Spiroplasma syrphidicola: SSYRP_v1c01310
Help
Entry
SSYRP_v1c01310 CDS
T02677
Symbol
potC
Name
(GenBank) spermidine/putrescine ABC transporter permease
KO
K11069
spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein
K11070
spermidine/putrescine transport system permease protein
Organism
ssyr
Spiroplasma syrphidicola
Pathway
ssyr02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ssyr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
SSYRP_v1c01310 (potC)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ssyr02000
]
SSYRP_v1c01310 (potC)
Transporters [BR:
ssyr02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Mineral and organic ion transporters
Spermidine/putrescine transporter
SSYRP_v1c01310 (potC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lipoprotein_8
BPD_transp_1
SBP_bac_8
SBP_bac_11
Transp_inhibit
DUF5056
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
16152817
NCBI-ProteinID:
AGM25727
UniProt:
R4U2X1
LinkDB
All DBs
Position
148972..151602
Genome browser
AA seq
876 aa
AA seq
DB search
MKNFLKSSYMGIVMLFIYVPIMILILFSFNSGESMSIFNGFSDRWYKELAHQQAFLQSII
VSVFVAVIATIISTIIGTFAALGLSKARKVTQKMTLSITNIPLINADIITAVALMMLFIA
MGANFGLLTLVLAHISFDIPFVIMTVLPRLRKIDPKLIEASLDLGAKPSQTLRKVILPVL
KPAIIAAAAIAFAMSFDDFIISYFTGGADVNVATFIYTMKRIKPFINAFGTICIAIIGFV
IIGWNGWNLYKIQHEKFRKEMLKGTYKDKDIMRYEIKLARWYHCLNRNTFKTEKQKEALR
WKIIRWENKYERAVLWVKNKRESFIERQQQKENISKISRKNFRWLAKSWKPLSLTLVTVG
SIGLLTGVYIVNNTYDLIVANWGGYITPELLTNFQKEYNVKVKYTVYDSNETLDNKLYTT
RYDVMVPSDYMVAKFAETNKIKPIDYVKLNAVNKDFNIIKPNSSFNGDMTGYQIGNKLFN
DKNIDIDVVKTANPEFYQQCVENPNPEVAYCLNKNNVASLNNGLLSILNKNTVSVLDDAN
NTNNNTIANYSIPYFWGDVSLLIRPTDSNIQFLQSIFDELNQKLPSTVTGKYGITKQPWV
DGRSQYVLNTVKYDEVETNGLSWDVLWKAAQNKKKVLLNNDYRNIFMLANQKNYFSPIPT
TKAQADQDFRDLETLLKYNNVALMNDELINAVGDGEFDFAFMYNGDGIYADQLFAASGKE
ASNNKIMIVHPNATSTGKANQIEGTNIWSDNMVLSNSVGNEELAYKFMNYIVQNSNVLSE
ELGYTSPYQQTMDFETNYGYYQDDVDPDSGEMVNYQENYVPVGKLCTDEKISAGVCTIDQ
KGQYVSKPGLADGPFTVTKLDEYLVDRYNVLIAGKN
NT seq
2631 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaactttcttaaatcttcatatatggggatagtaatgctttttatttatgttccg
attatgattttaattttattttcatttaacagtggggaaagtatgagtatttttaatggc
ttctctgatcgctgatataaagaattagctcaccaacaagcctttttacaaagtattatt
gtctcagtttttgtcgccgtgatagcaacaattatttcaacaattattggaacatttgca
gcgttagggttgagtaaagcgcgaaaagtaacacaaaaaatgaccttgtcgattactaat
attccattaattaatgccgatattattacagcggttgccttaatgatgttatttattgca
atgggagctaattttggtttactaacattagttttagcccatatttcatttgatattcct
tttgtaattatgacagtgttaccccgcttacgaaaaattgatccgaaattaattgaagca
tcattagatttaggggcgaagccatcacaaacattacgaaaagtaattttaccggtattg
aaaccagccattattgcggcagcagcgattgcttttgcgatgagttttgatgatttcatt
atttcttattttaccgggggtgctgatgttaacgttgcgactttcatttatacaatgaaa
cgaatcaaaccatttattaatgcttttggaacgatttgtatcgcaattattggttttgtt
attatcggttgaaatggttgaaatttgtataaaattcaacatgaaaaattccggaaagaa
atgttaaaaggaacgtataaagataaagatatcatgcgctatgaaattaaattagcccgt
tgatatcattgtttaaatcgtaatacttttaaaacggaaaaacaaaaagaagctttgcgc
tgaaaaattattcgttgggaaaataaatatgaacgggctgtactgtgagttaaaaataaa
cgtgaaagttttattgaacgtcagcaacaaaaagaaaatatcagtaaaatatcacggaaa
aatttccgttggttggcaaaaagctgaaaaccattatccctaactttagtaacggtgggg
tcaattggattattaacaggagtttatattgttaataatacctatgatctaattgttgcg
aactgagggggatacattaccccagaactattaactaattttcaaaaagaatataatgtt
aaagtaaaatatacagtttatgatagtaatgaaacattagataataaattatatacaaca
agatatgatgtaatggtgccaagtgactatatggttgctaagtttgccgaaaccaataaa
attaaaccaattgactatgtaaagttaaatgctgttaataaagactttaatattattaaa
ccaaattcaagttttaacggtgatatgacagggtatcaaattggtaataagttatttaat
gataaaaatattgatattgatgttgttaaaacagcaaacccggaattttatcaacaatgt
gttgaaaatcctaatcccgaagtggcatattgtttaaataaaaataatgttgcatcatta
aataatggtttgttaagtattttaaacaaaaatactgtcagtgtattggacgatgccaat
aatacaaataacaatacgattgctaattatagtattccctatttttgaggagatgtatcg
ctgttaattcgcccaacagatagcaatatacagtttttacaatcaatctttgatgagtta
aatcaaaaattaccatcaacagtaacaggaaaatatgggataactaaacaaccatgagtt
gatggtcgtagccagtatgttttaaatacggttaaatatgatgaggttgaaacaaacggt
ttgtcatgagatgttttatgaaaagcagctcaaaataagaaaaaagtcttattaaataat
gattaccgtaatatttttatgttagcaaatcaaaaaaattactttagcccaattccaaca
acaaaagcgcaagctgatcaagacttccgagatttagaaacattgcttaaatataataat
gttgctctaatgaacgatgaattaattaatgcggttggagatggtgaatttgattttgcc
tttatgtataatggggacggtatttatgctgaccaattatttgcagctagtggtaaagaa
gcaagcaataataaaattatgattgttcaccctaatgcgacatcaacaggaaaagcaaat
caaattgaaggaactaacatttgaagtgataatatggttttatcaaactcagttggtaat
gaagaattagcttataaatttatgaattacattgttcaaaatagtaatgtgttatcagaa
gaactaggttatacttcaccatatcaacaaacaatggattttgaaacaaattatggttat
tatcaagatgatgttgaccctgactcaggagaaatggttaattaccaagaaaactatgtt
ccagttggaaaactatgtactgatgaaaaaattagtgctggggtttgtacaattgaccaa
aaggggcaatatgtatcaaaaccaggattagcggatggaccatttacagtaacgaaatta
gatgagtatcttgttgatcgttataatgttttaattgctggaaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
