KEGG   Rickettsia bellii OSU 85-389: A1I_01520
Entry
A1I_01520         CDS       T00602                                 
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
  KO
K03046  DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
rbo  Rickettsia bellii OSU 85-389
Pathway
rbo03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rbo00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    A1I_01520
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:rbo03021]
    A1I_01520
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:rbo03400]
    A1I_01520
Enzymes [BR:rbo01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     A1I_01520
Transcription machinery [BR:rbo03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     A1I_01520
DNA repair and recombination proteins [BR:rbo03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      A1I_01520
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_4 RPOC_hybrid Apocytochr_F_C Biotin_lipoyl_2 Peptidase_M23 RnfC_N YqfD
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABV78696
UniProt: A8GV25
LinkDB
Position
295898..300103
AA seq 1401 aa
MRRRKLREHKPPNLEVSKVYKSNFKEKVFMSVVNFYGQLSNTQQFDQIRINIASPEQVRS
WSFGEVIKPETINYRTFKPEKDGLFCARIFGPVKDYECLCGKYKRMKNRGITCEKCGVEV
TVSRVRRERMGHIELAAPVAHIWFLKSLPSRISTLLDMTMRDIEKILYFENYVVVDPGLS
ILQKGELLTEEELQKAKDKYGEDAFTASIGAEVVQQMLKELDFPTLKQELYEELQNTTSE
VKKKKLVKRLKLVEDFLESENKPEWMIMNVLPVMPPELRPLVMLDGGRFATSDLNELYRR
VINRNNRLKKLIESKAPDIIVRNEKRMLQEAVDALFDNGRRGRAAKNANKRPFKSLSDML
KGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPELKLHQCGLPKKMALELFKPFIYSKLELYGIA
TTIKAAKRMVEAEKPEVWDVLEEVIREHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPLLIEGKAIQLHP
LVCAAFNADFDGDQMAVHIPLSIEAQLEARVFMMSTNNILSPANGRPIIVPDKDIVLGLY
YLTLAFDHEVGEGMMFSDLTEMEHALYNKFITIHTKIKYRRNQLNAEGKIVPVIVDTTYG
RLMVGELLPSNPNIEYKFINKPLTKKDISLVIDLVYRHCGQKATVIFADQLMKLGFKYAC
SSGISFGMDDMVVPKSKIVHIDETQLEIKEFEQQYSNGLITYGEKYNKVIDAWSRCTDRV
ANDMMKEIAKPPVSDDSNQQKINSIYMMAISGARGSFQQIKQLGGMRGLMTKSNGQIIPI
PIIANFKEGLTVFECFNSANGMRKGQIDTALKTASSGYLTRKLVDVAQDCIITEKDCNTD
KGIEVKSIIEGGEVIAPLAEMILGRTAAINIYHPVTNDLILTKGELINESKLEQIESAGL
DRIMIKSVLTCESSTGICAICYGRDLATGSLVSEGEAIGVIAAQSIGEPGTQLTMRTFHI
GGAATKGAEVSSVEASYDAKVKILSRNVVINSEERKIVMSRNCELLLLDNNGNEKAHSKI
PYGARLLVDEGDMVTKTQKLAEWDPYTIPIITEKSGKVLFKDMVEGISVRDVTDEATGIP
SKVIIESKQYSRGAELRPRIQLLDAKGEIIMLSNGLEARYYLPVGAVLSVEDGVQISVGD
IIARIPKESTTTKDITGGLPRVAELFEARRPKDHAVIAEIDGRVEFGKDYKSKRRIIINP
VDGSMGLEYMVPKGKHVVVNEGDFVKKGDLLIDGNPVLQDILKVMGVELLASYIVKEVQA
VYRLQGVKIDDKHIEVIIRQMLQKVEITDSGGTTLLVGEKIDRREFDEINEKAIKNGLRP
ADAQLILQGITKSSLQTRSFISAASFQETTRVLTEAAIAGKVDKLRGLKENVIVGRLVPA
GTGFFMDKMRKVAAKLDEENA
NT seq 4206 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgaggcgtagaaaattacgtgagcacaagcccccaaatcttgaagtatcaaaggtatat
aagagcaattttaaggaaaaagtatttatgagtgtagtaaatttttacggacaattaagt
aatactcaacaatttgatcagataagaattaatatagcaagtccagaacaagtacgttca
tggtctttcggtgaagtaataaaacctgaaactattaattatcgtacttttaaacctgaa
aaagatggtttattttgtgcaagaatttttggtccagtaaaagattatgaatgtctttgc
ggtaagtataagcgaatgaaaaaccgcggtattacttgtgaaaagtgcggtgttgaggtt
actgtttctagagtaagacgtgaaagaatggggcatattgaacttgcggctcccgttgct
catatttggtttctaaagtctcttccttcaagaattagtacgcttcttgatatgacgatg
cgagatatagaaaaaattctttattttgaaaattatgtggtagttgatcctggattatct
attctacaaaaaggtgagcttttaactgaagaagagctgcaaaaagcaaaggataaatac
ggggaagatgcatttactgcctctattggtgcagaagtagtacaacaaatgctaaaagag
cttgatttcccaacattaaagcaagagctgtacgaagaactacaaaatacgacttcagaa
gtaaaaaagaaaaagttagtaaagcgtttaaaattagtagaagactttttagaatctgaa
aataagccagaatggatgattatgaacgtgttgccggtcatgcctcctgaacttagaccg
cttgttatgttagatggtggaagattcgctacttcagatcttaatgaactttatagaaga
gtaattaatagaaataatcgtctaaagaagcttatagagtcaaaagcacctgatataatt
gttagaaatgaaaaaagaatgctgcaagaagcagtggatgcgttatttgataacggacgc
cgtggtagagcagcaaaaaatgctaataagcgtccatttaagtcattaagcgatatgcta
aaaggtaagcaaggtcgtttccgtcaaaacttacttggtaaaagggtggactactcagga
cgttcagttatcgtagtaggacctgagcttaaacttcatcagtgcggtttacctaaaaaa
atggctctagaactgttcaagccgtttatttactcaaaacttgaattatatggtattgct
acaactattaaagcagctaaaagaatggttgaggctgaaaagcctgaagtttgggatgtg
cttgaggaagttataagagaacaccctgtattacttaacagagctccgacactgcaccgt
ttgggtatccaagcatttgagccattattaatcgaaggtaaggcaatacagcttcatccg
cttgtttgtgccgctttcaatgcggactttgacggggaccaaatggctgtacatattcct
ttatcgattgaagcccagcttgaagctagggtatttatgatgtctactaataatatttta
agccccgctaatggacgtcctattattgtaccagataaagatatagtactcggcttatat
tatttaacgcttgcttttgatcatgaggtaggtgaggggatgatgttctcagacctaact
gaaatggagcatgctttatataacaaatttataacgattcatactaagataaaatatcgt
cgtaatcagttaaatgctgagggtaaaatagttcctgttatagttgatactacttatgga
agattaatggttggtgagttgttgccttctaatcctaatatagaatataagtttattaat
aagcctttaactaaaaaggatatatctctagtaatagatttagtctatcgtcactgcggt
caaaaagctacagtaatttttgctgatcagttgatgaagcttggtttcaaatatgcttgt
tcttcaggtatttcttttggtatggatgatatggttgtaccaaaatctaaaattgttcat
atcgatgaaacacagcttgagattaaggaatttgagcagcaatattcaaatggtttaatt
acttacggcgaaaaatataacaaggtaattgatgcatggtcaagatgtactgatagagta
gctaatgacatgatgaaagaaattgctaaaccacctgttagtgatgattcaaatcaacag
aagataaactctatatatatgatggctatttcaggtgctagagggtctttccagcagatt
aaacagcttggtggtatgcgtgggcttatgactaaatcaaatggtcaaattataccaata
cctattatcgctaactttaaggaaggattaactgtatttgaatgctttaactctgctaac
ggaatgcgtaaagggcaaatagatacagctttaaaaactgcaagctcaggttacttaaca
agaaaattagtagatgttgcacaagattgtattattactgaaaaagattgtaacactgat
aaaggtattgaagtaaagagtattatagaaggtggtgaagtaatagcgcctttagctgaa
atgattttaggtcgtacggcagctattaatatatatcatccggtgactaatgatttaatt
ctcaccaaaggtgaattaattaatgagtctaaattagagcaaattgagtctgcaggttta
gatagaattatgattaagtcggtattaacctgtgaaagttccaccggtatatgtgctata
tgttatggtagagatcttgctactggttcgttagtttccgaaggggaagctataggtgtg
atcgctgctcaatctatcggtgagcctggtacacagcttacaatgagaactttccacatt
ggaggagcagcaacgaaaggagcagaagtttcttctgtagaagcttcatatgatgcgaaa
gtaaaaattcttagccgtaacgtggttattaattccgaagaacgcaaaattgttatgagc
cgtaactgtgagttattattacttgataataacggcaatgaaaaagctcatagtaaaatc
ccatatggtgctagattacttgttgacgagggtgatatggttactaagacgcagaagctt
gcagaatgggatccatataccatacctatcattactgaaaaatctggtaaggtattattt
aaagatatggttgaggggatttcggttcgtgatgtaactgatgaggcaactggtattcca
agcaaagttatcattgaatcaaaacaatattcacgtggagcagaactaagaccacgaatc
cagcttcttgacgctaaaggtgaaattatcatgttatcaaatggtttagaagcaagatat
tatttaccagttggagcggttttaagtgtagaagatggggtgcagatatcagtaggtgat
ataattgcacgtattcctaaagagtcaactactactaaggatattactggtggtttacca
agagtagccgagcttttcgaagcaagacgtccaaaagatcatgcagtgattgctgagata
gatgggcgagtagagttcggtaaagattataaatctaagagacgtattattataaaccca
gttgacggttcaatgggtcttgagtatatggtgccaaaaggtaagcatgttgtggttaat
gagggagactttgttaagaaaggtgacttattaattgatggtaatccagtacttcaggat
attttaaaagtgatgggtgtagaacttcttgcaagctatattgttaaagaggtccaggct
gtttatcgtttacaaggggtaaaaattgatgataagcacatagaagtaattattcgtcag
atgttacaaaaagtagaaataacagactcaggcggtactacattattagtaggtgagaag
atagatcgacgtgaatttgacgaaataaatgaaaaagcaattaagaatggtttaagacct
gctgatgctcagttaatattacaaggtattactaagtcttctctgcaaactagatcattt
atatctgctgcatcattccaagaaactactagggttttaaccgaagctgctattgctggt
aaggttgataagctacgaggacttaaagagaatgttatagttgggcgtttagtacctgca
gggacaggtttctttatggacaaaatgcgtaaagtagcagcaaaacttgacgaagaaaat
gcttaa

DBGET integrated database retrieval system