KEGG   ORTHOLOGY: K12235
Entry
K12235                      KO                                     
Symbol
SRR
Name
serine racemase [EC:5.1.1.18]
Pathway
map00260  Glycine, serine and threonine metabolism
map00470  D-Amino acid metabolism
map01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09105 Amino acid metabolism
   00260 Glycine, serine and threonine metabolism
    K12235  SRR; serine racemase
  09106 Metabolism of other amino acids
   00470 D-Amino acid metabolism
    K12235  SRR; serine racemase
Enzymes [BR:ko01000]
 5. Isomerases
  5.1  Racemases and epimerases
   5.1.1  Acting on amino acids and derivatives
    5.1.1.18  serine racemase
     K12235  SRR; serine racemase
Other DBs
RN: R00589
GO: 0030378
Genes
HSA: 63826(SRR)
PTR: 747543(SRR)
PPS: 100984215(SRR)
GGO: 101140746(SRR)
PON: 100461570(SRR)
NLE: 100587573(SRR)
MCC: 703426(SRR)
MCF: 101865191(SRR)
CSAB: 103242132(SRR)
CATY: 105584078(SRR)
PANU: 101022060(SRR)
TGE: 112609773(SRR)
RRO: 104682021(SRR)
RBB: 108526307(SRR)
TFN: 117067936(SRR)
PTEH: 111521383(SRR)
CJC: 100393154(SRR)
CSYR: 103260572(SRR)
MMUR: 105857923(SRR)
OGA: 100953083(SRR)
MMU: 27364(Srr)
MCAL: 110304703(Srr)
MPAH: 110331444(Srr)
RNO: 303306(Srr)
MCOC: 116079048(Srr)
MUN: 110551469(Srr)
CGE: 100765356(Srr)
PLEU: 114691421(Srr)
NGI: 103730526(Srr)
HGL: 101701179(Srr)
CPOC: 100715409(Srr)
CCAN: 109697151(Srr)
DORD: 105985803(Srr)
DSP: 122100463(Srr)
OCU: 100355322(SRR)
OPI: 101530558(SRR)
TUP: 102497953(SRR)
CFA: 119863918(SRR)
VLG: 121472971(SRR)
AML: 100480745(SRR)
UMR: 103667152(SRR)
UAH: 113269141(SRR)
UAR: 123777176(SRR)
ELK: 111151250
LLV: 125087825
MPUF: 101673355(SRR)
ORO: 101366494(SRR)
EJU: 114213859(SRR)
ZCA: 113939199(SRR)
MLX: 118025204(SRR)
FCA: 101098904(SRR)
PYU: 121017333(SRR)
PBG: 122485105(SRR)
PTG: 102953178(SRR)
PPAD: 109255129(SRR)
AJU: 106983203(SRR)
HHV: 120245165(SRR)
BTA: 525340(SRR)
BOM: 102268037(SRR)
BIU: 109573620(SRR)
BBUB: 102389655(SRR)
CHX: 102180962(SRR)
OAS: 101118200
ODA: 120866658(SRR)
CCAD: 122447534(SRR)
SSC: 110256074(SRR)
CFR: 106729647(SRR)
CBAI: 105071500(SRR)
CDK: 105094392(SRR)
VPC: 102544894(SRR)
BACU: 103019746(SRR)
LVE: 103080390(SRR)
OOR: 101278882(SRR)
DLE: 111185868(SRR)
PCAD: 102980146(SRR)
PSIU: 116745184(SRR)
ECB: 100060209(SRR)
EPZ: 103554993(SRR)
EAI: 106821980(SRR)
MYB: 106723919(SRR)
MYD: 107183817(SRR)
MMYO: 118671925(SRR)
MLF: 102434001(SRR)
MNA: 107535626(SRR)
PKL: 118702524(SRR)
HAI: 109386874(SRR)
DRO: 112308496(SRR)
SHON: 119003790(SRR)
AJM: 119040672(SRR)
PDIC: 114502285(SRR)
PHAS: 123817016(SRR)
MMF: 118634415(SRR)
RFQ: 117013259(SRR)
PALE: 102891663(SRR)
PGIG: 120621062(SRR)
PVP: 105291843(SRR)
RAY: 107507707(SRR)
MJV: 108391804(SRR)
TOD: 119230655(SRR)
SARA: 101541158(SRR)
LAV: 100666282(SRR)
TMU: 101360579
DNM: 101413561(SRR)
MDO: 100018989(SRR)
GAS: 123244465(SRR)
SHR: 100929336(SRR)
PCW: 110222116(SRR)
OAA: 100078533(SRR)
GGA: 771635(SRR)
PCOC: 116228072(SRR)
MGP: 100542246(SRR)
CJO: 107322475(SRR)
NMEL: 110407583(SRR)
ACYG: 106049175(SRR)
TGU: 100219482(SRR)
LSR: 110482046(SRR)
SCAN: 103820216(SRR)
PMOA: 120507657(SRR)
OTC: 121345868(SRR)
PRUF: 121361584(SRR)
GFR: 102036315(SRR)
FAB: 101806575(SRR)
PHI: 102113320(SRR)
PMAJ: 107212772(SRR)
CCAE: 111937754(SRR)
CCW: 104691063(SRR)
ETL: 114060431(SRR)
ZAB: 102068903(SRR)
FPG: 101916779(SRR)
FCH: 102046432(SRR)
CLV: 102089987(SRR)
EGZ: 104131835(SRR)
NNI: 104012792(SRR)
ACUN: 113487188(SRR)
TALA: 104361793(SRR)
PADL: 103925570
ACHC: 115347427(SRR)
AAM: 106484318(SRR)
AROW: 112960730(SRR)
NPD: 112954685(SRR)
DNE: 112986372(SRR)
ASN: 106723485(SRR)
GGN: 109293179(SRR)
PSS: 102452370(SRR)
CMY: 102942154(SRR)
CPIC: 101942835(SRR)
TST: 117867724(SRR)
CABI: 116829463(SRR)
MRV: 120387501(SRR)
XLA: 108707966(srr.L)
XTR: 100144980(srr)
NPR: 108787564(SRR)
RTEM: 120927584(SRR)
BBUF: 120994777(SRR)
BGAR: 122930469(SRR)
LCM: 102360714(SRR)
RTP: 109920226(srr)
CIN: 100178889
PVM: 113817416
PJA: 122265738
PTRU: 123509500
HAZT: 108676607
EAF: 111695357
CEL: CELE_T01H8.2(T01H8.2)
BMY: BM_BM5490(Bm5490)
PCAN: 112561897
BGT: 106054191
MYI: 110450642
OBI: 106876719
OSN: 115214389
NVE: 5503411
ATEN: 116304113
AMIL: 114957515
PDAM: 113667992
SPIS: 111336225
XEN: 124433793
AQU: 100633547
ATH: AT4G11640(SR)
ALY: 9310772
CRB: 17884431
BRP: 103853518
BOE: 106322763
RSZ: 108821628
THJ: 104806384
CIT: 102614630
PVY: 116136922
MINC: 123203952
TCC: 18606504
GRA: 105765212
GAB: 108482877
DZI: 111306375
EGR: 104441764
GMX: 100799758
GSJ: 114413364
VRA: 106765813
VAR: 108346969
VUN: 114176096
CCAJ: 109800959
APRC: 113855383
CAM: 101488331
LJA: Lj0g3v0226429.1(Lj0g3v0226429.1) Lj0g3v0226429.2(Lj0g3v0226429.2) Lj0g3v0353159.1(Lj0g3v0353159.1) Lj4g3v2951170.1(Lj4g3v2951170.1) Lj4g3v2951170.2(Lj4g3v2951170.2)
ADU: 107479977
AIP: 107630810
LANG: 109332166
FVE: 101295227
RCN: 112175491
PPER: 18776715
PMUM: 103337476
PDUL: 117628115
MDM: 103429307
ZJU: 107429891
MNT: 21407049
CMO: 103482734
BHJ: 120067688
MCHA: 111022643
CMAX: 111490819
CMOS: 111459245
CPEP: 111794680
RCU: 8266453
JCU: 105645835
HBR: 110643525
POP: 7478049
PEU: 105129039
PALZ: 118033675
JRE: 109014449
QSU: 112010501
QLO: 115971271
TWL: 119986661
VVI: 100247899
VRI: 117931615
CANN: 107851618
NSY: 104228266
NTO: 104117352
NAU: 109216592
INI: 109166722
ITR: 116000831
SIND: 105164112
OEU: 111375118
SSPL: 121792327
ECAD: 122578245
LSV: 111920823
CCAV: 112527279
DCR: 108201032
CSIN: 114268297
BVG: 104892291
SOE: 110778493
NNU: 104596097
MING: 122081224
OSA: 4336624
DOSA: Os04t0555900-01(Os04g0555900)
OBR: 102716863
BDI: 100839879
ATS: 109763568
TDC: 119356120
SBI: 110436334
ZMA: 100216615
SITA: 101775337
SVS: 117864261
PVIR: 120683849
PHAI: 112901222
MUS: 103984797
DCT: 110107573
PEQ: 110034507
AOF: 109836957
ATR: 18423049
DDI: DDB_G0289463(srr)
DFA: DFA_11086(srr)
SMIN: v1.2.003586.t1(symbB.v1.2.003586.t1)
TCR: 506825.70
 » show all
Reference
  Authors
De Miranda J, Santoro A, Engelender S, Wolosker H
  Title
Human serine racemase: moleular cloning, genomic organization and functional analysis.
  Journal
Gene 256:183-8 (2000)
DOI:10.1016/S0378-1119(00)00356-5
  Sequence
[hsa:63826]
LinkDB

KEGG   ENZYME: 5.1.1.18
Entry
EC 5.1.1.18                 Enzyme                                 
Name
serine racemase;
SRR
Class
Isomerases;
Racemases and epimerases;
Acting on amino acids and derivatives
Sysname
serine racemase
Reaction(IUBMB)
L-serine = D-serine [RN:R00589]
Reaction(KEGG)
R00589
Substrate
L-serine [CPD:C00065]
Product
D-serine [CPD:C00740]
Comment
A pyridoxal-phosphate protein that is highly selective for L-serine as substrate. D-Serine is found in type-II astrocytes in mammalian brain, where it appears to be an endogenous ligand of the glycine site of N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptors [1,2]. The reaction can also occur in the reverse direction but does so more slowly at physiological serine concentrations [4].
History
EC 5.1.1.18 created 2007
Pathway
ec00260  Glycine, serine and threonine metabolism
ec00470  D-Amino acid metabolism
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K12235  serine racemase
K18348  serine/alanine racemase
Genes
HSA63826(SRR)
PTR747543(SRR)
PPS100984215(SRR)
GGO101140746(SRR)
PON100461570(SRR)
NLE100587573(SRR)
MCC703426(SRR)
MCF101865191(SRR)
CSAB103242132(SRR)
CATY105584078(SRR)
PANU101022060(SRR)
TGE112609773(SRR)
RRO104682021(SRR)
RBB108526307(SRR)
TFN117067936(SRR)
PTEH111521383(SRR)
CJC100393154(SRR)
CSYR103260572(SRR)
MMUR105857923(SRR)
OGA100953083(SRR)
MMU27364(Srr)
MCAL110304703(Srr)
MPAH110331444(Srr)
RNO303306(Srr)
MCOC116079048(Srr)
MUN110551469(Srr)
CGE100765356(Srr)
PLEU114691421(Srr)
NGI103730526(Srr)
HGL101701179(Srr)
CPOC100715409(Srr)
CCAN109697151(Srr)
DORD105985803(Srr)
DSP122100463(Srr)
NCAR124962869 124981273
OCU100355322(SRR)
OPI101530558(SRR)
TUP102497953(SRR)
CFA119863918(SRR)
VLG121472971(SRR)
AML100480745(SRR)
UMR103667152(SRR)
UAH113269141(SRR)
UAR123777176(SRR)
ELK111151250
LLV125087825
MPUF101673355(SRR)
ORO101366494(SRR)
EJU114213859(SRR)
ZCA113939199(SRR)
MLX118025204(SRR)
FCA101098904(SRR)
PYU121017333(SRR)
PBG122485105(SRR)
PTG102953178(SRR)
PPAD109255129(SRR)
AJU106983203(SRR)
HHV120245165(SRR)
BTA525340(SRR)
BOM102268037(SRR)
BIU109573620(SRR)
BBUB102389655(SRR)
CHX102180962(SRR)
OAS101118200
ODA120866658(SRR)
CCAD122447534(SRR)
SSC110256074(SRR)
CFR106729647(SRR)
CBAI105071500(SRR)
CDK105094392(SRR)
VPC102544894(SRR)
BACU103019746(SRR)
LVE103080390(SRR)
OOR101278882(SRR)
DLE111185868(SRR)
PCAD102980146(SRR)
PSIU116745184(SRR)
ECB100060209(SRR)
EPZ103554993(SRR)
EAI106821980(SRR)
MYB106723919(SRR)
MYD107183817(SRR)
MMYO118671925(SRR)
MLF102434001(SRR)
MNA107535626(SRR)
PKL118702524(SRR)
HAI109386874(SRR)
DRO112308496(SRR)
SHON119003790(SRR)
AJM119040672(SRR)
PDIC114502285(SRR)
PHAS123817016(SRR)
MMF118634415(SRR)
RFQ117013259(SRR)
PALE102891663(SRR)
PGIG120621062(SRR)
PVP105291843(SRR)
RAY107507707(SRR)
MJV108391804(SRR)
TOD119230655(SRR)
SARA101541158(SRR)
LAV100666282(SRR)
TMU101360579
DNM101413561(SRR)
MDO100018989(SRR)
GAS123244465(SRR)
SHR100929336(SRR)
PCW110222116(SRR)
OAA100078533(SRR)
GGA771635(SRR)
PCOC116228072(SRR)
MGP100542246(SRR)
CJO107322475(SRR)
NMEL110407583(SRR)
ACYG106049175(SRR)
TGU100219482(SRR)
LSR110482046(SRR)
SCAN103820216(SRR)
PMOA120507657(SRR)
OTC121345868(SRR)
PRUF121361584(SRR)
GFR102036315(SRR)
FAB101806575(SRR)
PHI102113320(SRR)
PMAJ107212772(SRR)
CCAE111937754(SRR)
CCW104691063(SRR)
ETL114060431(SRR)
ZAB102068903(SRR)
FPG101916779(SRR)
FCH102046432(SRR)
CLV102089987(SRR)
EGZ104131835(SRR)
NNI104012792(SRR)
ACUN113487188(SRR)
TALA104361793(SRR)
PADL103925570
ACHC115347427(SRR)
AAM106484318(SRR)
AROW112960730(SRR)
NPD112954685(SRR)
DNE112986372(SRR)
ASN106723485(SRR)
GGN109293179(SRR)
PSS102452370(SRR)
CMY102942154(SRR)
CPIC101942835(SRR)
TST117867724(SRR)
CABI116829463(SRR)
MRV120387501(SRR)
XLA108707966(srr.L)
XTR100144980(srr)
NPR108787564(SRR)
RTEM120927584(SRR)
BBUF120994777(SRR)
BGAR122930469(SRR)
LCM102360714(SRR)
RTP109920226(srr)
BFO118411234 118421738 118423389 118430995
BBEL109465494 109472612
CIN100178889
SCLV120332843 120340946 120341533 120344426
SPU105443552 583979 586391
APLC110984840 110984861
SKO100370513 100376523
PVM113817416
PJA122265738
PCHN125029033 125046522 125046590
HAME121862307 121862652
PCLA123753491 123767735
PTRU123509500
HAZT108676607
EAF111695357
CELCELE_T01H8.2(T01H8.2)
CBRCBG_12517 CBG_13739
BMYBM_BM5490(Bm5490)
NAINECAME_03341
LGILOTGIDRAFT_208911 LOTGIDRAFT_227146
PCAN112561897
BGT106054191
GAE121367812 121378700
HRF124144560 124151019
HRJ124282118 124286582
CRG105327847 105327858 105328907
MYI110450642
PMAX117320129 117332607
MMER123534131 123534209 123543908 123552110 123564084
OBI106876719
OSN115214389
LAK106154076 106154077
NVE5503411
EPA110246349 110247581 110247651
ATEN116304113
ADF107352782 107354742 107354743
AMIL114957515
PDAM113667992
SPIS111336225
DGT114523541 114523542
XEN124433793
AQU100633547
ATHAT4G11640(SR)
ALY9310772
CRB17884431
CSAT104718593 104737160
EUSEUTSA_v10028795mg
BRP103853518
BNA106396929 106397082
BOE106322763
RSZ108821628
THJ104806384
CIT102614630
CICCICLE_v10021870mg
PVY116136922
MINC123203952
TCC18606504
GRA105765212
GHI107894099 107947019
GAB108482877
DZI111306375
EGR104441764
GMX100799758
GSJ114413364
PVUPHAVU_002G288200g
VRA106765813
VAR108346969
VUN114176096
CCAJ109800959
APRC113855383
MTRMTR_1g056740 MTR_7g103510 MTR_8g098460
CAM101488331
LJALj0g3v0226429.1(Lj0g3v0226429.1) Lj0g3v0226429.2(Lj0g3v0226429.2) Lj0g3v0353159.1(Lj0g3v0353159.1) Lj4g3v2951170.1(Lj4g3v2951170.1) Lj4g3v2951170.2(Lj4g3v2951170.2)
ADU107479977
AIP107630810
AHF112732779 112790917
LANG109332166
FVE101295227
RCN112175491
PPER18776715
PMUM103337476
PAVI110754200 110758012 110763563
PDUL117628115
MDM103429307
ZJU107429891
MNT21407049
CSV101216967 101217208
CMO103482734
BHJ120067688
MCHA111022643
CMAX111490819
CMOS111459245
CPEP111794680
RCU8266453
JCU105645835
HBR110643525
MESC110608698 110608699
POP7478049
PEU105129039
PALZ118033675
JRE109014449
QSU112010501
QLO115971271
TWL119986661
VVI100247899
VRI117931615
SLY101252307 101252608 101261640
SPEN107028643 107028645 107028646
SOT102594901 102595236 102605212
CANN107851618
NTA107781728 107828409
NSY104228266
NTO104117352
NAU109216592
INI109166722
ITR116000831
SIND105164112
OEU111375118
EGT105960794 105966300
SSPL121792327
HAN110864402 110910645 110910646 110910672 110913297 110914774
ECAD122578245
LSV111920823
CCAV112527279
DCR108201032
CSIN114268297
BVG104892291
SOE110778493
CQI110702457 110719452
NNU104596097
MING122081224
TSS122654756 122670345
PSOM113299299 113362076
OSA4336624
DOSAOs04t0555900-01(Os04g0555900)
OBR102716863
BDI100839879
ATS109763568
TDC119356120
TAES123046374 123049764 123190110
SBI110436334
ZMA100216615
SITA101775337
SVS117864261
PVIR120683849
PHAI112901222
PDA103705524 113463456
EGU105034594 105036939
MUS103984797
DCT110107573
PEQ110034507
AOF109836957
ATR18423049
SMOSELMODRAFT_117623 SELMODRAFT_230692
CRECHLRE_06g278101v5
VCNVOLCADRAFT_127331
CSLCOCSUDRAFT_52433
CVRCHLNCDRAFT_56201
MISMICPUN_86447
MPPMICPUCDRAFT_34565
CCPCHC_T00008746001
SPOSPCC320.14
MBRMONBRDRAFT_37517
SREPTSG_10849
DDIDDB_G0289463(srr)
DPPDICPUDRAFT_89549
DFADFA_11086(srr)
SMINv1.2.003586.t1(symbB.v1.2.003586.t1)
PTIPHATRDRAFT_13987
FCYFRACYDRAFT_206137
AAFAURANDRAFT_31782
PIFPITG_08581
PSOJPHYSODRAFT_329918
EHXEMIHUDRAFT_308811 EMIHUDRAFT_69724
GTTGUITHDRAFT_160144
TCR506825.70
LMALMJF_06_0730
LIFLINJ_06_0760
LDOLDBPK_060760
LMILMXM_06_0730
LBZLBRM_06_0720
LPANLPMP_060700
NGRNAEGRDRAFT_33171
CGOTJ1899_06170(vanT)
BBEBBR47_05890
BFMBP422_28600
PJDPjdr2_5612
PBJVN24_01305
PRZGZH47_24205
SANSDK43_03870
WVRIE337_06620
ECASECBG_02847
EGAAL523_09455
EIEENLAB_26730(vanTG)
VCPH9L18_13845(vanT)
VFVK5K99_04115(vanT)
CLBClo1100_2028
CACECACET_c25460(vanTG)
CFMBJL90_20400
CGASJ1C67_03370
FPLAA4U99_10125
OVAOBV_09480(alr)
PFAAMM59RIKEN_12810
VCOPMM50RIKEN_08100(vanTG)
CFEMHCR03_19240(vanT)
CLEClole_1514
CSOCLS_04640
HSDSD1D_0543(vanTG)
ACELacsn021_25830(vanTG)
ACHTbsdcttw_22920
QDOH9Q78_03820(vanT)
CDFCD630_16280(vanTG)
PDCCDIF630_01805(vanTG)
CDCCD196_1551(vanTG)
CDLCDR20291_1526(vanTG)
PDFCD630DERM_16280(vanTG)
DGIDesgi_1751
VGUHYG85_23270(vanT)
IBUIB211_01762
LASAL9O85_05960(vanT)
ABUTAmi103574_02985(vanT)
CADCuri_c05080(vanT)
EUCEC1_04130
AARGAargi30884_01300
ABSIA9CBEGH2_02860
CIUG4D55_13015(alr)
ERMEYR00_02870(vanT)
LCGL3BBH23_19060
RTSCE91St31_07120
 » show all
Reference
1  [PMID:10557334]
  Authors
Wolosker H, Blackshaw S, Snyder SH.
  Title
Serine racemase: a glial enzyme synthesizing D-serine to regulate glutamate-N-methyl-D-aspartate neurotransmission.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 96:13409-14 (1999)
DOI:10.1073/pnas.96.23.13409
  Sequence
[mmu:27364]
Reference
2  [PMID:9892700]
  Authors
Wolosker H, Sheth KN, Takahashi M, Mothet JP, Brady RO Jr, Ferris CD, Snyder SH.
  Title
Purification of serine racemase: biosynthesis of the neuromodulator D-serine.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 96:721-5 (1999)
DOI:10.1073/pnas.96.2.721
  Sequence
[rno:303306]
Reference
3  [PMID:11054547]
  Authors
De Miranda J, Santoro A, Engelender S, Wolosker H
  Title
Human serine racemase: moleular cloning, genomic organization and functional analysis.
  Journal
Gene 256:183-8 (2000)
DOI:10.1016/S0378-1119(00)00356-5
  Sequence
[hsa:63826]
Reference
4  [PMID:15536068]
  Authors
Foltyn VN, Bendikov I, De Miranda J, Panizzutti R, Dumin E, Shleper M, Li P, Toney MD, Kartvelishvily E, Wolosker H.
  Title
Serine racemase modulates intracellular D-serine levels through an alpha,beta-elimination activity.
  Journal
J Biol Chem 280:1754-63 (2005)
DOI:10.1074/jbc.M405726200
  Sequence
[mmu:27364]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 5.1.1.18
IUBMB Enzyme Nomenclature: 5.1.1.18
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 5.1.1.18
BRENDA, the Enzyme Database: 5.1.1.18
CAS: 77114-08-0
LinkDB

KEGG   REACTION: R00589
Entry
R00589                      Reaction                               
Name
serine racemase
Definition
L-Serine <=> D-Serine
Equation
Reaction class
RC00302  C00065_C00740
Enzyme
5.1.1.10        5.1.1.18
Pathway
rn00260  Glycine, serine and threonine metabolism
rn00470  D-Amino acid metabolism
rn01100  Metabolic pathways
Orthology
K12235  serine racemase [EC:5.1.1.18]
K25316  amino-acid racemase [EC:5.1.1.10]
K25317  amino-acid racemase [EC:5.1.1.10]
Other DBs
RHEA: 10983
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system