KEGG   ORTHOLOGY: K01958
Entry
K01958                      KO                                     

Name
PC, pyc
Definition
pyruvate carboxylase [EC:6.4.1.1]
Pathway
ko00020  Citrate cycle (TCA cycle)
ko00620  Pyruvate metabolism
ko00720  Carbon fixation pathways in prokaryotes
ko01100  Metabolic pathways
ko01120  Microbial metabolism in diverse environments
ko01200  Carbon metabolism
ko01230  Biosynthesis of amino acids
Module
M00173  Reductive citrate cycle (Arnon-Buchanan cycle)
Disease
H00073  Pyruvate carboxylase deficiency
H01400  Secondary hyperammonemia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00020 Citrate cycle (TCA cycle)
    K01958  PC, pyc; pyruvate carboxylase
   00620 Pyruvate metabolism
    K01958  PC, pyc; pyruvate carboxylase
  09102 Energy metabolism
   00720 Carbon fixation pathways in prokaryotes
    K01958  PC, pyc; pyruvate carboxylase
Enzymes [BR:ko01000]
 6. Ligases
  6.4  Forming carbon-carbon bonds
   6.4.1  Ligases that form carbon-carbon bonds (only sub-subclass identified to date)
    6.4.1.1  pyruvate carboxylase
     K01958  PC, pyc; pyruvate carboxylase
Other DBs
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Genes
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GTR: GLOTRDRAFT_75067
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Reference
PMID:8048912
  Authors
MacKay N, Rigat B, Douglas C, Chen HS, Robinson BH
  Title
cDNA cloning of human kidney pyruvate carboxylase.
  Journal
Biochem Biophys Res Commun 202:1009-14 (1994)
DOI:10.1006/bbrc.1994.2029
  Sequence
[hsa:5091]
Reference
  Authors
Jitrapakdee S, St Maurice M, Rayment I, Cleland WW, Wallace JC, Attwood PV
  Title
Structure, mechanism and regulation of pyruvate carboxylase.
  Journal
Biochem J 413:369-87 (2008)
DOI:10.1042/BJ20080709
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K01959
Entry
K01959                      KO                                     

Name
pycA
Definition
pyruvate carboxylase subunit A [EC:6.4.1.1]
Pathway
ko00020  Citrate cycle (TCA cycle)
ko00620  Pyruvate metabolism
ko00720  Carbon fixation pathways in prokaryotes
ko01100  Metabolic pathways
ko01120  Microbial metabolism in diverse environments
ko01200  Carbon metabolism
ko01230  Biosynthesis of amino acids
Module
M00173  Reductive citrate cycle (Arnon-Buchanan cycle)
M00620  Incomplete reductive citrate cycle, acetyl-CoA => oxoglutarate
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00020 Citrate cycle (TCA cycle)
    K01959  pycA; pyruvate carboxylase subunit A
   00620 Pyruvate metabolism
    K01959  pycA; pyruvate carboxylase subunit A
  09102 Energy metabolism
   00720 Carbon fixation pathways in prokaryotes
    K01959  pycA; pyruvate carboxylase subunit A
Enzymes [BR:ko01000]
 6. Ligases
  6.4  Forming carbon-carbon bonds
   6.4.1  Ligases that form carbon-carbon bonds (only sub-subclass identified to date)
    6.4.1.1  pyruvate carboxylase
     K01959  pycA; pyruvate carboxylase subunit A
Other DBs
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Genes
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PAEI: N296_5622(accC)
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PAEM: U769_29865
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AFG: AFULGI_00002060
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AST: Asulf_02063
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THF: MA03_00880
LOKI: Lokiarch_39620(pycA)
 » show all
Reference
  Authors
Lai H, Kraszewski JL, Purwantini E, Mukhopadhyay B
  Title
Identification of pyruvate carboxylase genes in Pseudomonas aeruginosa PAO1 and development of a P. aeruginosa-based overexpression system for alpha4- and alpha4beta4-type pyruvate carboxylases.
  Journal
Appl Environ Microbiol 72:7785-92 (2006)
DOI:10.1128/AEM.01564-06
  Sequence
[pae:PA5436]
Reference
  Authors
Mukhopadhyay B, Patel VJ, Wolfe RS
  Title
A stable archaeal pyruvate carboxylase from the hyperthermophile Methanococcus jannaschii.
  Journal
Arch Microbiol 174:406-14 (2000)
DOI:10.1007/s002030000225
  Sequence
[mja:MJ_1229]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K01960
Entry
K01960                      KO                                     

Name
pycB
Definition
pyruvate carboxylase subunit B [EC:6.4.1.1]
Pathway
ko00020  Citrate cycle (TCA cycle)
ko00620  Pyruvate metabolism
ko00720  Carbon fixation pathways in prokaryotes
ko01100  Metabolic pathways
ko01120  Microbial metabolism in diverse environments
ko01200  Carbon metabolism
ko01230  Biosynthesis of amino acids
Module
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M00620  Incomplete reductive citrate cycle, acetyl-CoA => oxoglutarate
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00020 Citrate cycle (TCA cycle)
    K01960  pycB; pyruvate carboxylase subunit B
   00620 Pyruvate metabolism
    K01960  pycB; pyruvate carboxylase subunit B
  09102 Energy metabolism
   00720 Carbon fixation pathways in prokaryotes
    K01960  pycB; pyruvate carboxylase subunit B
Enzymes [BR:ko01000]
 6. Ligases
  6.4  Forming carbon-carbon bonds
   6.4.1  Ligases that form carbon-carbon bonds (only sub-subclass identified to date)
    6.4.1.1  pyruvate carboxylase
     K01960  pycB; pyruvate carboxylase subunit B
Other DBs
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COG: COG0511 COG5016
GO: 0004736
Genes
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PAEI: N296_5621(oadA)
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PAEC: M802_5619(oadA)
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PPSE: BN5_4309(oadA)
PFUW: KF707C_56370
PALC: A0T30_01435
PCQ: PcP3B5_02760(cfiA)
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DSA: Desal_0778
DHY: DESAM_20125
DPS: DP0686
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Reference
  Authors
Lai H, Kraszewski JL, Purwantini E, Mukhopadhyay B
  Title
Identification of pyruvate carboxylase genes in Pseudomonas aeruginosa PAO1 and development of a P. aeruginosa-based overexpression system for alpha4- and alpha4beta4-type pyruvate carboxylases.
  Journal
Appl Environ Microbiol 72:7785-92 (2006)
DOI:10.1128/AEM.01564-06
  Sequence
[pae:PA5435]
Reference
  Authors
Mukhopadhyay B, Patel VJ, Wolfe RS
  Title
A stable archaeal pyruvate carboxylase from the hyperthermophile Methanococcus jannaschii.
  Journal
Arch Microbiol 174:406-14 (2000)
DOI:10.1007/s002030000225
  Sequence
[mja:MJ_1231]
LinkDB

KEGG   ENZYME: 6.4.1.1
Entry
EC 6.4.1.1                  Enzyme                                 

Name
pyruvate carboxylase;
pyruvic carboxylase
Class
Ligases;
Forming carbon-carbon bonds;
Ligases that form carbon-carbon bonds (only sub-subclass identified to date)
Sysname
pyruvate:carbon-dioxide ligase (ADP-forming)
Reaction(IUBMB)
ATP + pyruvate + HCO3- = ADP + phosphate + oxaloacetate [RN:R00344]
Reaction(KEGG)
R00344
Substrate
ATP [CPD:C00002];
pyruvate [CPD:C00022];
HCO3- [CPD:C00288]
Product
ADP [CPD:C00008];
phosphate [CPD:C00009];
oxaloacetate [CPD:C00036]
Comment
A biotinyl-protein containing manganese (animal tissues) or zinc (yeast). The animal enzyme requires acetyl-CoA.
History
EC 6.4.1.1 created 1961
Pathway
ec00020  Citrate cycle (TCA cycle)
ec00620  Pyruvate metabolism
ec00720  Carbon fixation pathways in prokaryotes
ec01100  Metabolic pathways
ec01120  Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K01958  pyruvate carboxylase
K01959  pyruvate carboxylase subunit A
K01960  pyruvate carboxylase subunit B
Genes
HSA: 5091(PC)
PTR: 451356(PC)
PPS: 100980137(PC)
GGO: 101124777(PC)
PON: 100431540(PC)
NLE: 115834777(PC)
MCC: 713103(PC)
MCF: 102146568(PC)
CSAB: 103219837(PC)
CATY: 105577372(PC)
RRO: 104664756(PC)
RBB: 108518689(PC)
TFN: 117081547(PC)
CJC: 100401792(PC)
SBQ: 101036608(PC)
MMUR: 105867491(PC)
MMU: 18563(Pcx)
MCAL: 110285247(Pc)
MPAH: 110322171(Pc)
RNO: 25104(Pc)
MCOC: 116103338(Pc)
MUN: 110556500(Pc)
CGE: 100758970(Pc)
PLEU: 114685980 114709141
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OCU: 103346574(PC)
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PBA: PSEBR_a5592 PSEBR_a5593
PBC: CD58_29505 CD58_29510
PPUU: PputUW4_05383(pycB) PputUW4_05384(pycA)
PDR: H681_24670 H681_24675
PSV: PVLB_25325 PVLB_25330
PSK: U771_31395 U771_31400
PKC: PKB_0169(cfiB) PKB_0170(pycB)
PCH: EY04_29890 EY04_29895
PCZ: PCL1606_00610 PCL1606_00620
PCP: JM49_00570 JM49_00575
PFZ: AV641_22540 AV641_22545
PLQ: AA042_10655 AA042_10660
PALK: PSAKL28_52110 PSAKL28_52120
PRH: LT40_16545 LT40_16550
PSW: LK03_05755 LK03_05760
PPV: NJ69_19350 NJ69_19355
PSES: PSCI_1832 PSCI_1833
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PSOS: POS17_6118 POS17_6119
PKR: AYO71_00390 AYO71_00395
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PANR: A7J50_5805 A7J50_5806
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PSED: DM292_17870(oadA)
PKE: DLD99_28630(oadA) DLD99_28635
PALL: UYA_23950 UYA_23955
PUM: HGP31_21190(oadA) HGP31_21195
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PGY: AWU82_06750 AWU82_06755(oadA)
PLAL: FXN65_27490(oadA) FXN65_27495
PSEJ: HNQ25_02200 HNQ25_02205(oadA)
PVK: EPZ47_29585(oadA) EPZ47_29590
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PKH: JLK41_24585(oadA) JLK41_24590
PTY: JWV26_09400(oadA) JWV26_09405
PMAO: PMYSY11_4431(pycB) PMYSY11_4432(accC)
PATA: JWU58_00925 JWU58_00930(oadA)
PDW: BV82_2238(oadA) BV82_2239
AVN: Avin_02050(pycA) Avin_02060(pycB)
AVL: AvCA_02050(pycA) AvCA_02060(pycB)
AVD: AvCA6_02050(pycA) AvCA6_02060(pycB)
ACX: Achr_2030(pycA) Achr_2040(pycB)
PAGR: E2H98_18765
EMO: DM558_15145 DM558_15150(oadA)
ASEI: I8T81_08530
SDK: KHX94_11945 KHX94_11950(oadA)
MHC: MARHY2617(accC) MARHY2618(oadA)
MAD: HP15_3934 HP15_3935(pycB)
MBS: MRBBS_2714(cfiB) MRBBS_2715(pycB)
MSR: AU15_20485
MPQ: ABA45_12830 ABA45_12835
MARI: ACP86_10415 ACP86_10420
MARA: D0851_13690 D0851_13695(oadA)
MARJ: MARI_03700(cfiA) MARI_03710(cfiB)
HMI: soil367_08995(oadA) soil367_09000
SPOI: IMCC21906_01785 IMCC21906_01786
ZAL: AZF00_11690 AZF00_11695
LPN: lpg0466 lpg2664
LPO: LPO_0532(dcoA) LPO_2943(accC)
LPU: LPE509_00366 LPE509_02757
LPM: LP6_0457 LP6_2696
LPF: lpl0507(dcoA) lpl2591
LPP: lpp0531(dcoA) lpp2718
LPC: LPC_0475(accC) LPC_2878(dcoA)
LPA: lpa_00712 lpa_03896(accC)
LPE: lp12_0469 lp12_2657
LFA: LFA_0408(cfiB) LFA_2657(pycB)
LHA: LHA_0572(pycB) LHA_2961(accC)
LOK: Loa_00519(accC) Loa_00778(pycB)
LCD: clem_01600(cfiB) clem_12125(cfiA)
LLG: 44548918_00443(cfiA) 44548918_02476(accC_2)
LIB: E4T55_05540(oadA) E4T55_09700
LJR: NCTC11533_00441(cfiA) NCTC11533_02631(accC_2)
LWA: SAMEA4504053_0768(cfiA) SAMEA4504053_3168(accC_2)
LSS: NCTC12082_01813(accC_1) NCTC12082_02647(cfiA)
TMC: LMI_0266(accC) LMI_0806(pycB)
MDN: JT25_007875 JT25_007880
MDH: AYM39_19220 AYM39_19225
MKO: MKLM6_3889 MKLM6_3890
METL: U737_02020(oadA) U737_02025
MAH: MEALZ_2339(accC) MEALZ_2340(oadA)
MBUR: EQU24_05845(oadA) EQU24_05850
MEIN: methR_P1353 methR_P1354
MISZ: MishRS11D_08090 MishRS11D_08100
MEJ: Q7A_1446(accC) Q7A_1447(oadA)
MEC: Q7C_2078 Q7C_2079
THIS: HZT40_06605
TUN: J9260_05255
NHL: Nhal_2089 Nhal_2090
NWR: E3U44_14635 E3U44_14640(oadA)
ALV: Alvin_1668 Alvin_1669
ATEP: Atep_17960 Atep_17970
TVI: Thivi_0050 Thivi_0052
TMB: Thimo_1967 Thimo_1968
MPUR: MARPU_11480 MARPU_11485
TEE: Tel_09495 Tel_09500
TSY: THSYN_19970 THSYN_19975
TTP: E6P07_06335(oadA) E6P07_06340
THIP: N838_32650
CJAP: GWK36_06805 GWK36_06810(oadA)
THIM: KFB96_23175 KFB96_23185(oadA)
HHA: Hhal_0402
HHK: HH1059_19800(pycA)
HHC: M911_09600 M911_09605
EBS: ECTOBSL9_2867 ECTOBSL9_2868
TGR: Tgr7_1915 Tgr7_1916
TKM: TK90_1605 TK90_1606
TNI: TVNIR_1370(oadA_[H]) TVNIR_1371
TTI: THITH_07660 THITH_07665
TVR: TVD_08555 TVD_08560
APRS: BI364_08465 BI364_08470
WOC: BA177_11415
GAI: IMCC3135_13170(cfiB)
TTC: FOKN1_1828 FOKN1_1830
HCH: HCH_06704(oadA2) HCH_06705(accC2)
HAHE: ENC22_29375(oadA) ENC22_29380
CSA: Csal_1555 Csal_1556
HEL: HELO_2206
HCO: LOKO_01266(cfiB)
HSI: BOX17_13900
HALO: BWR19_07735 BWR19_07740
HAF: C8233_06890(oadA) C8233_06895
HCAM: I4484_13155
HAA: A5892_08205
CMAI: BFX80_12960 BFX80_12965
MMW: Mmwyl1_3925 Mmwyl1_3926
MARD: IBG28_02980 IBG28_02985(oadA)
MFOI: JSY38_12265 JSY38_12270(oadA)
TOL: TOL_3175 TOL_3176
TOR: R615_14925 R615_14930
OAI: OLEAN_C15090 OLEAN_C15100
MARS: A8C75_02420 A8C75_02425
BSAN: CHH28_06670(accC) CHH28_06675(oadA)
BMAR: HF888_01990 HF888_01995(oadA)
OME: OLMES_5310 OLMES_5311
TAU: Tola_1847 Tola_1848
FPP: FPB0191_00860
SOK: D0B54_12310
SINI: GT972_00550
GBI: PG2T_04565
SLIM: SCL_1363 SCL_1364
SVA: SVA_1884 SVA_1885
ACII: C4901_08795(oadA) C4901_08800
TBN: TBH_C1641 TBH_C1642
PSPI: PS2015_1024 PS2015_1025
REV: HUE57_11865(oadA) HUE57_11870
ENM: EBS_1371 EBS_1372(pycA)
PSE: NH8B_2214
CFON: HZU75_03135
RPJ: N234_29240 N234_30500
REH: H16_A1251(pyc)
CNC: CNE_1c12350(pyc1) CNE_BB1p09460(pyc1) CNE_BB1p09790(pyc2)
CUH: BJN34_06470
REU: Reut_B4717
RME: Rmet_1638(pyc)
CTI: RALTA_A1205
CBW: RR42_s0887 RR42_s0997
CCUP: BKK81_27245
CUP: BKK80_29070
CUU: BKK79_35025
COX: E0W60_16400
BUR: Bcep18194_C7328
BCEN: DM39_6434(pyc)
BCEW: DM40_5500(pyc)
BAM: Bamb_5754
BAC: BamMC406_5521
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BPSL: WS57_17045
BSTG: WT74_17570
BSTL: BBJ41_38100
BPX: BUPH_08182
PLG: NCTC10937_05220(cfiA) NCTC10937_05221(cfiB)
LMIR: NCTC12852_01160(cfiB)
BPAR: BN117_0570
BPA: BPP0604
BBH: BN112_2829
BBR: BB0610
BBM: BN115_0583
BBX: BBS798_0584
CSER: CCO03_05880
HYL: LPB072_08045
HYC: E5678_13360
OFO: BRW83_0353(cfiB)
NOK: FAY22_17820
SUTK: FG381_12165
SWS: I6J16_01180
RGE: RGE_21240(pyc)
RBN: RBXJA2T_17067
NIT: NAL212_1105 NAL212_1106
NII: Nit79A3_0623 Nit79A3_0624
NUR: ATY38_08390 ATY38_08395
DOE: DENOEST_1261(pyc)
TBD: Tbd_1555 Tbd_1556
MFA: Mfla_1511 Mfla_1512
MMB: Mmol_1149 Mmol_1150
MEH: M301_1330 M301_1331
MEI: Msip34_1392 Msip34_1393
MEP: MPQ_1465 MPQ_1466
MBAC: BN1209_0868(pycB) BN1209_0869(accC)
MBAT: BN1208_0780(pycB) BN1208_0781(cfiB)
MEU: ACJ67_07270 ACJ67_07275
MPAU: ZMTM_13120 ZMTM_13130
SDR: SCD_n01539 SCD_n01540
SULF: CAP31_08030 CAP31_08035
SPLB: SFPGR_22780 SFPGR_22790
SNIV: SFSGTM_18340 SFSGTM_18350(oadA)
SLAC: SKTS_19810 SKTS_19820
APET: ToN1_42570(pyc)
ARES: IWH25_08465
RBU: PG1C_01085
AZA: AZKH_p0179 AZKH_p0651
AZI: AzCIB_1176
ACOM: CEW83_08325
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AZQ: G3580_00230
THK: CCZ27_07435
DDZ: DSYM_18210
HHE: HH_1686(pycB) HH_1849
HCP: HCN_0952 HCN_1089(pycB)
HCB: HCBAA847_0885(pycB) HCBAA847_1014
HTY: BN2458_PEG0775 BN2458_PEG1057
HAD: CDV25_02905(oadA) CDV25_08560(accC)
HET: BBW65_01990 BBW65_07220
HCL: NCTC13205_00131(pycB) NCTC13205_00774(cfiB)
HWI: A0Z60_02225(oadA) A0Z60_02240
WSU: WS0565 WS1289(PYCA)
TDN: Suden_0622 Suden_1259
SUA: Saut_1375 Saut_1402
SULN: FJR47_05800
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SPAL: FM071_06520 FM071_06585
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SKU: Sulku_0513 Sulku_1608
SULR: B649_02565 B649_04090
CJE: Cj0933c(pycB) Cj1037c(pycA)
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CJJ: CJJ81176_0940 CJJ81176_1056(accC-1)
CJU: C8J_0870 C8J_0974(pycA)
CJN: ICDCCJ07001_885 ICDCCJ07001_999
CJI: CJSA_0878(pycB) CJSA_0980(pycA)
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CJQ: UC78_0887(cfiA) UC78_0994(cfiB)
CJL: PJ17_04505 PJ17_05330
CJW: PJ18_04580 PJ18_05135
CJR: CJE1011 CJE1181(accC-1)
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CJX: BN867_09190 BN867_10260
CFF: CFF8240_0676 CFF8240_1293
CFT: CFF04554_0685(pycA) CFF04554_1319(pycB)
CFV: CFVI03293_0644(pycA) CFVI03293_1343(pycB)
CFX: CFV97608_0695(pycA) CFV97608_1443(pycB)
CFZ: CSG_14410 CSG_6760
CAMP: CFT03427_0667(pycA) CFT03427_1267(pycB)
CFP: CR44_03395 CR44_06405
CCV: CCV52592_0748(pycA) CCV52592_0964(pycB)
CHA: CHAB381_0801 CHAB381_1620
CCO: CCC13826_1508(pycB) CCC13826_1812(pycA)
CCOC: CCON33237_0148(pycA) CCON33237_0494(pycB)
CLA: CLA_0587(pycA) CLA_1197(pycB)
CLR: UPTC16701_0587(pycA) UPTC16701_1176(pycB)
CLM: UPTC16712_0593(pycA) UPTC16712_1208(pycB)
CLQ: UPTC4110_0596(pycA) UPTC4110_1184(pycB)
CLN: UPTC3659_0623(pycA) UPTC3659_1426(pycB)
CLL: CONCH_0594(pycA) CONCH_1157(pycB)
CCOL: BN865_10940 BN865_11630
CCC: G157_03790 G157_04125
CCQ: N149_0906 N149_0972
CCF: YSQ_03835 YSQ_04560
CCY: YSS_04930 YSS_05610
CCOI: YSU_03865 YSU_04210
CCOF: VC76_04700(cfiA) VC76_05045(cfiB)
CCOO: ATE51_01546(cfiB) ATE51_01684(cfiA)
CAJ: CIG1485E_0963(pycA) CIG1485E_1317(pycB)
CIS: CINS_0508(pycA) CINS_1159(pycB)
CVO: CVOL_0524(pycA) CVOL_1174(pycB)
CPEL: CPEL_0541(pycA) CPEL_1312(pycB)
CAMR: CAQ16704_0621(pycA) CAQ16704_1219(pycB)
CSM: CSUB8521_0624(pycA) CSUB8521_1378(pycB)
CSF: CSUB8523_0612(pycA) CSUB8523_1479(pycB)
CGRA: CGRAC_0124(pycB) CGRAC_1247(pycA)
CURE: CUREO_0320(pycB) CUREO_0756(pycA)
CHYO: CHH_0851(pycA)
CHV: CHELV3228_1406(pycB) CHELV3228_1436(pycA)
CSPF: CSF_0784(pycB) CSF_1247(pycA)
CPIN: CPIN18020_1009(oadA) CPIN18020_1303(pycA)
CCUN: CCUN_0911(pycB) CCUN_1252(pycA)
CLX: CLAN_1036(pycA) CLAN_1120(pycB)
CAVI: CAV_0791(pycB) CAV_1013(pycA)
CHW: A2J15_001775 A2J15_002225
CAMZ: CVIC12175_0988(pycA) CVIC12175_1078(pycB)
CAMY: CSUIS_0506(pycB) CSUIS_1114(pycA)
COJ: CORN_0609(pycA) CORN_1269(pycB)
CUX: CUP3940_0490(pycA) CUP3940_0520(pycB)
CRX: CRECT_0496(pycB) CRECT_1424(pycA)
CGEO: CGEO_0554(pycB) CGEO_0896(pycA)
CBLA: CBLAS_0485(oadA)
CCOR: CCORG_0479(pycB) CCORG_0733(pycA)
CARM: CARM_0593(pycA) CARM_1224(pycB)
CMUC: CMCT_0599(pycB) CMCT_1701(pycA)
CSHO: CSHOW_0570(pycB) CSHOW_1022(pycA)
ABU: Abu_0176(pycB1) Abu_0605(accC2) Abu_1226(pycB2)
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