Synechococcus sp. PCC 6312: Syn6312_1425
Help
Entry
Syn6312_1425 CDS
T02370
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
syne
Synechococcus sp. PCC 6312
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_12
TPR_10
CHAT
TPR_7
TPR_1
TPR_2
TPR_16
TPR_4
TPR_MalT
TPR_8
TPR_14
TPR_17
TPR_3
MIT
TPR_19
SHPRH_helical-1st
RNPP_C
TPR_9
SNAP
TPR_11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY60595
UniProt:
K9RRL7
LinkDB
All DBs
Position
1396572..1399622
Genome browser
AA seq
1016 aa
AA seq
DB search
MKSGRGLIAGLLLCLGGAPITFSGEVIAQVRPTEYISQSGGLAEANQLNEQAVKLYQQGR
YNEALPLYQRSLAIWEKALGPNHPNVATGLNNLGALYQAQGNYAQALPLYQRSLAIREKA
LGPDHPDVAYSLNNLAALYQAQGNYAQALPLYQRSLTIWEKALGPDHLNVAYSLNNLAGL
YQDQNNYPQALPLHQRSLAIRQKALGPDHPDVAISLHNLAALYQAQGNYAQALPLYQRSL
AIREKALGPDHPDVAQSLNNLAALYHAQGNYAQALPLYQRGLAIREKALGPDHPDVANSL
ISLAVVYKDQGNYAQALPLNQRSLAIREKALGPDHPYVASSLNSLAGIYQDQGNYAQSVP
LYQRSLAIREKALGPDHPDVATSLNNLAVIYKDQGNYAQALPLYQRSLAILEKAQSPNDP
ILAASLNNLAILYWANNTTTQSLPLFNRALNIEETNLAQNLVIGSEEYKRNYLKTFTEST
NGALTYHLQAMPSSPEAAQQALTTILRRKGRVLDVLSNASLSLRRNLSPAAAQLLDDLSA
IRTQIAQITFATDLKPGQIATLKNLQANADKIETELSQRSATFQAVTQPVTIAALQQKIP
ADAALIEFMQYQPFNPKIGQFQAPRYAAYILLPQGNVHWVDLGEAARLEVQLKEFMNKIS
DPRLPSGAVKPVARQTDALLLEPIRAKLGTQVKHLLIAPDAELNLIPFAALVDAQNRYLI
ETYQITYLTSGRDLLRPGTPSSNPPLIFANIDYDRPGVPSSTPTLLAQGSSSASGTRGVN
QVSQELAKLTFGRLPNTGPEAEAIKALLPAAKIFTGATATENQLKASVQPLVLHLATHGF
FQSNAVRKPTNVGDRAIRGVEGEISGLPVENPLLRSGLWLAGGNVRQSGKEDGILTALEV
SGLDLQGTQLVVLSACQSGLGDVPTGEGVYGLRRAFVLAGAESQLSSLWIVGDAGTKELM
IKYYENLLRGQGRGEALRQAQLSFVKGTQYNNTYYWAAFIPTGEWGPMRFSGNRPR
NT seq
3051 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagcggtagggggctaattgcagggctgttactgtgtctagggggagctccgata
actttttccggagaagtcattgctcaagttaggccgactgaatacattagtcaaagtggg
ggcctggcagaagcaaatcaacttaatgagcaagctgtaaagctttatcaacaaggacgt
tacaatgaggccctgcctctctaccaacgtagtttagcaatttgggaaaaagctcttggc
cccaaccatcctaatgttgctactggcctcaacaatttgggagcactctaccaagctcaa
gggaactacgcccaggccctgcccctctatcagcgtagtttagcaattcgagaaaaagct
ctgggcccggatcatcccgatgtcgcttatagtctcaacaatttggcagcactctaccaa
gctcaagggaactacgcccaggccctgcccctctatcaacgtagtttaaccatttgggaa
aaagctctgggcccggatcacctcaatgtcgcttatagtctcaacaatttggcaggacta
taccaagatcaaaataactacccccaggccctgcccctccaccaacgtagtttagccatt
cgacaaaaagctctcggcccggatcaccccgatgtagccatcagcctccataatttggca
gcactctaccaagctcaagggaactacgcccaggccctgcccctctatcaacgaagttta
gcgattcgggaaaaagctctcggccccgatcaccccgatgtagcccaaagcctcaataat
ttggcagcactctaccatgctcaagggaactacgcccaggccctgcccctctaccaacgt
ggtttagcaattcgagaaaaagctctgggcccggatcaccctgatgtagctaatagcctc
attagtttggcagtagtatacaaagatcaagggaactatgcccaggccttgcccctcaat
caacgtagtttagccattcgagaaaaagctctcggccccgatcacccgtatgtagcctcc
agcctcaacagtttggcaggaatataccaagatcaagggaactacgcccagtccgtgccc
ctttatcaacgtagtttagccattcgagaaaaagctctcggccccgatcaccctgatgta
gctactagcctcaacaatttggcagtaatatacaaagatcaagggaactatgcccaggcc
ctgcccctctatcaacgtagtttagccatattggaaaaagctcagagccccaatgacccc
attctggccgccagcctcaacaatttggccattttatactgggctaacaataccacaacc
caaagcctccccctcttcaaccgagccttgaatattgaagaaacaaatctggcgcaaaac
ttagtcattggctccgaagaatacaaacgcaattacttaaaaacatttacagagtcaact
aatggggctttgacttaccacctccaggccatgccgagttcccctgaagcagcccaacag
gccctaacaacaattctccgccgcaaaggacgggtcttagatgtgctcagtaacgccagc
ctcagccttcgccgcaacttatcccccgccgctgcccaactcttagatgacttgagtgcg
attcggacgcaaattgcccaaattacatttgccacggatttgaagcccggacaaattgca
acgctaaaaaacctacaagcgaatgccgacaaaattgaaactgaactcagccagcgcagt
gccacttttcaagccgtaactcaacctgtaactattgccgcactccaacagaaaattcca
gccgatgctgccctgattgagtttatgcaataccagccctttaacccgaaaataggtcaa
ttccaggccccgcgctatgctgcctatattctgttgccccaaggaaacgtacattgggta
gatttaggtgaggccgccagactggaagtgcaactcaaagaattcatgaacaaaatcagc
gatccccgcttgcccagtggtgccgtcaagcccgttgcccgccaaaccgatgccctcctc
cttgaacccatccgggctaaattgggaactcaggtgaagcatttactcattgctcctgat
gccgaactcaacttaattccgtttgccgctctcgtcgatgctcaaaatcgctatttaatt
gaaacctatcaaattacctatctcacctctggtcgagacttactccgccccggtacccct
agctcgaacccgcccctgatttttgccaatattgactatgaccgacctggggtgcccagc
agcactcccactctccttgcccaaggatcatcatcagccagtggaacgagaggtgttaac
caagtcagtcaagagttagcaaaacttaccttcggccgcctgcccaacaccggtcccgaa
gctgaagcaattaaagccttattacccgccgccaaaatttttacaggtgccacagccact
gaaaatcaacttaaagccagcgttcagccccttgtcttgcacttggcgacacacggattc
tttcagagcaatgccgtccgcaaacctaccaatgttggagatagagccattcgaggagtt
gagggagaaatttctggcttacctgtagaaaatcccttgttgcggtcgggtctttggctg
gcgggaggtaatgttcgtcaaagcggtaaggaagatggcatcttaacagcactagaagtt
tcgggcttagatttgcagggaactcagctagttgtcctctcggcttgtcaatcggggttg
ggggatgtgccgactggagaaggtgtgtatggcttgcggcgggcgtttgtcttagccggt
gcagaaagtcaactcagctccctgtggattgtaggtgatgctggaaccaaggagttgatg
atcaagtattacgaaaatttgctgaggggacaaggacggggggaggcattgcggcaggca
cagttgagctttgtaaagggtacacagtacaacaacacctactattgggcagcatttatc
ccaactggggagtgggggccgatgaggttttctggcaatcgccctcggtag
DBGET
integrated database retrieval system