Candidatus Zinderia insecticola: ZICARI_052
Help
Entry
ZICARI_052 CDS
T01304
Symbol
rpoC2
Name
(GenBank) putative DNA-directed RNA polymerase subunit beta' C terminal domain (rpoC2)
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
zin
Candidatus Zinderia insecticola
Pathway
zin03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
zin00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
ZICARI_052 (rpoC2)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
zin03021
]
ZICARI_052 (rpoC2)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
zin03400
]
ZICARI_052 (rpoC2)
Enzymes [BR:
zin01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
ZICARI_052 (rpoC2)
Transcription machinery [BR:
zin03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
ZICARI_052 (rpoC2)
DNA repair and recombination proteins [BR:
zin03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
ZICARI_052 (rpoC2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADM89675
UniProt:
E0TIP8
LinkDB
All DBs
Position
51608..53953
Genome browser
AA seq
781 aa
AA seq
DB search
MIYEIFPKKISFNKINKYINKSRILKLINLICNKYNTDVAVNFSEKILRKGLYFSTKSGI
SISIEDAIIPKKKKKIILKGYKKIKNFKNKILNFPIIKKNKNININIWEKIDNKLEDLVL
KVIYPKNSILNKINSIFFMLKSGARGSINQIKQLSGMRGLMIKANGNIIKNPITSNFREG
LNMFQYFISTHGSRKGLSDTALKTANSGYLTRKLVDVSQDIVVREKDCGSNKGVVITNII
QDNEIIENIENRVFGRITSKKILDRKKKNIICKKNTIIDLNLFKIIKKEKIIKIEVRSPL
KCKTYNGICSYCYGYDLSKRRLVSIGTTVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGIMSNIKT
KLKSSIFCKYKGIVKFSKNLICVLKNKKIIVISKKSKIFILNSIKFILEEYELPLNCNLR
VKNNSYIKSGKKLFSWNYSSNKIISKHSGIIKFKNFKKNKNYKKIINKITNEYVIIIKNK
SIINYNKYIPKIKILYLNKNKLLYKKSTIKLNINNTILNVYNKQKISSGKTLAYIPKEKK
SIKDIMGGLPRISELFEVIKPKNRSLISEIKGILKISKKVKNKIYITIKNKIEKRKYIIN
IKKKKLLFGNNEIINKGDFITSGNIYTPDILKNLGIKKLVFYIMNEIQNIYRTQGVKIND
KHIEIILKQMLSKVEITKTKNFTYFKGEIENLNKILKINRKLILKKKKPIKYRNLLLGIT
KISLLKKSFMSSASFQETSKILTKASLFDKKDKLKGLKENIMIGKLLPAGTGNIINNYFK
K
NT seq
2346 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatttatgaaatttttcctaaaaaaatttcttttaataaaataaataaatatataaat
aaatctagaatattaaaattaataaatttaatatgtaataaatataatactgatgttgct
gtaaatttttctgaaaaaattttaagaaaaggtttatatttttcaacaaaatcaggtatt
tctattagtatagaagatgctattattcctaaaaaaaaaaaaaaaataattttaaaaggt
tataaaaaaataaaaaattttaaaaataaaattttaaattttccaataataaaaaaaaat
aaaaatataaatataaatatatgagaaaaaattgataataagttagaagatttagtttta
aaagtaatatatcccaaaaatagtattttaaataaaataaattctattttttttatgctt
aaatctggtgcgagaggttcaattaatcaaataaaacaattatctggaatgagaggttta
atgattaaagcaaatggtaatataattaaaaatccaattacttctaattttagagaaggt
ttgaatatgtttcaatattttatttctactcatggttctagaaaaggtttatcagataca
gctttaaaaactgctaattctggttatttaactagaaaattagttgatgtatctcaggat
attgtagtaagagaaaaagattgtggtagtaataaaggagttgttattacaaatattata
caagataatgaaattatagaaaatatagaaaatagagtttttggaagaattacttcaaaa
aaaattttagatagaaaaaaaaaaaatataatatgtaaaaaaaatactattatagattta
aatttatttaaaataattaaaaaagaaaaaattattaaaatagaagttagaagtccttta
aaatgtaaaacatataatggtatatgttcttattgttatggttatgatttatcaaaaaga
agattagttagtataggaactacagttggtataatagcagcacaatctataggtgaacct
ggtactcaattaactatgagaacatttcatacaggtggtataatgagtaatataaaaact
aaattaaaatcatctattttttgcaaatataaaggtattgttaaattttctaaaaattta
atttgtgttttaaaaaataaaaaaattattgttatttcaaaaaaaagtaaaatttttata
ttaaatagtattaaatttattttagaagaatatgaattaccattaaattgtaatttaaga
gtaaaaaataattcttatattaaatcaggtaaaaaattatttagttgaaattatagtagt
aataaaattatttctaaacattcaggtattattaaatttaaaaattttaaaaaaaataaa
aattataaaaaaataattaataaaataacaaatgaatatgttattattataaaaaataaa
agtataataaattataataaatatattcctaaaataaaaattttatatttaaataaaaat
aaattattatataaaaaaagtactataaaattaaatattaataatacaatattaaatgtt
tataataaacaaaaaattagttctggaaaaacattagcttatatacctaaagaaaaaaaa
tcaattaaagatattatggggggtttacctagaatttctgaattatttgaagttataaaa
cctaaaaatagatctttaatttcagaaattaaaggtatattaaaaatttctaaaaaagta
aaaaataaaatttatattactataaaaaataaaattgaaaaaagaaaatatattataaat
attaaaaaaaaaaaattattatttggtaataatgaaattataaataaaggagattttata
acttctggtaatatttatactccagatattttaaaaaatttaggaataaaaaaattagtt
ttttatattatgaatgaaatacaaaatatatatagaactcaaggagttaaaataaatgat
aaacatatagaaataatattaaaacaaatgttaagtaaagtagaaataactaaaactaaa
aattttacatattttaaaggcgaaatagaaaatttaaataaaatactaaaaattaataga
aaattaattttaaaaaaaaaaaaacctataaaatatagaaatttattattaggaataaca
aaaatttctttattaaaaaaatcatttatgtcatctgcatcttttcaagaaacttctaaa
attttaactaaagcttctttatttgataaaaaagataaattaaaaggattaaaagaaaat
attatgataggtaaattattaccagctggtactggtaatataataaataattattttaaa
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system