Tetrapisispora blattae: TBLA_0A03950
Help
Entry
TBLA_0A03950 CDS
T02489
Symbol
TBLA0A03950
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14556
U3 small nucleolar RNA-associated protein 12
Organism
tbl
Tetrapisispora blattae
Pathway
tbl03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
tbl00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
TBLA_0A03950 (TBLA0A03950)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
tbl03009
]
TBLA_0A03950 (TBLA0A03950)
Ribosome biogenesis [BR:
tbl03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
TBLA_0A03950 (TBLA0A03950)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
WD40
Utp12
ANAPC4_WD40
NBCH_WD40
WDR54
WD40_like
Nup160
RMC1_N
PALB2_WD40
eIF2A
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
14493371
NCBI-ProteinID:
XP_004177712
UniProt:
I2GVP1
LinkDB
All DBs
Position
1:986923..989733
Genome browser
AA seq
936 aa
AA seq
DB search
MVKSYQRFEQSSVFGVISSNSNCVWVPPSSKKSKSLGKVITGALENISVWDLKTSELEYV
LSDGLPPGSVDLKSSKPAEVSYLQFHSETGLIAAGYADGVIKLWDLVSKTVLLSFNGHKS
RITMLKFDKTGTQLISGSEDSNIIVWDLVSEVGLYKLRSHKGTITGLWCDSDNWLISTSK
DGLIKVWDLKTQQCIETHIAHTGECWALGIMTDFVVTSSADSQLKIWQMDLEGEPGSKLI
EKGAFEKQSKQRGLSIEFTTTSDGVHFFYVQNADKTVEIFRLRKDIEIAKAIKRREKRLT
EKGMTEEDIKTNISESYVSFVMHPFQVVRSMYKIKSVAWTLSLSTKLEVVVTTNSNTIEY
YSVPYEKRDPTSPTPIKAHTIELQGSRTDVRSIDISDDNALLATASNGELKIWNLNTKSC
IRTFECGYALTCKFLPGGLLVVVGTREGNLQLFDLASSVLLTTIEAAHEGAIWSLDVTND
GKRLVTGSADKSIKFWDFQVKQELIAGTSDKYVPQMNIVHDSTLELGDDILSIKISGDDK
FLAISLLDNTVKVFFLDSMKFFLSLYGHKLPVLSLDISDDTKVIITSSADKNIKIWGLDF
GDCHKSLFAHQDSIMCVKFLPGSHNFFSASKDGFVKYWDGDKFECIQKLAAHQSEVWALA
VSDNGERVVSVSHDHSIRIWEETDDQVFLEEEREKELEEQYEDTLLASLEEGNADDTFKG
DVKNDEDDEATRVSKQTIESLKAGERLMDALDLGIKEIEEMENYEAEMVKYKKKQRIDAP
VKPTGNAILLAVRKTPVEYIMDTLIGIKPSQLEDSLLVLPFSYVLKFLKFFDYVMKVPNI
LNNRLALICKNLFFILKSNSKELVSQKNEELKLQISRVKHQLRSALQTNEDDLGFNIQGL
KFIKQQWNMKHNFEFVDDYDQQAQAEKSAKKEYSVP
NT seq
2811 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgaaatcttaccaaagatttgaacaatcttcagtatttggtgtaatcagttcaaat
tcaaattgtgtctgggttcctccaagttcaaaaaaatccaaaagtttaggtaaagttata
acaggtgccctagagaatattagtgtatgggatcttaaaacctccgaattggaatatgta
ttatcagatggtttaccacctggttctgttgatttaaaatcctcaaagccagcagaagta
tcctacttacaatttcattccgaaacaggtttaatagcggcaggttatgctgatggtgta
ataaagctatgggatttagtctcaaaaacagtacttttatcttttaatggtcacaaatct
aggattacaatgttgaagtttgataaaactggtacccaattgatatcgggttctgaggat
tccaatattattgtctgggatttagtaagtgaagttgggttgtataaattacgttcacat
aaaggtaccatcactgggttatggtgtgatagtgataattggttaataagtacatcaaag
gatgggttaattaaggtttgggatttaaaaactcaacaatgtattgaaactcacattgct
catactggcgaatgttgggctttaggaataatgactgattttgtggtaacatcaagtgct
gattctcaactgaaaatatggcaaatggatcttgaaggagagccaggttccaaattaatt
gaaaaaggtgcatttgaaaagcaaagtaagcaaagaggtttatcgatagaatttacaact
acaagtgatggcgttcatttcttttatgttcagaatgctgacaaaactgtcgaaattttc
agattaagaaaagatattgaaattgcaaaagccataaaaagaagggaaaagagattaact
gaaaaggggatgactgaagaagatattaagacaaacatatctgaatcttatgtttcattt
gttatgcatcctttccaggttgtcagatcaatgtataaaatcaaatctgttgcatggact
ctttctttatccactaaattagaagtcgtagtaacaactaactctaatactattgaatat
tattctgtaccatatgagaaaagggaccctacatctccaactcctatcaaggctcatact
atagaattacaaggtagtcgaacagatgttcgttctattgatattagtgacgataatgcc
ttgttagccactgcttctaacggtgagttaaaaatatggaacttaaatacaaaatcctgt
ataagaacattcgagtgtgggtatgcgcttacttgtaagtttttacctggtggcctcctg
gttgttgtaggtacaagagagggtaatctacaattattcgatcttgcctcttcagtttta
ttgactactatagaagccgcccatgaaggagcaatttggtctttagatgtaactaatgat
ggtaaaaggcttgttactggttctgctgataagagcattaaattttgggatttccaagta
aagcaagaattgattgctggaacatccgataaatatgtcccacaaatgaatatagttcat
gattcaactcttgaattaggtgatgatattttgagtattaaaatttcaggtgatgataaa
tttttagcaatttccttactggacaatacagttaaagtattcttcttagattctatgaaa
tttttcctaagtctttatggtcataaattacctgttctatccctagatatatctgatgat
acaaaagtcatcattacatcttcagcagataaaaatattaaaatttggggtttagacttt
ggtgactgtcataaatctctgtttgcacatcaagattcgattatgtgtgtcaaatttctt
ccaggatcacataacttctttagtgcctctaaggatggttttgtaaaatattgggatggt
gataaatttgagtgtattcaaaaactagctgcgcatcaaagtgaagtgtgggccttagct
gtctctgataatggggaacgtgttgtttccgtttcacatgatcatagtattagaatttgg
gaagaaacagatgaccaagttttccttgaagaagaaagagaaaaagaattggaagaacaa
tatgaagatactttgttggcttcattagaagaaggaaatgcggatgacacttttaagggt
gatgtaaaaaatgatgaagatgatgaagcaactagggtaagtaaacaaaccatagagtcc
ttaaaagctggggaacgtttaatggatgctttagatttaggtattaaggaaattgaagaa
atggaaaactatgaagccgaaatggttaaatataaaaagaagcaacgtatagatgcacca
gtcaagccaacggggaatgctattttattagcagttcgtaaaacaccggtggaatatata
atggatactttgattggtatcaagccatcacaattggaagactctttacttgtattaccc
ttctcctacgtactcaagtttttgaaatttttcgactatgtgatgaaagttccaaatata
ttgaataatcgtttagctctaatatgcaaaaacttatttttcattttaaaatcgaatagt
aaagaattagtttctcaaaaaaatgaagagctcaagttacaaattagtagagttaaacat
caattaagatctgccttacaaactaatgaagatgatttaggtttcaacattcaaggtttg
aaatttatcaagcaacaatggaatatgaagcataattttgaatttgttgatgactatgat
caacaagctcaagctgaaaaatcagccaagaaagaatattcggtaccctag
DBGET
integrated database retrieval system
