Schistosoma mansoni: Smp_066290
Help
Entry
Smp_066290 CDS
T01095
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K11127
telomerase protein component 1
Organism
smm
Schistosoma mansoni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
smm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
smm03032
]
Smp_066290
DNA replication proteins [BR:
smm03032
]
Eukaryotic type
DNA Replication Termination Factors
Telomerase complex (animals)
Smp_066290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
WD40
TFIIIC_delta
FG-GAP_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8343169
NCBI-ProteinID:
XP_018650704
LinkDB
All DBs
Position
3:1662623..1687782
Genome browser
AA seq
1441 aa
AA seq
DB search
MNILELCLQLFLMGYLKCIDFANKYVKNVRFVLTCDSKSSVARNLCNRIDCQLLTVSGLT
THERGAAVRSLLGKYGKVLNESGFRNQLSVLIQKRDASIPLYLKLACDELRLYSNYEQLG
AKLKQLPDTISSLVIDVVKRVECSCGSELTRITLGLLTCSRQPLSTEELHNLIDEWLIES
WMEEQYKNGYTDSWQELKVPLDNLDNIMSNEKIIYQIINDQFNNKNKPTLSKGQPHLPSL
LLYILLTGLHPLLSGFNDERADIDEIDEELPFDDSMQTIKQEKLTIWNLGSRALSFSSRE
IHNLVYDICFNQSKYSIGHKKYEYSFKNNQTKNCNKRAKYSESIPDDKIHLKTVTLQTIH
NILASKLRNMKDLIYHLHHAGRLNEVVCLLTSPAFLIHQIESGYGLTLLDDMNRYITTTT
AHHQSESNNIPTSLDLMRDKIRTMQRFLASNYEFLIKHPYSFAELAINQDVDEWIHTIGY
ACLLSSNYQEKINGDLCKNFFRIKLNTNDNSCILPKIIQPIAIHKPVTPLTGSQDIPIAI
ELDRTGILLAYGTESGTVTVVEVQSLKTLCSFLGHNMPILSLCFLDEVDSSTTRSYSIPS
SQLWLVSTSQDASILIWDLSNVIKSVTCGITTSTSSQLCSLGGYHNKPVTVSAWHPKRRL
LATGGLDCLICLWEVGELGFGSYFTSTSSGCKKIKPSKKLNIKSSINSISFRLPNYASDS
EKSIPPEYLRDVLAVGCWDGSVHFYSLISMSWIKSLAISSSAICSLAYSPNNGRLLAILD
REGQSFILNADTFVYLGRLTENVSFSSINEFTSLDELHHLLPSQKGVLCFSKPTGRYLIQ
TGGGSSVGRINVWNAHLGAPEGPWINVIRNKKEMKQTILATTYAIDISGKHIIIGWNDGL
FTIVLITNGETIFSSDKLIPLINDNSSVQAISCGISPYYDDANLVIVGWSSGAVRLYHFS
FKPGTKSKRDDNSTVQSDLHSICDVSIVPLYTSWSHSIEHAENGTGEAGGTLCAAASDFI
AVSGGGNCEVWVYFVGSVLENPLVKSFCFREHSSQITAVAVQMDFIATGSKDKNVAIYKY
DSNSTTVTLQYIIYNASKDWIISLKWSYILYKMSDRKLTLLVGSNDQLIRLYRIKSKKYK
LKQTLVSDQSGIKSLDFNFPYIFSATSNGHISVWRYGKNGNFELISEMIISSPLDNLNSS
TTDENVVNLVKIQSFEYTPCYNPSTNESVINTCDELEPHQNEDSVVDTLEFSNRSSSPLS
NEDDSSQHHGITDENLFGDKNSMKGTSDYDELMDEGSDETPSQCSEKDLMTVDKCNNVAF
NGDLSTGFQMFDKYINRPGSSSELLNGTNVKLLIGQTISGSRNIQEFQFRVYEPSLTGYH
ATLSGHAGLIPCGLSCTKPLNSNNDDTLLISVAGQNCDSKTIGCDIRLWDLPLSNNSSLC
K
NT seq
4326 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatattttagaactttgtttgcaattgtttcttatgggatatctgaaatgtatcgac
tttgccaacaaatacgtaaagaatgttcgatttgttttaacatgtgattccaaatcatca
gttgctcgtaatttatgcaatcgaattgattgccaactattaactgtatctggactaact
acacacgaacgtggtgcagctgtacgtagtttacttggaaaatatggaaaagtattaaat
gaatccggttttcgaaatcagttatctgttttaattcaaaaacgagatgcaagcattcca
ctttatttgaaattggcttgtgatgaattacgtttgtacagtaattatgaacagttaggt
gcaaaattaaaacaactacctgatacaatctccagtttagtgatagatgttgtcaaacga
gttgaatgtagttgtggatcagaattaactcgtattacacttggtctacttacttgctct
cgtcaaccattatcaacagaagaattacataatttaattgatgaatggttaattgaatca
tggatggaagaacagtacaaaaatggttatacagattcttggcaagaattaaaagtacca
ttggataatcttgataatataatgtcaaatgagaagattatttatcaaataatcaatgat
caattcaataataaaaataagcctacattatctaaaggacaaccacatttaccgtcactt
ttattgtatatcttattaactggtcttcatcctttactttcgggtttcaatgatgaaaga
gctgatattgatgaaattgacgaagagttaccatttgatgattctatgcaaacaatcaaa
caagaaaagcttactatatggaatcttggatcaagagcattatcatttagcagtcgtgaa
atacacaatctagtctatgatatttgttttaatcaatcaaaatatagtataggtcataaa
aaatatgaatattcttttaaaaataatcaaaccaagaattgtaacaaacgtgcaaaatat
agtgaaagtatacctgatgataaaattcatctgaagacagtgactcttcaaactatacat
aatattttagcttcaaaattacgaaatatgaaagatttaatttatcatttacatcatgcc
ggtcgattaaatgaagttgtttgtttactcactagtccagcgtttcttattcatcagatt
gaatctggatatggtttgacattgttagacgatatgaatagatacattacaactactact
gcacatcatcaatctgaatcgaacaatattcctacttcattagatcttatgagggataaa
attagaactatgcaaagatttcttgcatcgaattatgaatttttaattaaacatccgtac
tcattcgctgaattggctatcaatcaagatgttgatgaatggattcatacaattggatat
gcatgtttacttagttcaaattatcaagaaaaaatcaatggtgacttatgtaaaaacttt
ttccgtattaaattaaatactaatgacaattcatgtatcctaccgaaaattattcaacca
attgcaattcataaaccagtcacaccattaactggttctcaagatatcccaattgcaatt
gaacttgatcgaacaggtattttattagcttatggaactgagtctggcacagttactgtt
gtcgaggtgcaatcacttaagacattatgttcatttcttggacataatatgccaatactt
agtttatgttttcttgatgaagttgacagttctacgactagatcatacagtattcccagt
tcacaattatggttagttagtactagtcaagatgctagtatacttatttgggatttatcg
aatgtgataaaaagtgttacatgtggaattacaaccagtaccagttctcaattatgctct
ttaggtggatatcataataaacctgtgactgtatctgcctggcatccgaaacgccgtctt
ttggctactggtggtttagattgtttaatttgtttatgggaagttggtgaattgggattt
ggatcatattttacatcgacatcatctggttgcaaaaaaattaaacctagtaaaaaactg
aatatcaaatcgtctattaattcaatctcttttcgtttacctaattatgcatcggatagt
gaaaaatctattcctcctgaatatttacgtgatgttttagcagtgggatgttgggatggt
tccgtccatttttatagtctcatatctatgagttggataaagtctcttgcaatctcatca
tctgctatttgttcactggcttactcgccaaataatggcagactattagctattcttgat
agagaaggtcaaagtttcattttgaatgcggatacatttgtatatctaggtcggttaact
gaaaatgtcagtttctcatcaattaatgaattcactagtcttgatgaactgcatcattta
ttaccgagtcaaaagggagtattatgtttctctaaaccaactggacgttatcttattcaa
actggtggtgggtcatcagttggtcgaattaatgtttggaatgctcatcttggtgcacct
gaaggtccatggattaatgttattcgaaataagaaagaaatgaaacaaactatacttgcc
acaacctatgctattgacataagtggaaaacacataataattggatggaatgatggtctc
ttcactattgttctaataaccaatggtgaaactatattcagttcggataaattaattcct
ctgataaacgataattcatctgttcaagctatctcttgtggtatttcaccttactacgat
gatgctaatcttgtcattgttggctggtcatctggtgcggttagattatatcattttagt
tttaagcccggtactaaatcaaaacgggatgataattccactgttcagtctgacttacat
tctatttgtgatgtatccattgtacctttgtatacttcttggtcacattctattgaacat
gcagagaatgggacaggtgaagctggtggtactctatgcgcagctgcttccgattttatc
gcagttagcggaggtggaaattgtgaagtatgggtatatttcgttggttccgtgttagaa
aatcctttagtgaaatcattttgttttcgagaacatagtagtcaaataactgctgtcgca
gtacaaatggattttatagccacaggctcgaaagataaaaatgtagctatctacaaatat
gattcaaatagtacaactgtaacacttcaatacatcatatataatgcttctaaagattgg
attatatcattgaaatggtcatatattttgtataaaatgtctgacagaaaactaacatta
cttgttggaagtaatgatcagttaattcgtttatatagaattaaatcaaagaaatataaa
ttgaaacaaacacttgtttcagatcaatctggtattaaatcacttgatttcaattttcct
tatattttttctgctacatctaatggtcatataagtgtatggcgatatggtaaaaatgga
aattttgaacttatcagtgaaatgattatatcatcaccgttagacaacttgaactcgagt
acaaccgatgagaatgttgtgaatcttgttaaaattcaatcattcgaatatactccttgt
tataatccatcgaccaatgaaagtgtcatcaatacctgcgatgaactagaacctcatcaa
aatgaagattctgtggtagatactttggagttcagtaatagatcaagttcaccattgtct
aatgaagatgacagttcacagcatcatggtattacggatgaaaatttgtttggagacaaa
aatagcatgaaaggaacttctgactatgatgaattaatggacgagggttccgatgaaaca
ccaagtcaatgctcagagaaagatttaatgactgtggataaatgtaataatgttgctttc
aatggtgatctatcaacaggatttcaaatgtttgacaaatatattaatcgtcctggttcc
tcgtcagaattacttaatgggactaatgtgaaacttttgattggccaaacaatatccggt
tcacgtaatattcaagagtttcaatttcgagtgtatgaaccgtcacttacaggatatcat
gctactctaagtggtcatgctggcctaattccgtgtggattaagttgtacaaagcctcta
aattcaaataatgatgatacattacttatcagtgtagctggtcaaaattgtgattctaaa
accattggctgtgatattcgactatgggatttgcctttatcgaataattcttcattatgt
aagtga
DBGET
integrated database retrieval system