Trichodesmium erythraeum: Tery_1543
Help
Entry
Tery_1543 CDS
T00387
Name
(GenBank) Protein splicing site
Organism
ter
Trichodesmium erythraeum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
DUF3670
Intein_splicing
Helicase_C
LAGLIDADG_3
ResIII
SAM_2
DEAD_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABG50823
CyanoBase:
Tery_1543
UniProt:
Q115K1
LinkDB
All DBs
Position
2343203..2347798
Genome browser
AA seq
1531 aa
AA seq
DB search
MAILHSFWVTEHEQPSFLFIWGEAWHRVTEEDAGEVEKITNNPYSITLDELLKLSEANIY
LSLEKHKKSTNQTLGIPTKLSESNQKLYPIHSAISLSEIPENLYIYPWKIEGICLEPDEA
IKFLQSIPLGQTTESFIGSDLKFWSHLARWSLDLLARCKFLPSIEQRSITQEFITTWQPL
IDSSIDQTRLKNFAQQMPLVCRTYNLDWQLHPSLESLQIITKNNSYSNLPRLQSSQEIIQ
DFLKNTIDKQIRQLSAEISLTETTSLNSSIRQWLKSLSGKLSLKLPAPQETKKIQKILDN
WKSPLQEYQAIENKFVACFCLHSPSNNSQQWKLEYCLQGLDNPDFLVDAKTIWENPVASL
NYQGKTIKLPQETLLKGLGLASRIYPIIEPSLQEATPQYCLLTSQQAYDFIKSGSGRFID
SGLGVILPPSLANREGWASRLGLSIQATAPKMKKTEKLGLKSLLNFKWQLSIGGHKLTKA
EFEKLVSQDSPLVEVNGEWVELQGQDVRAAKNFFASRKDQMSLSLEDALRLATGDTQTVE
KLPVVNFEAGGQFQELLDTLTNNRSLEEVSTPENFRGELRNYQARGVSWLSFLERWGLGA
CLADDMGLGKCVLHDTEIYVNGMVMEAEQIWQAYAGEAEFDGEGFWTEPNKELLVNSLDE
TTGKIVFARIRRLYRQWVREKLRKVRLKDGSSITITCRHKLFIRDSWKNDFQVGDDVCVP
AKLMWDGKPEDPDVVKFVAWQVAEGWERVNSGMFGVSQKGKDVLEGLLEVFSRLGKRYDI
KINCPKVVAHGSKKNCYEFSAHSLEYRKFLEEKRYGWGKRSHEKTIPLFIMQADLDSVRV
FLSNYFDAEGWVNKTVRCVEISTASSQLIQELSILLRRFGVWMKISPQQKCATNGTGVFC
TYYIGTFGGNSARCFLQEIGFNDSGKQENLKSICEKIADSNVEGIPASDIVAELVEKTQL
PVGSLGIQDPIYMDGCQDFSPTSLEKVINSIEDIISGAGEEEYGQLKSSKLRNKTLEAYS
LLNILELEIYKTRLQKLLNQEVYYCQIESIEEMEYEGWVYDFEVSKYHNFVANNIICHNT
IQTIAFLLKQQEQKALKGPTLLVCPTSVLGNWEREVKKFGPTLKAIVHHGDKRAKGKGFA
TAVKDTNLVITSYALLHRDEKILETIKWQSVIVDEAQNIKNPEAKQSQAARKLDASFRIA
LTGTPVENRLSELWSILDFLNPGYLGQKQFFQRRFAIPIEKYGDTSSLQILRSLVQPFIL
RRLKTDKDIIQDLPEKQENTIFCPLANEQALLYQNIVENSLAEIDTVGGIQRKGKILALL
IKLKQLCNHPVLLQIKKGSRKKVEITDKNSGKLQRLGAMLEEIISEEERAIIFTQFAEWG
KVLQPYLQKSLGREVSFLYGSTQRSKREEMIDQFQLDPQGPPVMILSLKAGGTGLNLTRA
NHVFHFDRWWNPAVENQATDRVFRIGQTRNVQVHKFVCTGTLEEKIHDLIESKKELAEQV
VGAGEKWLTELDTDQLRNLLILDRNQVIKEE
NT seq
4596 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaattttacatagtttttgggtgacagaacatgaacaacctagttttttatttatt
tggggagaagcttggcacagagttacagaagaggatgctggtgaagtagaaaaaattact
aataatccttattcaataactttagatgaactattaaagttatctgaggcaaatatatat
ttatctttagaaaagcacaaaaaatccacaaatcaaactttaggtatccccacaaagtta
tcagaatctaaccaaaaattatacccaattcactctgctataagtttatcagaaattcca
gaaaatttatatatttatccctggaaaatagaaggaatttgtctagaacctgatgaagca
attaaatttttacaatctattcctctaggacaaactactgaatctttcatcgggtcagat
ttaaagttttggtctcatcttgctcgatggagtcttgacttattagcaagatgtaagttt
ttaccttctattgaacaaagatctattacacaagaatttattacaacttggcaaccttta
attgatagttctatagaccaaacaagattgaaaaattttgcccaacaaatgcctcttgtt
tgtcgtacatataatcttgattggcaattacatccttctttagaaagtttacaaataatt
actaaaaataatagttactcaaatttacctcgacttcaatcaagtcaagaaattatacag
gatttcttgaaaaatacaatagataaacagattagacaactatcagctgaaatatctcta
acagaaactacctcattaaattcttcaattagacaatggttgaagtctttatcaggaaaa
ttaagtttaaaattacctgctcctcaagaaacaaaaaaaattcaaaaaatacttgataat
tggaagtcacctctacaagaatatcaagctatagaaaataagtttgttgcctgtttttgt
ctccactcaccatcaaataattcccaacaatggaagctagaatattgtctccaaggactt
gataacccagattttttggttgatgctaaaactatttgggaaaatcctgtggcaagttta
aattatcaaggtaaaacaattaaactgcctcaagaaactttgcttaaaggtttgggttta
gcatcaagaatttatccaattattgagcctagtttacaagaagcaactccccaatattgc
ttactaacttcacaacaagcttatgattttattaaaagtggaagtgggcggtttattgat
agtggactgggggtaattttgcctcctagtttagctaaccgagaagggtgggcttctcgt
ttgggcttaagtattcaggctacagctccaaaaatgaaaaaaactgaaaaacttgggttg
aaaagtcttctcaattttaagtggcagttgtctattggaggtcataaattaactaaagct
gaatttgaaaaattagtttctcaagatagtcctttagtagaagttaatggtgagtgggtg
gagttacaaggtcaagatgtccgagctgctaaaaatttctttgcctctcgtaaagaccaa
atgagtttatctttggaagatgctttgcgcctggcgactggggatactcagactgtggaa
aagttgcctgttgttaattttgaagctgggggtcaatttcaggaacttttagatacttta
actaataatcgttctttagaggaagtttctactcctgagaattttcggggagaactgcgc
aattatcaagcacgaggggtaagttggttgagttttctggaacgttggggtttgggtgct
tgtttggcggacgatatgggtttgggtaagtgtgtgttgcacgatacagaaatttatgtt
aatggtatggtaatggaagcagaacaaatttggcaagcttatgcaggtgaggctgaattt
gatggggaagggttttggacagagcctaataaggagttattggtaaattctttagatgag
acaactggtaaaattgtctttgctcggatccgacggttatatcgccagtgggtacgggaa
aagttacggaaggttaggttgaaggatggtagtagtattactattacttgtaggcataaa
ttatttattcgcgatagttggaaaaatgattttcaggtgggagatgatgtttgtgtacct
gcaaagctgatgtgggatgggaaaccagaagatccagatgtggttaagtttgttgcttgg
caagtagctgaaggatgggaaagggttaattctggaatgtttggtgtttctcagaaggga
aaggatgttttggaaggtttacttgaagtttttagcagacttggaaaacgatatgatatt
aaaattaattgccctaaagttgttgctcatggtagcaagaaaaattgttatgaatttagt
gcgcatagtttagagtatcggaaatttttggaagaaaaaagatatggctgggggaagcga
tcgcatgaaaaaactatcccactatttataatgcaggctgacttagacagcgttagagtt
tttctgagcaactactttgatgcagagggttgggtaaacaaaactgtaagatgtgtcgaa
atttctacagcatcatcccaacttattcaagaattatctatccttctcagacgctttggg
gtttggatgaaaatttcacctcaacagaaatgcgctactaatggtactggagttttttgt
acctattatattggtacatttggtggtaattcggcacgctgttttttacaagaaatagga
tttaatgattcaggaaaacaagaaaatcttaagtcaatttgtgaaaaaattgctgactct
aatgttgaaggaattcctgcttctgatatagttgctgagttagtagaaaaaactcaacta
ccagtgggaagtttaggaattcaggatccaatttatatggatggttgccaagatttttct
cctactagtttagaaaaagttattaacagtattgaggatattattagtggagctggggaa
gaggagtatggtcaactgaaatcttcaaaattgaggaataaaactttagaggcttattct
ttactgaatattttagagctagaaatttataaaactaggctgcaaaaattactcaaccaa
gaggtctattattgtcagatagaatctatcgaagagatggaatatgagggatgggtttat
gattttgaagtgagcaaatatcataattttgttgctaataatattatttgtcataatact
attcaaactatagcttttctactgaaacaacaagagcaaaaagcacttaaaggacctacg
ttattagtttgtcctacttctgtattaggaaattgggaaagagaggtcaaaaagttcgga
ccgactttaaaagcaatagtacatcatggggataaacgtgctaaaggtaaagggtttgct
acagcagtaaaagatacaaatttagtcataacaagttatgctttattgcatcgagatgag
aaaatattggagacaataaaatggcagtcagtgatagttgatgaagcccaaaatattaaa
aatccagaggcaaaacaatctcaagcagctagaaagttagatgcatcatttagaattgct
ttaacaggaactcctgtagaaaatcgcctttcagaattatggtcaattttggattttttg
aatcctggatatttaggtcaaaagcaatttttccagcgtcggtttgctattcctattgag
aaatatggcgatacaagttcgttgcaaattttgcgttctcttgttcaaccatttattctc
cgtcgccttaaaactgataaagatattattcaagatttaccagaaaaacaggaaaatact
attttttgcccactggcaaatgaacaagcattgctttatcaaaatatagttgaaaattct
ttggcagaaattgatactgttggtggtattcagcgaaaaggaaaaattttagctttgtta
ataaaactgaaacagttgtgtaatcatcctgtacttttacaaatcaaaaaaggtagtagg
aaaaaggtagaaattactgataaaaattcagggaaattacaacgtttaggggcaatgttg
gaagaaataatttctgaggaagaacgggcaattatttttacacaatttgctgaatgggga
aaggttttacaaccttatttgcagaaaagtttaggtagggaagtttcttttttatatggt
tctactcagaggagtaaaagggaggaaatgattgatcaatttcaactggatcctcaaggt
cctcctgtcatgattttgtcgttaaaagctggaggtactggtttaaatttgactcgggct
aatcatgtttttcattttgatagatggtggaatcctgcagtggaaaatcaggctacggat
cgggtatttagaattggtcaaactcgaaatgttcaggtgcataagtttgtttgtactgga
actttggaggagaaaatacatgatttaattgaaagtaaaaaggagttggctgagcaggtt
gtaggtgcgggtgaaaaatggttgactgaacttgatacggatcagttgagaaatttatta
atacttgacagaaatcaagtgattaaagaggaataa
DBGET
integrated database retrieval system