Staphylococcus aureus subsp. aureus FDAARGOS_5: X998_04355
Help
Entry
X998_04355 CDS
T03492
Symbol
addB
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase/deoxyribonuclease subunit B
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
sauf
Staphylococcus aureus subsp. aureus FDAARGOS_5
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sauf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sauf03400
]
X998_04355 (addB)
Enzymes [BR:
sauf01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
X998_04355 (addB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sauf03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
X998_04355 (addB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
UvrD_C
AAA_30
Anamorsin_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVD96834
LinkDB
All DBs
Position
complement(1409060..1412536)
Genome browser
AA seq
1158 aa
AA seq
DB search
MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGS
LRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFS
EKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGED
SLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFS
LFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFNQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHI
NILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNID
TKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLER
GIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKGHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQA
ETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVF
GDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMP
QPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGS
SGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLYDEI
VADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEG
YQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLT
NEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRR
KPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKV
YYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWSDIDEDKLEQDL
IKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFI
QHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETIN
PIEAIQNININDEFGGEQ
NT seq
3477 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattacatgcttatttaggtagagcgggaacaggtaagtctacgaaaatgttgacc
gaaataaaacaaaaaatgaaagcagatccgcttggagatccaatcattttaattgcgcca
actcaaagtacatttcaattagaacaagcctttgtcaatgatccggaattaaatggtagt
ttaagaacagaagtgttgcattttgaacgattaagtcatcgtattttccaagaagttggt
agttatagcgaacaaaagttatctaaagctgcaacggaaatgatgatttataacattgtt
caagaacaacaaaagtatttaaaactttatcaatcacaagcaaaatattatgggtttagt
gaaaaattaacagaacaaattcaagattttaaaaaatatgcagtaacgcctgaacattta
gaacactttattgctgataaaaatatgcaaactcgaactaaaaataagttagaggatatt
gctttaatataccgtgagttcgaacaacgcattcaaaacgagtttattacgggtgaggat
tcattacaatattttattgattgtatgccgaaatcagagtggctaaaacgtgctgatata
tatattgatggttttcacaacttttcaacgattgagtatttaataatcaaaggattaatt
aaatatgcgaagagtgtcacaattatattgacgacagatggtaaccacgatcaatttagt
ttatttagaaaaccatcggaagtgttacgacatattgaagaaatagcaaatgaactcaat
atttctattgaacgtcaatatttcaaccaattatatcgcttcaataatcaagatttaaag
catcttgaacaagaatttgatgcacttcaaatcaatcgagtggcatgtcaaggtcatatc
aatattttagaatctgcgactatgagagaggaaataaatgaaattgcgcgacgtatcatc
gttgatattcgtgataagcaattacgatatcaagatattgctattttatatcgtgatgaa
tcttatgcttatttatttgattccatattaccgctttataatattccttataatattgat
acaaagcgttcgatgacacatcatccggtcatggaaatgattcgttcattgattgaagtt
attcaatctaattggcaagtgaatccaatgctacgcttattgaagactgatgtgttaacg
gcatcatatctaaaaagtgcatacttagttgatttacttgaaaattttgtacttgaacgt
ggtatatacggtaaacgttggttagatgatgagctatttaatgtcgaacattttagcaaa
atggggcgtaaagggcataaactgaccgaagatgaacgtaacacatttgaacaagtcgtt
aagttaaagaaagatgtcattgataaaattttacattttgaaaagcaaatgtcacaagcg
gaaactgtaaaagattttgcaactgctttttatgaaagtatggaatatttcgaactgcca
aatcaattgatgacagagcgagatgaacttgatttaaatggtaatcatgaaaaggcggag
gaaattgatcaaatatggaatggcttaattcaaatccttgatgacttagttctagtattt
ggagatgaaccaatgtcgatggaacgtttcttagaagtatttgatattggtttagaacaa
ttagaatttgttatgattccgcaaacattggaccaagtaagtattggtacgatggatttg
gctaaagtcgataataagcaacatgtttacttagtaggtatgaatgatggaacgatgcca
caaccagtaactgcgtcaagcttgattacagatgaagaaaagaaatactttgaacagcag
gctaatgtcgagttaagtccaacatcagatattttacagatggatgaagcatttgtttgt
tatgttgctatgactagagctaagggagatgttacattttcttacagtctaatgggatca
agtggtgatgataaggagatcagcccatttttaaatcaaattcaatcattgttcaaccaa
ttggaaattactaacattcctcaataccatgaagttaacccattgtcactaatgcaacat
gctaagcaaaccaaaattacattatttgaagcattgcgtgcttggttatatgatgaaatt
gtggctgatagttggttagatgcttatcaagtaattagagatagcgatcatttaaatcaa
ggtttagattatttaatgtcagcattaacgtttgacaatgaaactgtaaaattaggtgaa
acgttgtctaaagatttatatggtaaggaaatcaatgccagtgtatcccgttttgaaggt
tatcaacaatgcccatttaaacactatgcgtcacatggtctgaaactaaatgagcgaacg
aagtatgaacttcaaaactttgatttaggtgatattttccattctgttttaaaatatata
tctgaacgtattaatggcgattttaaacaattagacctgaaaaaaataagacaattaacg
aatgaagcattggaagaaattttacctaaagttcagtttaatttattaaattcttcagct
tactatcgttatttatcaagacgcattggcgctattgtagaaacaacactaagcgcatta
aaatatcaaggcacgtattcaaagtttatgccaaaacattttgagacaagttttagaagg
aaaccaagaacaaatgacgaattaattgcacaaacattaacgacaactcaaggtattcca
attaatattagagggcaaattgaccgtatcgatacgtatacaaagaatgatacaagtttt
gttaatatcattgactataaatcctctgaaggtagtgcgacacttgatttaacgaaagta
tattatggtatgcaaatgcaaatgatgacatacatggatatcgttttacaaaataaacaa
cgccttggattaacagatattgtgaaaccaggtggattattatacttccatgtacatgaa
cctagaattaaatttaaatcatggtctgatattgatgaagataaactagaacaagattta
attaaaaagtttaagttgagtggtttagttaatgcagaccaaactgttattgatgcattg
gatattcgtttagaacctaaattcacttcagatattgtaccagttggtttgaataaagat
ggctctttgagtaaacgaggcagccaagtggcagatgaagcaacgatttataaattcatc
caacataacaaagagaattttatagaaacagcttcaaatattatggatggacatactgaa
gttgcaccattaaagtacaaacaaaaattgccatgtgctttttgtagttatcaatcggta
tgtcatgtagatggcatgattgatagtaagcgatatcgaactgtagatgaaacaataaat
ccaattgaagcaattcaaaatattaacattaatgatgaatttgggggtgagcaatag
DBGET
integrated database retrieval system
