Shewanella polaris: FH971_13585
Help
Entry
FH971_13585 CDS
T06579
Name
(GenBank) KR domain-containing protein
Organism
spol
Shewanella polaris
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
PP-binding
Ketoacyl-synt_C
Acyl_transf_1
KR
KAsynt_C_assoc
PKS_DH_N
adh_short
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDE31898
UniProt:
A0A4Y5YH13
LinkDB
All DBs
Position
3124177..3132054
Genome browser
AA seq
2625 aa
AA seq
DB search
MSQSSNKDKRLNKRLKDMPVAIVGMASIFANSRYLNKFWDLISEKIDAIIDVPETHWNAE
DYYNADKSMADKSYCKRGGFLPEVDFNPMEFGLPPNILELTDTSQLLSLVVAKEVLADAG
IDAQYDTDRIGITLGVGGGQKINHSLSGRLQYPILKKVFKNSGLSDEDTEMLIKKFQDQY
IHWEENSFPGSLGNVIAGRIANRFDLGGMNCVVDAACAGSLAAMRMAITELVEGRSDMML
TGGVCTDNSPSMYMSFSKTPAFTTNDTIQPFDIDSKGMMIGEGIGMMALKRLDDAERDGD
RIYAVIKGIGSSSDGKFKSIYAPRPEGQAKALRRAYDDAGFAPQTVGLIEAHGTGTAAGD
VAEFNGLKSVFADGNDIKQHIALGSVKSQVGHTKSTAGTAGVIKVALALHHKVLPPTINV
SKPNPNLNIQDSPFYLNTETRPWLPRADNTPRRAGISAFGFGGTNFHIVLEEYRQEHARG
DKYRQRSVPQSLLIHAENKAALQAQLTALQSEINAVDTTQQNRQEIVLADFGKRFALNTI
APNAARIGLVVASLADLTIQLTQALAQLSSNTADSWQLPSGTSYRAAALIHPEAASHKVA
ALFAGQGAQYLNMGADLACLYPEMRQQLMQADKVFAQHKQTPLSQIMYPNPAFEAEDIAA
QQAALTNTANAQSAIGAVSMGQYAILTQAGFKADMVAGHSFGELSALCAAGVISQADYYQ
LAFARGQAMAATPKDQDAGVMYAIIVPAQSVDHGVEKLEQCISAFEGVKVANYNAPTQLV
IAGPTASCTLAAQAITTELGFKAIALPVSGAFHTPLVAHAQQPFAAAINKIKFAKPKLSL
YANGTGKAHPNDAKAIQAAFSEHMLQSVRFSEQLNAMYDAGARVFVEFGPKNILQKLVEA
TLGNKAESVSVVSLNPNPKGNSDTQLRQAACQLAVLGVALTEVDPYQAPIAELAKVSPMN
VKLTASNYISPATQAKMQKSLQTGTVTSQTVEVPVEKVVEKIVEKEVIKTEYIEVPATSA
QAQASAVAAPLAATTPVAKAQPVNSSVPASADSIGSFFAAQQQTAELHQQFLAIPQQYGN
TFAHLMTAQAQMASSGLAIPERLQRSMEMFHQHQAQTLQSHTQFLTQQAQANQAALAMLQ
GQTPMPMAAPVSVQTASVQPAFVQPSQVAQATTTPSPVVAPIAPAPVQTAQAVQSQPTAS
QPIQTPVAQQVSSAAVSAPTAGLTQQQVLDTMLNVVADKTGYPTEMLELGMDMEADLGID
SIKRVEILGTVQDELPGLPELSPEDLAECRTLGEIVSYMQTKLPAANSVAVASTGSTSVD
AVAPASTGLTAENVQRTMLAVVADKTGYPTEMLELGMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDE
LPGLPELSPEDLAECRTLGEIVSYMQTKLPAASTVAPASVASTVPATGLSAESVQRTMLA
VVADKTGYPTEMLELGMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPGLPELNPEDLAECRTLGE
IVSYMQTKLPAVSTAAPASAVSSSAAPTTGLSADTVLSTMMSVVADKTGYPAEMLELSMD
MEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPGLPELNPEDLAECRTLGEIVSYMQTKLPATNTEAPV
SAPATTGLSADSVLSTMMSVVADKTGYPAEMLELSMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDEL
PGLPELNPEDLAECRTLGEIVSYMQTKLPAATAIAPVAPASTANKVDVNTAALPPHSEVA
LKKLPAADKLADCFSTDSCIVITDDGHNAGLLAEKLNAKGLTVAVIRNPQTITVAHSPLS
SDIKSYTLSSIDDAQIAQVIADIKADLGAEHAIAGFIHLQPQTTANSSELMSCTVAAKAA
VDNAFLWAKHLHAEFAKPTQASRLCYFTVSRLDGGFGYLDNTQLATAELNQAALSGLSKT
LSHEWPQVFCRALDIANNIDTTSFADAIVAELFDIDGANTSADRINEVGISSQGRVTLVA
GNASEQFAPASLNRNDTILVTGGAKGVTFECALTLAKQCQSHFVLAGRSQHFGKDLPAWA
QGKKASELKAAAIAYIQSQGNKPTPKQIDALVWPISSSLEIDAALNAFSKVGASAQYVSM
DVSNATAVAASLKSLTNTKGDSFTINGVIHGAGVLADKHIQDKTLDELNRVYHTKVTGLA
SIINALDPQQIKLIALFSSAAAFYGNTGQSDYAMSNEILNKTALKLAHTLPQAKVMSFNW
GPWDGGMVSSALKKMFVERGVYVIPLQAGAELFAHSLLSQQGAQLLIGSDMQGSSEQDNT
AKKLNADALLIAKGSLTFATNTLVTKAFAANAVTTKAVTTKSSATDIISQTVTRVLTPAE
MPFVSDHCIAGNPVLPTVCAMQWMRDAAETLCHVPVSIAEYKLLKGVIFDTNEPHLLQLE
LTQTDAGISALISSRLLNDPSAVMKPQYQAQLVINKAILAIDVAKPTVGDSSLAQWANMA
PLYSGAELYQNGTLFHGPRLQGIAQVLAFDDAQLLCQVQLPSINASDCQGFIPSSALGGS
QIFAEDLLLQAMLVWARLKYDAASLPSSTGECVTAWPFANGDKGYIQLDVVKHSGRMLVA
NVSLYHQDGRLSCQMLNAKVTISKSLNGAFIPHQASAELSHKDTV
NT seq
7878 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagccaatccagtaataaagataagcgtttaaacaaacgcttaaaagacatgcctgtc
gcgattgtcggcatggcaagtatttttgctaactcacgttacctaaacaagttttgggat
ttaatcagcgaaaaaattgatgcgattatcgacgttccagaaacccattggaatgccgaa
gattactacaatgccgataaatcaatggccgataaaagctactgtaagcgcggtggtttt
ttacctgaagtcgatttcaatccaatggaatttggcctgccacctaatatcctcgaacta
acagacacctcgcaactcttatcgttagtggtcgccaaagaagtgttagctgatgctggt
attgatgcacagtacgataccgatcgcatcggtattacactaggtgtcggcggtggtcaa
aaaatcaatcatagcctcagcggtcgcttgcagtacccaatactcaaaaaagtatttaaa
aatagtggtctaagtgatgaagacactgagatgttgataaaaaagtttcaggatcaatat
attcactgggaagagaactcatttccaggctcactcggcaatgtaattgctggacgtatt
gcaaaccgctttgatttaggcggcatgaattgcgtggttgacgcagcttgtgcaggttct
ttagcagcaatgcgcatggcgattacagagttagtggaaggccgcagtgacatgatgctc
actggtggtgtgtgtaccgataactcgccttctatgtacatgagcttttcaaaaacgcca
gcatttaccaccaacgacaccattcaacctttcgatattgattcaaaaggtatgatgata
ggtgaaggtattggcatgatggcgcttaaacgtcttgatgatgccgagcgtgatggtgac
cgaatttatgctgttattaaaggtattggctcatcatctgatggtaagtttaaaagtatt
tatgcaccgcgtcctgaaggccaagcaaaagcattaagacgcgcttatgatgatgcaggt
tttgcgccgcaaactgttggcttaattgaagcccatggtaccggtactgctgcaggggat
gttgcggagttcaatggcctgaaatcagtgtttgcagacggtaatgatatcaaacagcac
attgctcttgggtcagttaaatcacaagttggccacactaaatcgacagccggaaccgca
ggtgtaatcaaagttgctctggctttgcatcataaagtattgccaccgaccattaacgtc
agtaaaccgaatccaaatttaaacattcaagattcgccattttatttaaacaccgaaacc
cgcccttggttacctcgtgcagacaatacgccgcgccgcgcgggtattagtgcctttggt
tttggtggcaccaacttccacattgtgttggaagaatatcgtcaagaacatgctcgaggc
gataagtatcgtcaacgttcagtgccacaaagtctattgatccatgctgaaaataaagcc
gcattacaggctcaattaaccgcactgcaaagtgaaattaatgctgttgataccacacag
caaaatcgccaagaaattgtattagccgattttggtaaacgttttgccttgaataccatc
gcccctaatgcggcacgtataggtttagtggttgcttcattagcagacttaaccattcag
ctgactcaggcgcttgcgcagttaagctcaaatactgccgacagctggcaattgccttct
ggtaccagttatcgcgcagcagcattgattcatcctgaagcggcaagccataaagtggca
gcactatttgctgggcaaggggcacaatatctgaacatgggcgccgatttagcctgtttg
tatccagaaatgcgtcagcaactgatgcaagctgataaggtatttgcgcaacataaacaa
acgccactatcgcaaatcatgtacccaaatcctgcttttgaagccgaagatattgccgcg
caacaggcagcattaaccaatacagccaatgcccagagtgctattggcgcggtcagcatg
ggccaatatgcaatattgactcaagcaggttttaaagccgatatggttgctggccatagt
tttggtgaactgtcagcattatgtgcagcaggcgtcattagccaagctgattattaccaa
ttggcctttgctcgtggccaagcaatggcggcgacacctaaagatcaagacgctggcgta
atgtacgccattattgtcccagctcaatctgttgaccacggagttgaaaagcttgaacag
tgcattagtgcatttgaaggcgttaaggtggctaattacaatgcaccaacccaactggtt
attgcaggcccaacagcgtcatgtaccttagcggcgcaagcaatcactactgaacttggt
tttaaagcaatcgccctgccggtttctggtgcgttccacactccattagtggcgcatgcg
cagcagccgtttgctgcggcaatcaataagattaaatttgctaagccaaaactaagcctt
tatgccaatggcacaggtaaagcacatcctaatgatgctaaagcaatccaagctgcattt
agtgaacatatgctgcaatcggttcgttttagcgagcaactaaacgccatgtatgatgct
ggtgctcgtgtatttgttgagtttggtcctaaaaacatcctccaaaaattggtggaggct
accctaggcaataaagcagaatcagtcagtgtagtgagcttgaacccaaatcctaaaggc
aatagtgacactcaactgcgccaagcggcttgtcagcttgcagtattaggtgttgcatta
accgaggttgatccatatcaagcgcctatcgcagaacttgcaaaagtgtcaccgatgaac
gttaagttgaccgcgagtaattatattagtccggccactcaagccaaaatgcaaaaatca
ttgcaaactggcaccgttaccagccagacagtggaagtgcctgtcgaaaaagttgtggaa
aagattgtggaaaaagaagtcattaaaactgaatacattgaagtgcctgcaacatcagca
caagctcaagcctctgcagtcgccgcacctttagcggcaacgactcctgtagctaaagct
caaccggttaactcaagtgtgccagcgtcggccgatagtatcggttcattttttgctgcg
cagcaacaaacagctgaattacatcagcagtttttagccataccacagcaatatggcaac
acctttgctcacctgatgacagcccaagcacaaatggcgtcatcgggattagccattcca
gaaagattgcaacgttcgatggagatgttccaccagcatcaagcacaaacattgcaaagt
catacccaatttttaacgcagcaagcacaagcaaaccaagccgcattagccatgttgcaa
gggcaaacaccaatgcctatggctgctccagtatctgtacaaacggcatcagttcagcct
gcatttgtgcagccaagccaagttgctcaagccacaacgacaccttcgccagtggtagca
cctattgctccagctccggttcaaacagctcaagcagttcaatctcaaccaacagccagt
caaccgattcaaactcctgtcgctcagcaagttagctcagcagcggtttctgcaccaaca
gccggactaacacagcaacaagtgttagacactatgctcaatgtagtcgcagacaaaacc
ggttacccaacagaaatgcttgaacttggcatggacatggaagccgaccttggtatcgac
tcaatcaagcgggtagaaattttaggcacagtacaagatgagcttccaggcttacctgaa
ctgagcccagaagatttagccgagtgtcgcaccttgggcgaaatcgttagctatatgcaa
accaaattaccagcggccaactcggttgctgtagcgtcaacgggatcaacatcggtagat
gctgttgcacctgcatcaacaggcttaacggctgaaaacgtccaacgtaccatgttagct
gtggttgccgataaaaccggttacccaactgaaatgcttgaacttggcatggacatggaa
gcagaccttggtatcgactccatcaagcgtgtagaaattttaggcacagtacaagatgag
cttccaggcttacctgaactgagcccagaagatttagccgagtgtcgcaccttgggtgaa
atcgtcagttatatgcaaaccaaattgcctgctgccagcacagtggcgccagcatcagtt
gcatctacagtgccagcaacaggcttaagtgcagaaagcgttcagcgtactatgttagct
gtggttgccgataaaaccggttacccaactgaaatgcttgaactaggcatggacatggaa
gccgaccttggtatcgactcaattaaacgcgttgaaattctcggcacagtgcaagatgaa
ctaccaggtttacctgaactgaacccagaagatttagccgagtgtcgcaccttgggcgaa
atcgtcagctacatgcaaactaaactgcctgcagtcagcactgcagctccagcatcagcc
gtatcctcatctgccgcaccaacaacgggcttgagtgctgatacagtattaagcaccatg
atgtcagtagtggccgataaaaccggttatcctgctgaaatgcttgaactgagcatggac
atggaagccgaccttggtatcgactcaatcaaacgtgttgaaattttaggcacagtgcaa
gacgaactacccggtttgcctgagctgaacccagaagatttagccgagtgtcgtaccttg
ggcgaaattgtcagttatatgcaaaccaaattgcctgcaaccaacactgaggctccagta
tctgctccagcaacaacaggattaagtgctgatagcgttttaagcaccatgatgtcagta
gtagccgacaaaaccggttaccctgcagaaatgcttgaactgagcatggacatggaagcc
gatttaggtatcgactcaatcaaacgcgtcgagattttaggtactgtgcaagatgagctt
ccaggcttacctgagctgaacccagaagatttagccgaatgtcgcaccctaggtgaaatc
gttagctacatgcaaaccaaattgcctgcagcaaccgcgattgcgccggtcgcaccagca
tcaacagcaaacaaggttgacgttaacaccgcagcattaccgccacacagcgaggtagcg
ctaaaaaagttaccagcggcggataaactcgcagattgcttttcaacagactcttgtatt
gtcatcacagacgatggccacaatgcaggtttactggctgaaaagctaaatgcaaaggga
ttaaccgtcgccgttattcgtaacccacaaaccattaccgtggcacattcacccttaagc
agtgatattaaaagttacaccttgagcagtattgatgatgcccaaattgcacaagtgatt
gccgatattaaggccgacttgggcgctgaacatgccattgcgggctttattcatttacag
ccacaaaccaccgctaacagcagcgaattaatgtcgtgcactgttgcagcaaaagccgct
gtcgacaacgcgtttttatgggctaagcatcttcacgctgagtttgccaaaccaactcaa
gcttcgcgtttatgctactttaccgtgagccgtttagacggtggatttggttatcttgat
aatactcagctagcaacagcagagcttaaccaagcagccttatctggtctaagcaaaacc
ctaagccatgaatggccacaggtgttttgccgcgcattagacattgccaacaatattgat
actacaagctttgccgatgccatcgttgcagagttatttgatatcgatggtgccaatact
agcgcggaccgcattaatgaagtggggatcagtagccaaggtcgagtaaccttagttgcc
ggcaatgccagcgagcagttcgcaccagcaagcttaaacagaaatgacactattttggtc
accggcggcgcaaaaggcgtaacgtttgaatgcgccctcaccttagccaaacaatgccaa
tcacattttgtgttagcaggtcgtagccaacattttggcaaagacttaccggcttgggca
caagggaaaaaagcctctgagttaaaagccgctgccatcgcttatattcaatctcaaggc
aacaagccgacgccaaaacagattgatgcactcgtatggccaattagcagcagcctagaa
atagatgctgcgttaaacgcgttcagcaaggttggtgccagtgctcaatatgtctcgatg
gatgtcagcaatgccaccgcggtagctgccagccttaaaagcctgactaataccaagggc
gactcattcaccattaacggggttattcacggtgctggcgtattagccgataagcacatt
caagataaaaccttggatgaacttaaccgcgtataccacaccaaagtgactggacttgct
agcattattaatgcactcgacccacaacagattaagcttattgcgctgttttcatcggct
gccgctttttacggtaataccggtcaaagtgattacgctatgtcgaatgaaattctcaat
aaaaccgcactgaaactggcacacaccttaccgcaagctaaagtgatgagttttaattgg
ggcccttgggatggcggtatggtcagttcagcattaaagaaaatgtttgttgaacgtggc
gtttacgttattccgctacaagcaggtgccgagttatttgcccacagtttattaagccaa
caaggagcacaactgctcattggctctgatatgcaaggttcatcagagcaggataacact
gcaaaaaagcttaatgcggacgctttgcttattgccaagggttcgctgacatttgctact
aatacacttgtgactaaagcatttgcggctaacgcagttacgactaaggcagttacgact
aagtcatcagctactgatattatcagtcagacggtgactcgagtattaaccccggctgaa
atgccttttgttagcgatcattgtattgctggcaatccggtattaccaacggtatgcgcc
atgcaatggatgcgtgatgcggcagaaaccttatgtcatgtgcctgtcagtattgctgaa
tacaaattgcttaaaggggttatttttgacaccaatgagccacatttgttgcaactggaa
ctaacgcaaactgacgcagggatcagcgcgctgatctcctctcgtttgttaaacgatcct
agcgcagtcatgaaaccgcaataccaagctcaattggtgatcaataaagcaatattggca
attgatgttgctaaacccactgttggcgacagcagtttggctcaatgggctaacatggca
ccattgtattcaggcgctgaactgtaccaaaatggaaccttgtttcatggtccgcggttg
caaggcattgctcaagtgttggcatttgatgacgctcaactattgtgtcaggttcaattg
ccgagcattaatgccagcgattgccaaggttttataccgtcatcggcattaggtggtagc
caaattttcgctgaagatttgctactacaagccatgttggtatgggcaagactaaaatac
gatgccgcaagcttaccgtcatcaaccggtgagtgtgttactgcttggccatttgcaaat
ggcgataaaggttatattcaacttgatgtggttaaacacagcggcagaatgctagtggct
aacgtgagtttatatcatcaagacggccgcctgagttgccaaatgctcaatgctaaagtg
accattagtaagagtttgaatggggcatttattccacatcaagcttctgctgaactttca
cacaaggacacagtgtga
DBGET
integrated database retrieval system