Pseudoalteromonas translucida TAC125: PSHAa2647
Help
Entry
PSHAa2647 CDS
T00282
Name
(GenBank) conserved protein of unknown function with GGDEF domain
Organism
pha
Pseudoalteromonas translucida TAC125
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
MASE6
Trep_Strep
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI87695
UniProt:
Q3IFG3
LinkDB
All DBs
Position
I:2800121..2801227
Genome browser
AA seq
368 aa
AA seq
DB search
MLHFWYKEFPQYPRDHKDYWRTRLIAHSLLICCCYFLILTLLNVFYFSSYDIALIDALGL
IASLSICIWFNKTAQVSKAAWVVALMIVGLIMLFIVSAKGHAHSLFWATLIPPFTFFLVG
RNWGSILSSIAFGICAYLVYLQQQLSITIGLSALFNFIEVSIAHVLLFRFYEKTRFSAYS
HLSKRNAEIKQLAETDKLTGLYNRQKFDFELSQLLSENNNERKSNIVMICDIDHFKKVND
TYGHLAGDNVLSEFANILQNKLTNSALIARWGGEEFTIILRDSSLDNAINEAEELRAFIA
THLIDNRALTISIGIAKAHVDDTALHLLERADKALYKAKLQGRDQVCVASDNLTKTRYEN
TLSKSAAI
NT seq
1107 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctacatttttggtataaagaatttccgcaataccctagagatcataaggattactgg
cgaacacgcttaattgcacattctttattaatctgctgctgctactttttaattttaacc
ttactaaatgttttttatttttcgagttacgatattgcacttattgatgccttaggactt
atagcctcattaagtatttgtatatggtttaataaaacagctcaggttagtaaagctgct
tgggttgttgcattaatgatagttggcttaataatgctctttatagtatcggcaaagggt
catgctcattcattattttgggcaacacttattccgccttttactttttttttagttggg
cgtaattggggaagtatattaagtagcattgcttttggtatttgtgcctatctagtttac
ttacagcaacaactatcaattaccataggtttatctgcattatttaattttattgaagtg
tctattgcgcatgttttattatttaggttttatgaaaaaacgcgtttttcggcttactct
catctttcgaagcgcaatgccgaaataaaacagctagccgaaaccgataagctcaccggg
ctatataacaggcaaaaatttgattttgaattgtcgcaattactgagtgaaaataataat
gagcgaaaatcaaatatagtgatgatttgcgacatagatcactttaaaaaagtaaacgat
acttatggccatttagcgggtgataacgtgcttagtgagtttgccaatattttacaaaac
aagcttacaaatagtgcattaattgcacgctggggcggagaagagtttactattattctt
cgagatagcagcctagataacgcaattaacgaagctgaagagctcagagcgtttattgcc
actcatttaatcgataatagagcgttaactatcagtattggtatagctaaagcgcatgtt
gacgacactgctttgcatcttttagagcgcgccgataaagcgctttataaagcaaaatta
caagggcgagatcaagtctgtgttgctagcgacaacttaaccaaaactcgctatgaaaac
acattaagtaaatccgctgctatttaa
DBGET
integrated database retrieval system