KEGG   Rickettsia rickettsii Arizona: RPO_02270
Entry
RPO_02270         CDS       T01721                                 
Name
(GenBank) DNA mismatch repair protein MutS
  KO
K03555  DNA mismatch repair protein MutS
Organism
rra  Rickettsia rickettsii Arizona
Pathway
rra03430  Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rra00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03430 Mismatch repair
    RPO_02270
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:rra03400]
    RPO_02270
DNA repair and recombination proteins [BR:rra03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    Mismatch and loop recognition factors
     RPO_02270
SSDB
Motif
Pfam: MutS_V MutS_III MutS_I MutS_II MutS_IV AAA_14 AAA_29
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFB24698
LinkDB
Position
complement(403562..406222)
AA seq 886 aa
MNLQELKQKYNYDVATKMMQQYLDIKFAHLDCLLLFRMGDFYEMFYEDAILASNVLGIAL
TKRGKNGEEEIAMCGVPYHALENYLTKLIEENYKVAICDQLETPEEAKNRGGYKAVVTRD
VTRIITPGTIIEENLIASAEPNYLASLVIPKNKETASLCYVDLSTSEIVVVNVPETEILN
ELARLKPREILLSENLRSSNLADSIFKQLNFRITYQVDSFFAINKCKKIILDFYKMKDIK
GIGEISSSQICAIGSVLEYLSLTQKQNIPHLPIPRIINFHSYMTIDFSTRRNLEIVTNSQ
GDSQGSLLSTLNHTVTKQGGRLLYNFLSSPLTNIAKINHRLNITEFFYSNLEIVKKIREL
LKKTSDIERCLTRITMNRSSGRDLLSIKYTLETATIIKEVFFDAYGFNLPDFIEKIIKPL
SGDAELYNLIDETIREDAPNNLNDGGIIKHEYHPKVAQLHDLINNGKLYIEKLKDQYRKE
TGIDSLKISHNNVIGLFIDITAKNVNKILDPKFIHRQTTVNHVRYTTAELQKLESELVNA
KTLVISLEKELYADICSQVIEKASYLRMLASSLSGLDVFCNFAYIADEYDYVKPEFTDDL
SFDIVKGRHPVVEKALQRESKSFVYNDCHLSELERIWLITGPNMAGKSTFLRQNAIIAII
AQIGSFVPAKSAKIGVVDKIFSRIGAADDLIKGQSTFMAEMLETSAILAQSTKNSLIILD
EVGRGTSTYDGVSIAWSVLEYIHDKLKCRCLFATHYHELTVMSNFLPALQNYTIAIEESG
KDILFLHNIISGAADRSYGLHVAALAGLPESVINRAEQILLKFEKTSTGKGKNILSTESN
NLSLFYLEPNKTTISSKLDKKFSTIDPDKLSPKEALELIYELKKLV
NT seq 2661 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatcttcaagagttgaaacaaaaatataattacgatgttgcaacgaaaatgatgcag
caatatctagacattaaatttgctcatttagattgtttactactctttagaatgggtgat
ttttatgaaatgttctatgaagatgcaattctagcaagcaatgtacttggcattgcttta
acaaagcgcggcaaaaacggcgaagaagaaattgcgatgtgcggggtaccttatcatgcc
cttgagaattatttaactaagttaattgaagaaaattataaggttgctatttgtgatcaa
ctagaaacacctgaagaagcaaagaatagaggcggttataaagcggtagttactagggat
gttacacgtattataactccgggaactataattgaagaaaatttaattgcttcagccgaa
cctaattatttagcaagtctcgtaataccgaaaaataaagaaacagctagcctttgttat
gttgatctttctacttccgaaattgttgtagttaatgtaccggaaacggaaattcttaat
gagctggctcgtttaaaacctcgtgaaattctgcttagcgaaaatctgagatcttctaat
cttgcggatagtattttcaaacaattaaattttcgtattacctatcaagttgatagtttt
tttgcgattaataaatgcaaaaaaatcattttagatttttataaaatgaaagatattaaa
ggaatcggcgagatatctagtagtcaaatttgtgccataggtagcgttttagaatattta
tcgttaacgcaaaaacaaaatattcctcatttgccaatccctagaattatcaattttcat
agctatatgactattgatttctctactagacgcaaccttgaaattgtcacaaactcacaa
ggcgactcgcaaggaagtttattaagcacccttaatcatacggttactaaacaaggtgga
cgtttactatataattttctttcaagtcctttaaccaacattgctaaaataaatcatcgt
ttaaatattaccgagttcttttattccaacttagaaatagtaaaaaaaattagagaactt
ctaaaaaaaactagtgatatagaacgctgcttaacacgtattacgatgaacagaagttca
ggtcgtgatttacttagcattaaatatactttagaaacggcaacgattattaaagaagta
ttctttgacgcttacggttttaatttacctgattttatcgaaaaaattattaaacctcta
tcaggtgatgcagaattatataatttaatagacgaaacaatacgagaagatgcaccgaat
aatttaaatgacggaggtataataaaacatgaatatcatccgaaagtagcccaattacat
gatttaattaataacggaaaattatatattgaaaagctaaaagatcaatatcgcaaagaa
acgggaatagacagtttaaaaatatctcataataatgttatagggctttttatcgatatc
accgctaaaaatgttaataaaatccttgatcccaaatttattcaccgtcaaacaacggtt
aatcatgttcgttacactactgctgaactacaaaagcttgaaagtgagttagtcaatgct
aaaaccttagtaataagcttagaaaaagaattatatgcggatatttgtagccaagtaatc
gaaaaagcttcctatttacgaatgcttgcaagctccttaagcgggcttgacgtattttgt
aattttgcttacatcgctgatgaatatgattatgttaagcctgagtttaccgatgattta
agctttgatatcgttaaaggacggcatcctgtagtagagaaagcactacagcgagaaagc
aaaagctttgtatataatgattgtcatttatcagagcttgagcgtatttggttaattacc
ggtcctaatatggcaggtaaaagtacttttttacgtcaaaacgccattattgcaatcatt
gctcaaataggctcgttcgtgccggcaaaaagtgctaaaataggggtagtcgacaaaata
tttagccgaataggtgctgccgatgacttaattaagggacaatcgacctttatggcagag
atgcttgaaacctcggcaatccttgctcaatctacaaaaaactcactaatcatacttgat
gaggtaggtagaggcacatccacttatgacggggtatctatagcatggtcggtgcttgaa
tatattcatgataagctgaaatgtcgctgtttatttgcaacgcactatcatgagctaacc
gttatgagtaattttctgccggctttgcaaaattatactattgctattgaggagtcaggt
aaagatattctatttttacataatattatatcaggtgctgccgataggtcctacggtctt
catgttgcagctcttgccggtcttcctgagagtgttataaacagagctgagcagattctg
cttaaatttgaaaaaacttctacaggtaaaggaaaaaatattttatcaacggaatcaaat
aatttgagtttgttttatcttgaacctaataaaactactataagcagcaaattagataaa
aaattcagcactatcgatcctgataaactatcccctaaagaagcacttgagttaatttat
gagttaaagaagttggtttga

DBGET integrated database retrieval system