KEGG   ENZYME: 6.5.1.2
Entry
EC 6.5.1.2                  Enzyme                                 
Name
DNA ligase (NAD+);
polydeoxyribonucleotide synthase (NAD+);
polynucleotide ligase (NAD+);
DNA repair enzyme (ambiguous);
DNA joinase (ambiguous);
polynucleotide synthetase (nicotinamide adenine dinucleotide);
deoxyribonucleic-joining enzyme (ambiguous);
deoxyribonucleic ligase (ambiguous);
deoxyribonucleic repair enzyme (ambiguous);
deoxyribonucleic joinase (ambiguous);
DNA ligase (ambiguous);
deoxyribonucleate ligase (ambiguous);
polynucleotide ligase (ambiguous);
deoxyribonucleic acid ligase (ambiguous);
polynucleotide synthetase (ambiguous);
deoxyribonucleic acid joinase (ambiguous);
DNA-joining enzyme (ambiguous);
polynucleotide ligase (nicotinamide adenine dinucleotide);
poly(deoxyribonucleotide):poly(deoxyribonucleotide) ligase (AMP-forming, NMN-forming)
Class
Ligases;
Forming phosphoric-ester bonds;
Ligases that form phosphoric-ester bonds (only sub-subclass identified to date)
Sysname
poly(deoxyribonucleotide)-3'-hydroxyl:5'-phospho-poly(deoxyribonucleotide) ligase (NAD+)
Reaction(IUBMB)
NAD + (deoxyribonucleotide)n-3'-hydroxyl + 5'-phospho-(deoxyribonucleotide)m = (deoxyribonucleotide)n+m + AMP + beta-nicotinamide D-nucleotide (overall reaction) [RN:R00382];
(1a) NAD + [DNA ligase]-L-lysine = [DNA ligase]-N6-(5'-adenylyl)-L-lysine + beta-nicotinamide D-nucleotide;
(1b) [DNA ligase]-N6-(5'-adenylyl)-L-lysine + 5'-phospho-(deoxyribonucleotide)m = 5'-(5'-diphosphoadenosine)-(deoxyribonucleotide)m + [DNA ligase]-L-lysine;
(1c) (deoxyribonucleotide)n-3'-hydroxyl + 5'-(5'-diphosphoadenosine)-(deoxyribonucleotide)m = (deoxyribonucleotide)n+m + AMP
Reaction(KEGG)
R00382
Substrate
NAD [CPD:C00003];
(deoxyribonucleotide)n-3'-hydroxyl;
5'-phospho-(deoxyribonucleotide)m;
[DNA ligase]-L-lysine;
[DNA ligase]-N6-(5'-adenylyl)-L-lysine;
5'-(5'-diphosphoadenosine)-(deoxyribonucleotide)m
Product
(deoxyribonucleotide)n+m [CPD:C00039];
AMP [CPD:C00020];
beta-nicotinamide D-nucleotide;
[DNA ligase]-N6-(5'-adenylyl)-L-lysine;
5'-(5'-diphosphoadenosine)-(deoxyribonucleotide)m;
[DNA ligase]-L-lysine
Comment
The enzyme, typically found in bacteria, catalyses the ligation of DNA strands with 3'-hydroxyl and 5'-phosphate termini, forming a phosphodiester and sealing certain types of single-strand breaks in duplex DNA. Catalysis occurs by a three-step mechanism, starting with the activation of the enzyme by NAD+, forming a phosphoramide bond between adenylate and a lysine residue. The adenylate group is then transferred to the 5'-phosphate terminus of the substrate, forming the capped structure 5'-(5'-diphosphoadenosine)-[DNA]. Finally, the enzyme catalyses a nucleophilic attack of the 3'-OH terminus on the capped terminus, which results in formation of the phosphodiester bond and release of the adenylate. RNA can also act as substrate, to some extent. cf. EC 6.5.1.1, DNA ligase (ATP), EC 6.5.1.6, DNA ligase (ATP or NAD+), and EC 6.5.1.7, DNA ligase (ATP, ADP or GTP).
History
EC 6.5.1.2 created 1972, modified 1976, modified 2016
Orthology
K01972  DNA ligase (NAD+)
Genes
ECOb2411(ligA) b3647(ligB)
ECJJW2403(ligA) JW3622(ligB)
ECDECDH10B_2576(ligA) ECDH10B_3829(ligB)
EBWBWG_2173(ligA) BWG_3338(ligB)
ECOKECMDS42_1962(ligA) ECMDS42_3081(ligB)
ECEZ3677(lig) Z5073(yicF)
ECSECs_3283(ligA) ECs_4522(ligB)
ECFECH74115_3642(ligA) ECH74115_5017(ligB)
ETWECSP_3359(ligA) ECSP_4641(ligB)
ELXCDCO157_3048(ligA) CDCO157_4259(ligB)
EOIECO111_3141(ligA) ECO111_4469(ligB)
EOJECO26_3464(ligA) ECO26_4953(ligB)
EOHECO103_2930(ligA) ECO103_4511(ligB)
ECOOECRM13514_3236(ligA) ECRM13514_4655(ligB)
ECOHECRM13516_3097(ligA) ECRM13516_4436(ligB)
ESLO3K_00605(ligB) O3K_07345(ligA)
ESOO3O_18305(ligA) O3O_25065(ligB)
ESMO3M_00635(ligB) O3M_07395(ligA)
ECKEC55989_2701(ligA) EC55989_4112(ligB)
ECGE2348C_2597(ligA) E2348C_3911(ligB)
EOKG2583_2943(ligA) G2583_4383(ligB)
ELRECO55CA74_14565(ligA) ECO55CA74_21020(ligB)
ELHETEC_2524 ETEC_3888
ECWEcE24377A_2698(ligA) EcE24377A_4148(ligB)
EUNUMNK88_3013(ligA) UMNK88_4451
ECPECP_2435 ECP_3745
ENAECNA114_2488(lig) ECNA114_3791(ligB)
ECOSEC958_4054(yicF) EC958_5024
ECVAPECO1_2814(yicF) APECO1_4135(ligA)
ECOAAPECO78_15790(ligA) APECO78_22070
ECXEcHS_A2546(ligA) EcHS_A3858(ligB)
ECMEcSMS35_2566(ligA) EcSMS35_3981(ligB)
ECYECSE_2702 ECSE_3928
ECRECIAI1_2469(ligA) ECIAI1_3818(ligB)
ECQECED1_2855(ligA) ECED1_4330(ligB)
EUMECUMN_2733(ligA) ECUMN_4162(ligB)
ECTECIAI39_2556(ligA) ECIAI39_4168(ligB)
EOCCE10_2794(ligA) CE10_4205(ligB)
EBRECB_02311(ligA) ECB_03504(yicF)
EBLECD_02311(ligA) ECD_03504(ligB)
EBEB21_02272(ligA) B21_03456(ligB)
EBDECBD_0078 ECBD_1271
ECIUTI89_C2743(lig) UTI89_C4191(yicF)
EIHECOK1_2728(ligA) ECOK1_4087(ligB)
ECZECS88_2601(ligA) ECS88_4061(ligB)
ECCc2945(lig) c4471(yicF)
ELOEC042_2620(ligA) EC042_3979
ELNNRG857_12090(ligA) NRG857_18130(ligB)
ESEECSF_2275 ECSF_3482
ECLEcolC_0064 EcolC_1267
EKOEKO11_0076 EKO11_1317
EKFKO11_04465(ligB) KO11_10755(ligA)
EABECABU_c27320(ligA) ECABU_c41060(ligB)
EDHEcDH1_0058 EcDH1_1250
EDJECDH1ME8569_2345(ligA) ECDH1ME8569_3532(ligB)
ELUUM146_04565(ligA) UM146_18390(ligB)
ELWECW_m2640(ligA) ECW_m3923(ligB)
ELLWFL_12925(ligA) WFL_19175(ligB)
ELCi14_2743(ligA) i14_4133(ligB)
ELDi02_2743(ligA) i02_4133(ligB)
ELPP12B_c2522(ligA) P12B_c3775(ligB)
ELFLF82_1196(ligA) LF82_1197(ligB)
ECOLLY180_12410(ligA) LY180_18780(ligB)
ECOIECOPMV1_02614(ligA) ECOPMV1_03981(ligB)
ECOJP423_13380(ligA) P423_20245(ligB)
EFEEFER_0763(ligA)
EALEAKF1_ch2291(ligB) EAKF1_ch3591(ligA)
EMAC1192_17400 C1192_23400(ligA)
ESZFEM44_02115(ligA) FEM44_10820(ligB)
STYSTY2663(ligA)
STTt0431(ligA)
SEXSTBHUCCB_4670
SENTTY21A_02220(ligA)
STMSTM2427(lig) STM3739(yicF)
SEOSTM14_2982(ligA) STM14_4503(ligB)
SEVSTMMW_24461 STMMW_37281
SEYSL1344_2390(lig) SL1344_3705(ligB)
SEMSTMDT12_C24450(ligA) STMDT12_C37960(ligB)
SEJSTMUK_2459(ligA) STMUK_3725(yicF)
SEBSTM474_2529(ligA) STM474_3913(ligA)
SEFUMN798_4061
SETUSTU288_08500(ligA) STU288_18895(ligB)
SETCCFSAN001921_04635(ligA) CFSAN001921_21750
SENRSTMDT2_23901(ligA) STMDT2_36251
SENDDT104_24801(ligA) DT104_37231
SENICY43_12985(ligA) CY43_19400(ligB)
SEENSE451236_02220 SE451236_18355(ligA)
SPTSPA0438(ligA) SPA3591(yicF)
SEKSSPA0411 SSPA3354
SPQSPAB_00529 SPAB_04639
SEISPC_1233(ligA) SPC_3821(yicF)
SECSCH_2425(lig) SCH_3662(yicF)
SEHSeHA_C2686(ligA) SeHA_C4065(ligA)
SHBSU5_03030 SU5_04216
SENHCFSAN002069_13340 CFSAN002069_19625(ligA)
SEEHSEEH1578_04785(ligB) SEEH1578_21450(ligA)
SEESNSL254_A2620(ligA) SNSL254_A4019(ligA)
SENNSN31241_1390 SN31241_35320
SEWSeSA_A2662(ligA) SeSA_A3947(ligA)
SEASeAg_B2571(ligA) SeAg_B3956(ligA)
SENSQ786_11990(ligA) Q786_18285
SEDSeD_A2792(ligA) SeD_A4126(ligA)
SEGSG2459(lig) SG3692(yicF)
SELSPUL_0455(lig) SPUL_3825(yicF)
SEGASPUCDC_0455(lig) SPUCDC_3811(yicF)
SETSEN2408(lig) SEN3561(yicF)
SENAAU38_12215(ligA) AU38_18185(ligB)
SENOAU37_12225(ligA) AU37_18375(ligB)
SENVAU39_12225(ligA) AU39_18380(ligB)
SENQAU40_13700(ligA) AU40_20475(ligB)
SENLIY59_12550(ligA) IY59_18820(ligB)
SENJCFSAN001992_14950(ligB) CFSAN001992_21440(ligA)
SEECCFSAN002050_01615 CFSAN002050_19075(ligA)
SEEBSEEB0189_001165 SEEB0189_007430(ligA)
SEEPI137_02060(ligA) I137_18345
SENBBN855_25110(ligA) BN855_38340(ligA2)
SENEIA1_12120(ligA) IA1_18180
SENCSEET0819_02490(ligB) SEET0819_19585(ligA)
SESSARI_00461 SARI_03901
SBGSBG_2225(ligA) SBG_3320
SBZA464_2554 A464_3816
SBVN643_10810(ligA) N643_16515
SALZEOS98_00530(ligB) EOS98_06830(ligA)
SFLSF2466(ligA) SF3686(ligB)
SFXS2612(lig) S4082(yicF)
SFVSFV_2463(lig) SFV_3883(yicF)
SFESFxv_2715(ligA) SFxv_4015(ligB)
SFNSFy_3502 SFy_5253
SFSSFyv_3578 SFyv_5328
SFTNCTC1_02711(ligA) NCTC1_03981(ligB)
SSNSSON_2500(lig) SSON_3759(yicF)
SBOSBO_2435(lig)
SDYSDY_2608(lig)
SDZAsd1617_03511 Asd1617_05333
SHQA0259_15795(ligA) A0259_22100(ligB)
ENCECL_00115(ligB) ECL_03741
ENLA3UG_00645(ligB) A3UG_16450(ligA)
ECLGEC036_01140 EC036_31990
ECLEECNIH2_01190(ligB) ECNIH2_16435(ligA)
ECLNECNIH4_00665(ligB) ECNIH4_06705(ligA)
ECLIECNIH5_00760(ligB) ECNIH5_15370(ligA)
ECLXLI66_00565(ligB) LI66_15780(ligA)
ECLYLI62_00980(ligB) LI62_17280(ligA)
ECLZLI64_00645(ligB) LI64_15205(ligA)
ECLOENC_02710
EHMAB284_01530(ligB) AB284_09640(ligA)
EXFBFV63_00550 BFV63_15600(ligA)
ECLAECNIH3_00765(ligB) ECNIH3_15460(ligA)
ECLCECR091_00765(ligB) ECR091_15395(ligA)
EAUDI57_03200(ligA) DI57_18005(ligB)
EKBBFV64_00395 BFV64_16160(ligA)
ENOECENHK_00650(ligB) ECENHK_16015(ligA)
EECEcWSU1_00093(ligB) EcWSU1_03246(ligA)
ELGBH714_12390(ligA) BH714_15630
ECANCWI88_00585 CWI88_06320(ligA)
ERNBFV67_00420 BFV67_15910(ligA)
ECLSLI67_001400(ligB) LI67_017295(ligA)
ECHGFY206_00490(ligB) FY206_17785(ligA)
ESHC1N69_00410 C1N69_16330(ligA)
ENTEnt638_0092 Ent638_2939
EASEntas_0098 Entas_3145
ENRH650_07980(ligA) H650_14570
ENXNI40_000425(ligB) NI40_016045(ligA)
ENFAKI40_0102(ligB) AKI40_1433(ligA)
LNICWR52_12080(ligB) CWR52_18975(ligA)
EBGFAI37_06155(ligB) FAI37_13035(ligA)
ENDA4308_07640(ligB) A4308_20710(ligA)
ENZG0034_00435(ligB) G0034_16655(ligA)
ENSHWQ15_01355(ligA) HWQ15_08855(ligB)
ENKLOC22_03915(ligA) LOC22_11395(ligB)
EHUD5067_0000570(ligB) D5067_0006710(ligA)
ESAESA_00834 ESA_04079
CSKES15_0059(ligA1) ES15_1101(ligA2)
CSZCSSP291_04080(ligA) CSSP291_18915(ligB)
CSJCSK29544_01010 CSK29544_02043
CCONAFK62_14310(ligA) AFK62_19680(ligB)
CDMAFK67_14710(ligA) AFK67_20295(ligB)
CSIP262_01597 P262_05677
CMJAFK66_000320(ligB) AFK66_005105(ligA)
CUIAFK65_14185(ligA) AFK65_19460(ligB)
CMWAFK63_04090(ligA) AFK63_18860(ligB)
CTUCTU_30080(ligA) CTU_41510(ligB)
KPNKPN_02758(ligA) KPN_03995(yicF)
KPUKP1_4005(ligA) KP1_5350(yicF)
KPMKPHS_38240 KPHS_51610
KPPA79E_0118 A79E_1343
KPHKPNIH24_09530(ligA) KPNIH24_25690(ligB)
KPZKPNIH27_18300(ligA) KPNIH27_24665(ligB)
KPVKPNIH29_19135(ligA) KPNIH29_25550(ligB)
KPWKPNIH30_19335(ligA) KPNIH30_26005(ligB)
KPYKPNIH31_18540(ligA) KPNIH31_25050(ligB)
KPGKPNIH32_19665(ligA) KPNIH32_26870(ligB)
KPCKPNIH10_18675(ligA) KPNIH10_25660(ligB)
KPQKPR0928_18695(ligA) KPR0928_25175(ligB)
KPTVK055_3473(ligB) VK055_4754(ligA)
KPOKPN2242_16850(ligA) KPN2242_23045(ligB)
KPRKPR_0362(ligB) KPR_1952(ligA)
KPJN559_0151 N559_1499
KPID364_14050(ligA) D364_20415
KPAKPNJ1_00119 KPNJ1_01582
KPSKPNJ2_00120 KPNJ2_01553
KPXPMK1_00255(ligA) PMK1_01499(ligB)
KPBFH42_09905(ligA) FH42_16325(ligB)
KPNEKU54_000590(ligB) KU54_007260(ligA)
KPNULI86_00590(ligB) LI86_07265(ligA)
KPNKBN49_0112(ligB) BN49_3968(ligA)
KVAKvar_0106 Kvar_1298
KPEKPK_0101(ligB) KPK_1381(ligA)
KPKA593_04045(ligA) A593_10195(ligB)
KVDKR75_01345(ligA) KR75_07590
KVQSP68_07870(ligA) SP68_14160
KOXKOX_05995(ligB) KOX_26820(ligA)
KOEA225_4273 A225_5669
KOYJ415_03765(ligB) J415_10810(ligA)
KOMHR38_04485(ligB) HR38_24980(ligA)
KMIVW41_00145(ligB) VW41_16230(ligA)
KOKKONIH1_21060(ligA) KONIH1_28525(ligB)
KOCAB185_07880(ligB) AB185_15270(ligA)
KQUAVR78_03855 AVR78_23360(ligA)
EAEEAE_00345(ligA) EAE_06430(ligB)
EARCCG28847 CCG32715
KQVB8P98_00605 B8P98_07920
KLLBJF97_21020(ligA) BJF97_28155
KLWDA718_00715(ligB) DA718_07950(ligA)
KARLGL98_00560(ligB) LGL98_06890(ligA)
KGRJJJ10_00645(ligB) JJJ10_07715(ligA)
RORRORB6_00700(ligA) RORB6_19315(ligB)
RONTE10_01640(ligB) TE10_20750(ligA)
RPLNB1209_06710(ligA)
RAODSD31_00615 DSD31_07015
RTGNCTC13098_00116(ligB) NCTC13098_01858(ligA)
REEelectrica_00098(ligB) electrica_01362(ligA)
CROROD_23701(ligA) ROD_41691
CKOCKO_00382 CKO_05104
CFDCFNIH1_05890(ligB) CFNIH1_23490(ligA)
CBRAA6J81_17715 A6J81_24265(ligA)
CWECO701_05785(ligA) CO701_22575
CYOCD187_07210
CPOTFOB25_11865(ligB) FOB25_18380(ligA)
CFQC2U38_17820(ligA) C2U38_26395
CSEDJY391_00480(ligB) JY391_06945(ligA)
CAMAF384_13395(ligA) F384_19775(ligB)
CAFAL524_02455 AL524_10000(ligA)
CIFAL515_00870 AL515_16600(ligA)
CFARCI104_00470 CI104_18105
CIRC2U53_09215 C2U53_28410(ligA)
CIEAN232_04890 AN232_11635(ligA)
CPARCUC49_12430(ligA) CUC49_18785
CTELGBC03_03865(ligB) GBC03_11915(ligA)
CITZE4Z61_17495(ligB) E4Z61_23680(ligA)
CARSE1B03_19050(ligA) E1B03_25695(ligB)
BFLBfl507(lig)
BPNBPEN_524(ligA)
BVABVAF_507(ligA)
BCHRBCHRO640_539(ligA)
BENBOBLI757_511(ligA)
BEDBTURN675_503(ligA)
BECGN160_02980(ligA)
HDEHDEF_0769(ligA)
SECTA359_05080
SEHCA35E_00023
SENMTRABTM_A_01670(ligA)
RIPRIEPE_0561(ligA)
RIGAOQ88_02100 AOQ88_02350
MENMEPCIT_171(ligA)
MEOMPC_482(ligA)
EBTEBL_c11050(ligA) EBL_c39220(ligB)
CNTJT31_12255(ligB) JT31_18650(ligA)
CEMLH23_05500(ligB) LH23_22280(ligA)
CENLH86_05435(ligB) LH86_20810(ligA)
CLAPNCTC11466_01181(ligA_2) NCTC11466_04573(ligB)
PGELG71_03620(ligB) LG71_11360(ligA)
ESCEntcl_0102 Entcl_1343
KLEAO703_15150(ligA) AO703_20930(ligB)
KSAC813_16010 C813_22470(ligA)
KORAWR26_00440(ligB) AWR26_07215(ligA)
KRDA3780_16730(ligA) A3780_24255(ligB)
KCOBWI95_08335 BWI95_21850(ligA)
KOTEH164_00425(ligB) EH164_06255(ligA)
KPSEIP581_16245(ligA) IP581_22635(ligB)
KIENCTC12125_00295(ligA_1) NCTC12125_03916(ligB)
KASKATP_01170(ligB) KATP_12390(ligA)
ICPICMP_111(ligA)
LAXAPT61_06365(ligA) APT61_21730(ligB)
LEIC2U54_05285 C2U54_21670(ligA)
LEHC3F35_11225 C3F35_18360(ligA)
LEEDVA44_00415 DVA44_06480
LERGNG29_00400(ligB) GNG29_16280(ligA)
LEAGNG26_00395(ligB) GNG26_16125(ligA)
LPNUKQ929_05530(ligA)
LAZA8A57_00595 A8A57_15175(ligA)
LEFLJPFL01_0084 LJPFL01_2981
LEWDAI21_03940 DAI21_11490(ligA)
BUFD8682_15270(ligB) D8682_21955(ligA)
BAGEBADSM9389_11560(ligA) BADSM9389_41260
BFTMNO13_06305(ligA) MNO13_24080(ligB)
SBWTGUWTKB_1700(ligA)
DENMHIR_DE00659(ligA)
HEDTPER_HE00445(ligA)
GEDFVIR_GE00394(ligA)
CMIKPMARG_ME00309(ligA)
PPETC9I82_179
SYMK6K13_17095(ligA)
APINGFK87_00106(ligA)
METYMRY16398_01070(ligB) MRY16398_14760(ligA)
AHNNCTC12129_01411(ligA) NCTC12129_04924(ligB)
YREHEC60_11405(ligA)
SGOEA8O29_001030(ligB) A8O29_006625(ligA)
KINAB182_06345(ligA) AB182_25885(ligB)
PDZHHA33_02710(ligB) HHA33_09305(ligA)
IZHFEM41_05835(ligB) FEM41_22925(ligA)
PTFPROFFT_A_03820(ligA)
PLARGII40_00368(ligA)
SNYKEC38_01000(ligA)
PSHISAMEA2665130_0714(ligA)
PSGCG163CM_02200(ligA) G163CM_36850(ligB)
EBFD782_0078 D782_1240
EBCC2U52_08805 C2U52_16345(ligA)
EBUCUC76_16165 CUC76_22495(ligA)
PSTSE05_25450
EEPGJT83_00205(ligA)
EEMGJT87_00180(ligA)
YPEYPO0041 YPO2989(dnaL)
YPKy0100 y1492(lig)
YPHYPC_0201(ligB) YPC_1396(ligA)
YPAYPA_2178 YPA_3501
YPNYPN_1393 YPN_3809
YPMYP_0042(lig) YP_2614(ligA)
YPPYPDSF_2097 YPDSF_3864
YPGYpAngola_A0046(ligA2) YpAngola_A2744(ligA1)
YPZYPZ3_0038 YPZ3_2633
YPTA1122_04940(ligB) A1122_11030(ligA)
YPDYPD4_0039(ligA2) YPD4_2619
YPXYPD8_0040(ligA2) YPD8_2613
YPWCH59_2135 CH59_3080(ligA)
YPJCH55_3001 CH55_4084(ligA)
YPVBZ15_3527 BZ15_538(ligA)
YPLCH46_2113(ligA) CH46_873
YPSYPTB0038 YPTB2711(ligA)
YPOBZ17_2557 BZ17_3919(ligA)
YPIYpsIP31758_0042(ligA2) YpsIP31758_1321(ligA1)
YPYYPK_1432 YPK_4175
YPBYPTS_0039 YPTS_2811
YPQDJ40_2384 DJ40_3824(ligA)
YPUBZ21_2016(ligA) BZ21_3381
YPRBZ20_2083 BZ20_3490(ligA)
YPCBZ23_2300(ligA) BZ23_3654
YPFBZ19_2083(ligA) BZ19_3488
YENYE0048 YE1211(ligA)
YEPYE105_C0049 YE105_C2899
YEYY11_00781 Y11_29141
YELLC20_05222
YEWCH47_3460 CH47_607(ligA)
YETCH48_412(ligA)
YEFFORC2_1232 FORC2_4049
YEEYE5303_09681(dnaL) YE5303_43071
YSIBF17_08055(ligB) BF17_23090(ligA)
YALAT01_2429 AT01_3644(ligA)
YFRAW19_3205(ligB) AW19_373(ligA)
YINCH53_1829 CH53_521(ligA)
YKRCH54_1291(ligA) CH54_2583
YROCH64_1355(ligA) CH64_2640
YRUBD65_1936 BD65_942(ligA)
YRBUGYR_05300(ligA) UGYR_09985(ligB)
YAKACZ76_03140(ligA) ACZ76_09310(ligB)
YMADA391_06460(ligA) DA391_22690
YHID5F51_00260(ligB) D5F51_15565(ligA)
YCAF0T03_00255(ligB) F0T03_06765(ligA)
YMOHRD69_05145(ligB) HRD69_19130(ligA)
SMARSM39_3055(ligA)
SMACSMDB11_2840(ligA)
SMWSMWW4_v1c35550(ligA)
SPESpro_3444
SRRSerAS9_3635
SRLSOD_c33630(ligA) SOD_c46660(ligB)
SRYM621_18285(ligA) M621_25280
SPLYQ5A_018215(ligA) Q5A_025220(ligB)
SRSSerAS12_3636
SRASerAS13_3637
SSZSCc_315(lig)
SMAFD781_3225 D781_4529
SLQM495_17735(ligA)
SERFL085_10910(ligA)
SERSSERRSCBI_17275(ligA)
SFWWN53_07455(ligB) WN53_26550(ligA)
SFGAV650_03365(ligB) AV650_22635(ligA)
SRZAXX16_0606 AXX16_1845
SERASer39006_002115 Ser39006_007190(ligA)
SERQCWC46_02115 CWC46_07185(ligA)
SERMCLM71_17045(ligA) CLM71_23320
SQUE4343_16530(ligB) E4343_23480(ligA)
SFJSAMEA4384070_3572(ligA)
SOFNCTC11214_01645(ligB) NCTC11214_03223(ligA_1)
SSURATE40_014425(ligA)
SURIJ0X03_06230(ligA)
SRHZFO014_10370(ligB) FO014_17190(ligA)
SENPKHA73_17400(ligA)
SFOZ042_04270(ligA)
RAHRahaq_1110 Rahaq_4368
RACEJHW33_16255(ligB) JHW33_22260(ligA)
RAQRahaq2_1181 Rahaq2_4488
RAAQ7S_05325(ligA) Q7S_22190(ligB)
ROXBV494_00810(ligA) BV494_17045
RVCJ9880_07400(ligB) J9880_13360(ligA)
GQUAWC35_11725(ligB) AWC35_18890(ligA)
FSMCCS41_04920
EAMEGXP68_06085(ligA) GXP68_20920(ligB)
RBADH2866_02095(ligA) H2866_08380(ligB)
ECAECA0043 ECA3583(ligA)
PATREV46_00220(ligB) EV46_17780(ligA)
PATOGZ59_00470 GZ59_36080(ligA)
PCTPC1_3403 PC1_4208
PCCPCC21_000280 PCC21_034070
PCVBCS7_21270(ligB)
PWAPecwa_3562 Pecwa_4491
PPARA8F97_00820(ligA) A8F97_18995
PECW5S_3699 W5S_4673
PWSA7983_02910(ligA) A7983_07980
PPOABJK05_12020(ligA) BJK05_16720
PBRAB5S52_04650(ligA) B5S52_21795
PPUJE2566_17135(ligA) E2566_21350(ligB)
PARII2D83_04815(ligA) I2D83_21800(ligB)
PAQUDMB82_0004425(ligA) DMB82_0020165(ligB)
PVZOA04_00470(ligB) OA04_36720(ligA)
PPAVLOZ86_00930(ligB) LOZ86_04855(ligA)
DDDDda3937_00179(ligA) Dda3937_01130(yicF)
DZEDd1591_0801 Dd1591_4144
DDCDd586_3342 Dd586_4112
DZCW909_16055(ligA) W909_19940
DSOA4U42_04640(ligA) A4U42_08595(ligB)
CEDLH89_12845(ligB) LH89_16990(ligA)
DFNCVE23_17835(ligA) CVE23_22045
DDQDDI_3310 DDI_4191
DAQDAQ1742_00043(ligB) DAQ1742_03569(ligA)
DICDpoa569_000043(ligB) Dpoa569_000771(ligA)
DDADd703_0835 Dd703_3947
BGJAWC36_00555(ligA) AWC36_18155(ligB)
BRBEH207_13610(ligA) EH207_17535(ligB)
BNGEH206_04290(ligA) EH206_22255(ligB)
BIZHC231_04435(ligA) HC231_23190(ligB)
LBQCKQ53_01870 CKQ53_04840
LPOPI6N93_02975(ligA) I6N93_16605(ligB)
SGLSG1678
SODSant_1246(ligA)
PESSOPEG_2942(ligA)
SENYHBA_0146(ligA)
EAMEAMY_0052(ligB) EAMY_2481(lig)
EAYEAM_0046 EAM_2387(ligA)
ETAETA_00440 ETA_11030(lig)
EPYEpC_00450 EpC_11480(lig)
EPREPYR_00047(ligB) EPYR_01224(lig)
EBIEbC_00470 EbC_32700(ligA)
ERJEJP617_12190(ligB) EJP617_35380(ligA)
EGEEM595_0046(ligB) EM595_2602(lig)
EPECI789_02020 CI789_18410
EHDERCIPSTX3056_297(ligA)
ERWIGN242_05730(ligA) GN242_20870(ligB)
ETPLU633_18060(ligA) LU633_24440(ligB)
BUCBU067(lig)
BAPBUAP5A_066(lig)
BAUBUAPTUC7_067(lig)
BAJCCWS_00320
BUACWO_00315
BUPCWQ_00345
BAKBAKON_067(lig)
BUHBUAMB_063(lig)
BAPFBUMPF009_CDS00523(lig)
BAPGBUMPG002_CDS00524(lig)
BAPUBUMPUSDA_CDS00522(lig)
BAPWBUMPW106_CDS00523(lig)
BABbbp_062(lig)
BCCBCc_039(lig)
BAJBCTU_038(lig)
BAPHIX46_00345
WBRlig
WGLWIGMOR_0326(ligA)
PAMPANA_2759(ligA) PANA_3935(yicF)
PLFPANA5342_0115(yicF) PANA5342_1289(ligA)
PAJPAJ_2044(ligA) PAJ_3138(yicF)
PAQPAGR_g0114 PAGR_g1266
PVAPvag_2198(lig) Pvag_3210(yicF)
PAGGAL522_04190 AL522_18065(ligA)
PAOPat9b_2834 Pat9b_3926
KLNLH22_02645(ligB) LH22_08400(ligA)
PANTPSNIH1_00945(ligA)
PANPPSNIH2_03740(ligA)
HHSHHS_05270(ligA)
PCKBMSBPS_0151
PAGCBEE12_01635(ligA) BEE12_06520
PSTWDSJ_18320(ligA)
PALHB1H58_07945 B1H58_13070(ligA)
PANSFCN45_13745(ligA) FCN45_19220(ligB)
PEYEE896_00525(ligB) EE896_05475(ligA)
PDISD8B20_12260(ligA) D8B20_17120(ligB)
PERLAC65_11480(ligA)
PGZC2E15_15390(ligA) C2E15_20940
PCDC2E16_15085(ligA) C2E16_20355
MINTC7M51_02257(ligA) C7M51_03421(ligB)
MTHIC7M52_00601(ligA) C7M52_03627(ligB)
TCIA7K98_14335(ligA) A7K98_20920
TPTYNCTC11468_02683(ligA_3) NCTC11468_03862(ligB_1)
PLUplu0286 plu1398(ligA)
PLUMA4R40_01395 A4R40_06985(ligA)
PAYPAU_00221(yicF) PAU_01408(ligA)
PTTVY86_00630(ligA) VY86_09395
PAKHB0X70_01300 B0X70_07105(ligA)
PLUICE143_01300 CE143_07025
PMRPMI1823(ligA)
PMIBBB2000_1939(ligA)
PVLAOB99_11180(ligA)
PVGCRN77_09705(ligA)
PHAUPH4a_01315(ligA)
PROTBTA34_10865(ligA)
PCOLF1325_12760(ligA)
PCIBF9282_12880(ligA)
PPEEI6G31_15315(ligA)
XBOXBJ1_0236 XBJ1_3119(ligA)
XBVXBW1_0265(ligB) XBW1_1819(ligA)
XNEXNC1_3208(ligA) XNC1_4509(ligB)
XNMXNC2_3087(ligA) XNC2_4358(ligB)
XDOXDD1_2701(ligA) XDD1_3802(ligB)
XPOXPG1_0199(ligB) XPG1_1152(ligA)
XHOA9255_01110(ligA) A9255_16110
XBUHGO23_00980(ligB) HGO23_07180(ligA)
PSIS70_02810(ligA) S70_09015(ligB)
PSXDR96_1377 DR96_3737(ligA)
PSTABGK56_06185(ligA) BGK56_12045
PRGRB151_003190(ligB) RB151_027660(ligA)
PALACO695_03335 CO695_11350(ligA)
PHEINCTC12003_01476(ligA)
PRQCYG50_02265(ligA) CYG50_14660(ligB)
PRJNCTC6933_00358(ligB) NCTC6933_02435(ligA)
PVCG3341_07485(ligA)
MMKMU9_2867
ASYAUT07_00033(ligA)
AENARADI_0525(ligA)
ANSArsFIN_00390(ligB) ArsFIN_29140(ligA)
AEDE3U36_02910(ligA)
AETLDL57_04595(ligA) LDL57_15120(ligB)
MWIMNY66_00930(ligB) MNY66_10220(ligA)
EICNT01EI_1249
ETRETAE_1137(ligA)
ETDETAF_1062
ETEETEE_3087(ligA)
ETCETAC_05460(ligA)
EDWQY76_14545(ligA)
EDLAAZ33_05900(ligA)
EHOA9798_11060(ligA)
HAVAT03_00930 AT03_07235(ligA)
HPARAL518_04450 AL518_18350(ligA)
OPODSM2777_02890 DSM2777_12510(ligA)
LPVHYN51_10725 HYN51_14615(ligA)
PFQQQ39_00840 QQ39_12995(ligA)
PRAGEKN56_00465(ligB) EKN56_16930(ligA)
LRINCTC12151_00060(ligB) NCTC12151_01038(ligA)
HINHI_1100
HITNTHI1265(ligN)
HIPCGSHiEE_06560
HIQCGSHiGG_09150(ligA)
HIFHIBPF_11680(ligA)
HILHICON_01890(ligA)
HIUHIB_12580
HIER2846_1238(lig)
HIZR2866_1300(lig)
HIKHifGL_000763(ligA)
HIAH733_1353
HIHNF38_08610(ligA)
HIWNTHI477_00632(ligA_2)
HICNTHIC486_01693(ligA_2)
HIXNTHI723_00539(ligA_2)
HPRPARA_07920
HDUHD_0830(ligA)
HAYC3V42_05490(ligA)
HPITNCTC13334_00403(ligA)
HHZNCTC10839_00821(ligA_1)
HAEGNCTC8502_01234(ligA)
HPAAE5Q53_00860(ligA)
HSEML3077_03300(ligA)
HAPHAPS_0011(ligA)
HPAZK756_07105(ligA)
HPASJL26_06065(ligA)
HPAKJT17_03575(ligA)
GLECJD39_00370(ligA)
HSOHS_0377(lig)
HSMHSM_0700
PMUPM1716(lig)
PMVPMCN06_2141(ligA)
PULNT08PM_2053
PMPPmu_20610(ligA)
PMULDR93_645(ligA)
PDAG4362423_02037(ligA_2)
PSKYA6B44_07355(ligA)
PATLKGI96_10360(ligA)
PCAIK7G93_001412(ligA)
MSUMS1766(lig)
BSUNA4G13_06160(ligA)
MHTD648_19250(ligA)
MHQD650_6920(ligA)
MHATB824_19240(ligA)
MHXMHH_c27790(ligA2)
MHAEF382_04610(ligA)
MHAMJ450_03610(ligA)
MHAOJ451_04850(ligA)
MHALN220_10735(ligA)
MHAQWC39_03480(ligA)
MHAYVK67_03480(ligA)
MVRX781_18220
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PPROPPC_1946(ligA) PPC_5735(ligA)
PFEPSF113_4026 PSF113_5491(ligB)
PFNHZ99_08415 HZ99_15645
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PTVAA957_16495 AA957_21885
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PVRPverR02_23310 PverR02_29285
PAZOAYR47_04725 AYR47_29730
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PSRPSTAA_1887(ligA) PSTAA_4081(ligB)
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PNNKEM63_05410(ligA)
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PMUYKSS95_10990(ligA)
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AVNAvin_03590 Avin_30290(ligA)
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ACXAchr_25290(ligA) Achr_38150(ligB)
PBBAKN87_03615 AKN87_08475
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SUTRL0B52_01185(ligA)
GAPGAPWK_1913
FPPFPB0191_00841
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SDFACG33_07015(ligA)
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THINCRN91_07995
THOSP60_05820
PSPIPS2015_1781
EOFNARSGI1_02190(ligA)
EORNARRFE1_00610(ligA)
EOPNARPIN1_01780(ligA)
CDIZCEDIAZO_02663(ligA_2)
SADEGFK82_00510(ligA)
RMARmag_0280
REOHUE58_00835
VOKCOSY_0266(lig)
EPSL0Y14_07785(ligA)
EBHBSEPE_0403(ligA)
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REUReut_A1886
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CTIRALTA_A1696(ligA)
CBWRR42_m2409
CGDCR3_1152(ligB)
CPAUEHF44_13125(ligA)
COXE0W60_19985(ligA)
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BMVBMASAVP1_A2062(ligA)
BMLBMA10229_A3249(ligA)
BMNBMA10247_1334(ligA)
BMALDM55_210(ligA)
BMAEDM78_1875(ligA)
BMAQDM76_190(ligA)
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BMAFDM51_1261(ligA)
BMAZBM44_1793(ligA)
BMABBM45_1355(ligA)
BPSBPSL2164(ligA)
BPMBURPS1710b_2588(ligA)
BPLBURPS1106A_2499(ligA)
BPDBURPS668_2442(ligA)
BPRGBP346_A2568(ligA)
BPSEBDL_3383(ligA)
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BPSUBBN_1298(ligA)
BPSDBBX_1784(ligA)
BPZBP1026B_I1232(ligA)
BPQBPC006_I2543
BPKBBK_2799(ligA)
BPSHDR55_2419(ligA)
BPSABBU_3406(ligA)
BPSOX996_2006(ligA)
BUTX994_424(ligA)
BTEBTH_I2022(ligA)
BTQBTQ_1888(ligA)
BTJBTJ_467(ligA)
BTZBTL_1707(ligA)
BTDBTI_1466(ligA)
BTVBTHA_1861(ligA)
BTHEBTN_3061(ligA)
BTHMBTRA_1987(ligA)
BTHADR62_3207(ligA)
BTHLBG87_1931(ligA)
BOKDM82_1748(ligA)
BOCBG90_2972(ligA)
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BSAVWS86_07675(ligA)
BVIBcep1808_1931
BVEAK36_1874(ligA)
BURBcep18194_A5334
BCNBcen_6053
BCHBcen2424_2024
BCMBcenmc03_2044
BCJBCAL2096(ligA)
BCENDM39_2087(ligA)
BCEWDM40_2661(ligA)
BCEOI35_2022(ligA)
BAMBamb_2057
BACBamMC406_1926
BMJBMULJ_01995(ligA)
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BMKDM80_2951(ligA)
BMULNP80_2083(ligA)
BCTGEM_1416
BCEDDM42_3074(ligA)
BCEPAPZ15_15090(ligA)
BDLAK34_1082(ligA)
BPYRABD05_00025(ligA) ABD05_16315(ligA)
BCONNL30_12680(ligA)
BUBBW23_2973(ligA)
BDFWI26_09605(ligA)
BLATWK25_09755(ligA)
BTEIWS51_20460(ligA)
BSEMWJ12_10160(ligA)
BPSLWS57_28675(ligA)
BMECWJ16_10390(ligA)
BSTGWT74_10550(ligA)
BSTLBBJ41_01790(ligA)
BANNJFN94_10200(ligA)
BGLbglu_1g12650
BGUKS03_2230(ligA)
BUGBC1001_2170
BGFBC1003_1283
BGDbgla_1g25730
BGOBM43_3860(ligA)
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BUKMYA_1809
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BGPBGL_1c24660(ligA)
BPLAbpln_1g24290
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BURKDM992_10240(ligA)
BXEBxe_A1676
BXBDR64_3841(ligA)
BPHBphy_1343
BGEBC1002_1778
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BPYBphyt_2461
BUZAYM40_12745(ligA)
BFNOI25_3138(ligA)
BCAIK788_0003772
PSPWBJG93_03555(ligA)
PARABTO02_09765(ligA)
PARBCJU94_12840
PHSC2L64_06560(ligA)
PTERC2L65_06295(ligA)
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PTSCUJ90_10540(ligA)
PCAFDSC91_003785
PMEGFNZ07_24750(ligA)
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PACPFAZ97_06275(ligA)
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PDIOPDMSB3_2601(ligA)
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PVEUC34_11020(ligA)
POXMB84_15400(ligA)
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PFGAB870_21465(ligA)
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PFIBPI93_016640(ligA)
PLGNCTC10937_00438(ligB) NCTC10937_03748(ligA)
HYFDTO96_102317(ligA_3)
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CABASBC2_14430(ligA)
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LIMNHKT17_07880(ligA)
CARIFNU76_22415(ligA)
VTRMYVALT_F_03200(ligA)
VLAGKR41_00434(ligA)
VCVGJV44_00120(ligA)
BPEBP3560(ligA)
BPCBPTD_3507(ligA)
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BPARBN117_3317(ligA)
BPABPP3353(ligA)
BBHBN112_4611(ligA)
BBRBB3804(ligA)
BBMBN115_3476(ligA)
BBXBBS798_3584(ligA)
BPTBpet1706(ligA)
BAVBAV1072(ligA)
BHOD560_2252(ligA)
BHMD558_2231(ligA)
BHZACR54_03353(ligA)
BTRMSAMEA390648702516(dnaL)
BBROBAU06_18630(ligA)
BFZBAU07_07715(ligA)
BPDZBBN53_05705(ligA)
BOHAKI39_17840(ligA)
BGMCAL15_17045(ligA)
BOJCBF45_14000(ligA)
AXYAXYL_01488(ligA)
AXONH44784_005801
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OTROTERR_16820(lig)
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EBAebA6380(lig)
ABREpbN1_39200(ligA)
APETToN1_09570(ligA)
ATWC0099_07905(ligA)
RBHB4966_07495(ligA)
DARDaro_1734
DEYHYN24_08655(ligA)
QAUKI612_12195(ligA)
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AZOazo2001
AOAdqs_2156
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ACOMCEW83_04820
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TMZTmz1t_2190
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TCLTchl_2779
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TAKTharo_2073
AZQG3580_10515(ligA)
ZPAC3497_06795(ligA)
FPHOSHINM1_011400(ligA)
FMYHO273_06905(ligA)
APPCAP2UW1_3629
KCICKCE_0134(ligA)
KCTCDEE_0782
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DVUDVU_1608(ligA)
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SAMESAMCFNEI73_Ch2452(ligA)
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ATUAtu2082
ARAArad_2980(ligA)
ATAAWN88_15415
AGRAGROH133_07396(ligA)
ATFAch5_19700
AVIAvi_2876
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AGTEYD00_08540(ligA)
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REIIE4771_CH03096(ligA)
RLERL3293(ligA)
RLTRleg2_2579
RLGRleg_2840
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RTRRTCIAT899_CH11290(ligA)
RIRBN877_I2158(ligA)
RPUSCFBP5875_08850(ligA)
RHLLPU83_2721(ligA)
RGARGR602_CH02484(ligA)
RHNAMJ98_CH03000(ligA)
RPHAAMC79_CH02998(ligA)
RHXAMK02_CH02930(ligA)
RHVBA939_04905
RHKKim5_CH03046(ligA)
REZAMJ99_CH02999(ligA)
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RHRCKA34_14690
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PLEOOHA_1_04155(ligA)
HDIHDIA_2896(ligA)
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AUAM673_15255
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AALMLUX29_10610(ligA)
AUBLXB15_05330(ligA)
BRND1F64_16470(ligA)
THDBHV28_13120(ligA)
PSINCAK95_01735
NOHG5V57_32080(ligA)
TSOIZ6_21380(ligA)
RBMTEF_06010
PSFPSE_4255
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CCRCC_1522
CCSCCNA_01590(ligA)
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BREVE7T10_08630(ligA)
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BNDKWG56_06635(ligA)
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SILSPO1680(ligA)
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JANJann_2504
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OATOAN307_c23890(ligA)
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OTMOSB_15330(ligA)
OCTFTO60_07330(ligA)
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TGLHFZ77_01730(ligA)
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PALXGQA70_10310(ligA)
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RSHRsph17029_1280
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RCPRCAP_rcc01664(ligA)
RHPLPB142_10065
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BOOE2K80_06605(ligA)
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POZI0K15_19975(ligA)
PALWPSAL_007370(ligA)
PPAFI8N54_08765(ligA)
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SSING7078_02705(ligA)
SSAUH8M03_05965(ligA)
SARIH5J25_16450(ligA)
SCHYGVO57_04755(ligA)
SSUAFPZ54_06430(ligA)
SJPSJA_C1-16330(ligA)
SINBSIDU_06470
SCHSphch_1243
SSYSLG_11790(ligA)
SYBTZ53_15985
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SPHTK426_15660
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SBARH5V43_03135(ligA)
SAMISAMIE_1003820
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CIJWG74_13260
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SFLASPHFLASMR4Y_00600(ligA)
SPHYCHN51_14010
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BFWB5J99_01840
SPZRG5C33_17135(ligA)
PALGHFP57_08950(ligA)
PARJJ4G78_03450(ligA)
PHAOHF685_04320(ligA)
SMICSmB9_29730(ligA)
SPHSETR14_14810(ligA) ETR14_26455(ligA)
SANDH3309_10505(ligA)
POQKZX46_17285(ligA)
AEPAMC99_01361
ALBAEB_P1592
AAYWYH_00258(ligA_1)
AMXAM2010_1405
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ADOA6F68_01935(ligA_2)
TFVIDJ81_12400(ligA)
CNAAB433_11750
CMANA9D14_12715
ERYCP97_07985
EGNBMF35_a1692
EFVCHH26_07315
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GDIGDI3200(ligA)
GDJGdia_3160
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