KEGG   ORTHOLOGY: K03049
Entry
K03049                      KO                                     

Name
rpoE1
Definition
DNA-directed RNA polymerase subunit E' [EC:2.7.7.6]
Pathway
ko03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
Other DBs
COG: COG1095
GO: 0003899
Genes
COO: CCU_27490
MJA: MJ_0397
MFE: Mefer_0872
MVU: Metvu_1471
MFS: MFS40622_0922
MIF: Metin_1061
MJH: JH146_1443
MIG: Metig_1030
MMP: MMP0440
MMQ: MmarC5_1197
MMD: GYY_02275
MMAK: MMKA1_04610(rpoE1)
MMAO: MMOS7_04560(rpoE1)
MMAD: MMJJ_05910(rnr)
MAE: Maeo_0280
MVO: Mvol_0001
MTH: MTH_264
MMG: MTBMA_c07140(rpoE1)
METC: MTCT_0227
MWO: MWSIV6_0680(rpoE1)
METE: tca_00244(rps1)
METK: FVF72_00980(rpoE)
MTHM: FZP57_03260(rpoE)
MST: Msp_0624(rpoE1)
MRU: mru_1482(rpoE1)
MSI: Msm_0197
MEB: Abm4_0717(rpoE1)
MMIL: sm9_0849(rpoE1)
MEYE: TL18_06070
MOL: YLM1_0982
METH: MBMB1_1382(rpoE1)
MFC: BRM9_0608(rpoE1)
MCUB: MCBB_1625(rpoE1)
METT: CIT01_10260(rpoE)
MFV: Mfer_0442
MKA: MK1451(rpoE1)
AFU: AF_1117
FPL: Ferp_2225
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GAH: GAH_01871
PFU: PF0256
PFI: PFC_00335
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PAB: PAB1105(rpoE1)
PYN: PNA2_0899
PYS: Py04_0407
TKO: TK1699
TON: TON_1913
TGA: TGAM_0499(rpoE1)
TSI: TSIB_0026
THE: GQS_05625
THA: TAM4_1013
THM: CL1_0758
TLT: OCC_01494
THS: TES1_1962
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TEU: TEU_03965
PPAC: PAP_00790
MBAR: MSBR2_2626
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MTHR: MSTHT_2420
MTHE: MSTHC_0862
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MBU: Mbur_2280(rpoE1)
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MTP: Mthe_1321
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MHI: Mhar_1911
MHU: Mhun_2863
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MBG: BN140_1418(rpoE1)
MEMA: MMAB1_1820(rpoE)
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MBN: Mboo_0245
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MPD: MCP_0352(rpoE1)
MEZ: Mtc_0059(rpoE-1)
RCI: RCIX2017(rpoE)
HAL: VNG_2053G(rpoE')
HSL: OE_3874R(rpoE1)
HHB: Hhub_3348(rpoE1)
HALH: HTSR_1915(rpoE1)
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HSU: HLASF_1985(rpoE1)
HSF: HLASA_1971(rpoE1)
HMA: rrnAC2829(rpoE')
HHI: HAH_0108(rpoE')
NPH: NP_5080A(rpoE1)
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HTI: HTIA_2042
HMU: Hmuk_0728
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HWA: HQ_1337A(rpoE1)
HWC: Hqrw_1398(rpoE1)
HVO: HVO_1899(rpoE1)
HME: HFX_1990(rpoE1)
HLA: Hlac_2396
HDF: AArcSl_0226(rpoE1)
HTU: Htur_3454
NMG: Nmag_1488(rpoE)
NAT: NJ7G_2521
SALI: L593_13895
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TVO: TVG0469653(TVG0469653)
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IIS: EYM_05605
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SSO: SSO0415(rpoE1)
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MIY: Micr_00944(rpoE1_2)
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PSYT: DSAG12_03409(rpoE1)
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Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K03050
Entry
K03050                      KO                                     

Name
rpoE2
Definition
DNA-directed RNA polymerase subunit E" [EC:2.7.7.6]
Pathway
ko03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03050  rpoE2; DNA-directed RNA polymerase subunit E"
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03050  rpoE2; DNA-directed RNA polymerase subunit E"
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03050  rpoE2; DNA-directed RNA polymerase subunit E"
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03050  rpoE2; DNA-directed RNA polymerase subunit E"
Other DBs
COG: COG2093
GO: 0003899
Genes
LUO: HHL09_16850 HHL09_17395
MJA: MJ_0396
MFE: Mefer_0873
MVU: Metvu_1472
MFS: MFS40622_0923
MIF: Metin_1062
MJH: JH146_1442
MIG: Metig_1029
MMP: MMP0441(rpoE2)
MMQ: MmarC5_1196
MMD: GYY_02280
MMAK: MMKA1_04620(rpoE2)
MMAO: MMOS7_04570(rpoE2)
MMAD: MMJJ_05900
MAE: Maeo_0281
MVO: Mvol_0002
MTH: MTH_265
MMG: MTBMA_c07150(rpoE2)
METC: MTCT_0228
MWO: MWSIV6_0681(spt4)
METE: tca_00245
MST: Msp_0623(rpoE2)
MRU: mru_1481(rpoE2)
MSI: Msm_0196
MEB: Abm4_0718(rpoE2)
MMIL: sm9_0850(rpoE2)
MEYE: TL18_06065
MOL: YLM1_0981
METH: MBMB1_1383
MFC: BRM9_0609(rpoE2)
MCUB: MCBB_1626(spt4)
MFV: Mfer_0441
MKA: MK1452(rpoE2)
AFU: AF_1116
FPL: Ferp_2226
GAC: GACE_0914
GAH: GAH_01872
PFU: PF0255
PFI: PFC_00330
PAB: PAB7428(rpoE2)
PYN: PNA2_0898
PYS: Py04_0406
TKO: TK1698
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TLT: OCC_01499
THS: TES1_1963
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TEU: TEU_03970
PPAC: PAP_00785
MBAR: MSBR2_2627
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MAC: MA_3693(rpoE2)
MMA: MM_0597
MMAC: MSMAC_0713
METM: MSMTP_0913
MTHR: MSTHT_2419
MTHE: MSTHC_0863
MHOR: MSHOH_0827
MBU: Mbur_2281(rpoE2)
MMET: MCMEM_0430
MMH: Mmah_0491
MPY: Mpsy_0972
MTP: Mthe_1322
MCJ: MCON_3185(rpoE2)
MHI: Mhar_1912
MHU: Mhun_2864
MLA: Mlab_0657
MBG: BN140_1417(rpoE2)
MEMA: MMAB1_1819
MPI: Mpet_0092
MBN: Mboo_0244
MPL: Mpal_0602
MPD: MCP_2674(rpoE2)
MEZ: Mtc_0180(rpoE-2)
RCI: RCIX624(rpoE2)
HAL: VNG_2051G(rpoE'')
HSL: OE_3872R(spt4)
HHB: Hhub_3347(spt4)
HALH: HTSR_1916(rpoE2)
HHSR: HSR6_1985(rpoE2)
HSU: HLASF_1984(rpoE2)
HSF: HLASA_1970(rpoE2)
HMA: rrnAC2830(rpoE'')
HHI: HAH_0109(rpoE'')
NPH: NP_5078A(spt4)
NMO: Nmlp_1555(spt4)
HUT: Huta_2206
HTI: HTIA_2043
HMU: Hmuk_0727
HALL: LC1Hm_3239(rpoE2)
HWA: HQ_1338A(spt4)
HWC: Hqrw_1399(spt4)
HVO: HVO_1898(spt4)
HME: HFX_1989(rpoE2)
HLA: Hlac_2395
HDF: AArcSl_0227(rpoE2)
HTU: Htur_3455
NMG: Nmag_1489(spt4)
NAT: NJ7G_2520
SALI: L593_13900
TAC: Ta1090
TVO: TVG0469462(TVG0469462)
PTO: PTO0867
FAI: FAD_0460
CDIV: CPM_1267
MEAR: Mpt1_c03730(spt4)
MARC: AR505_1373
ABI: Aboo_0567
APE: APE_0256a.1(rpoE2)
ACJ: ACAM_0195(rpoE2)
SMR: Smar_0834
IHO: Igni_0083
IIS: EYM_05600
DKA: DKAM_1344
TAG: Tagg_1374
IAG: Igag_1103
HBU: Hbut_0438
STO: STK_03785(spt4)
SSO: SSO5798(rpoE2)
SOL: Ssol_1392
SSOA: SULA_1438
SSOL: SULB_1439
SSOF: SULC_1437
SAI: Saci_0835
SID: M164_1736
SII: LD85_1946
SIH: SiH_1664
SIR: SiRe_1585
SIC: SiL_1577
MSE: Msed_2240
STEP: IC006_1510
PAI: PAE3563
PIS: Pisl_0921
PCL: Pcal_1991
PAS: Pars_2230
PYR: P186_0692
POG: Pogu_2633
TNE: Tneu_0898
CMA: Cmaq_0717
TTN: TTX_0606(Spt4)
TUZ: TUZN_0246
VDI: Vdis_0416
VMO: VMUT_1128
TPE: Tpen_0414
ASC: ASAC_1119
ACIA: SE86_06735
NMR: Nmar_1236
NID: NPIRD3C_0875(spt)
NIN: NADRNF5_0707(spt)
NCT: NMSP_0439(spt4)
NGA: Ngar_c18430(rpoE``)
NVN: NVIE_003750(rpoE'')
NEV: NTE_01704
NFN: NFRAN_2360(spt)
NCV: NCAV_0853(spt)
NBV: T478_0493
NDV: NDEV_1219(spt)
CCAI: NAS2_0369
KCR: Kcr_1338
BARC: AOA65_1089(spt4)
BARB: AOA66_1284(spt4)
NEQ: NEQ231
NAA: Nps_02860
MARH: Mia14_0093
MIY: Micr_00945(spt4_2)
LOKI: Lokiarch_06360(spt4_1) Lokiarch_41990(spt4_2)
PSYT: DSAG12_03410(spt4)
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Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006
Reference
  Authors
Hirtreiter A, Damsma GE, Cheung AC, Klose D, Grohmann D, Vojnic E, Martin AC, Cramer P, Werner F
  Title
Spt4/5 stimulates transcription elongation through the RNA polymerase clamp coiled-coil motif.
  Journal
Nucleic Acids Res 38:4040-51 (2010)
DOI:10.1093/nar/gkq135
  Sequence
[mja:MJ_0396]
Reference
  Authors
Klein BJ, Bose D, Baker KJ, Yusoff ZM, Zhang X, Murakami KS
  Title
RNA polymerase and transcription elongation factor Spt4/5 complex structure.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 108:546-50 (2011)
DOI:10.1073/pnas.1013828108
  Sequence
[pfu:PF0255]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system