Pseudoalteromonas translucida KMM 520: PTRA_a1343 Help Entry PTRA_a1343        CDS       T04220                                  Symbol hrpA Name (GenBank) ATP-dependent helicase HrpA   KO K03578   ATP-dependent helicase HrpA [EC:5.6.2.6] Organism ptn  Pseudoalteromonas translucida KMM 520 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ptn00001]  09190 Not Included in Pathway or Brite   09191 Unclassified: metabolism    99980 Enzymes with EC numbers     PTRA_a1343 (hrpA) Enzymes [BR:ptn01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.6  RNA 3'-5' helicase      PTRA_a1343 (hrpA) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  DUF3418 OB_NTP_bind Helicase_C HA2_C DEAD AAA_19 AAA_22 ResIII nSTAND3 AAA_11 AAA_25 T2SSE NACHT SLFN-g3_helicase HA2_N AAA_23 NTPase_1 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ALS32568 UniProt:  A0A0U2WW92 LinkDB All DBs Position I:1240120..1244007 Genome browser AA seq 1295 aa AA seqDB search MVNLGQLFGELKTCLKKDQFIFKKRLHGVKKITDENKHANALEKIAADITRSQALRAQRL AALPKVTYPEQLPVSQKKDVIKNAIANNQVVIIAGETGSGKTTQIPKMCLELGRGVDGLI GHTQPRRLAARTVANRIAEEMQCELGQQVGFKIRFSDQVSNNTYIKLMTDGILLAEIQQD RFLNQYDTIIIDEAHERSLNIDFILGYLKNLLPKRPDLKIIITSATIDPERFSKHFDDAP IIEVSGRTFPVDVRYNPVTEINKEDMEAEGDQLQGIFDAVDELCAEGPGDILIFLNGERE IRDTADALSKRNLKHTDILPLYSRLSNAEQNRIFAPHSRRHIILSTNVAETSLTVPGIRY VIDPGTARISRYSYRTKVQRLPIEPISQASANQRMGRCGRVEAGICIRLYAEDDFLSRPE FTDPEILRTNLASVILQMLALGLGDMAQFPFVQAPDSRNISDGLTLLEELQAVHPTKRND KTVLTQSGRELSRLPVDPRLAKMVLTAHKLGALREVIIIVAALSIQDPRERPQEKRAAAN EKHGRFDDPDSDFIAFLNLWNYLEEQQSELTNSQFRKLCQKDFLAYMRLREWQDIVYQIS TVCNEMGMKATSNAADGEQVHKALLSGMLSHIGFKDEKQIYKGARNSQFHIFPGSGLFKK SPKWLMSAELVETSKLYARTNAKIDINWVEPLAQHLVKRSYTEPHWEKKPGAVIAFEQQT LYGLLIVNKRRCVYSNIDPKVSRELFIRTALVEQELGLNESFLEFNRELIEDIQVLENKS RRRDILVDEQTLFEFYDKKIPKEINNRAAFLKWYKTQKQQNKHYLQMSRDDLMQHGASSI TEFDYPDTWQQDNLILPLAYHFDPGQAVDGVAVQIPVALLNQVQESGFDWHIPAFRHELI SGLIKSLPKSLRRNFVPAPNYADAVLAAIEPLQGSLIDALSNRLLKMTGVRVDPDAWDLS ALAAHLRLQFEVRGDNDKLLARGLDLAKLKAQLQGEVTQTLSKVADKGIEKVDLTQWDFG ELPNSYVKKQGQYEIKAYPALVDKKSTAAIELFDNEVKAQVAHQQGLRRLVLLNVPSPIK YLQQNLPNKAKLGLYFNPFGKIADLIDDCIAAGVDSLLLKYGDIRTSDAFESVKEHIRGE LGDAVVEIATQVEQVLSIAHALHKKMKGRVDLTMITAHGDIKSQLESLVFKGFVSQHGAT KLSDLIRYLKAIQKRLEKLPIDPNRDRLCVLELDKVAQEYKKQANKTPKGMPIPKEVEAI FWMQQELRVSLFAQTLGTPYPISAKRVLNAIKEIE NT seq 3888 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt gtggtaaacctaggtcagttgtttggcgagctaaagacgtgcttgaaaaaagatcaattc atttttaaaaaacgcttacatggcgtaaaaaaaataaccgatgaaaataagcatgccaac gcgcttgaaaaaatagcggccgacattacccgtagccaagcactgcgcgcgcagcgttta gccgctttgcctaaagtgacttacccagagcaattaccggtgagtcaaaaaaaggatgtg attaaaaacgcgattgctaataaccaagtggttattattgcaggtgaaaccggttcaggt aaaaccacgcaaattcctaaaatgtgtttagagctagggcgtggggttgatggcttaatt ggccacactcaaccaaggcgactagcagcacgaacggtggcgaatcgtattgcagaagaa atgcagtgtgaacttggccaacaagttggttttaaaatacgctttagcgatcaggtctcg aataatacctatattaaactaatgaccgacggtattttacttgccgaaattcaacaagat cgatttttaaatcaatacgacaccattattattgatgaagcgcacgaacgtagtttaaac attgactttattttaggttatttaaaaaacttactccctaagcgccccgatttaaaaata ataattacttcagcaacgatcgatccggagcgtttttcaaagcactttgatgatgcgcca attatagaagtatcagggcgaaccttcccggttgatgtacgttacaacccagttactgag ataaataaagaagatatggaagccgaaggcgaccaactgcaaggtatttttgatgcagta gatgagctgtgtgcagaaggccccggcgacattttaatatttttaaatggtgagcgtgaa atacgcgataccgccgatgctctcagtaaacgtaatttaaaacacactgatatattgccg ctttattcgcgtttatcaaacgccgagcaaaaccgcatatttgcaccgcactcgcgccgc 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