Treponema putidum: JO40_12345
Help
Entry
JO40_12345 CDS
T03278
Name
(GenBank) helicase
Organism
tpk
Treponema putidum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Helicase_C
SNF2-rel_dom
ResIII
DEAD
PLDc_2
RE_NgoFVII
DUF5965
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIN94770
LinkDB
All DBs
Position
2552839..2556408
Genome browser
AA seq
1189 aa
AA seq
DB search
MQSTLIDNSEHLKLTDTLKELINIPGITRIDIATGYWDIPGTQLIAEELRAFLERSEDAH
LRILIGKDPYLFAQYSADVKYKDADYPQDFIRTDLADLKVKSEYIPAVQLLLDFCKEQHE
GQHDPKIEIRIFRGLSADDKQQFFHSKCYIFYGEGRAFGIIGSSNFTGKGLQENSELNYL
ETVPQIITAKPDEINRSKGHISWFNEKWALASDWTQEFLEEVLRKSEIGIESEKTERPSQ
SQHELPCTILSPYQTYIKFLIDQFDEVINGDGKITPDEYIPHDEEFKQLTYQNQAVNQGF
AIMKRHQGFILADVVGLGKTFTALMIVKRHLIETNFTHPVLIITPPAIHQSWLDSINYFD
KNETSQKKIKQRINLTTIGRLDDSGESDDYADGNDFDLVLKKEQYGMIVVDESHRFRNSN
TLMYQKLDNLIGSINPQPYVMLLSATPQNNAPYDLRNQIYLFQREHKNATLCNLGEFGND
LERYFKEKQDRYKQYIQRYKLMNGIKIQKTPEELAQDKKNLIADNKDIRKHIVEPLIIRR
TRTDIEKYYQDDVKTQALKFPKINKPIEIPYEMKGELGNLFNSTINIIAPQVSQIDTDEA
GNQIFSLGTEAGKDGLGYYRYRAIEFLKNKEHRALYEVKNLTVSNTAERLAQLMEMLLVK
RLESSQAAFKESLHNLSRYTENMIRMWEVNRIFICPDLDVNKELGNNAIKNNDEFKQCLD
MLADKAKKANKRNSGSEYEGSNKEYKRADFDESYITLLRNDLQLIKNLCSKWDVQTADPK
MSTFIYETANQFLNKRRNKNRKLIIFTECIATQKALVQKLYEMPIPHCNVLSITSANRDD
MKDIIAANFDANYKGEKRDDYQILITTDVLSEGVNLHRANSILNYDSPWNATRLMQRLGR
INRIGTEAKEIWNYNFYPSTLGDAQINIKNRTYIKLQTFHELFGEDSQIYSTKEEVRHFD
PVIYETSDDEESPLMPFIAELQTFQKEQPDEYAKLKSIDKPVISAIQNQQHGSFAAMHEY
NDRHEYMQSLLYFSSNIKTQQVSQLEFFEALKPLIQLETQQSEIKIDTITACKRSIMECY
EKDKQNSALIIRQRNSKQNKEITQARTKIQELYTSINSVELHNMLDAISDAIMHHNSALA
KKVLKIDFDNTGLFDNKADVIKELYQLAHQNKPETDTYTALSIALITER
NT seq
3570 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaagtacgctgattgacaattccgaacatttaaaactgactgatacactcaaagaa
ctgatcaacatccccggtattacccgcattgacattgcaaccggctactgggatattccc
ggcacacagctgattgcagaagaacttcgggcattcttagaacgctcagaggatgcgcac
ctgcgtatacttatcgggaaggatccgtatctttttgcgcaatacagtgccgacgttaaa
tataaagacgccgattatcctcaagattttatcagaaccgatcttgccgatttaaaagtg
aaatcggaatatattcccgctgtgcagcttttactggacttttgcaaggagcagcatgaa
ggtcaacatgaccccaaaatagaaattcgtattttccgcggtctaagcgcggatgataag
cagcaattcttccattcaaagtgctatattttttacggtgaaggaagagctttcggcatt
ataggcagcagcaattttacaggaaaaggattacaggaaaattccgaactgaattatttg
gaaacggtaccccagattatcactgcaaaaccggatgaaataaacaggtcgaaaggtcat
atctcatggttcaatgaaaaatgggcattagcttccgattggacgcaggagtttttagaa
gaagtgctaagaaaatcggagatagggatagaaagtgaaaaaacagaacgcccctcacaa
tctcaacatgaattaccgtgtaccatcctttctccctatcaaacctatattaaatttttg
atcgatcagtttgatgaagtaataaacggagacggcaaaatcactcctgatgaatatatc
cctcatgatgaggagttcaaacagcttacctatcaaaatcaagctgtcaatcaaggtttt
gcaattatgaagaggcaccaaggctttatccttgccgatgtagtcggactaggaaaaact
tttactgcattgatgattgtgaaacggcacttgatagaaacgaactttactcatccggtg
ttaattatcaccccgccagctattcaccagagttggctcgattcaatcaactatttcgac
aaaaacgaaacttctcagaaaaaaattaaacagcgtattaaccttaccacaatcgggcgt
cttgatgacagcggagaaagtgatgattatgctgacggaaatgattttgatttagtatta
aaaaaagaacaatacggaatgattgtagttgacgaaagtcaccgctttaggaacagcaat
acgctcatgtatcaaaaacttgataacttaataggaagtataaatcctcagccctatgtt
atgcttctttcggcaaccccgcaaaataatgctccgtatgatctacggaatcagatttat
ttattccagcgtgaacataaaaatgcaaccctgtgtaacctcggcgaatttggaaatgat
cttgaacgctactttaaagaaaaacaagaccgatacaagcagtatattcaacggtataaa
cttatgaatgggataaaaattcaaaagacaccggaagaattagctcaagataaaaaaaat
cttattgcggacaataaagatatacggaaacatattgttgaaccgttaataatccgccga
acaagaacggatattgaaaaatattatcaagacgatgtaaaaactcaagcattgaaattt
cctaaaataaataaaccgattgaaataccctatgagatgaaaggcgaattaggaaatctt
tttaacagtacgataaatattattgccccgcaagttagtcaaattgatacggatgaggct
ggaaatcagattttttcactcggtacggaagcaggaaaagacggcctcggttattaccgc
tacagagcgattgaatttctgaaaaacaaagagcatcgtgcattatacgaagtaaaaaat
ttaacggtaagtaatacggcggaacggttagcccagttgatggaaatgttgctggttaaa
cggcttgaaagcagccaagcagcctttaaagaatctttgcataacttatcccgctatact
gaaaatatgattaggatgtgggaagtaaatcgtatttttatttgtcccgatttggatgta
aataaagaactcggcaataatgctattaaaaacaacgatgaatttaagcagtgtcttgac
atgctagcagataaagcgaaaaaagcgaataaaagaaattccggcagcgaatatgaaggt
tctaataaagaatataaaagagctgattttgatgaaagctatataaccttgttgcgcaat
gatttacagcttatcaaaaacttatgttcaaaatgggatgttcaaacagctgatcctaaa
atgagtacttttatttatgaaacagctaatcaattcttaaataaaagaagaaataaaaat
agaaagttaattatttttaccgaatgtattgcaactcaaaaagcattggttcaaaaatta
tacgaaatgccgataccgcattgcaatgttctttcaattacgtcagcaaatcgtgatgat
atgaaagatattattgcggcaaactttgatgcaaattacaaaggtgaaaaacgtgatgat
taccagatacttattaccaccgatgtcctttccgaaggcgtaaacctgcaccgtgctaat
tcaattttaaattatgactcgccgtggaatgcaacgcggcttatgcagcggcttgggcgt
attaaccgtatcggtacggaagcaaaagaaatatggaattataatttttatccttcaaca
ttgggtgatgcacaaataaatattaagaatagaacatatataaaattgcaaacctttcat
gaattattcggtgaagattcacaaatttattcaacaaaagaagaagtaaggcattttgat
ccggtaatatacgaaacatccgatgatgaagaatctccgcttatgccgtttattgcagaa
ttacaaacatttcaaaaagagcagccggatgagtatgccaaactaaaatcgatagacaag
cctgttatttccgccatacaaaatcaacaacacggatcatttgctgcgatgcacgaatat
aacgatcggcatgagtatatgcaatcattattatatttttcgtccaacattaagactcag
caagttagccaactggagttttttgaagccttaaaaccgctgatacaacttgagacacaa
cagtctgaaataaagatagataccataacagcctgtaaaagatcgattatggaatgctat
gaaaaagataaacaaaactcagcattgattattaggcaaagaaatagcaaacagaacaaa
gagataacgcaagcgcgaactaaaatacaagaattatacacaagtattaactccgttgaa
ttgcataacatgctcgatgccatttctgatgccattatgcaccataattcggcattagca
aaaaaagtattaaaaatagactttgacaatactgggctattcgataataaggcagatgtc
attaaagaactctatcaattagcgcatcaaaataaacctgaaaccgatacatacactgca
ttatcaatagcacttataacggaaagatag
DBGET
integrated database retrieval system
