ORTHOLOGY: K00294 Help Entry K00294                      KO                                      Symbol E1.2.1.88 Name 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase [EC:1.2.1.88] Pathway map00250   Alanine, aspartate and glutamate metabolism map00330   Arginine and proline metabolism map01100   Metabolic pathways Module M00970   Proline degradation, proline => glutamate Reaction R00245   L-glutamate gamma-semialdehyde:NAD+ oxidoreductase R00707   (S)-1-pyrroline-5-carboxylate:NAD+ oxidoreductase R00708   (S)-1-pyrroline-5-carboxylate:NADP+ oxidoreductase R04444   L-1-pyrroline-3-hydroxy-5-carboxylate:NAD+ oxidoreductase R04445   L-1-pyrroline-3-hydroxy-5-carboxylate:NADP+ oxidoreductase R05051   L-erythro-4-hydroxyglutamate:NAD+ oxidoreductase R13148   Disease H00190   Hyperprolinemia Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]  09100 Metabolism   09105 Amino acid metabolism    00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism     K00294  E1.2.1.88; 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase    00330 Arginine and proline metabolism     K00294  E1.2.1.88; 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase Enzymes [BR:ko01000]  1. Oxidoreductases   1.2  Acting on the aldehyde or oxo group of donors    1.2.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor     1.2.1.88  L-glutamate gamma-semialdehyde dehydrogenase      K00294  E1.2.1.88; 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase BRITE hierarchy Other DBs COG:  COG1012 GO:  0003842 Genes HSA:  8659(ALDH4A1) PTR:  456575(ALDH4A1) PPS:  100984082(ALDH4A1) GGO:  101136541(ALDH4A1) PON:  100172770(ALDH4A1) PPYG:  129007292(ALDH4A1) NLE:  100589865(ALDH4A1) HMH:  116813001(ALDH4A1) SSYN:  129472545(ALDH4A1) MCC:  714870(ALDH4A1) MCF:  102116569(ALDH4A1) MTHB:  126955254 MNI:  105483124(ALDH4A1) CSAB:  103225487(ALDH4A1) CATY:  105597650(ALDH4A1) PANU:  101007593(ALDH4A1) TGE:  112622497(ALDH4A1) MLEU:  105548889(ALDH4A1) RRO:  104679838(ALDH4A1) RBB:  108515308(ALDH4A1) TFN:  117093225(ALDH4A1) PTEH:  111547539(ALDH4A1) CANG:  105506026(ALDH4A1) CJC:  100408656(ALDH4A1) SBQ:  101039944(ALDH4A1) CIMI:  108287424(ALDH4A1) ANAN:  105708558(ALDH4A1) CSYR:  103252743(ALDH4A1) MMUR:  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SJAV_09470(pruA) SSHI:  J5U23_01327 SIS:  LS215_0436 SIA:  M1425_0398 SIM:  M1627_0412 SID:  M164_0436 SIY:  YG5714_0396 SIN:  YN1551_2635 SII:  LD85_0429 SIH:  SiH_0990 SIR:  SiRe_0401 SIC:  SiL_0430 SULA:  BFU36_10905 SULE:  GFS03_03195 SAI:  Saci_0166 SACN:  SacN8_00790 SACR:  SacRon12I_00790 SACS:  SUSAZ_00835 SULO:  GFS33_08040 MSE:  Msed_0367 MEMJ:  MJ1HA_0461 MCN:  Mcup_1708 MHK:  DFR87_04215 MPRU:  DFR88_04775 MTEN:  GWK48_07090 MJN:  MjAS7_1039 AMAN:  B6F84_03995 SAZO:  D1868_10820 CSTY:  KN1_14660(rocA) SAHS:  HS7_15850(rocA) TTN:  TTX_1787(putA) VSO:  Vsou_08900 ASC:  ASAC_0743 NIR:  NSED_08130 NID:  NPIRD3C_1020 NIN:  NADRNF5_0546 NUE:  C5F50_03885 NIP:  NsoK4_06780 NZT:  NZOSNM25_000441 NGA:  Ngar_c32570(rocA) NVN:  NVIE_021970(rocA) NEV:  NTE_03539 NCV:  NCAV_1597(rocA) NDV:  NDEV_1224(putC) CSU:  CSUB_C0570 TAH:  SU86_005810 NIU:  DSQ19_00375 CCAI:  NAS2_1167 MIY:  Micr_00007 MARV:  ARM1_0314 LOB:  NEF87_000294 NEF87_002492  » show all TaxonomyUniProt Reference PMID:8621661   Authors Hu CA, Lin WW, Valle D   Title Cloning, characterization, and expression of cDNAs encoding human delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase.   Journal J Biol Chem 271:9795-800 (1996) DOI:10.1074/jbc.271.16.9795   Sequence [hsa:8659] LinkDB All DBs

ORTHOLOGY: K13821 Help Entry K13821                      KO                                      Symbol putA Name RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase [EC:1.5.5.2 1.2.1.88] Pathway map00250   Alanine, aspartate and glutamate metabolism map00330   Arginine and proline metabolism map01100   Metabolic pathways map01110   Biosynthesis of secondary metabolites Module M00970   Proline degradation, proline => glutamate Reaction R00245   L-glutamate gamma-semialdehyde:NAD+ oxidoreductase R00707   (S)-1-pyrroline-5-carboxylate:NAD+ oxidoreductase R00708   (S)-1-pyrroline-5-carboxylate:NADP+ oxidoreductase R01253   L-proline:quinone oxidoreductase R04444   L-1-pyrroline-3-hydroxy-5-carboxylate:NAD+ oxidoreductase R04445   L-1-pyrroline-3-hydroxy-5-carboxylate:NADP+ oxidoreductase R05051   L-erythro-4-hydroxyglutamate:NAD+ oxidoreductase R13148   Brite KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]  09100 Metabolism   09105 Amino acid metabolism    00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism     K13821  putA; RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase    00330 Arginine and proline metabolism     K13821  putA; RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03000 Transcription factors     K13821  putA; RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase Enzymes [BR:ko01000]  1. Oxidoreductases   1.2  Acting on the aldehyde or oxo group of donors    1.2.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor     1.2.1.88  L-glutamate gamma-semialdehyde dehydrogenase      K13821  putA; RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase   1.5  Acting on the CH-NH group of donors    1.5.5  With a quinone or similar compound as acceptor     1.5.5.2  proline dehydrogenase      K13821  putA; RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase Transcription factors [BR:ko03000]  Prokaryotic type   Ribbon-helix-helix    Other families     K13821  putA; RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase BRITE hierarchy Other DBs COG:  COG0506 COG1012 COG4230 GO:  0004657 0003842 Genes ECO:  b1014(putA) ECJ:  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Ple7327_2699 SCS:  Sta7437_2545 STAN:  STA3757_27680(putA) GLT:  GlitD10_0549(putA) GCY:  LQF76_06020(pruA) DTB:  BH720_019450(pruA) CCOT:  CCAX7_13610(putA)  » show all TaxonomyUniProt Reference PMID:22040654   Authors Moxley MA, Tanner JJ, Becker DF   Title Steady-state kinetic mechanism of the proline:ubiquinone oxidoreductase activity of proline utilization A (PutA) from Escherichia coli.   Journal Arch Biochem Biophys 516:113-20 (2011) DOI:10.1016/j.abb.2011.10.011   Sequence [eco:b1014] Reference PMID:18586269   Authors Zhou Y, Larson JD, Bottoms CA, Arturo EC, Henzl MT, Jenkins JL, Nix JC, Becker DF, Tanner JJ   Title Structural basis of the transcriptional regulation of the proline utilization regulon by multifunctional PutA.   Journal J Mol Biol 381:174-88 (2008) DOI:10.1016/j.jmb.2008.05.084   Sequence [eco:b1014] LinkDB All DBs

ENZYME: 1.2.1.88 Help Entry EC 1.2.1.88                 Enzyme                                  Name L-glutamate gamma-semialdehyde dehydrogenase; 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase; Delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase; 1-pyrroline dehydrogenase; pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase; pyrroline-5-carboxylic acid dehydrogenase; L-pyrroline-5-carboxylate-NAD+ oxidoreductase; 1-pyrroline-5-carboxylate:NAD+ oxidoreductase; Delta1-pyrroline-5-carboxylic acid dehydrogenase Class Oxidoreductases; Acting on the aldehyde or oxo group of donors; With NAD+ or NADP+ as acceptor BRITE hierarchy Sysname L-glutamate gamma-semialdehyde:NAD+ oxidoreductase Reaction(IUBMB) L-glutamate 5-semialdehyde + NAD+ + H2O = L-glutamate + NADH + H+ [RN:R00245] Reaction(KEGG) R00245; (other) R00707 R00708 R04444 R04445 R05051 R13148 Reaction Substrate L-glutamate 5-semialdehyde [CPD:C01165]; NAD+ [CPD:C00003]; H2O [CPD:C00001] Product L-glutamate [CPD:C00025]; NADH [CPD:C00004]; H+ [CPD:C00080] Comment This enzyme catalyses the irreversible oxidation of glutamate-gamma-semialdehyde to glutamate as part of the proline degradation pathway. (S)-1-pyrroline-5-carboxylate, the product of the first enzyme of the pathway (EC 1.5.5.2, proline dehydrogenase) is in spontaneous equilibrium with its tautomer L-glutamate gamma-semialdehyde. In many bacterial species, both activities are carried out by a single bifunctional enzyme [3,4].The enzyme can also oxidize other 1-pyrrolines, e.g. 3-hydroxy-1-pyrroline-5-carboxylate is converted into 4-hydroxyglutamate and (R)-1-pyrroline-5-carboxylate is converted into D-glutamate. NADP+ can also act as acceptor, but with lower activity [5]. History EC 1.2.1.88 created 1972 as EC 1.5.1.12, modified 2008, transferred 2013 to EC 1.2.1.88 Pathway ec00250   Alanine, aspartate and glutamate metabolism ec00330   Arginine and proline metabolism ec01100   Metabolic pathways Orthology K00294   1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase K13821   RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase Genes HSA:  8659(ALDH4A1) PTR:  456575(ALDH4A1) PPS:  100984082(ALDH4A1) GGO:  101136541(ALDH4A1) PON:  100172770(ALDH4A1) PPYG:  129007292(ALDH4A1) NLE:  100589865(ALDH4A1) HMH:  116813001(ALDH4A1) SSYN:  129472545(ALDH4A1) MCC:  714870(ALDH4A1) MCF:  102116569(ALDH4A1) MTHB:  126955254 MNI:  105483124(ALDH4A1) CSAB:  103225487(ALDH4A1) CATY:  105597650(ALDH4A1) PANU:  101007593(ALDH4A1) TGE:  112622497(ALDH4A1) MLEU:  105548889(ALDH4A1) RRO:  104679838(ALDH4A1) RBB:  108515308(ALDH4A1) TFN:  117093225(ALDH4A1) PTEH:  111547539(ALDH4A1) CANG:  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L3I90_05670(pruA) AFLO:  HEQ12_02165(pruA) STOQ:  K2F26_05085(pruA) SKV:  NIES73_43060 RCS:  NIES932_01950 OCF:  WJM97_17780(pruA) TOQ:  HCG51_31365(pruA) TTQ:  NIES37_20790 TOI:  HG267_07080(pruA) TOZ:  HGR01_11295(pruA) ALAX:  NIES50_65830 SCYT:  SAMD_64760 SCYS:  NIES4073_16690 BSEN:  DP114_16170(pruA) BOX:  DP113_16105(pruA) NCN:  BZZ01_08310 CTHE:  Chro_5229 PLP:  Ple7327_2699 SCS:  Sta7437_2545 STAN:  STA3757_27680(putA) GLT:  GlitD10_0549(putA) GCY:  LQF76_06020(pruA) DTB:  BH720_019450(pruA) RRS:  RoseRS_1548 RCA:  Rcas_2305 CAU:  Caur_1794 CHL:  Chy400_1941 CAG:  Cagg_3333 HAU:  Haur_4731 CALL:  OZ401_001547 OZ401_001710(pruA) TTR:  Tter_0870 ATM:  ANT_02040 ABAT:  CFX1CAM_0256(rocA) PSUB:  Pelsub_P0544 LEK:  hrd7_00280(rocA) CAP:  CLDAP_20900 PBF:  CFX0092_A0613(rocA) KBS:  EPA93_21145(pruA) KBB:  ccbrp13_58550 CCZ:  CCALI_00130 FGI:  OP10G_1184 CCOT:  CCAX7_13610(putA) VAB:  WPS_19900(putC) DRA:  DR_0813 DR_A0030 DGE:  Dgeo_0850 Dgeo_1174 DDR:  Deide_13670 Deide_13850 DMR:  Deima_1366 Deima_1986 DPT:  Deipr_1835 DGO:  DGo_CA1424(rocA) DGo_CA2361 DPD:  Deipe_2789 Deipe_3650 DSW:  QR90_11670 QR90_11740 DCH:  SY84_01255 SY84_02595 DAB:  AUC44_06630 AUC44_07395 DPU:  SU48_09425 SU48_09475 DEZ:  DKM44_06165(pruA) DKM44_08565 DWU:  DVJ83_07220(pruA) DVJ83_14215 DFC:  DFI_07875 DFI_09315 DEIN:  DAAJ005_08690(pruA) DAAJ005_08780 DGA:  DEGR_15270 DEGR_18580 DPH:  EHF33_00525(pruA) DRD:  LMT64_10435(pruA) DRB:  N0D28_10925 N0D28_11675(pruA) DAH:  DAETH_07520 DAETH_16430 DAQU:  M8445_11710(pruA) M8445_12155 DTAE:  LAJ19_04830(pruA) LAJ19_05300 DMB:  E5F05_13965 E5F05_16380(pruA) DSC:  ABOD76_14000(pruA) ABOD76_17450 DEID:  HLB42_11440 HLB42_11510(pruA) TRA:  Trad_1881 TTH:  TT_C1213 TTJ:  TTHA1578(TTHA1578) TTS:  Ththe16_1596 TTL:  TtJL18_0467 TSC:  TSC_c22660 THC:  TCCBUS3UF1_4410 TOS:  Theos_1562 TAQ:  TO73_2030 TBC:  A0O31_01431 TANT:  KNN15_02895(pruA) MRB:  Mrub_2639 MRE:  K649_09340 MTAI:  Mtai_v1c22460 MSV:  Mesil_3126 OPR:  Ocepr_2044 MHD:  Marky_2140 CPOR:  BED41_01765 TLI:  Tlie_1889 ARAM:  KAR29_00350(pruA) KAR29_11580(pruA) APRP:  KIH16_00350(pruA) KIH16_11640(pruA) TLE:  Tlet_1448 TME:  Tmel_0014 TFE:  JYK00_00015(pruA) FNO:  Fnod_1641 FPE:  Ferpe_1995 FIA:  NA23_10000(pruA) FRR:  IB67_00405 FNG:  JM64_07230 FGW:  QO060_00410(pruA) FTHL:  U0O82_03710(pruA) OCY:  OSSY52_04910(pruA) PMO:  Pmob_0275 MAEO:  JRV97_10825(pruA) DTN:  DTL3_0456 KOL:  Kole_1012 KPF:  IX53_06155 MPG:  Theba_2157 MINF:  MESINF_0752(rocA) ASAC:  ATHSA_1514 NBN:  HYY55_03935 THEM:  FPV09_07280(pruA) MAQE:  RJ40_01450 MFK:  E2N92_13130 MOU:  OU421_05655 MESB:  L1S32_08990 HAHS:  HSRCO_0522(putA) HALX:  M0R89_21220 HAXY:  NGM07_02410 SAIM:  K0C01_00170 HLM:  DV707_07440 HLA:  Hlac_3373 HAH:  Halar_1051 TAC:  Ta0603 TVO:  TVG0647983(TVG0647983) OMR:  OXIME_000515 PTO:  PTO1261 CDIV:  CPM_1334 MEUZ:  KRP56_01295 APE:  APE_0807.1 ACJ:  ACAM_0568 SJV:  SJAV_09470(pruA) SSHI:  J5U23_01327 SIS:  LS215_0436 SIA:  M1425_0398 SIM:  M1627_0412 SID:  M164_0436 SIY:  YG5714_0396 SIN:  YN1551_2635 SII:  LD85_0429 SIH:  SiH_0990 SIR:  SiRe_0401 SIC:  SiL_0430 SULA:  BFU36_10905 SULE:  GFS03_03195 SAI:  Saci_0166 SACN:  SacN8_00790 SACR:  SacRon12I_00790 SACS:  SUSAZ_00835 SULO:  GFS33_08040 MSE:  Msed_0367 MEMJ:  MJ1HA_0461 MCN:  Mcup_1708 MHK:  DFR87_04215 MPRU:  DFR88_04775 MTEN:  GWK48_07090 MJN:  MjAS7_1039 AMAN:  B6F84_03995 SAZO:  D1868_10820 CSTY:  KN1_14660(rocA) SAHS:  HS7_15850(rocA) TTN:  TTX_1787(putA) VSO:  Vsou_08900 ASC:  ASAC_0743 NIR:  NSED_08130 NID:  NPIRD3C_1020 NIN:  NADRNF5_0546 NUE:  C5F50_03885 NIP:  NsoK4_06780 NZT:  NZOSNM25_000441 NGA:  Ngar_c32570(rocA) NVN:  NVIE_021970(rocA) NEV:  NTE_03539 NCV:  NCAV_1597(rocA) NDV:  NDEV_1224(putC) CSU:  CSUB_C0570 TAH:  SU86_005810 NIU:  DSQ19_00375 CCAI:  NAS2_1167 MIY:  Micr_00007 MARV:  ARM1_0314 LOB:  NEF87_000294 NEF87_002492  » show all Taxonomy Reference 1  [PMID:13681370]   Authors ADAMS E, GOLDSTONE A.   Title Hydroxyproline metabolism. IV. Enzymatic synthesis of gamma-hydroxyglutamate from Delta 1-pyrroline-3-hydroxy-5-carboxylate.   Journal J Biol Chem 235:3504-12 (1960) Reference 2   Authors Strecker HJ.   Title The interconversion of glutamic acid and proline. III. Delta1-Pyrroline-5-carboxylic acid dehydrogenase.   Journal J Biol Chem 235:3218-3223 (1960) Reference 3  [PMID:12223682]   Authors Forlani G, Scainelli D, Nielsen E.   Title [delta]1-Pyrroline-5-Carboxylate Dehydrogenase from Cultured Cells of Potato (Purification and Properties).   Journal Plant Physiol 113:1413-1418 (1997) DOI:10.1104/pp.113.4.1413 Reference 4  [PMID:1618807]   Authors Brown ED, Wood JM.   Title Redesigned purification yields a fully functional PutA protein dimer from Escherichia coli.   Journal J Biol Chem 267:13086-92 (1992) Reference 5  [PMID:17554163]   Authors Inagaki E, Ohshima N, Sakamoto K, Babayeva ND, Kato H, Yokoyama S, Tahirov TH.   Title New insights into the binding mode of coenzymes: structure of Thermus thermophilus Delta1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase complexed with NADP+.   Journal Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 63:462-5 (2007) DOI:10.1107/S1744309107021422 Other DBs ExplorEnz - The Enzyme Database:  1.2.1.88 IUBMB Enzyme Nomenclature:  1.2.1.88 ExPASy - ENZYME nomenclature database:  1.2.1.88 BRENDA, the Enzyme Database:  1.2.1.88 CAS:  9054-82-4 LinkDB All DBs

REACTION: R04444 Help Entry R04444                      Reaction                                Name L-1-pyrroline-3-hydroxy-5-carboxylate:NAD+ oxidoreductase Definition L-1-Pyrroline-3-hydroxy-5-carboxylate + NAD+ + 2 H2O <=> L-erythro-4-Hydroxyglutamate + NADH + H+ Equation C04281 + C00003 + 2 C00001 <=> C05947 + C00004 + C00080 Comment possibly two-step reaction (R04443+R05051) NADPH (see R04445) Reaction class RC00001   C00003_C00004 RC00255   C04281_C05947 Enzyme 1.2.1.88 Pathway rn00330   Arginine and proline metabolism rn01100   Metabolic pathways Brite Enzymatic reactions [BR:br08201]  1. Oxidoreductase reactions   1.2  Acting on the aldehyde or oxo group of donors    1.2.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor     1.2.1.88      R04444  L-1-Pyrroline-3-hydroxy-5-carboxylate + NAD+ + 2 H2O <=> L-erythro-4-Hydroxyglutamate + NADH + H+ BRITE hierarchy Orthology K00294   1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase [EC:1.2.1.88] K13821   RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase [EC:1.5.5.2 1.2.1.88] Other DBs RHEA:  31158 LinkDB All DBs

REACTION: R04445 Help Entry R04445                      Reaction                                Name L-1-pyrroline-3-hydroxy-5-carboxylate:NADP+ oxidoreductase Definition L-1-Pyrroline-3-hydroxy-5-carboxylate + NADP+ + 2 H2O <=> L-erythro-4-Hydroxyglutamate + NADPH + H+ Equation C04281 + C00006 + 2 C00001 <=> C05947 + C00005 + C00080 Comment possibly two-step reaction NADH (see R04444) Reaction class RC00001   C00005_C00006 RC00255   C04281_C05947 Enzyme 1.2.1.88 Pathway rn00330   Arginine and proline metabolism rn01100   Metabolic pathways Brite Enzymatic reactions [BR:br08201]  1. Oxidoreductase reactions   1.2  Acting on the aldehyde or oxo group of donors    1.2.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor     1.2.1.88      R04445  L-1-Pyrroline-3-hydroxy-5-carboxylate + NADP+ + 2 H2O <=> L-erythro-4-Hydroxyglutamate + NADPH + H+ BRITE hierarchy Orthology K00294   1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase [EC:1.2.1.88] K13821   RHH-type transcriptional regulator, proline utilization regulon repressor / proline dehydrogenase / delta 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase [EC:1.5.5.2 1.2.1.88] Other DBs RHEA:  24946 LinkDB All DBs

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