KEGG   ORTHOLOGY: K13524
Entry
K13524                      KO                                     
Symbol
ABAT
Name
4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase [EC:2.6.1.19 2.6.1.22]
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Module
M00027  GABA (gamma-Aminobutyrate) shunt
Disease
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Brite
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    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
   00650 Butanoate metabolism
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
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   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
   00280 Valine, leucine and isoleucine degradation
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
  09106 Metabolism of other amino acids
   00410 beta-Alanine metabolism
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
 09150 Organismal Systems
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   04727 GABAergic synapse
    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
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    K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
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    2.6.1.19  4-aminobutyrate---2-oxoglutarate transaminase
     K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
    2.6.1.22  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
     K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
Amino acid related enzymes [BR:ko01007]
 Aminotransferase (transaminase)
  Class III
   K13524  ABAT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
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Reference
  Authors
Tamaki N, Sakata SF, Matsuda K
  Title
Purification, properties, and sequencing of aminoisobutyrate aminotransferases from rat liver.
  Journal
Methods Enzymol 324:376-89 (2000)
DOI:10.1016/S0076-6879(00)24247-X
  Sequence
[rno:81632]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K07250
Entry
K07250                      KO                                     
Symbol
gabT
Name
4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase [EC:2.6.1.19 2.6.1.22 2.6.1.48]
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Module
M00027  GABA (gamma-Aminobutyrate) shunt
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00640 Propanoate metabolism
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
   00650 Butanoate metabolism
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
  09105 Amino acid metabolism
   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
   00280 Valine, leucine and isoleucine degradation
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
   00310 Lysine degradation
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
  09106 Metabolism of other amino acids
   00410 beta-Alanine metabolism
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01007 Amino acid related enzymes
    K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.6  Transferring nitrogenous groups
   2.6.1  Transaminases
    2.6.1.19  4-aminobutyrate---2-oxoglutarate transaminase
     K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
    2.6.1.22  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
     K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
    2.6.1.48  5-aminovalerate transaminase
     K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
Amino acid related enzymes [BR:ko01007]
 Aminotransferase (transaminase)
  Class III
   K07250  gabT; 4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
Other DBs
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Reference
  Authors
Schneider BL, Ruback S, Kiupakis AK, Kasbarian H, Pybus C, Reitzer L
  Title
The Escherichia coli gabDTPC operon: specific gamma-aminobutyrate catabolism and nonspecific induction.
  Journal
J Bacteriol 184:6976-86 (2002)
DOI:10.1128/JB.184.24.6976-6986.2002
Reference
  Authors
Knorr S, Sinn M, Galetskiy D, Williams RM, Wang C, Muller N, Mayans O, Schleheck D, Hartig JS
  Title
Widespread bacterial lysine degradation proceeding via glutarate and L-2-hydroxyglutarate.
  Journal
Nat Commun 9:5071 (2018)
DOI:10.1038/s41467-018-07563-6
  Sequence
[eco:b2662]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K14268
Entry
K14268                      KO                                     
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davT, gabT
Name
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Pathway
map00250  Alanine, aspartate and glutamate metabolism
map00310  Lysine degradation
map00650  Butanoate metabolism
map01100  Metabolic pathways
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00650 Butanoate metabolism
    K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
  09105 Amino acid metabolism
   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
   00310 Lysine degradation
    K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01007 Amino acid related enzymes
    K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.6  Transferring nitrogenous groups
   2.6.1  Transaminases
    2.6.1.19  4-aminobutyrate---2-oxoglutarate transaminase
     K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
    2.6.1.48  5-aminovalerate transaminase
     K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
Amino acid related enzymes [BR:ko01007]
 Aminotransferase (transaminase)
  Class III
   K14268  davT, gabT; 5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
Other DBs
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Genes
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Reference
  Authors
Yamanishi Y, Mihara H, Osaki M, Muramatsu H, Esaki N, Sato T, Hizukuri Y, Goto S, Kanehisa M
  Title
Prediction of missing enzyme genes in a bacterial metabolic network. Reconstruction of the lysine-degradation pathway of Pseudomonas aeruginosa.
  Journal
FEBS J 274:2262-73 (2007)
DOI:10.1111/j.1742-4658.2007.05763.x
  Sequence
[pae:PA0266]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K00823
Entry
K00823                      KO                                     
Symbol
puuE
Name
4-aminobutyrate aminotransferase [EC:2.6.1.19]
Pathway
map00250  Alanine, aspartate and glutamate metabolism
map00410  beta-Alanine metabolism
map00640  Propanoate metabolism
map00650  Butanoate metabolism
map01100  Metabolic pathways
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
Module
M00027  GABA (gamma-Aminobutyrate) shunt
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00640 Propanoate metabolism
    K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
   00650 Butanoate metabolism
    K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
  09105 Amino acid metabolism
   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
  09106 Metabolism of other amino acids
   00410 beta-Alanine metabolism
    K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01007 Amino acid related enzymes
    K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.6  Transferring nitrogenous groups
   2.6.1  Transaminases
    2.6.1.19  4-aminobutyrate---2-oxoglutarate transaminase
     K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
Amino acid related enzymes [BR:ko01007]
 Aminotransferase (transaminase)
  Class III
   K00823  puuE; 4-aminobutyrate aminotransferase
Other DBs
RN: R00908 R01648
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GO: 0003867
Genes
QSU: 111989914 112005914
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PNO: SNOG_11641
PTE: PTT_11058
BZE: COCCADRAFT_23640
BSC: COCSADRAFT_88200
BOR: COCMIDRAFT_86789
TASA: A1Q1_04094
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MGL: MGL_2651
MRT: MRET_2610
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ECO: b1302(puuE)
ECJ: JW1295(puuE)
ECD: ECDH10B_1419(puuE)
EBW: BWG_1134(puuE)
ECOK: ECMDS42_1100(puuE)
ECE: Z2486(goaG)
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SFE: SFxv_1480(puuE)
SFN: SFy_1876
SFS: SFyv_1934
SFT: NCTC1_01382(gabT1)
SBO: SBO_1760(goaG)
SBC: SbBS512_E1538(gabT1)
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CTU: CTU_39680(puuE)
KPN: KPN_03825
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KPP: A79E_0288
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KPX: PMK1_01327(puuE)
KPNU: LI86_01480
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EAR: CCG30725
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DDD: Dda3937_04150(goaG)
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BTHM: BTRA_4790(gabT)
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Reference
  Authors
Kurihara S, Oda S, Kato K, Kim HG, Koyanagi T, Kumagai H, Suzuki H.
  Title
A novel putrescine utilization pathway involves gamma-glutamylated intermediates of Escherichia coli K-12.
  Journal
J Biol Chem 280:4602-8 (2005)
DOI:10.1074/jbc.M411114200
  Sequence
[eco:b1302]
LinkDB

KEGG   ENZYME: 2.6.1.19
Entry
EC 2.6.1.19                 Enzyme                                 
Name
4-aminobutyrate---2-oxoglutarate transaminase;
beta-alanine-oxoglutarate transaminase;
aminobutyrate aminotransferase (ambiguous);
beta-alanine aminotransferase;
beta-alanine-oxoglutarate aminotransferase;
gamma-aminobutyrate aminotransaminase (ambiguous);
gamma-aminobutyrate transaminase (ambiguous);
gamma-aminobutyrate-alpha-ketoglutarate aminotransferase;
gamma-aminobutyrate-alpha-ketoglutarate transaminase;
gamma-aminobutyrate:alpha-oxoglutarate aminotransferase;
gamma-aminobutyric acid aminotransferase (ambiguous);
gamma-aminobutyric acid transaminase (ambiguous);
gamma-aminobutyric acid-alpha-ketoglutarate transaminase;
gamma-aminobutyric acid-alpha-ketoglutaric acid aminotransferase;
gamma-aminobutyric acid-2-oxoglutarate transaminase;
gamma-aminobutyric transaminase (ambiguous);
4-aminobutyrate aminotransferase (ambiguous);
4-aminobutyrate-2-ketoglutarate aminotransferase;
4-aminobutyrate-2-oxoglutarate aminotransferase;
4-aminobutyrate-2-oxoglutarate transaminase;
4-aminobutyric acid 2-ketoglutaric acid aminotransferase;
4-aminobutyric acid aminotransferase (ambiguous);
aminobutyrate transaminase (ambiguous);
GABA aminotransferase (ambiguous);
GABA transaminase (ambiguous);
GABA transferase (ambiguous);
GABA-alpha-ketoglutarate aminotransferase;
GABA-alpha-ketoglutarate transaminase;
GABA-alpha-ketoglutaric acid transaminase;
GABA-alpha-oxoglutarate aminotransferase;
GABA-2-oxoglutarate aminotransferase;
GABA-2-oxoglutarate transaminase;
GABA-oxoglutarate aminotransferase;
GABA-oxoglutarate transaminase;
glutamate-succinic semialdehyde transaminase;
GabT
Class
Transferases;
Transferring nitrogenous groups;
Transaminases
Sysname
4-aminobutanoate:2-oxoglutarate aminotransferase
Reaction(IUBMB)
4-aminobutanoate + 2-oxoglutarate = succinate semialdehyde + L-glutamate [RN:R01648]
Reaction(KEGG)
R01648;
(other) R00908
Substrate
4-aminobutanoate [CPD:C00334];
2-oxoglutarate [CPD:C00026]
Product
succinate semialdehyde [CPD:C00232];
L-glutamate [CPD:C00025]
Comment
Requires pyridoxal phosphate. Some preparations also act on beta-alanine, 5-aminopentanoate and (R,S)-3-amino-2-methylpropanoate. cf. EC 2.6.1.120, beta-alanine---2-oxoglutarate transaminase.
History
EC 2.6.1.19 created 1965, modified 1982, modified 2012, modified 2021
Pathway
ec00250  Alanine, aspartate and glutamate metabolism
ec00410  beta-Alanine metabolism
ec00640  Propanoate metabolism
ec00650  Butanoate metabolism
ec01100  Metabolic pathways
ec01120  Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K00823  4-aminobutyrate aminotransferase
K07250  4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 5-aminovalerate transaminase
K13524  4-aminobutyrate aminotransferase / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
K14268  5-aminovalerate/4-aminobutyrate aminotransferase
Genes
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ETWECSP_1827(puuE) ECSP_3607(gabT)
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EOIECO111_1685(puuE) ECO111_3386(gabT)
EOJECO26_1869(puuE) ECO26_3731(gabT)
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