Pseudoalteromonas marina: CPA52_05260
Help
Entry
CPA52_05260 CDS
T06578
Name
(GenBank) mechanosensitive ion channel protein
Organism
pmaa
Pseudoalteromonas marina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_2nd
MS_channel_1st
MS_channel_3rd
Rpf1_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATG57692
LinkDB
All DBs
Position
complement(1150062..1151141)
Genome browser
AA seq
359 aa
AA seq
DB search
MLKNTLDVINNTPWLSTAAYLLLITILLFFIRFFIMYWLKKWTSKTTFTFDTLLLDSISK
PLTLCTFIVLITILEHDTFVIDPELANRIPFNSINIVLALLALIFFLNHFIIGTVNHYAK
QSAVIFNSQSIIKGVIRVTLFSVGLLVLLGTLGISITPIIASLGITSLAVALALQPTLEN
FFSGVQLVIDKPIRVGDFIELESKEQGFVEKIGWRSTWVKMLPNNMIIIPNSQLSKSRII
NYFYPEKELSVPVDVSVHYSSDLEFVEQVTLEVARQVLIDHEWGVDDYNTFVVYHTFDNS
SINFTVMLRAKEYFNRFWVKSAFIKALHKRYNQEGIVIPFPITAINTAQEAANFNSDKN
NT seq
1080 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcaaaaatacgcttgacgttattaacaacaccccttggttgagtacagcagcttac
cttttactcataactatactcttgttttttattcgtttttttataatgtattggttaaaa
aagtggacatcaaaaaccacttttaccttcgataccctacttcttgattcaatatctaaa
ccactcacactttgcacatttattgtgctaatcaccattttggagcacgatacattcgtt
attgaccccgagttagcgaaccgaattccgttcaacagcatcaatattgtattagcttta
cttgcacttattttctttttaaatcactttattattggcacggttaatcactacgctaaa
caatctgccgttatattcaattctcaaagtattattaagggggttattcgcgttacattg
ttttcagtagggttgttggttttattaggcacattgggtatttcaattacacctattatt
gcatctcttggtattacgtcattggcggtggcacttgccttacaacccacccttgaaaac
tttttttcgggcgtgcagcttgttatagataaacccatacgggtcggggattttattgag
cttgagtcaaaggagcaaggctttgtagaaaaaattggttggcgctctacgtgggttaaa
atgctgccaaataatatgattattattcctaatagtcagctttctaaatcgcgtattatt
aattacttttaccccgaaaaagagctgagtgtacctgtagatgtaagcgtacattacagc
tcagacctagaatttgtagagcaagtaacgcttgaagttgcgcgacaagtactgattgac
catgagtggggcgttgatgattacaatacctttgtggtgtatcacacctttgataactca
agtattaattttaccgtaatgctgcgcgcaaaagagtactttaatcggttttgggttaaa
tctgcttttattaaagcgctgcacaaacgctataaccaagaaggtattgtgatccccttt
cctattacagctattaacacagcgcaagaagccgctaattttaatagtgataaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
