Spiroplasma citri: SCITRI_001547
Help
Entry
SCITRI_001547 CDS
T04628
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
sck
Spiroplasma citri
Pathway
sck03030
DNA replication
sck03430
Mismatch repair
sck03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sck00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SCITRI_001547 (dnaE)
03430 Mismatch repair
SCITRI_001547 (dnaE)
03440 Homologous recombination
SCITRI_001547 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
sck03032
]
SCITRI_001547 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sck03400
]
SCITRI_001547 (dnaE)
Enzymes [BR:
sck01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SCITRI_001547 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
sck03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
SCITRI_001547 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sck03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
SCITRI_001547 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE75422
UniProt:
A0A1J0Z2B9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1268797..1271841)
Genome browser
AA seq
1014 aa
AA seq
DB search
MTIPHLNVRTSYSLLSSLITFDKYFTYAMTTGLLSLAICDNNMFGVYEFHQLCQKNKIKP
IIGLNVIIWFNDIPYNMNLFARNQKGYFNLVEISSLVMINTENKKNVTLDEISKFLTTDV
KIIINYTTDDYQPELYQTLKSLLKVETDLYLGINNGNLSLLESLQTLLASEQIIWNNKVQ
YFTSEDFIAYKVVDTIKTQTLFKESKMKDLYGWVSPPSYYQQYFDNIKTFITGINVFPLH
KGTIFDNLLRYPTPEGQTAQQFLQEICQTALKQKRISSSKTTYLERLNYELTVINKMGFN
DYFLIVWDYVRYAKQQNIFVGPGRGSAAGSLVSYLLDITTIDPITYNLLFERFLNPERKS
LPDIDIDFEDDKREMVVEYLFEKYGSEHVAHIITFQTIGMKMAIRDICRIFDIAIEEADK
MSKAVPLEYNYHYEEAINSNPLFEIYQKKYPQVFLHLKKIIGLPRQTGTHAAGVVLTQQR
LQTIIPVKEGYNGIYQTQYSMNYLEELGILKMDLLGLRNLTILHDVIDNIYQETKVKLDV
NTLPLNDRKTYQLLAQGDTKGIFQLESPGMTKVLVDMVPDQLEDIVATSSLYRPGPQDNI
PLFIKRKKKLAKVTYIDERLAEILAPTYGIIVYQEQVMLIAQKVANFSLAKADVLRRAMG
KKDASIMSQMKTEFIEEAVKNHYVEKIAQEIWELIYKFAAYGFNRSHAVAYSLLGYQMAY
LKANYSSQFLASLLTHVIGDEHKTNDYIALAKKNHLTIVPPNINAPYRQYHTIDNQICVP
LLIIKQIGFAFFNKIAQEYQTNGMLTDLYDLFIRLYKKGLNRKTYEALCFSGALDVFKMN
RITLFNNYQRILTYIELIKTQEENENLVVDFSLAEKPELVIEPNDEVICLEKEYEFLGFY
LSNHPLKYIREKAGYQDKTTLISNLRLSLGSTNVLILVKRLKIITDKNNNKMAFLDCYDE
SGEISITAFAGIYKDYANLLKVNNVLLLNIKLGTYNNKINGIINRIKFISGEQE
NT seq
3045 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaattccccatttaaatgttcgaacaagttatagtttattatcatctttaattact
tttgataaatattttacttatgctatgacaacgggtttattatcattggcaatttgtgat
aataatatgtttggggtttatgaatttcaccaactttgtcaaaaaaataaaattaaacca
attattggcttaaatgttattatttgatttaatgatattccttataatatgaatttattt
gcccgtaatcaaaagggttattttaatttagttgaaatttcatctttagtaatgattaat
actgaaaataaaaaaaatgtaacattagatgaaattagcaagtttttaacaacagatgtt
aagattattattaattatacaacagatgattatcagcctgaattatatcaaacgctaaag
agccttttaaaagttgaaacagatttatatctaggtattaataatggcaatctatcattg
ttagagtcactgcaaacattacttgcaagtgaacaaattatttgaaataataaagtacaa
tattttacaagtgaagattttattgcttataaagttgttgatacaattaaaacacaaact
ttatttaaagaaagtaaaatgaaagatttatatggttgagtatcaccaccctcctattat
caacaatattttgacaatattaaaacatttattactggaattaatgtttttcctttacac
aaagggactatttttgataatttattacgttatccaaccccagaaggtcaaacagcacaa
cagtttttacaagaaatttgtcaaacagctttaaaacaaaaaagaattagtagttctaaa
acaacatatcttgagcggttaaattatgaattaacagtgattaataaaatgggttttaat
gattattttttaattgtatgagattatgttcgttatgcaaaacaacaaaatatttttgtt
gggcctggtcgaggcagtgctgccggtagtttagttagttacttattagatattacgaca
attgatccaattacctataatttactgtttgaacgctttttaaatccagagcgaaaaagt
ttaccagatattgatattgattttgaagatgataaacgagaaatggttgttgaatattta
tttgaaaaatatgggagtgaacatgttgcacatattatcacttttcaaacgattggaatg
aaaatggcaattcgagatatttgccgaatttttgatattgcaattgaagaagcagacaag
atgagcaaagcagttccattagaatataattatcattatgaagaagcaattaattcaaat
cctctttttgaaatttatcaaaaaaaatacccccaagtatttttacatttaaaaaaaatt
attggtttaccacgccaaacaggaacccatgcggctggtgttgttttaacgcaacaacgg
ttacaaacaattatcccagttaaagaaggctataatggaatttatcaaacgcaatattca
atgaattatttagaagaattgggaattttaaaaatggatttattaggattacgaaattta
acaattttacatgatgtgattgataatatttaccaagaaacaaaagtaaaattagatgtt
aacactttaccattaaatgatcgaaaaacttatcaattattagctcaaggagatacaaaa
gggatttttcaattagaatcaccagggatgacgaaagttttagttgatatggttccggac
caattagaggatattgttgcaacttcttcgttatatcgccctggtccccaagataacatt
cccttgtttattaaacggaaaaaaaaattagcaaaagttacttatattgatgaacggtta
gctgaaattttagcaccaacttatggcattattgtttatcaagagcaagttatgttaatt
gctcaaaaagttgctaatttttcattagctaaagctgatgtgcttcgtcgtgcaatgggg
aaaaaagatgcatcaattatgagccaaatgaaaactgaatttattgaagaagcagttaaa
aaccattatgttgagaaaatagcacaagaaatttgagaattaatttataaatttgctgcc
tatgggtttaatcggagccatgcggttgcatattcattattgggttatcaaatggcctat
ttaaaagcaaattattcttcccagtttttagctagtttattaacacatgttattggtgat
gaacataaaacaaatgattatattgctttagcaaaaaagaatcatttaacaattgtccca
ccaaatattaatgctccatatcgacaatatcatactattgataatcaaatttgtgttcca
ttattaattattaaacaaattggtttcgctttttttaataaaattgcccaagagtatcaa
actaatggaatgcttacggatttatacgatttgtttattcgcctgtataaaaaaggttta
aatcgaaaaacttatgaagcattatgtttttccggagcattagatgtttttaagatgaac
cggattactttgtttaataattatcaacggattcttacttacattgagttaattaaaact
caagaagagaatgaaaatttagttgttgatttttcattagctgaaaaaccagaattagta
attgaaccaaacgatgaagttatttgtttagaaaaagaatatgaatttttagggttttat
ttatcaaatcatccgttaaaatatattcgtgaaaaagcaggatatcaagataaaacaaca
ttaattagtaatttacgtttaagtttaggatcaacaaatgttttaattctagtgaagcga
ttaaaaataattactgataaaaacaataataaaatggcatttttagattgttatgatgaa
agtggcgaaattagtattactgcttttgcaggtatctataaggattatgctaatttatta
aaagttaataatgtattattattaaatattaagttaggaacatataataataaaattaat
gggattattaaccgtattaagtttattagtggggagcaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
