Tetrahymena thermophila: TTHERM_001417299
Help
Entry
TTHERM_001417299 CDS
T01020
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Brite
Pattern recognition receptors [BR:
tet04054
]
Cytoplasmic pattern recognition receptors
NOD-like receptors
TTHERM_001417299
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_6
LRR_5
LRR_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24442324
NCBI-ProteinID:
XP_012655340
UniProt:
W7X6W0
LinkDB
All DBs
AA seq
600 aa
AA seq
DB search
ENQIGDEGASSLGSALAKCINLSNLTLFLSENQIGDEGVSSLGSALAKCINLSNLTLDLS
YNEIGDEGASGLGSALAKCINLSKLTLSLSENQIGDEGVSSLGSALAKCINLSKLTLSLS
RKYKGDKDESDLGSALVNCTNLSNLKINLQYNKISTIGAQGLGFALASCTNLSNLSLNLR
GNQISAIAALDLGMALVNCTNLSILKLNLEYNFILDEGASGLSSALANCANLSNLKLNLN
KNQISDGGAQGLSFALENCANLSNLILKLSDNEIGTIGVSGLGSGLANCVNLSNLTLDLS
NNKIDDEGASSLSSGLSNSANLQKLILTLGQNEIGNEGASGLGFALVNCTNLSNLTLNLN
INLIGDVGASGLGSALVNCTNLSNLTLNLGANQIDETSVSGLGRALADCTNLTNLTLNLD
FNQIGNIGASDLGRTLSNCTNLQNLTLIVGGNQIGDEGAQGLGSALVNCTNLSNLIFSLG
YNQIGAIGALGLGSALKNCTNLSNLTLNLFRNYIGTIGASALGSAIQSCNQLSNLTLNLG
YNEIGAIGAQSLGSALLNCPNLSNLVLNLIGNEINESQLLKVESKCLKSKRLVVFERYFQ
NT seq
1804 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
tgaaaattaaattggtgatgaaggtgcatcaagcttaggttctgctttagcaaagtgcat
taatctctcaaatttgacacttttccttagtgaaaattaaattggtgatgaaggtgtatc
aagcttaggttctgctttagcaaagtgcattaatctctcaaatttgacacttgacctttc
ttacaatgaaattggtgatgaaggtgcatcaggcttaggttctgctttagcaaagtgcat
taatctctcaaaattgacacttagccttagtgaaaattaaattggtgatgaaggtgtatc
aagcttaggttctgctttagcaaagtgcattaatctctcaaaattgacacttagccttag
cagaaaatataagggtgataaagatgaatcagatttaggctctgctttagtaaattgcac
taatctctcaaatttgaaaattaatcttcaatacaataaaattagtacaattggtgcata
aggcttaggttttgctttggcaagttgcactaatctttcaaacttgtcgcttaatcttag
ggggaattaaattagtgcgattgctgcattagacttaggtatggcattagtaaattgtac
taatctctcaattttgaaacttaatctagaatacaatttcattcttgatgaaggcgcatc
aggcttaagttcggctttagcaaattgtgctaatctctcaaatttgaaacttaatctaaa
caaaaattaaattagtgatggaggtgcataaggcttaagttttgctttagaaaattgtgc
taatctctcaaatttgatacttaagttaagtgacaatgaaattggtacaattggtgtatc
aggtttaggttctggtttagcaaattgcgttaatctctcaaatttgacacttgatctaag
taataataaaattgatgatgaaggtgcatcaagcttaagttctggtttatcaaattccgc
taacctgtaaaaattgatacttactcttggataaaatgaaattggtaatgaaggtgcatc
aggcttaggttttgctttagtaaattgcactaatctctcaaatctgacgcttaatcttaa
tatcaatttaattggcgacgtaggtgcatcaggtttaggttctgctttagtaaattgcac
taatctctcaaatttgacacttaatcttggtgccaattaaattgatgaaactagcgtatc
aggtttaggtagagctttagcagattgcactaatctcacaaatcttacacttaatcttga
cttcaattaaattggtaatattggagcatcagacttaggtagaactttatcaaattgcac
taatctataaaatttaacacttattgttggcggaaattaaattggcgatgaaggtgctta
gggcttaggctctgctttagttaattgcactaatctctcaaatttgatatttagtcttgg
gtacaatcaaataggtgcaattggtgcattaggtttaggttctgctttaaaaaactgcac
taatctctcaaatttgacacttaatcttttcagaaattatattggcacaattggtgcatc
agctttaggttcagctatataaagttgcaattaactttcaaatttgacacttaatcttgg
gtacaatgaaattggtgcaataggtgcataaagcttaggttctgctttactaaattgtcc
taacctttcaaatttagtacttaatcttattggtaacgaaatcaatgaatcatagttatt
gaaagttgaaagtaaatgtttaaaatcaaaaagattagttgtctttgaaagatatttcta
atga
DBGET
integrated database retrieval system