Vibrio sp. EJY3: VEJY3_09700
Help
Entry
VEJY3_09700 CDS
T01683
Name
(GenBank) flagellar biosynthesis, cell-distal portion of basal-body rod
Organism
vej
Vibrio sp. EJY3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3869
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEX22420
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2160356..2162941)
Genome browser
AA seq
861 aa
AA seq
DB search
MSDFPDLLSAFGEAVDALKVKLSTDSGTRTTYNGEEIKSIAADIDAQYAEIKGTLNALTE
NQQSGVVIFQTYALLTDHTPTSEQETGSFKVVNDPDSSLNGYYTWVSETTYTKDADLVTN
EVNEANTSDAVSGSAVVNYTASIRASILALKEEQLQRLGVDIDIDLAAGSAPSAGYWAFN
EVASGDGSLEGLEVYVSGAGTINIRVYSDTDGLFTKVSEVIGVAVLDGLNTLTPSDFGDI
SIAEGQYIAVQSGTATLQYSSDTYYSGGLLNLGINDSITNTIPVNEIYIQAKFTLSNIVQ
SVTSDALSSLKNSVNEFSGEAGSISLSSNLDKILIVSNSYNQTSGLKGKSPTAVASSLSD
YNFANMSTNGATMNRNSQWVREDTAVRGDTFSMYNPSHAIIVENQNTKTTQTDDEYIEST
QELIDVLLSRGVIPIIVSEWAASTQAGVMVDGEVRNVRALKALAEKNGLLFVDGTTKQWL
LTPTTYDDFWYSAHPKTRTQFMIADAFRNVTKQLPSPRQTMKIFRARNSPSSISELIYST
TGERHRLFKELMTSHEAIADIDAAMFDTDGGNGASLQVVYDEYVRLEQSEVIDSMTEYSL
IESTLPVVTNSVSLTINDTSATVYVRVKSDSDVWWEECFLVNGVFKTPNIVGVVDYDKVA
FLLYKSGGVDLTESPVISWTDGVTKSARKSYTMIATVGEEMLTQPFVVDAGSVASSWINN
GSLQVVIPDDGQLPTDCSGCVEVTSVAAISQAFSYTQLEDSVDVTIRVWARLWKAQHPST
SNFSESEINYETPDTGTIVVRLSGTSSPLAASSIMTDEVGLHWCELEFLGCLSGLTTSAM
VTVQSDNDDIQIAKVSVKRRN
NT seq
2586 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgatttccctgatttacttagtgcttttggagaagctgttgacgcattaaaggtc
aagctcagcactgattccggcacccgtaccacttataatggcgaagaaatcaagtctatt
gctgccgatattgatgctcagtacgccgagattaaaggcactctgaatgcattgacagaa
aaccagcaatcaggcgtggtcatatttcaaacttacgcgttattgactgatcatacacca
accagtgaacaggaaaccggctcatttaaagtggtcaatgaccctgatagctcgttaaat
ggttattacacctgggtaagtgaaaccacgtatacaaaagatgccgatttggttacaaat
gaggttaatgaagccaataccagtgatgctgtgagcggaagcgctgtggttaattacaca
gccagcattcgtgcatcgatcctcgcgctaaaagaggaacagctccagcggctcggagtg
gatattgatatagatctggcggctggcagtgctccatcagccggatattgggcgttcaac
gaggtcgcctctggggacggttcgttagaagggctagaggtttacgtgtctggcgcagga
acaatcaatataagggtttattcagatactgatggacttttcacaaaggtgagtgaggtg
atcggcgtagccgtacttgatgggttaaacacgctaactccgagcgactttggtgatatt
agcattgcagaagggcaatatatagcagtccaaagtggtaccgcaacccttcaatattcg
agtgacacctattattcaggtggactgctcaacttaggaattaatgacagtattaccaac
actatccctgttaacgagatctatattcaggcgaagttcacattgagcaatattgttcaa
tccgttacgtctgacgcgttatctagcctaaaaaattccgtcaatgagtttagtggggag
gccggttctatatctctatcatcaaatctcgataagatattgattgttagtaacagttat
aaccaaacttccgggctaaaaggaaaatcgccaaccgcagtagcgtcatctttgtctgat
tataatttcgctaacatgtcaaccaatggtgcaacaatgaaccgcaactcccagtgggtg
agagaagacacggctgttaggggagataccttttctatgtacaatccaagtcatgccatt
attgttgagaaccaaaacacaaaaacaacccagacagatgatgaatatattgaatcgaca
caggagctgatagacgtactgctaagcaggggagttattcctattattgtaagtgagtgg
gcggcatcaacacaggctggtgtaatggttgatggcgaggttagaaatgtaagagcacta
aaggcattggcagagaaaaacggtctgctttttgttgatggcactactaaacaatggtta
ctaactcctactacgtatgatgatttctggtattccgctcaccctaaaaccagaacccaa
ttcatgattgcggatgcatttagaaacgtgaccaagcaactaccatctccacgacaaaca
atgaaaattttcagagccaggaactcaccatcatcaatatctgagctgatttacagtacc
acaggtgaaagacaccgattattcaaggagctaatgaccagccatgaagctattgccgat
attgatgcggcaatgtttgacactgatggcggtaacggagcgagtctgcaggttgtatat
gatgaatatgtacgacttgagcaaagcgaagtgattgattctatgacggaatattcccta
atagagagcacgctgcctgtagtaacgaatagtgtgtcgttaacgataaatgacacgtca
gcaacagtctacgtcagagttaaaagtgacagtgatgtgtggtgggaagagtgcttctta
gttaatggggtatttaaaacgcctaacattgttggtgtagttgattatgataaggtggcc
ttcttgctgtataagtcaggaggggtagatctgacagaaagtcccgttatatcttggaca
gacggtgtaactaaatcggcaagaaagtcatacacgatgattgctacagttggagaggag
atgttaacgcagccgtttgtggttgatgctggttcggtggcatctagctggataaataac
ggctctctgcaagttgtgatcccagacgatgggcaacttccaaccgattgctcggggtgc
gtagaagtgacctccgtggcggctatttctcaggcgttcagttatacacaactagaagat
agtgtggatgttaccatccgtgtttgggcgcgactgtggaaggcacaacacccgagcacg
tctaatttttcggaatcagaaataaattatgaaacaccagacactgggacaattgttgtt
agactgagcggtacaagcagcccattggccgccagctcgataatgacagatgaggtaggt
cttcattggtgtgaattagaatttcttggttgtttaagcggtcttactacgtccgcgatg
gtcacggttcaatcagataatgatgacatccaaatagctaaagtatctgtaaaaagacgg
aattag
DBGET
integrated database retrieval system