Shewanella psychrophila: Sps_02929
Help
Entry
Sps_02929 CDS
T05063
Name
(GenBank) regulatory P domain of subtilisin-like proprotein convertase
Organism
spsw
Shewanella psychrophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
P_proprotein
PKD_4
PKD
ChitinaseA_N
DUF4625
Bact_surface_Ig-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQS38076
UniProt:
A0A1S6HRC1
LinkDB
All DBs
Position
complement(3354776..3357286)
Genome browser
AA seq
836 aa
AA seq
DB search
MLNKLSPLAIAIAGVMAVSAPVQAKSISNHEYVKDSILVVYKDNTTKSERLSAQRLVRGS
IRDLNADGIDDKFSRLLDGRLAKMSLRSGANVDEAIKVISKHPAVKYAEPNYVIKAIGTP
DDPDFVSLWGMNNTGQDGGTTDADIDAVEAWDITTGDTSVVVGVIDTGVDYNHEDLQGNI
WTNPNEIPGNGIDDDGNGVIDDVHGYSAINDNGDPMDGNGHGTHVSGTIGAKGNNGIGVV
GVNWDVTIVGCQFLDAGGSGSTEGAIACIDYMTDLKINHGVDIKATNNSWGGGGFSQALK
DSIDSAGDAGILFFAAAGNSASDNDATPSYPASYDSDAVMAIASTDRNDNMSGFSQWGLT
SVDMGAPGSSILSTTPGNGYSTFSGTSMATPHMTGAAALVWSINPDLSVAEMKQLLMDSG
DTNADLTGKTVAGTRLNVATALDMADPSPSYRFTATPVSQTVEAGSGTSYDFSVGSVAGW
DDTVALTVAVSPALDGVTLSTDSVMAGDMFTVDVMTADNAAWGDYTITVSGDDGMIQKDK
SVSLTVLPQGLEDFTYRNDSSVDIPDNDAAGITSTIEVSDEVQIFGVNADVNITHTWSGD
LLVTLTSPAGTEVVLSNRAGGSADDIIKSWDLSDFNGEMVAGTWTLFVSDNVGADTGTLN
SWGMVVSGVGDAAPAAPVASFDYSVDSLNVAFTNTSTDANDDIVSYSWSFGDGSVSADMS
PSYVYAAAGTYSVSMTVTDAEGNEDTAMMDVEVFEHSITAGVTRARVSRRGSALVDLTWD
GASGESVTIYRDGVMVATTDNDGRYRDRFTNAPASVEYKICETSTSLCSDPITAQF
NT seq
2511 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgaacaaactgtcacctctggcaattgccattgcaggggttatggctgtatctgcg
ccagtacaagcaaaatcaatttctaatcatgagtatgttaaagactcaattctcgttgtt
tataaagataatacgactaagagtgagcgactttcggctcagagattagtgagaggctcc
attcgggatctcaatgctgatggtatcgatgataaattttctcgcttgctcgatggacgc
ttagctaaaatgtctttgcgttcaggcgcaaatgttgatgaggcaattaaggtcatcagt
aaacaccctgcggttaagtatgccgagcctaactatgtgataaaggccataggtacacca
gatgatcctgactttgtctctctttggggcatgaataacacaggtcaggatggtggaacg
accgatgccgatatcgatgcggtggaagcctgggatatcactacaggtgatactagcgta
gtcgttggtgttatcgacacgggtgtcgattataaccatgaagatctacagggaaatatt
tggactaaccctaatgaaatccctggtaatggtatcgatgatgacggcaacggtgtgatc
gatgatgttcacggttacagcgccatcaatgataatggcgatccaatggacggtaacggt
catggtacacatgtatcgggtactattggcgctaaaggcaacaatggtatcggtgttgtt
ggcgtaaactgggacgtgacgatcgtgggttgtcaattcctcgatgcgggtggctcaggt
tctaccgaaggggcgattgcctgtatcgattatatgacagatcttaagatcaatcatggt
gtcgacatcaaggcgaccaacaactcatggggtggcggtgggtttagccaagcgctaaaa
gactcaattgattcagcaggcgatgcaggcatcttattcttcgctgcagcgggtaacagc
gcgtcagataatgatgctactcctagttatccggcaagttatgattcagatgctgtgatg
gctattgccagtaccgatagaaatgacaatatgtcaggcttctcacagtggggcttaacc
agtgtagatatgggagcaccaggttcatctattctatcgacgactccaggtaatggttat
tcgaccttttcggggacttcgatggcaacgcctcatatgacaggtgctgctgctttagtt
tggtctattaacccagatttgagcgttgccgagatgaagcaactgctgatggattcaggt
gatacgaatgctgacctaacaggcaagactgttgcaggtactcgactcaacgtagcgact
gcattggatatggccgatccttctccaagttatcgcttcactgcaacgccagtgtctcaa
actgtcgaagcgggttctggcaccagttatgatttcagtgtcggtagtgtagcgggttgg
gatgatacagttgcgctaacagttgccgtttcacctgcactcgatggtgtgactctatct
accgactctgtgatggcgggagatatgtttaccgtcgatgtgatgactgcagataatgcg
gcatggggtgactacaccattaccgtttctggtgatgatggcatgatccagaaagacaag
tcagtatctctgactgtgcttccacaggggcttgaagacttcacttaccgcaatgactca
tctgtagacattcctgataacgatgcagctggtatcaccagcactatcgaggttagtgat
gaggtgcagatatttggtgttaatgccgatgtgaatatcactcatacctggagtggtgat
ttactggtgactttgacttcaccagctggcacagaagttgttctatctaatcgtgctggt
ggcagtgccgatgacatcatcaagagttgggatctaagtgacttcaatggtgagatggta
gccggtacttggacgctatttgttagtgataatgttggtgctgatacaggtacactaaat
agctggggtatggtggtttctggtgttggtgatgcggctcctgctgcacctgttgcaagc
ttcgattacagtgttgatagcctgaatgtggcatttactaacacgagtactgatgctaat
gacgatatcgttagctatagctggagcttcggtgatggttcggtttctgctgatatgagc
ccaagctatgtttatgctgctgcaggtacatactctgtgtctatgactgtgactgatgcc
gaaggcaacgaagacacagctatgatggacgttgaagtgtttgagcacagcatcacagct
ggtgttacacgagcgagagtttcacgtcgcggtagtgcacttgtggatctgacatgggat
ggtgcttctggtgagtctgtaactatctatcgtgatggtgtcatggtcgcaactacagat
aacgacggtcgttaccgtgaccgtttcactaatgctccagcatcggttgagtacaagatc
tgtgaaacctctactagcctatgttctgatccaattacggctcagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system