Porphyromonas gingivalis TDC60: PGTDC60_0128
Help
Entry
PGTDC60_0128 CDS
T01516
Name
(GenBank) leucine-rich protein
KO
K13730
internalin A
Organism
pgt
Porphyromonas gingivalis TDC60
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
LRR_6
LRR_9
Roc
TIR_2
COR
G-alpha
Ras
Arf
ThsB_TIR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAK24298
LinkDB
All DBs
Position
complement(144774..148928)
Genome browser
AA seq
1384 aa
AA seq
DB search
MKAKKPQAILDIEKTYNIDIPDLSLQGEIDWWVDRYFKQDSSGAVVELRLRSCHIDGKAW
LVDFPALKKLDLSYNQIRKFEGLDHLASLTELDLSGNQIAKLEGLNALTSLTRLDLSYNQ
IRKFEGLDHLASLTELDLSGNQIAKLEGLNALTSLTRLDLSDNQIAKLEGLDSLTSLTEL
YLSGNQIAKLEGLDHLTSLTRLDLRGNQIAKLEGLDHLTSLTGLNLSGNQIRKLEGLDSL
TSLTELYLSGNQIAKLEGLNALTSLTELYLSGNQIAKLEGLNALTSLTGLNLSGNQISKL
ESLASLTSLTRLNLSDNQIAKLEGLNALTSLTGLDLRGNQIAKLEGLDHLTSLTRLDLRG
NQIRKLEGLDSLTSLTQLDLSGNQISKLESLNALTSLTELDLSDNQIATLESLASLTSLT
ELDLSDNQIAKLEGLNALTSLTGLDLRGNQIAKLEGLDHLTSLTRLDLRGNQIRKLEGLD
SLTSLTQLDLSGNQISKLESLNALTSLTELDLSDNQIATLEGLNALTSLTRLDLSDNQIA
KLESLASLTSLTRLDLSDNQIAKLEGLKDLTQLQELDVSGNDIQSVDDIKLLAPILEQTL
EKLRIHDNPFVALSGLILSPYDNHLPEIKALLEKEKEKQKKTSVEYHPFCKVMLLGNHSS
GKTTFLSQYDTNYTYQENTHVLSIHRSNNPNAIFYDFGGQDYYHGIYQAFFTTQSLYLLF
WDAKKDRNFVSVDDKEYQTLNFNRPYWLGQIAYASNRCMSVGGNPDGKDKTQTIDDTIII
QTHADETGAKQQTLGCAAGNGVLEEIYVSLEPKANSAVHALNYLNERVREVIASRSKSIQ
ITEKDKGLYEALPSIAGDNKHSPVSLETLAAELNMGRDENDLYTIEYLQTELNQLSLRGE
VLYYRENEKLNSYVWLDPAAFVQMIHGEILQKDDINRGTVPKEVFERKLHRLSSGSTSVE
HVQNGNMTLQLLLEELIVYEDKDCYVIPGYLPLHSDDEAYKWLTLGFERPNFVLKFERFI
PFGLINQIIAYYGREEGALKRYWRDQVIFTAGREMDRRQIEQEEKKEGLPKANAEDYLIW
IKLDFTDLAISVFIKEQRKTSAKDMQRKEVAILSDILDMYWNNIPPREQLGDKGAEQTRS
TIRETNRKKRPIQDLYLSCAQADKDLTESHYIHLGTLDDESKTTARIAAYPLKDGAIDKE
RVREVSTRPYKHLSVNKKLSGVKRVFISYSKHDREELEQCLLFFKPLVKSGHIELYYDEL
TKFETPIHSEIRRRITGADCIIALVSQNYLGTDYILDHELPVIEDYEKTLIPIQIKPCTF
YEVETLSKHYFALKAKVVNLDSRIFTVPDGVTASALREQNWCDVVREFKEKVLGITKQEV
NTDE
NT seq
4155 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagccaagaagccacaagccattttagacatagagaagacctataacattgatatt
cctgatctctccttacaaggagagatagattggtgggtagataggtatttcaagcaagat
tcctccggtgcagtcgtcgagcttcgtcttagaagttgtcacatagatggcaaggcttgg
cttgtcgattttcctgctctaaaaaagcttgatctatcgtataaccaaatccgtaagttt
gagggtttggatcatctcgcctccttaacagagcttgatctatcgggtaaccaaatcgct
aagcttgagggtctgaatgctctcacctccttaacaaggcttgatctatcgtataaccaa
atccgtaagtttgagggtttggatcatctcgcctccttaacagagcttgatctatcgggt
aaccaaatcgctaagcttgagggtctgaatgctctcacgtccttaacaaggcttgatcta
tcggataaccaaatcgctaagcttgagggtcttgattctctcacgtccttaacagagctt
tatctatcgggtaaccaaatcgctaagcttgagggtctggatcatctcacctccttaaca
aggcttgatctaaggggtaaccaaatcgctaagcttgagggtctggatcatctcacctcc
ttaacagggctgaatctatcgggtaaccaaatccgtaagcttgagggtcttgattctctc
acgtccttaacagagctttatctatcgggtaaccaaatcgctaagcttgagggtctgaat
gctctcacgtccttaacagagctttatctatcgggtaaccaaatcgctaagcttgagggt
ctgaatgctctcacgtccttaacagggctgaatctatcgggtaaccaaatcagcaagctt
gagagtctggcttctctcacgtccttaacaaggctgaatctatcggataaccaaatcgct
aagcttgagggtctgaatgctctcacctccttaacagggcttgatctaaggggtaaccaa
atcgctaagcttgagggtctggatcatctcacctccttaacaaggcttgatctaaggggt
aaccaaatccgtaagcttgagggtcttgattctctcacgtccttaacacagcttgatcta
tcgggtaaccaaatcagcaagcttgagagtctgaatgctctcacctccttaacagagctt
gatctatcggataaccaaatcgctacgcttgagagtctggcttctctcacgtccttaaca
gagcttgatctatcggataaccaaatcgctaagcttgagggtctgaatgctctcacctcc
ttaacagggcttgatctaaggggtaaccaaatcgctaagcttgagggtctggatcatctc
acctccttaacaaggcttgatctaaggggtaaccaaatccgtaagcttgagggtcttgat
tctctcacgtccttaacacagcttgatctatcgggtaaccaaatcagcaagcttgagagt
ctgaatgctctcacctccttaacagagcttgatctatcggataaccaaatcgctacgctt
gagggtctgaatgctctcacgtccttaacaaggcttgatctatcggataaccaaatcgct
aagcttgagagtctggcttctctcacatccttaacaaggcttgatctatcggataaccaa
atcgctaagcttgagggtttaaaagacctgacgcaattgcaagaacttgatgtttcgggc
aatgatattcaatcagttgatgatattaagctattggctccgattctggagcaaacttta
gaaaaactgagaatccatgacaatccctttgttgcattatcgggcttgatactctctcct
tatgataatcatttgccggagattaaagctcttcttgaaaaagaaaaagaaaaacagaaa
aagacttcagttgaatatcacccattttgcaaagtaatgctattgggaaatcattcttcg
ggtaaaacaacatttcttagtcaatatgatacaaattatacatatcaggaaaatacacat
gtgctgtcgatacatcgaagcaataaccctaatgccatcttttacgactttggggggcaa
gactattatcatgggatttaccaagccttttttaccacccaatcgttataccttctcttt
tgggatgctaagaaggatcgaaactttgtgagcgtagatgataaagaatatcagactctt
aatttcaatcgcccctattggttaggacagatagcctatgcctccaatcgttgtatgtcg
gttggaggaaatcctgatggcaaggacaaaacacagaccatagacgatacaattatcatt
cagactcatgccgatgaaacgggcgctaagcagcaaaccttaggctgtgcagccgggaat
ggagtattggaggaaatctatgtatccttagagcccaaggcgaatagtgccgtacatgcg
ctcaactatctgaatgagcgggtgcgagaagttatcgcaagcaggagtaaatcaattcag
atcactgaaaaagataagggattgtacgaagctcttccctcaatcgccggtgataataaa
cacagtcctgtctctctcgaaactcttgcggctgaactgaatatgggaagagatgaaaat
gatctttacaccatagagtatctacagaccgaattgaaccaactcagtctgcggggggag
gtgctttactatcgtgagaatgagaagctgaacagctatgtttggttagatccggctgct
tttgtccaaatgattcatggagaaatcctccaaaaagacgacatcaatagaggaacggtt
cctaaagaggtttttgagcgcaaactccatcgtctaagctccggaagtacatctgtagaa
catgtccaaaatggtaatatgactttgcagctattattggaagagctgatcgtatatgaa
gataaggactgctatgtgataccgggatacctcccattgcattccgatgacgaagcctat
aagtggcttactttgggattcgagaggcccaattttgtcctcaaattcgaacgttttatc
ccctttggcctgatcaaccagattatagcctactatggacgggaagaaggtgctctaaag
cgatattggcgagatcaggtcatcttcacagcaggccgtgagatggataggcgacagatt
gaacaagaagaaaagaaagagggtttgcccaaggcgaatgccgaggattatctgatctgg
atcaagctcgactttaccgacttggccatatccgtattcatcaaagagcagagaaagaca
tccgctaaggatatgcagcggaaagaagttgctatcctcagtgatatattggatatgtat
tggaacaatatccctccgagggagcaactaggagataagggtgcggagcaaacgagaagc
actattcgtgaaacaaacagaaagaagagacccatccaggatctctacctctcctgtgcc
caagcggataaagatttgacggagtctcattatatccatttgggcacgctggacgatgag
agcaagaccacggcgaggattgcagcctatccgttgaaggatggtgctatcgataaagag
cgagtgcgagaagtatctacccgtccctacaaacatctttccgtcaataaaaaactatcg
ggagtaaagcgcgtcttcatatcgtattccaagcatgaccgtgaggagcttgagcaatgt
cttttattcttcaaacccttggtgaagagtgggcatatcgaactatactatgacgaactg
accaaattcgaaacacctatccatagcgaaatcagaagaaggatcaccggagccgattgt
attattgcattggtcagccaaaattatttgggtacagactacatcctcgaccatgagttg
ccggtcatcgaggattatgaaaagacacttatccccatccagatcaaaccctgtactttc
tatgaagtagaaaccttgtccaagcattatttcgcattgaaggccaaagtcgtcaatctt
gacagccgtatttttactgtgccggatggtgtcactgcgtcagctcttcgagagcagaat
tggtgtgatgtagtcagagagttcaaagagaaggtattaggaataacaaaacaggaggta
aatacagatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
