta
cgtgacattttgaataaattttctaaattattagatatgattgaaataactatagactta
gaagaagttcaagaaaataaagtttatttaatttcgacaagttttgataatgaactagaa
attattgctaatgaaaaaaatgccttaatgaagaaaatcaaaaaacataaagatgatgta
gaaaaagatatttttgcagataaatatgataggacttataaaagagcaaatagagaagat
attagattagtagattgtaataccaacgtatttttatttagagtaacaaaaaaagattgt
ggtttagttcaacaagataaaaaaaaatatatgacagtacgtatgaataaaaatgaattc
ttatttacaacgaatacattaaaaaatttatgtaaacaatatgatcattgtttaaatatt
tataatacattacaatcagaaatcataaataaaacaatatgtgctgtttctacatataca
ccagttattgaaaagtttattgatttagtatctacattagatgtattaatatctttttca
gtcgtttgtcataattcaccatttccatatgttcgaccagtaatagtcgatcatggagaa
aatgtaattatgagaaaatcacgtcatccattgttagaattacaatataatttgaataac
ttcatacctaatgatatccatatgaataaaaagaacagtaggttaattatagttaccgga
cctaatatgggagggaaaagtacatacattagacaaacagctattatatgtatattagct
caaataggtatgtttgtaccatgtgatttttgtgaagttcctatatttacacaaattatg
tgcagagttggagcttccgattttcaattaaaaggaatttcaacctttttatcagaaatg
atagaagcagcagcaattgtaaaaaatgctgatcaaaattcttttattattgttgacgaa
ctaggtagaggtacatctacttatgaaggattaggtataagttggtctattggaaaatat
attttagataatataaaatgtttttgtctatttgcaactcatttccatgaaatgtcaaat
attgcttatcaatgtgaaggggttattaacagacatgtagaaactacaattgataaggag
aaaaagaaaatttgctttttatatgaaattaaagatggagcttcaaataaaagttatgga
gttaatgttgctgaaattgccaaattaccaaaagaagttattcaaaaagcttatgaaaaa
gtagaggaactcgaatcagctgaaaataaatattacttaaaagaaaaattaaatatagat
acttcagcaagtgctgatgaaaattataaaatgaaaatttcaaattatatgaaaataaaa
gatgaaattcattatttattttcatctactaatgaaaatgaatttatggaacgcttcgtt
tccaaaaaaaattatttaaaagaattagctatataa
DBGET
integrated database retrieval system