Shewanella frigidimarina: Sfri_3864
Help
Entry
Sfri_3864 CDS
T00395
Name
(GenBank) outer membrane protein RomA
Organism
sfr
Shewanella frigidimarina
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lactamase_B_2
Lactamase_B_3
Lactamase_B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI73689
UniProt:
Q07WC5
LinkDB
All DBs
Position
complement(4616831..4617940)
Genome browser
AA seq
369 aa
AA seq
DB search
MKILMSLLVVLGALIVIILISKYWFASRGHKTQIFSNTEKVYQSGISSLWPIAKAYGSAK
RQAPIPQGEIPLEALTPEILDQSTEDTVYRLGHSTLLMRLDGEYLLIDPVFSERASPVQW
AGPKRFHQSPISIADLPAIKAVIISHDHYDHLDRAAIEQLAAKVQHFVTPLKVGEYLTTW
GVDAIQVTELEWWQSVELNGLSITATPAQHFSGRGLLDRNQTLWASWVIQGLQHKVFFSG
DSGYFNGFKEIGERYGPFDLSMIETGAYNELWSDIHMLPEQSLQAHIDVQAKAMMPIHNG
TFDLALHDWFEPFERINQLAKQQNVTLLTPKFGQAVMLANPQASELWWRAIMLEPQNTDE
LNQVVINSN
NT seq
1110 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatattaatgagtcttttagtcgtgcttggtgcattgattgtcattattttgatc
agtaaatattggtttgcatcgcgtggacataaaacacaaatattcagcaataccgaaaaa
gtctatcaatctggtattagcagcttatggccaattgccaaagcttatgggtcggcaaag
cgccaagcgcccattccccaaggtgagattccattagaagcactgactccagagatattg
gatcaatcaacggaagacactgtttatcgtttaggccattcaacgttattgatgcgtctt
gatggtgaatatttattgattgacccggtatttagcgagcgagcatcaccggtgcagtgg
gctgggccaaaacgttttcatcaatcgccaatcagtattgctgatttaccggcaataaaa
gcggtgattattagccatgatcattacgatcaccttgatagagcagccatagagcaattg
gctgccaaggtgcaacattttgtgaccccacttaaagtgggtgagtacttaaccacttgg
ggcgtagatgccattcaagtgactgaactggaatggtggcagtctgttgaattaaatggc
ttgagcattaccgctacgccagcacaacatttttctggccggggcttgcttgatcgtaac
caaaccttatgggctagttgggtgattcaaggcttacaacataaggtgttttttagcgga
gacagtggctattttaatggctttaaagaaattggtgagcgttatggaccatttgatctc
agcatgattgaaactggcgcctataatgaattgtggagtgatatccatatgttgccagag
caaagcctacaggcacatattgatgttcaagcaaaggcaatgatgccaatacacaatggc
acctttgatttagcattgcatgattggtttgagccttttgaacgtattaaccagctagca
aaacagcaaaatgtcaccttgcttacgccaaagtttggtcaagcggtgatgttagccaat
ccacaagctagcgagttatggtggcgtgccattatgcttgaaccacaaaatacagatgaa
ttaaatcaagttgtcatcaacagcaattaa
DBGET
integrated database retrieval system