Shewanella sp. WE21: CKQ84_02130
Help
Entry
CKQ84_02130 CDS
T05404
Name
(GenBank) rRNA (guanine-N1)-methyltransferase
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
shew
Shewanella sp. WE21
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shew00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
shew02044
]
CKQ84_02130
02035 Bacterial motility proteins [BR:
shew02035
]
CKQ84_02130
Secretion system [BR:
shew02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
CKQ84_02130
Bacterial motility proteins [BR:
shew02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
CKQ84_02130
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Neisseria_PilC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVI64776
UniProt:
A0A2R3ES08
LinkDB
All DBs
Position
complement(513485..516991)
Genome browser
AA seq
1168 aa
AA seq
DB search
MIIKKLACSILLALTFVSAFSFGDDTELYVKESTTRTGARPKVLVIFDNSGSMSTEEITQ
VVDYDPNYDYPAVSGSGYSDTLIYYAVGGGGLPTPDTSSDKRNFKASLNGCSQSKAALAE
FGRFTGYIREFTSSGTTGVWKELPETNGTAIKVIDCWEDISQINPSNSSSYPNGFPANGV
TTGSGSKKKAYPYFTSSLPGTTWTNALAAANNTDFGVGQPITLYTDNYLRWYGLSKAGKL
PTVKVSRLEIAKKAISNIISSTPTVDFGLAVFNYNYPNEGNRDGGRIVSGITQMTDSTRA
SLLTTIDNLLAKTNTPLCETMYEAYRYFAGKGVKYGHSDTDYGSYVGNKPPYDSLVEKSG
NYASPFKVCTDIAYVIYVTDGSPTVDKNANNDVISLTATGSKEGDYSSFSKNLDTASYLP
ALASYMFNNDLINKLDSSNTEQMQNVRTYTIGFSKGAEDAAPLLAETAKRGGGLYFAAQN
SLELQNALNDALSNILNIDSSFTSPSIASNNFDRTQTFDAAYYAMFLPGKGPRWSGNLKK
LKVTADGTLVDSKGNAAIADNGNIKDGACTIWSDCVAQKDGNKVEVGGVAAQIRKQDVRN
ILSNLNGSSSLTPLTLANAQTAAGGDAALASYMRTSVDELANTLNWLNGIDVDDDNKDGS
TTDKRNDVMGDPLHSKPLALNFGTKSATDIRIMLGTNQGVVHMFKDAGESVSETWGFIPY
ELLPNLTELRSNDPSGVHTVYGMDSSPVAYTETDAEGKVIKAWVYMGMRRGGSSYYALNV
TNPDSPSLMWTINPSTDGFSDLGQTWSEPIVTKIVGYEKPVLIFGGGYDVSFDATPSSSP
VGRAVYIVDAEKGTLIHSFGGSASGATALSGILDSIPNSVAVLDSNNDGYTDRIYASDVG
ANVWRIDLPSASKSSWSAFKLASLGGTDSNNRRFYAEPVVAQTMFTNLSEVKVTTESGTT
TTKTYQNVPYDAVVIGSGTRPHPSSTDINDMFFTLQDRNVVTKSFTGGDVPEAITINDLY
DVTSTAPASEADNISFGKKLGWFYDFSGLGEKSLTAALIVQGKVYFTSYSPPADSVADNV
CLVSGSGKLYPFDLHKGTRSFSQLYYELGERVPDTPQIVIPAPESGKDPYIYIIGVGKGE
KNENGDYTGTINVASGLGVNKIYYHINE
NT seq
3507 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattattaaaaagctggcttgttctatactacttgcgctgacttttgtgtcggctttc
tcctttggtgacgatactgagttatatgtaaaagaatcaacaactcgaacgggcgcaaga
cctaaagtgctcgttatatttgataactcaggaagtatgtcaactgaagaaattactcag
gttgtagattatgaccctaactatgactacccagccgtaagtggttctgggtatagtgat
actcttatttattatgctgttggcggtgggggattacccacccctgatactagctctgat
aagcgtaattttaaagctagtttaaatggatgtagtcaaagcaaagctgcattagcagag
tttggtcgttttactgggtatataagagagttcacatcaagtggtactactggcgtttgg
aaagaactacctgaaacaaatggtactgcaataaaagtaattgattgttgggaagatatt
tctcaaataaatccgagtaattcatcatcatatcctaatggatttcctgctaatggggta
acaacggggtcaggtagtaaaaagaaagcatatccatattttacttcttcactaccagga
acaacttggaccaatgctttagccgcagccaataatactgactttggtgttggacaacct
attaccttgtacactgataattacctaagatggtacggattatctaaagcgggaaaatta
ccaacggtaaaagtttcaagactagaaattgcgaagaaagcgatttctaatattattagt
tcaactccaacagtggattttggacttgctgtatttaattataattatccaaatgaaggt
aatcgagacggtggtcgaattgtatctggcattactcagatgacggatagtacgcgtgcg
agtttattaactactattgataatttgctggcaaaaacaaatacaccactatgtgagact
atgtatgaagcttaccgttattttgccggtaagggcgttaaatatggtcatagtgataca
gattatggctcttatgttggaaataaaccaccgtatgacagcttagtggagaagagtggt
aactacgcaagtccatttaaagtatgtacggatattgcttatgttatctatgtcactgat
ggctctccaacagttgataaaaatgcgaataatgacgttattagtttaactgccacagga
agtaaagaaggggattactcttcattttctaaaaatctagatacagcaagctatttgccc
gcattagctagttatatgtttaataacgacttaattaacaagttggacagttcaaatact
gaacaaatgcagaatgttcgtacttatactattggttttagtaaaggtgcagaagatgcc
gcacctttacttgctgagacggctaaaagaggtggtggtttatattttgctgctcaaaac
agtcttgaactacagaatgcacttaatgatgcgttatcaaatattttgaatattgattca
agttttacatctccaagtattgctagtaataattttgataggactcagacatttgatgcc
gcttattacgctatgtttctcccaggcaaaggacctcgttggagcggtaatttaaaaaaa
ttaaaagtaaccgcagatggtacattggttgatagtaaaggaaatgcagctatagcagat
aacggcaatattaaagatggtgcctgtactatatggtcggattgtgttgcgcaaaaggat
gggaataaagttgaggtcggcggagtcgcggcacaaattagaaagcaagatgttaggaat
attttaagtaacttaaatgggtcctccagtttaacgcccttaacacttgctaatgcacaa
actgcagcaggaggtgatgctgcgctagctagctatatgagaactagcgtggatgagctt
gctaatacgttaaattggcttaatgggatagatgtcgacgacgataataaagatggtagt
acgacagataaacgtaatgatgttatgggtgatcctcttcattctaagccactagcactc
aatttcggcacaaaaagcgcgactgatattcgtatcatgcttggcacgaatcaaggtgtt
gtgcatatgtttaaagatgcgggcgaatctgtatcagagacttggggctttattccctat
gagttattgcctaatttaacagaattgagaagtaatgatccttcaggtgtacacacagta
tacggaatggattcatctccagttgcttacacagaaactgatgctgagggtaaagtgatt
aaagcatgggtctatatggggatgcgtcgaggtggatcgtcttattatgccctcaatgtg
acaaaccctgatagcccttctctaatgtggactattaatccatcaacggatggtttttct
gatcttggacaaacatggtctgagcctatagtgacgaaaatcgttggttatgaaaagcct
gtactcatttttggtggtggctacgatgttagttttgatgcaactccttcatcttctccg
gtaggtcgtgcggtttatattgtcgatgcagagaagggaactttgattcattcatttggt
ggctctgcatcgggtgcaacagcactttcgggaattctggatagcattccaaactcagtc
gccgtacttgatagtaataatgatgggtatacagataggatttatgcctccgatgtcggt
gcaaatgtctggcgtattgatcttccaagtgcaagtaagtcgagttggagtgcatttaaa
ttggcttctttaggtggtactgatagtaataatcgccgtttttatgcagaacctgttgta
gcacaaacgatgtttactaatttatccgaagttaaggtgacaacagagagtggtactact
acgactaaaacttatcaaaatgttccctatgatgcggtggtgattggaagtggaacgcga
ccccacccatcatctactgatatcaatgatatgttttttacattgcaagatcgtaatgtg
gtgactaagagttttactggcggtgatgttcccgaggcgatcacaatcaatgatctctat
gatgtgacttctactgcacctgcgtctgaagccgacaacataagtttcggtaaaaaactc
ggctggttctatgattttagtggtctaggtgaaaagagtttaacagctgccttgattgtc
caaggcaaagtttatttcacttcttattctccccctgctgactcggttgccgataacgtg
tgtttagtgtctggttctggcaagttatatccgttcgatttgcacaaaggaacgagatcc
ttttctcaattatattatgaactgggtgaacgtgtaccggatacaccgcagattgttatt
cctgcacctgaatccggtaaagatccctatatctatattattggagttggtaaaggtgag
aaaaatgaaaatggggattatacaggtacaatcaacgttgcttctgggttaggtgttaat
aaaatttattatcatataaatgaatga
DBGET
integrated database retrieval system
