KEGG   ORTHOLOGY: K27684
Entry
K27684                      KO                                     
Symbol
capadc
Name
carboxyaminopropylagmatine decarboxylase [EC:4.1.1.127]
Pathway
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Reaction
R13284  N1-[(S)-3-amino-3-carboxypropyl]agmatine carboxy-lyase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09100 Metabolism
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   00330 Arginine and proline metabolism
    K27684  capadc; carboxyaminopropylagmatine decarboxylase
Enzymes [BR:ko01000]
 4. Lyases
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    4.1.1.127  carboxyaminopropylagmatine decarboxylase
     K27684  capadc; carboxyaminopropylagmatine decarboxylase
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SOR: SOR_1015
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BFE: K6V30_15365(nspC)
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BFC: BacF7301_19485(nspC)
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PGI: PG_0152(nspC)
PGN: PGN_0265
PGT: PGTDC60_0429(nspC)
PAH: Poras_1120
PCRE: NCTC12858_01601
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PSOE: CE91St14_11420
PORP: J4862_03720(nspC)
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PMUC: ING2E5A_1758(nspC)
PET: PEIBARAKI_5730
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DYS: G7050_04945(nspC)
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APS: CFPG_744
PPN: Palpr_2823
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PARC: CI960_08395(nspC)
PMER: INE87_00470(nspC)
PGOL: K6V26_08705(nspC)
PJO: LK449_07910(nspC)
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CNI: Calni_0887
MPI: Mpet_0843
 » show all
Reference
PMID:37878710
  Authors
Xi H, Nie X, Gao F, Liang X, Li H, Zhou H, Cai Y, Yang C.
  Title
A bacterial spermidine biosynthetic pathway via carboxyaminopropylagmatine.
  Journal
Sci Adv 9:eadj9075 (2023)
DOI:10.1126/sciadv.adj9075
  Sequence
[syn:sll0873]
LinkDB

KEGG   ENZYME: 4.1.1.127
Entry
EC 4.1.1.127                Enzyme                                 
Name
carboxyaminopropylagmatine decarboxylase;
sll0873 (locus name)
Class
Lyases;
Carbon-carbon lyases;
Carboxy-lyases
Sysname
N1-[(S)-3-amino-3-carboxypropyl]agmatine carboxy-lyase
Reaction(IUBMB)
N1-[(S)-3-amino-3-carboxypropyl]agmatine = N1-(3-aminopropyl)agmatine + CO2 [RN:R13284]
Reaction(KEGG)
R13284
Substrate
N1-[(S)-3-amino-3-carboxypropyl]agmatine [CPD:C22886]
Product
N1-(3-aminopropyl)agmatine [CPD:C20560];
CO2 [CPD:C00011]
Comment
A pyridoxal 5'-phosphate protein. The enzyme, characterized from the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803, participates in a biosynthetic pathway for spermidine.
History
EC 4.1.1.127 created 2024
Pathway
ec00330  Arginine and proline metabolism
ec01100  Metabolic pathways
ec01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Orthology
K27684  carboxyaminopropylagmatine decarboxylase
Genes
ILO: IL2000
ILI: K734_10070
IPI: CEW91_03030(nspC)
IDI: CWC33_08530(nspC)
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SPX: SPG_0846(nspC)
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SND: MYY_1279
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SNM: SP70585_0959(nspC)
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SNB: SP670_1399(nspC)
SNP: SPAP_0952
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SPNE: SPN034156_18730
SPNU: SPN034183_08250
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CBAR: PATL70BA_2247(nspC)
VGU: HYG85_03645(nspC)
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MPI: Mpet_0843
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Reference
1  [PMID:37878710]
  Authors
Xi H, Nie X, Gao F, Liang X, Li H, Zhou H, Cai Y, Yang C.
  Title
A bacterial spermidine biosynthetic pathway via carboxyaminopropylagmatine.
  Journal
Sci Adv 9:eadj9075 (2023)
DOI:10.1126/sciadv.adj9075
  Sequence
[syn:sll0873]
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 4.1.1.127
IUBMB Enzyme Nomenclature: 4.1.1.127
ExPASy - ENZYME nomenclature database: 4.1.1.127
BRENDA, the Enzyme Database: 4.1.1.127
LinkDB

KEGG   REACTION: R13284
Entry
R13284                      Reaction                               
Name
N1-[(S)-3-amino-3-carboxypropyl]agmatine carboxy-lyase
Definition
N1-[(S)-3-amino-3-carboxypropyl]agmatine <=> N1-(3-Aminopropyl)agmatine + CO2
Equation
C22886 <=> C20560 + C00011
Enzyme
4.1.1.127
Pathway
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rn01100  Metabolic pathways
rn01110  Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
Enzymatic reactions [BR:br08201]
 4. Lyase reactions
  4.1  Carbon-carbon lyases
   4.1.1  Carboxy-lyases
    4.1.1.127
     R13284  N1-[(S)-3-amino-3-carboxypropyl]agmatine <=> N1-(3-Aminopropyl)agmatine + CO2
Orthology
K27684  carboxyaminopropylagmatine decarboxylase [EC:4.1.1.127]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system