KEGG   ORTHOLOGY: K15633
Entry
K15633                      KO                                     
Symbol
gpmI
Name
2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase [EC:5.4.2.12]
Pathway
map00010  Glycolysis / Gluconeogenesis
map00260  Glycine, serine and threonine metabolism
map00680  Methane metabolism
map01100  Metabolic pathways
map01110  Biosynthesis of secondary metabolites
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
map01200  Carbon metabolism
map01230  Biosynthesis of amino acids
Module
M00001  Glycolysis (Embden-Meyerhof pathway), glucose => pyruvate
M00002  Glycolysis, core module involving three-carbon compounds
M00003  Gluconeogenesis, oxaloacetate => fructose-6P
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00010 Glycolysis / Gluconeogenesis
    K15633  gpmI; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
  09102 Energy metabolism
   00680 Methane metabolism
    K15633  gpmI; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
  09105 Amino acid metabolism
   00260 Glycine, serine and threonine metabolism
    K15633  gpmI; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
Enzymes [BR:ko01000]
 5. Isomerases
  5.4  Intramolecular transferases
   5.4.2  Phosphotransferases (phosphomutases)
    5.4.2.12  phosphoglycerate mutase (2,3-diphosphoglycerate-independent)
     K15633  gpmI; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
Other DBs
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MBI: Mbov_0776(pgam)
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Reference
  Authors
Fraser HI, Kvaratskhelia M, White MF
  Title
The two analogous phosphoglycerate mutases of Escherichia coli.
  Journal
FEBS Lett 455:344-8 (1999)
DOI:10.1016/S0014-5793(99)00910-2
  Sequence
[eco:b3612]
Reference
PMID:8021172
  Authors
Leyva-Vazquez MA, Setlow P
  Title
Cloning and nucleotide sequences of the genes encoding triose phosphate isomerase, phosphoglycerate mutase, and enolase from Bacillus subtilis.
  Journal
J Bacteriol 176:3903-10 (1994)
DOI:10.1128/jb.176.13.3903-3910.1994
  Sequence
[bsu:BSU33910]
LinkDB

KEGG   ORTHOLOGY: K15635
Entry
K15635                      KO                                     
Symbol
apgM
Name
2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase [EC:5.4.2.12]
Pathway
map00010  Glycolysis / Gluconeogenesis
map00260  Glycine, serine and threonine metabolism
map00680  Methane metabolism
map01100  Metabolic pathways
map01110  Biosynthesis of secondary metabolites
map01120  Microbial metabolism in diverse environments
map01200  Carbon metabolism
map01230  Biosynthesis of amino acids
Module
M00001  Glycolysis (Embden-Meyerhof pathway), glucose => pyruvate
M00002  Glycolysis, core module involving three-carbon compounds
M00003  Gluconeogenesis, oxaloacetate => fructose-6P
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00010 Glycolysis / Gluconeogenesis
    K15635  apgM; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
  09102 Energy metabolism
   00680 Methane metabolism
    K15635  apgM; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
  09105 Amino acid metabolism
   00260 Glycine, serine and threonine metabolism
    K15635  apgM; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
Enzymes [BR:ko01000]
 5. Isomerases
  5.4  Intramolecular transferases
   5.4.2  Phosphotransferases (phosphomutases)
    5.4.2.12  phosphoglycerate mutase (2,3-diphosphoglycerate-independent)
     K15635  apgM; 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
Other DBs
RN: R01518
COG: COG3635
GO: 0004619
Genes
MELL: IVG45_21965(apgM)
MMAI: sS8_0739
NHL: Nhal_1577
NWR: E3U44_15175
GSU: GSU1818
GSK: KN400_1841
GME: Gmet_1428
GPI: GPICK_06545
GAO: A2G06_07810
GBZ: JZM60_13155
GEM: GM21_2331
GEB: GM18_1698
GUR: Gura_2382
GEO: Geob_2765
GLO: Glov_2464
GBM: Gbem_1879
GBN: GEOBRER4_23530(apgM)
PCA: Pcar_0824(apgM) Pcar_1514
PPD: Ppro_0776
DEU: DBW_1698
DVE: DESUT3_18810(apgM)
DEP: AOP6_1251(apgM)
DVU: DVU_0889
DVL: Dvul_2095
DVM: DvMF_1414
DFL: DFE_0104
DMA: DMR_28980
DGG: DGI_2697
DDE: Dde_2732
DHY: DESAM_22581(apgM)
DPI: BN4_10242(apgM) BN4_20389
PPRF: DPRO_0282(apgM) DPRO_3892(apgM)
PSEF: PSDVSF_05220(apgM)
PPOR: JCM14722_03350(apgM)
DBA: Dbac_3387
THEW: TDMWS_12000(apgM)
DRT: Dret_1930
DPS: DP1731
DSF: UWK_00456
DDU: GF1_02110(apgM)
DML: Dmul_36820(apgM)
DAL: Dalk_3060
DMM: dnm_070630(apgM)
SFU: Sfum_1217
DBR: Deba_1383
MGM: Mmc1_0814
CSOA: LIS82_13380(apgM)
PLUT: EI981_03830(apgM)
CNO: NT01CX_2398(apgM)
CBV: U729_239
CACE: CACET_c11130(apgM)
CTH: Cthe_1292
HSC: HVS_11105
CCE: Ccel_2140
CSS: Cst_c06320(apgM)
CSD: Clst_0600(pgm2)
ESR: ES1_14490
ESU: EUS_07740
RCH: RUM_16750
BPRO: PMF13cell1_00910(gpmI_1)
BPRL: CL2_06890
HSD: SD1D_2181(apgM)
EAC: EAL2_c21490(apgM2)
SWO: Swol_1301
SLP: Slip_0290
SALQ: SYNTR_1225
SGY: Sgly_2881
PTH: PTH_1598
DAE: Dtox_1375
DAU: Daud_1058
CBAR: PATL70BA_1010(apgM)
TACI: TDSAC_0218
FMA: FMG_0474
AMEI: LV469_07245(apgM)
LPIL: LIP_2706
PDX: Psed_6291
RXY: Rxyl_2948
DMC: btf_1575 btf_665(apgM)
DMD: dcmb_1521 dcmb_711(apgM)
DMG: GY50_0630(gpmM) GY50_1530
DFO: Dform_00032(apgM) Dform_00837(apgM)
ABAT: CFX1CAM_0780(apgM) CFX1CAM_1181(apgM)
LEK: hrd7_31620(apgM)
DRA: DR_2227
DGE: Dgeo_2232
DDR: Deide_22650(apgM)
DGO: DGo_CA0246(bcpC)
DFC: DFI_01355
DGA: DEGR_02330(apgM)
DAH: DAETH_03380(apgM)
TTH: TT_C1888
TTJ: TTHA0116(TTHA0116)
TAQ: TO73_1905
MRB: Mrub_0466
RBA: RB8924(bcpC)
IPA: Isop_0585
KST: KSMBR1_0297(ppd) KSMBR1_1005(apgM1)
BPIT: BPIT_32810
PCOR: KS4_25410
TLI: Tlie_0818
BTH: BT_2402
BFR: BF0609
BFG: BF638R_0606(apgM)
BXY: BXY_09920
BVU: BVU_2051
PBT: ING2E5B_2218(apgM)
PMUC: ING2E5A_0098(apgM)
PSAC: PSM36_0077(apgM)
APS: CFPG_658
PDI: BDI_0260
TFO: BFO_3154
PRU: PRU_1017
DORI: FH5T_13805
AAE: aq_542(bcpC)
HTH: HTH_1861
TAL: Thal_0634
TMA: TM1774
TMW: THMA_1818
TMQ: THMB_1818
TMX: THMC_1818
TPT: Tpet_1062
TNP: Tnap_1040
TRQ: TRQ2_1050
TNA: CTN_0964
TLE: Tlet_0278
TME: Tmel_1409
TAF: THA_1725
THER: Y592_07880
FNO: Fnod_0732
PMO: Pmob_0139
MARN: LN42_11160
DTN: DTL3_1207(apgM)
KOL: Kole_1526
ASAC: ATHSA_1733
MSCH: N508_000342(apgM)
DTU: Dtur_0007
NDE: NIDE4112(apgM)
NMV: NITMOv2_4466(apgM)
NIO: NITINOP_0768(apgM)
NJA: NSJP_0748(apgM)
LFC: LFE_1124
BANA: BARAN1_0502(apgM)
MOX: DAMO_1610(apgM)
MESG: MLAUSG7_0554(apgM) MLAUSG7_0842(apgM)
MESA: MLASG1_0241(apgM) MLASG1_0353(apgM)
MWO: MWSIV6_0135(apgM) MWSIV6_0803(apgM2)
METE: tca_00384 tca_01540(gpmI)
MST: Msp_0485(apgM1) Msp_1299(apgM2)
MRU: mru_0459(apgM1) mru_1139(apgM2)
MEB: Abm4_0224(apgM) Abm4_0809
MMIL: sm9_0312(apgM1) sm9_0897(apgM2)
METH: MBMB1_0408(apgM1) MBMB1_1171(apgM2)
MFC: BRM9_1376(apgM1) BRM9_1854(apgM2)
MFI: DSM1535_0038(apgM1) DSM1535_2075(apgM)
MCUB: MCBB_0374(apgM1) MCBB_1076(apgM2)
MKA: MK1193
PFU: PF1959
PFI: PFC_08785
PHO: PH0037(PH0037)
PAB: PAB2318
PYN: PNA2_0565
PYS: Py04_0108
TKO: TK0866
TON: TON_0442
TGA: TGAM_0731(apgM)
TSI: TSIB_1580
THE: GQS_03000
THA: TAM4_869
THM: CL1_0248
TLT: OCC_11994
THS: TES1_0154
TNU: BD01_0264
TEU: TEU_07035
TCQ: TIRI35C_0813(apgM)
PPAC: PAP_01310
MBAR: MSBR2_2244
MBAK: MSBR3_2297
MAC: MA_0132
MMA: MM_1418
MMAC: MSMAC_3266
METM: MSMTP_3139
MTHR: MSTHT_1913
MTHE: MSTHC_1370
MHOR: MSHOH_3991
MBU: Mbur_1982
MMET: MCMEM_0211
MMH: Mmah_0223
MPY: Mpsy_2177
MTP: Mthe_0545
MCJ: MCON_1451
MHI: Mhar_0528
MHU: Mhun_0447
MEMA: MMAB1_0442(apgM) MMAB1_2342(apgM)
MPI: Mpet_0068
MAQE: RJ40_10850
MBN: Mboo_0678
MPD: MCP_1263(apgM-1) MCP_1945(apgM-2) MCP_2448(apgM-3)
MEZ: Mtc_1004(gpmA-1) Mtc_1636(gpmA-2)
RCI: RCIX2144(gpmA-2) RCIX838(gpmA-1)
TAC: Ta0413
TVO: TVG1213330(TVG1213330)
PTO: PTO1271
FAI: FAD_0440
CDIV: CPM_0369
MEAR: Mpt1_c02310(apgM) Mpt1_c05450(apgM1)
MARC: AR505_0474
ABI: Aboo_1101
APE: APE_1616.1(apgM)
ACJ: ACAM_1014(apgM)
SMR: Smar_0332
IHO: Igni_1374
IIS: EYM_07205
IPC: IPA_01230
DKA: DKAM_0338
TAG: Tagg_0654
IAG: Igag_0471
HBU: Hbut_1197
STO: STK_03770(apgM)
SSO: SSO0417
SOL: Ssol_1394
SSOA: SULA_1440
SSOL: SULB_1441
SSOF: SULC_1439
SCAS: SACC_06110
SAI: Saci_0837
SID: M164_1734
SII: LD85_1944
SIH: SiH_1662
SIR: SiRe_1583
SIC: SiL_1575
MSE: Msed_2238
MEMJ: MJ1HA_2558
MCN: Mcup_0070
AHO: Ahos_0709
ACIH: HS5_20830
CSTY: KN1_19960
STEP: IC006_1512
SAHS: HS7_06710
PAI: PAE2326
PIS: Pisl_1043
PCL: Pcal_1668
PAS: Pars_1540
PYR: P186_0579
POG: Pogu_0674
TNE: Tneu_1474
CMA: Cmaq_0340
TTN: TTX_2061(gpmA)
TUZ: TUZN_1419
VDI: Vdis_1202
VMO: VMUT_2050
THEL: IG193_02520(apgM)
ASC: ASAC_1099
ACIA: SE86_06635
NMR: Nmar_0537
NIN: NADRNF5_1644(apgM)
NIW: Nisw_02190(apgM)
NIP: NsoK4_05665(apgM)
NCT: NMSP_1136(apgM1)
NGA: Ngar_c15320(apgM)
NVN: NVIE_006920(apgM)
NEV: NTE_02050
NCV: NCAV_1222(apgM)
NBV: T478_1093(apgM)
NDV: NDEV_0528(apmG)
CCAI: NAS2_0489
KCR: Kcr_1216
BARC: AOA65_1069(apgM)
BARB: AOA66_0351(apgM)
NAA: Nps_03375
NAER: MJ1_0763
 » show all
Reference
  Authors
Johnsen U, Schonheit P
  Title
Characterization of cofactor-dependent and cofactor-independent phosphoglycerate mutases from Archaea.
  Journal
Extremophiles 11:647-57 (2007)
DOI:10.1007/s00792-007-0094-x
  Sequence
[afu:AF_1751]
LinkDB

KEGG   ENZYME: 5.4.2.12
Entry
EC 5.4.2.12                 Enzyme                                 
Name
phosphoglycerate mutase (2,3-diphosphoglycerate-independent);
cofactor independent phosphoglycerate mutase;
2,3-diphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase;
phosphoglycerate phosphomutase (ambiguous);
phosphoglyceromutase (ambiguous);
monophosphoglycerate mutase (ambiguous);
monophosphoglyceromutase (ambiguous);
GriP mutase (ambiguous);
PGA mutase (ambiguous);
iPGM;
iPGAM;
PGAM-i
Class
Isomerases;
Intramolecular transferases;
Phosphotransferases (phosphomutases)
Sysname
D-phosphoglycerate 2,3-phosphomutase (2,3-diphosphoglycerate-independent)
Reaction(IUBMB)
2-phospho-D-glycerate = 3-phospho-D-glycerate [RN:R01518]
Reaction(KEGG)
R01518
Substrate
2-phospho-D-glycerate [CPD:C00631]
Product
3-phospho-D-glycerate [CPD:C00197]
Comment
The enzymes from higher plants, algae, some fungi, nematodes, sponges, coelenterates, myriapods, arachnids, echinoderms, archaea and some bacteria (particularly Gram-positive) have maximum activity in the absence of 2,3-bisphospho-D-glycerate. cf. EC 5.4.2.11 phosphoglycerate mutase (2,3-diphosphoglycerate-dependent). The enzyme contains two Mn2+ (or in some species two Co2+ ions). The reaction involves a phosphotransferase reaction to serine followed by transfer back to the glycerate at the other position. Both metal ions are involved in the reaction.
History
EC 5.4.2.12 created 2013
Pathway
ec00010  Glycolysis / Gluconeogenesis
ec00260  Glycine, serine and threonine metabolism
ec00680  Methane metabolism
ec01100  Metabolic pathways
ec01110  Biosynthesis of secondary metabolites
ec01120  Microbial metabolism in diverse environments
Orthology
K15633  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
K15635  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase
Genes
AJM119060933
BFO118408464
BBEL109478518
SPU591606
APLC110981255
AJC117121340
SKO100374181
RZE108374675
PXU106128655
ISCIscW_ISCW020443
DSV119445847
RSAN119390231
RMP119172891
VDE111242842
VJA111258851 111264944
TUT107364420
DPTE113798840
DFR124496201
CSCU111632029
PTEP107443904 107448761
SDM118189005
CELCELE_F57B10.3(ipgm-1)
CBRCBG_12654
BMYBM_BM13317(Bma-ipgm-1)
LOALOAG_08132
NAINECAME_02212
TSPTsp_02466
BGT106064511
NVE5496527 5510305 5515139
EPA110245398
ATEN116302246
ADF107354794
AMIL114972505
PDAM113670039
SPIS111340131
DGT114516156
XEN124443895
HMG100201970
TADTRIADDRAFT_32533
AQU100632232
ATHAT1G09780(iPGAM1) AT3G08590(iPGAM2)
ALY9318640 9325834
CRB17890745 17899490
CSAT104739574 104743192 104745010 104755179 104764544 104764545 104768077
EUSEUTSA_v10007256mg EUTSA_v10020418mg
BRP103836310 103870611
BNA106362381 106401004 106452851 106453134 111213187
BOE106295684 106311555
RSZ108822958 108830944 108863593
THJ104799818 104803424
CPAP110821299
CIT102622582
CICCICLE_v10011402mg
PVY116120159
MINC123202351 123224066
TCC18602404
GRA105774937 105793975 105796357
GHI107902893 107910752 107915995 107927473 107951353
GAB108463902 108476273 108488716
DZI111279593 111307714
EGR104425144 104433381
GMX100794734 100820155
GSJ114396118 114425287
PVUPHAVU_008G077900g
VRA106759444
VAR108329339
VUN114185029
CCAJ109818417
APRC113853304
MTR11435852
CAM101512802
PSAT127127244
LJALj1g3v2570560.1(Lj1g3v2570560.1) Lj1g3v2570560.2(Lj1g3v2570560.2) Lj1g3v2570560.3(Lj1g3v2570560.3) Lj3g3v0461640.1(Lj3g3v0461640.1)
ADU107485416
AIP107639756
AHF112743904 112797274
LANG109335625 109359501
FVE101294379
RCN112192241
PPER18772584
PMUM103342439
PAVI110769388
PDUL117631026
MDM103433797 103450793
PXB103930255 103960166
ZJU107431219 107431420
MNT21405570
CSV101217925
CMO103501500
BHJ120073329
MCHA111023145
CMAX111465975 111478204
CMOS111432374 111453539
CPEP111781725 111804059
RCU8283033
JCU105649052
HBR110667706 110668731
MESC110620860 110623085
POP18100041 7472502
PEU105112284 105121814
PALZ118047221 118048237
JRE108990002
CILL122278911
QSU112003698 112013656 112038391
QLO115953623 115954105
TWL119993112
VVI100245007
VRI117920314
SLY101248497
SPEN107025856
SOT102577561(PGAM)
SSTN125875773
CANN107878039
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