KEGG   Candidatus Vesicomyosocius okutanii: COSY_0248
Entry
COSY_0248         CDS       T00530                                 
Symbol
uvrA
Name
(GenBank) excinuclease ABC subunit A
  KO
K03701  excinuclease ABC subunit A
Organism
vok  Candidatus Vesicomyosocius okutanii
Pathway
vok03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vok00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    COSY_0248 (uvrA)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:vok03400]
    COSY_0248 (uvrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:vok03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     COSY_0248 (uvrA)
  DSBR (double strand breaks repair)
   NHEJ (non-homologous end-joining)
    SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)
     Supressor
      COSY_0248 (uvrA)
SSDB
Motif
Pfam: UvrA_inter UvrA_DNA-bind ABC_tran SMC_N AAA_29 AAA_16 AAA_22 AAA_21 nSTAND1 RsgA_GTPase AAA_23 DnaJ_CXXCXGXG nSTAND3 NACHT cobW Viral_helicase1
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAF61378
UniProt: A5CXD8
LinkDB
Position
249770..252586
AA seq 938 aa
MDQISIRGARVHNLKNIDIDIPRNKLIVITGLSGSGKSSLAFDTIYAEGHRRYVESLSAY
ARQFLSLMEKPDVDHIEGLSPAISIEQKSTSHNPRSTVGTITEIYDYLRLLFARIGIPIC
PKHKINLESQTISQMVNNIVKLPIGRKIMLLAPIVQNRKGSHVQLLKELNQQGFLRARID
GVVVYIDEMEVLNSKVNHSIEIVVDRLKIREDMISRLSESLETALNLSAGLVRIAPMEYE
SSLQEKVFSAKFSCIECGYSLSELEPRLFSFNNPVGACQTCDGLGVRDTFDEQKVVVSPS
MSLADGAVYGWGRSNAYFYQILMLVGKYYGFSIETPYEQLSNKHKKIVLYGSGTDDIDFS
RIKGRKGWSNKAKPFEGIIPRMMRRYETSEINSVREELSRYVVSKNCTECHGDRLNESAR
NVFIDEQNLSNITKLSIADIYSFLKEVKLEGVRGQIAEKILKEIIQRLEFLINVGLEYLS
LDRRANSLSGGEAQRIRLASQIGAGLMGVLYVLDEPSIGLHQRDNQKLLNTLAYLRDIGN
TVIMIEHDEEAIKQADYVIDIGPGAGVHGGEIVAIGIPKDIENNLKSLTGDYLSGRQSIK
VPTKRKSANQWIRIKGAKGNSLNNVDLSIPIGVLTCVTGVSGSGKSTLINDTLYALAARE
LHHAQITPAEYESVEGLNYLDKIVNIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFSLVRDLFSQTLEAK
LRGYKAGRFSFNVKGGRCEACKGDGLIKVEMHFLSDIYVSCDVCQGQRYNQQTLEVFYKG
KSISQVLGMTVEQAIRFFQSISKIKQKLQTLMEVGLSYITLGQNATTLSGGEAQRIKLAK
ELSRMDTGRTLYILDEPTTGLHFHDIKLLLSVINRLCERNNTIVIIEHNLDVIKTADWII
DLGPEGGNKGGQIIAFGTPEEVAQVKESYTGEYLKTYV
NT seq 2817 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatcaaattagtattcgtggtgctagagttcacaatttaaaaaatatcgatattgat
attcctagaaataaattgattgtaattactggactatctggatcaggtaaatcttcatta
gcttttgatactatttatgcagaaggacatcgtcgttatgtagagtctttatcagcttat
gcacgtcaatttttatcactcatggaaaaacctgatgttgatcatattgaagggttatct
ccagctatctctattgagcaaaaatccacttcacataatccacgctcaacagttggtaca
attactgaaatttatgactatttaagattattgtttgcacgtattggtattcctatttgc
ccaaaacacaaaattaatcttgaatctcaaaccatttctcaaatggttaataatattgtt
aaattaccaattggtagaaaaattatgttgttagcacctattgttcagaaccgtaaaggt
agccatgtacaattattaaaagagttaaatcagcaaggttttttaagggctagaattgat
ggtgtagttgtgtatatagatgaaatggaagtattgaatagtaaggttaatcatagtatt
gaaattgtagttgatcgtttaaaaatacgagaagatatgatttcacgtttatctgaatca
ttagaaactgcacttaatttaagcgcaggtttggtacgcattgcacctatggaatatgaa
tcatctttgcaagaaaaggtattttccgctaagttttcttgtattgaatgcggttactca
ttaagtgaattggagcctaggcttttctcatttaataatccagttggtgcttgccaaact
tgtgatggactgggtgtgagagatacatttgatgaacaaaaagttgtagttagtcctagt
atgagtttagcagatggggcagtttatggttggggacgctcaaatgcttatttttatcaa
atattaatgttagtaggtaagtattacggctttagtattgaaacaccttatgaacaatta
agtaataagcacaaaaaaattgtcctttatgggagtggcacagatgatattgacttttca
agaatcaaaggacgtaagggttggtctaataaagctaagccatttgagggtattattcca
agaatgatgcgtcgttatgaaacaagtgagattaatagcgttagagaagagctttctcgt
tatgttgttagtaagaattgtactgaatgtcatggcgatagattaaatgaatcagctaga
aatgtgtttattgatgagcaaaatttatcaaatattactaagctttctattgctgatatt
tatagttttttaaaagaggtaaagctggaaggagttcgtggtcaaattgcggaaaaaatt
ttaaaagaaattattcaacgtttagaatttttaattaatgtggggttagagtatttaagt
cttgatcgtagagcaaatagcttatcaggtggtgaggcacagcgtattcgcttagctagt
cagattggtgcaggattgatgggtgtcttgtatgtacttgatgaaccatcaataggttta
catcaaagagacaatcaaaagctattaaacacacttgcctatttgcgtgatattggaaat
acagtgattatgatagaacacgatgaagaagcaattaaacaggccgattatgtaattgat
attgggcctggtgctggtgtacatggaggtgaaatagttgctattggtatacctaaagat
attgaaaataatcttaagtctttaacaggtgattatctaagtggtcgtcaaagtattaaa
gttcctactaaacgaaaaagtgccaatcaatggattcgtattaaaggcgctaagggtaat
agccttaataatgttgatttgtctattcctataggtgtgttaacttgtgtgacaggcgta
tctggttctggaaaatcaaccttaattaatgatactttgtatgctttggcagcaagggaa
cttcatcatgcacaaataacacctgctgaatatgaatcagtcgaaggattgaattatctt
gataaaattgttaatattgatcaaagtccaattggacgtacaccacgttctaatccagct
acttatacaggtgtattttcgttagtgcgtgatttattttcacaaactttagaggcaaag
ttacgtggttataaagcaggtcgttttagttttaatgttaaaggaggtaggtgtgaagcg
tgcaagggtgatggattgattaaggtagaaatgcatttcctatcagatatttatgtatca
tgtgatgtatgtcaaggtcagcgttataatcaacaaactttagaagtgttttataaagga
aaaagcatttcgcaggtacttggtatgactgtagaacaggcaattaggtttttccaatct
atttctaaaattaaacaaaaactacaaactctaatggaggttggactctcttatattact
cttgggcaaaatgcaactactttatctggtggtgaagcacaacgtattaaattagcaaag
gaattgtcaagaatggatactggacgaacgctttatattcttgatgagccgacaacgggt
ttgcattttcatgatattaaacttttgttatcagttattaatagattatgcgagcgtaac
aatactattgttattattgaacataaccttgatgttattaaaactgcagattggattatt
gatttaggacctgagggaggtaataagggtgggcagattattgcatttggtacaccagaa
gaagtggcacaagttaaggaatcgtatacaggagaatatttaaaaacttacgtgtaa

DBGET integrated database retrieval system