Pedobacter heparinus: Phep_2034
Help
Entry
Phep_2034 CDS
T00978
Name
(GenBank) amino acid adenylation domain protein
Organism
phe
Pedobacter heparinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
Aminotran_3
Ketoacyl-synt_C
PP-binding
KAsynt_C_assoc
AMP-binding_C
Thiolase_N
SpoVAD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACU04239
UniProt:
C6XWU5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2347192..2353722)
Genome browser
AA seq
2176 aa
AA seq
DB search
MLNKGTITDSFSGQAKIFPENIALDFNNNQLTYKELDERSNQLAHYLRAQGVKQETLVPI
CINRSIEMIVGILGIIKAGGAYVPIDPQYPAARIGYILDEIKTEFTVSNRESCKNLPGKT
ILLDEEWDLISKEPFVATTVATKDTDLIYVIYTSGSTGKPKGVMVEHRSLSTYIRTQTTY
FQINPADRILQFSSYCFDASVEQIFLALLNGATLILVEGALLNDMDAFSLFLKNKKVTHL
HSTPGFLENLNPDGYPNLKRVVAGGDLCKKSLFKKWIGKVDFYNKYGPTECTITAAEYHC
TSDDAERVKVLPIGRPLENVDIYILDEFMNPVPESTGEIHIGGIQVSRGYFNRPELTKKQ
FIDSPFKAGERLYKTGDLGRWLPDGNIEFQGRADDQVKIRGYRIELAEVENALSECGDVK
QCVVITRTDQQNGKSLIAYVIPHGDFNRTAIADYMKKKLPEYMIPQLIVSLDTIPLTPNG
KVDKKALPDVDAGAFLSSIYVAPKHPTEQKIAAVWQSLLNVKRVGIKDNFFELGGNSLLA
QKLVALLKELELLLPVTRLYQHPTVEGIAAFIDGRSFKTAPKKELKAISGNDIAVVGMAG
RFPGADTVDEFWQNLKEGKETTHFFTDEELDPSIPDVLKKSPNYVKARGIINDPAGFDAV
FFGINPKLAELMDPQHRLFLEISWEALEHSGHVPQKYDGTIGVFAGCRFNTYYSNNVISN
TALIENAGAFQVSTVSDKDYIASRTAYALDLKGPAVNVQSACSTSLLAIAQAVESIRNGH
CDVALAGGSSMLVPVNSGHLYEDGAMLSSDGHCRAFDADAKGTVFSDGAGVIVLKNKAKA
ELDGDTIYAVIKGIGLSNDGGGKGSFTAPSAEGQAAAISMAIADAGVSAADISYIEAHGT
ATPLGDPIEIEGLNMAFAEQEKKQFCAIGSVKSNFGHLTGASGVAGMIKTVFSLYYKQLP
PSINYKTPNPHIDFANSPFFVNDILRDWNPGRKRIAGVSSFGVGGTNVHIVLEEAENPVK
PDNKSIRPVQLLCWSAKAENSIHGYGLKLADYLNKQGLNLADVAYTLHSSRSDFNHRRFV
VASSAADFAEKIANEPLLAANTRILKEYPQELVFMFPGQGAQFLNMGKDLYVAEPVFRQA
MDECAALLAEVMQENILDVIYPENVNEAAENRLKNTRYSQPALFTIGYALGKLWMSWGIF
PTAFIGHSIGEFVAAYFSGILSLPDALKLIASRGKMMSGLPEGSMLSIRSDVETVKTLLS
DEIALAAVNSPNLSVVAGTTTAIADLVTQLDEMGILNRLLPTSHAFHSHMMDPVIEPFNA
LVETITLNEPLIPIVSTVTGEWLTNEEATNPTYWAKHLRSTVNFGAAAQKLLTEGYNLFV
EIGPGNSAATLTRQQAAGKPIAVIASLEQGENEQSSYNSVLKALGQLWLNGVEPNWTSFY
KNEDRTVINGLPTYFFNKKQYWVNPVLPVQFTNLLLPAEPITVQQDIKSSPIMRKQVLID
KIKELLENASGIDMSNITPEMTFIEMGLDSLLLTQVALNLKKQFALPITFRQLNEEYSTT
GLLADYLATKLPAEAMPANPGPPTTAQPVYLNGSQAGPVNHTALDLISQQLQLLAKQVSI
LQGSQMPSVNEQYNNHQVQQPIVKFNANTQLTAEESLEIKKPFGAAAKIERQSAALNEVQ
QNYLNDLIVRYNNKTKGSKAYTQQHRSYMADPRVVSGFRPATKDLVYSIVINKSKGSRLW
DIDDNEYIDALNGFGSNMLGYQPDIIKHALIDQIEKGYEIGPQHELSGEVSKLICEFTSF
DRAALCNTGSEAVLGAMRIARTVTGRSIIVAFTGSYHGIADEVIVRGSKKLKTFPAAPGI
MPEAVQNMLILDYGTEESLQIIEERAHEIAAVLVEPIQSRRADFQPIEFLNKLRKITEDA
ETVLIFDEVISGFRFHPGGVQALFGIKADIGTYGKVAGGGISIGIIAGKKKYMDALDGGF
WQYGDDSIPEVGVTYFAGTFVRHPLALATAKASLTYLKEAGPALQENLNANGLYIADAIN
KICRKLNVPMYIAQYGSLWRIKFIEEYPYNELFFTLMRYKGIHILEGFACFLTTAHTAED
IQTIIRCFEESLMELKAVGLIPEYQHQIAETDNEIANYNNLNIPPFPGAKLGKDKDGNPA
WFIKDEKNPGEFLQVI
NT seq
6531 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaataaaggaacaataacggattcattttcagggcaagccaaaattttccctgaa
aatattgcgctggattttaataacaatcagcttacctacaaagaactagacgaaaggtcg
aatcagctggcccattatttaagggcgcagggcgtaaaacaagaaacacttgttcccatc
tgcattaaccgctctatagagatgattgtaggcatacttggcattattaaagctggcggt
gcttatgttcccattgaccctcaatatccagctgcaagaattgggtacatcctggacgaa
attaaaactgaattcactgtcagtaatcgtgaaagttgcaaaaatttgccgggaaagaca
attttgctagacgaagaatgggatttaatcagcaaagagccgtttgttgccactaccgta
gctaccaaagacacggatttgatatatgtaatctatacgtccggatcaacgggtaagccc
aaaggtgttatggttgaacaccggtcattatctacttacatccgcacccagacaacttat
tttcaaatcaaccccgcagataggatactacagttttcgagctattgctttgatgcctca
gttgagcaaatattcctggccttattaaatggggctacactgatattggttgaaggggca
ttgctcaatgatatggatgcgttttctttattccttaaaaacaaaaaagtaacgcactta
cacagcacaccgggttttctggaaaatctgaacccggatggttatccaaatttaaaaaga
gtggtagccggtggtgacctgtgtaaaaagtcattatttaaaaaatggataggaaaggtt
gacttttataacaagtacggcccgacagaatgtacaataaccgcagctgaataccactgt
acatcagatgatgcagaacgagttaaggtccttcccataggacgtcccctcgaaaatgtg
gatatctacatccttgatgagttcatgaatcctgttcctgaatcgaccggagaaatacat
attggtggcatacaggtatccagggggtattttaaccgcccggaactaactaaaaaacag
tttattgacagtccgtttaaagccggagaacgattgtacaagacaggtgatcttggcaga
tggttgcctgacggaaatattgagtttcaggggagagctgatgatcaggtaaaaataaga
ggttacagaattgaacttgctgaagtggaaaatgcacttagcgaatgtggtgacgtaaaa
caatgtgttgtaattaccagaacggatcaacaaaatggcaaaagtttaattgcctatgtc
atacctcatggcgatttcaacagaacagcgattgcggattacatgaaaaagaaactgccg
gaatatatgatccctcagttgattgtttcgttggataccattccacttaccccgaacgga
aaggtggataaaaaagcgctgccagatgtagatgcaggagcctttttgagtagtatatat
gttgcgccgaaacaccctactgaacaaaagattgcagcagtatggcaatctctgttaaat
gtaaaacgggtaggcattaaagataatttttttgaattgggaggaaattccctgctggct
caaaaattagtggcacttttgaaagagctggaactgttgttgcctgtaaccaggctgtac
caacaccctacggttgaaggtattgcagcttttatagacggacgcagtttcaaaacggcc
cctaaaaaagaattgaaagctataagtggaaatgatattgcggtagtcgggatggccggg
aggtttccaggagcagataccgttgatgaattctggcagaatttaaaggaaggaaaggaa
actacacatttctttacagatgaagaactggacccatctataccggatgtgctgaaaaaa
agccccaattatgttaaggcaagaggaataataaatgatcccgctggttttgatgctgtt
ttttttggtattaatcctaaacttgcagaattgatggatcctcaacatcgtctctttcta
gaaatttcctgggaggcattggaacacagtggccatgtacctcagaaatatgatggcact
attggtgtttttgcaggatgcaggtttaacacctattattcgaacaatgtaatttccaac
acagcacttattgaaaatgcaggagcttttcaagtaagcactgtaagtgataaggattac
attgcaagccgtaccgcttatgcactggatttaaaaggaccagctgtaaatgttcagtca
gcctgttccacttcgctgctggcgatagcacaggcagtagaaagtatcagaaacgggcac
tgcgatgtagctctggcgggtggctcttctatgctcgtacctgtaaatagcggacacctt
tatgaagatggtgcaatgttgagtagcgatggacattgccgggctttcgatgcagatgca
aagggtaccgtatttagcgatggtgcaggtgtaattgtgttaaagaacaaggctaaagcc
gaactggatggtgataccatttatgcagtaattaaaggcattggcttaagtaacgacggc
ggcggaaaaggtagtttcacagcacccagtgcagaaggccaggctgctgcgatcagtatg
gctatagcagatgccggggtttctgcagcagatatctcttacattgaagcgcatggcaca
gccacacctttgggtgatccaattgagattgagggcctgaatatggcttttgctgagcag
gaaaaaaaacaattttgcgccattggctctgttaaaagcaatttcggccatttaaccggt
gcgtcgggtgttgcaggtatgatcaagacggtgttttcattgtactacaaacaactccct
ccttcaatcaattacaaaacgcccaatcctcatatcgatttcgcaaacagtccttttttt
gtcaatgatatactacgcgattggaatccaggtcgtaaacggattgctggcgttagttct
tttggcgttggcggcacgaatgtacatatagtattggaagaggcggaaaatccggttaaa
ccagacaataaaagcatccgtcctgtccaattgctgtgctggtcggcaaaggctgaaaat
agcatccatggttatggtttaaaattagccgactacctcaataaacagggcttaaacctg
gcagatgtcgcatataccctacatagttcaagatcagattttaatcacagaagatttgtc
gtagcttcatctgcagcagactttgcagaaaaaatagccaatgagccgctactcgctgca
aacaccaggattcttaaagaatatccacaagagcttgtattcatgtttccgggacaggga
gcccagtttctgaatatgggtaaggacctgtatgttgctgaacccgtattcagacaagct
atggatgaatgtgctgcgctgcttgctgaagtgatgcaggagaacattttggatgtaatc
tatcctgaaaatgtaaatgaagccgcagaaaacagacttaaaaatacccgatatagtcag
cccgccctatttactattggatatgccttaggcaaactctggatgagctggggtatattc
cccactgcgtttatcgggcatagtataggcgaattcgtagctgcctatttttctgggata
ctgtctttaccagatgccttgaaactaattgcctcccgtggcaagatgatgagtggttta
ccggaaggcagtatgttgtctatacgttctgatgtggaaacagtaaaaacactactttct
gatgagatagccctggctgcagtaaacagtccaaatttaagtgttgttgcaggcactacc
acagcaattgcggacctggttactcaactggatgaaatggggatacttaatcgcttattg
ccaaccagccatgcgtttcattcacacatgatggatcccgttattgaaccgttcaatgcg
cttgtggaaaccataacgctaaatgaaccgcttattccaattgtttcaaccgtaacaggt
gaatggctaactaatgaagaggccaccaacccgacttactgggctaagcatttaagatca
accgttaatttcggagcagctgcgcaaaaacttttaactgagggctataatttatttgtg
gaaattggccctggcaattcagctgctaccttaacccgtcagcaggctgccggtaagccg
attgcagttattgcctcgctggaacaaggagaaaatgagcagtcttcctataattcagta
ttaaaggcattaggtcagctctggctgaacggtgtagagccaaattggacctcgttttat
aaaaacgaagacagaacagtgataaatggactgccaacctattttttcaataaaaaacaa
tactgggtaaacccggttttacctgttcaatttacaaacctattgttacctgctgaaccg
attactgtccagcaggatattaaatcatccccaataatgagaaagcaagttttaattgac
aaaattaaagagctattggaaaatgcatcaggcatagacatgagcaacatcacccctgaa
atgacctttattgagatggggttagattccttgttgctcacacaggttgccctgaattta
aaaaagcaatttgcattgccgatcacgttcagacaactgaatgaggaatacagcactacg
ggacttttagcagactatttggcaaccaaattacctgctgaggcaatgccggcgaatcct
ggcccgccaactacggcacagccggtttacttaaatggcagtcaagcgggtccggtcaac
catacggcattagacctgatcagtcagcaattgcagctattggcaaagcaggtttcaatt
ttgcaaggcagccagatgccatcggtaaatgaacagtataacaaccatcaggtacagcag
ccaatagtaaagtttaacgcaaatactcagctaaccgctgaagaaagcctggaaattaaa
aaaccatttggagcggctgcaaaaattgaaagacaatcagcagcgctgaatgaagtgcag
caaaattacctgaacgatttaattgtacgttacaacaataaaacaaaaggcagcaaagcc
tatacacaacagcaccggtcgtacatggccgatccgagagtggtttcaggattcaggcca
gcaacaaaagacctggtctattcaattgtaatcaacaaatccaaaggaagtcgtttatgg
gatattgatgataacgaatatatcgatgccttgaacggttttggctcaaatatgcttggt
tatcagccagacatcattaaacatgctttaattgatcagattgaaaagggttatgaaatc
ggacctcagcatgaattatccggagaggtatccaaactcatctgtgaattcaccagcttt
gatcgggcagcactgtgcaacactggttcagaagctgtattaggtgcaatgcgaatagct
cggaccgttacagggcgatcaataatcgttgcttttacgggctcttatcatggcattgca
gatgaggtgatcgttaggggaagtaaaaagttaaaaacttttcctgctgctccgggcatc
atgcctgaagcggttcaaaatatgcttatcctggattatggtacagaagaatctttgcag
atcattgaagaacgtgcacatgaaattgctgcagtattggttgaaccgatacaaagcaga
cgagctgattttcaaccaattgaatttcttaataaattgagaaaaattactgaggatgct
gaaaccgtcttaatttttgatgaggttatttctggctttcgctttcatcccggaggagtt
caggcactctttggcattaaagctgatattggcacctacggtaaggtagcgggtggcggc
atttccataggaatcattgcaggtaagaaaaaatatatggatgcattggatggggggttc
tggcaatatggtgatgactcaattccagaggttggcgttacgtattttgcaggaacattt
gtaaggcatccattggcattggctactgccaaagcctcgctaacttacctgaaagaagca
ggtccggcgttgcaggaaaacctcaatgcaaacggcttatatattgccgatgcaattaat
aaaatatgcaggaaattaaatgttccgatgtacatcgcacagtatggttcattatggagg
attaagtttattgaggaatatccttataatgaactgttctttacattaatgcgttacaaa
gggattcatatactcgagggatttgcctgcttccttaccaccgcacatactgcagaagat
atccaaacgatcatcaggtgcttcgaagaaagtttaatggaacttaaagccgtaggttta
attcccgaatatcagcaccagatagctgaaaccgacaatgaaatagccaattataataac
ttaaatatcccccccttcccaggtgcaaaattgggtaaagataaagatggcaatcctgcc
tggtttatcaaggatgagaaaaatccaggagaatttcttcaggtgatataa
DBGET
integrated database retrieval system