KEGG   ORTHOLOGY: K01941
Entry
K01941                      KO                                     
Symbol
E6.3.4.6
Name
urea carboxylase [EC:6.3.4.6]
Pathway
map00220  Arginine biosynthesis
map00791  Atrazine degradation
map01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
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   00220 Arginine biosynthesis
    K01941  E6.3.4.6; urea carboxylase
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   00791 Atrazine degradation
    K01941  E6.3.4.6; urea carboxylase
Enzymes [BR:ko01000]
 6. Ligases
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    6.3.4.6  urea carboxylase
     K01941  E6.3.4.6; urea carboxylase
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GBR: Gbro_3888
GPO: GPOL_c37390
GOR: KTR9_3823
GTA: BCM27_20050
GRU: GCWB2_19605(kipA2)
GOM: D7316_04836(kipA_2)
GAV: C5O27_08515
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GJI: H1R19_05050 H1R19_18455
GOI: LK459_15190
TPR: Tpau_1594
TSM: ASU32_04290 ASU32_08590
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KRS: EQG70_16920
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CCEU: CBR64_03770
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HJE: HacjB3_02225
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NVR: FEJ81_05735
HLR: HALLA_20730
NBG: DV706_20150
NAS: GCU68_20990
AG: BAD16654
 » show all
Reference
PMID:15090492
  Authors
Kanamori T, Kanou N, Atomi H, Imanaka T
  Title
Enzymatic characterization of a prokaryotic urea carboxylase.
  Journal
J Bacteriol 186:2532-9 (2004)
DOI:10.1128/JB.186.9.2532-2539.2004
  Sequence
[ag:BAD16654]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K14541
Entry
K14541                      KO                                     
Symbol
DUR1
Name
urea carboxylase / allophanate hydrolase [EC:6.3.4.6 3.5.1.54]
Pathway
map00220  Arginine biosynthesis
map00791  Atrazine degradation
map01100  Metabolic pathways
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09105 Amino acid metabolism
   00220 Arginine biosynthesis
    K14541  DUR1; urea carboxylase / allophanate hydrolase
  09111 Xenobiotics biodegradation and metabolism
   00791 Atrazine degradation
    K14541  DUR1; urea carboxylase / allophanate hydrolase
Enzymes [BR:ko01000]
 3. Hydrolases
  3.5  Acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds
   3.5.1  In linear amides
    3.5.1.54  allophanate hydrolase
     K14541  DUR1; urea carboxylase / allophanate hydrolase
 6. Ligases
  6.3  Forming carbon-nitrogen bonds
   6.3.4  Other carbon-nitrogen ligases
    6.3.4.6  urea carboxylase
     K14541  DUR1; urea carboxylase / allophanate hydrolase
Other DBs
RN: R00005 R00774
COG: COG0154 COG0439 COG1984
GO: 0004847 0004039
Genes
SCE: YBR208C(DUR12)
AGO: AGOS_ADR051C
ERC: Ecym_1184
KLA: KLLA0_E08119g
KMX: KLMA_40362(DUR1)
LTH: KLTH0E12078g
VPO: Kpol_299p2
ZRO: ZYRO0F08976g
CGR: CAGL0M05533g
NCS: NCAS_0B02280(NCAS0B02280)
NDI: NDAI_0C05400(NDAI0C05400)
TPF: TPHA_0L01560(TPHA0L01560)
TDL: TDEL_0B03290(TDEL0B03290)
TGB: HG536_0D01270
ZMK: HG535_0A07880
PPA: PAS_chr4_0173
DHA: DEHA2D07040g
PIC: PICST_28452(DUR1)
SPAA: SPAPADRAFT_48105
LEL: LELG_01799
CAL: CAALFM_C104660WA(DUR1)
CTP: CTRG_04692
COT: CORT_0B06740
CDU: CD36_04410
CTEN: CANTEDRAFT_94782
YLI: YALI0E07271g YALI0E35156g
CLU: CLUG_00442
CLUS: A9F13_08g02497
CAUR: CJI97_002001
SLB: AWJ20_5191(DUR1)
PKZ: C5L36_0B06440
BNN: FOA43_000511(DUR1)
BBRX: BRETT_003123(DUR1)
FGR: FGSG_10913
FPU: FPSE_01375
FVR: FVEG_11593
FOX: FOXG_12848
NHE: NECHADRAFT_79968
PLJ: VFPFJ_02005
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CFJ: CFIO01_04268
ELA: UCREL1_11217
PFY: PFICI_00808
NPA: UCRNP2_1608
SMIN: v1.2.013193.t1(symbB.v1.2.013193.t1) v1.2.013193.t2(symbB.v1.2.013193.t2)
 » show all
Reference
PMID:3025621
  Authors
Genbauffe FS, Cooper TG
  Title
Induction and repression of the urea amidolyase gene in Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
Mol Cell Biol 6:3954-64 (1986)
DOI:10.1128/MCB.6.11.3954
Reference
PMID:1802034
  Authors
Genbauffe FS, Cooper TG
  Title
The urea amidolyase (DUR1,2) gene of Saccharomyces cerevisiae.
  Journal
DNA Seq 2:19-32 (1991)
DOI:10.3109/10425179109008435
  Sequence
[sce:YBR208C]
LinkDB

KEGG   ENZYME: 6.3.4.6
Entry
EC 6.3.4.6                  Enzyme                                 
Name
urea carboxylase;
urease (ATP-hydrolysing);
urea carboxylase (hydrolysing);
ATP---urea amidolyase;
urea amidolyase;
UALase;
UCA
Class
Ligases;
Forming carbon-nitrogen bonds;
Other carbon-nitrogen ligases
Sysname
urea:carbon-dioxide ligase (ADP-forming)
Reaction(IUBMB)
ATP + urea + HCO3- = ADP + phosphate + urea-1-carboxylate [RN:R00774]
Reaction(KEGG)
R00774
Substrate
ATP [CPD:C00002];
urea [CPD:C00086];
HCO3- [CPD:C00288]
Product
ADP [CPD:C00008];
phosphate [CPD:C00009];
urea-1-carboxylate [CPD:C01010]
Comment
A biotinyl-protein. The yeast enzyme (but not that from green algae) also catalyses the reaction of EC 3.5.1.54 allophanate hydrolase, thus bringing about the hydrolysis of urea to CO2 and NH3. Previously also listed as EC 3.5.1.45. The enzyme from the prokaryotic bacterium Oleomonas sagaranensis can also use acetamide and formamide as substrates [4].
History
EC 6.3.4.6 created 1972, modified 1986 (EC 3.5.1.45 created 1978, incorporated 1986)
Pathway
ec00220  Arginine biosynthesis
ec00791  Atrazine degradation
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K01941  urea carboxylase
K14541  urea carboxylase / allophanate hydrolase
Genes
EPA: 110248952
ATEN: 116302264
CRE: CHLRE_08g360050v5
VCN: VOLCADRAFT_98356
MNG: MNEG_1218
CSL: COCSUDRAFT_19857
CVR: CHLNCDRAFT_133810
SCE: YBR208C(DUR12)
AGO: AGOS_ADR051C
ERC: Ecym_1184
KLA: KLLA0_E08119g
KMX: KLMA_40362(DUR1)
LTH: KLTH0E12078g
VPO: Kpol_299p2
ZRO: ZYRO0F08976g
CGR: CAGL0M05533g
NCS: NCAS_0B02280(NCAS0B02280)
NDI: NDAI_0C05400(NDAI0C05400)
TPF: TPHA_0L01560(TPHA0L01560)
TDL: TDEL_0B03290(TDEL0B03290)
TGB: HG536_0D01270
ZMK: HG535_0A07880
PPA: PAS_chr4_0173
DHA: DEHA2D07040g
PIC: PICST_28452(DUR1)
PGU: PGUG_04496
SPAA: SPAPADRAFT_48105
LEL: LELG_01799
CAL: CAALFM_C104660WA(DUR1)
CTP: CTRG_04692
COT: CORT_0B06740
CDU: CD36_04410
CTEN: CANTEDRAFT_121521 CANTEDRAFT_94782
YLI: YALI0E07271g YALI0E35156g
CLU: CLUG_00442
CLUS: A9F13_08g02497
CAUR: CJI97_002001
SLB: AWJ20_5191(DUR1)
PKZ: C5L36_0A05680 C5L36_0B06440
BNN: FOA43_000511(DUR1)
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FPU: FPSE_01375
FVR: FVEG_04571 FVEG_11593
FOX: FOXG_07646 FOXG_12848
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MAW: MAC_09102
MAJ: MAA_09279
CMT: CCM_01972
PLJ: VFPFJ_01943 VFPFJ_02005
VAL: VDBG_05273
VDA: VDAG_06924
CFJ: CFIO01_04268 CFIO01_12769
ELA: UCREL1_11217
PFY: PFICI_00100 PFICI_00808
PSCO: LY89DRAFT_625418
ANI: AN0887.2
AFM: AFUA_1G15520
ACT: ACLA_019830
NFI: NFIA_009890
AOR: AO090005001159
ANG: ANI_1_1870014(An01g13810)
APUU: APUU_50920A
PCS: Pc20g09590
TMF: PMAA_052430
PBL: PAAG_02163
PBN: PADG_00734
PNO: SNOG_02186
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Reference
1
  Authors
Roon, R.J. and Levenberg, B.
  Title
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  Journal
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  Authors
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  Journal
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  Journal
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  Journal
J Bacteriol 186:2532-9 (2004)
DOI:10.1128/JB.186.9.2532-2539.2004
  Sequence
[ag:BAD16654]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 6.3.4.6
IUBMB Enzyme Nomenclature: 6.3.4.6
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 6.3.4.6
BRENDA, the Enzyme Database: 6.3.4.6
CAS: 9058-98-4
LinkDB

KEGG   REACTION: R00774
Entry
R00774                      Reaction                               
Name
Urea:carbon-dioxide ligase (ADP-forming)
Definition
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Equation
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Reaction class
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Enzyme
6.3.4.6
Pathway
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Orthology
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K14541  urea carboxylase / allophanate hydrolase [EC:6.3.4.6 3.5.1.54]
Other DBs
RHEA: 20899
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system