KEGG   ORTHOLOGY: K28501
Entry
K28501            RNA       KO                                     
Symbol
SNOR131_132_133
Name
small nucleolar RNA SNOR131/132/133
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis
    K28501  SNOR131_132_133; small nucleolar RNA SNOR131/132/133
  09184 RNA family
   03100 Non-coding RNAs
    K28501  SNOR131_132_133; small nucleolar RNA SNOR131/132/133
Ribosome biogenesis [BR:ko03009]
 Related small nucleolar RNAs
  Box C/D snoRNAs
   SnoRNAs act as guides for 2'-O-ribose methylation
    K28501  SNOR131_132_133; small nucleolar RNA SNOR131/132/133
Non-coding RNAs [BR:ko03100]
 Small nucleolar RNA
  K28501  SNOR131_132_133; small nucleolar RNA SNOR131/132/133
Genes
ATH: AT3G02435 AT3G02445 AT5G01195
CRB: 111830307 111831770 111831771
BRP: 117129144 117129146 117134501
BNA: 125579359 125579360 125581175 125581176 125588196 125609691
RSZ: 130495349 130495350 130497279 130497280 130497281 130497282
CIT: 112498695 112498696 127903170
PVY: 116140939 116140940
MINC: 123196153
GRA: 128033350 128035168
GHI: 121207099 121210255 121214347 121224002
GAB: 128284587 128289565
HSYR: 120157975 120158119 120173203 120200854
EGR: 120293046 120293047 120293048 120293049
RARG: 115753932 115753933
GMX: 113000601 113001304 113002467
GSJ: 114401074 114407929 114424813
PVU: 137816749 137816750
VAR: 128195699
VUN: 114165696
VUM: 124833427
CCAJ: 114915289 114916326
APRC: 113856725 113864087
MTR: 112420547 112420548 112420549 112420550
TPRA: 123919216 123919217 123919218
CAM: 113786808 113786809 113786810
PSAT: 127089953 127089954 127089955 127089956
VVO: 131633530 131633537 131633538 131633539
ADU: 127739977
AHF: 112700629 112725743 112762054
PCIN: 129319130
AANS: 126801354 126801355 126801358 126801359 126801360 126801361
RCN: 112195596 112195598 112195599 112195600
PDUL: 117636234 117636235
MDM: 114819365 114820290 114820291 114820292 139188314
MSYL: 126584054 126588110 126594664 126594666 126594667 126601038
PCOX: 137714041 137714042 137730387 137741231 137746362 137746363 137746364
ZJU: 112491490
MNT: 112091096
CSAV: 115701704 115701705 115701706 115701707
CSV: 116404838
CMO: 127150788
BHJ: 120074818 120078853
CMAX: 111478908
CMOS: 111433353
CPEP: 111804588
RCU: 112536562
MEAN: 126679621
JCU: 119370377
MESC: 122724469 122724726
POP: 112324573 112328062
PALZ: 118030893 118063128
PNZ: 133677737 133690399
JRE: 118348114 118348381
CILL: 122277914 122280252
CAVE: 132162688 132162689
AGLU: 133874421 133874422 133874423 133874425 133874426
QSU: 111996801 136070892
QLO: 115954351
CSAA: 142611469
VVI: 132254224
VRI: 117921360
SLY: 112942249 112942250 112942251 112942252 112942254 112942255
SPEN: 114074123 114074124 114074125 114074126 114074127 114074128
SSTN: 125871980 125871981 125871982 125871984 125871985 125871986 125871987
SDUL: 129883789 129883790 129883791 129883792 129883793
CANN: 124887555 124887556 124887557 124887558 124887560
LBB: 132634529 132634531 132634532 132634533 132634534
NSY: 138872269 138874245 138874246 138874248 138874249 138874250 138874251 138874252 138890983
NTO: 117274579 117274580 117274581 117274582 117274583 117274584 117274586 117274587 117274588 117276630 117276632 117276633 117277196 117277197 117280582 117280583 117280584 117280585 117280586 117280587 117280588 117280589 117280590 117280591 117280592 117280593 117280594 117280595 117280596 117280597 117280598 138896573 138896574 138896575 138896576 138896577 138896578 138896579 138896580 138896581 138896582 138896583 138896584 138896585 138896586 138896587 138896588 138896589 138896590 138896591 138896592 138896593 138896594 138896595 138896596 138896597 138896598 138896599 138896600 138896601 138896602 138896603 138896604 138896605 138896606 138896607 138896608 138896609
ITR: 116007723 116007724 116007725
HPUM: 140885562
PHUA: 140960593 140977906
PTAB: 142541239 142550397
CCAV: 112513871
DCR: 135147450 135151841
CSIN: 114267749
RVL: 131305794 131305795 131305796 131321430 131321432 131321433
AEW: 130790408 130790409 130790410
DLT: 127789421 127789423 127789424
SOE: 130468364 130468366 130468367
ATRI: 130827995 130827996 130827997 130827998
SLAF: 141593410 141593411 141616251 141622623 141622637 141622644 141636846 141636848 141654096
MOF: 131147433 131161152
MING: 122082957 122087769 122087770 122087771
TSS: 122649237 122649238 122649240
PSOM: 113300845 113314628 113339139 113339142 113345094
OBR: 121054051 121054053 121054054 121054055 121055408 121055409 121055410 121055411 121055413
OGL: 127769092 127769093 127785521 127785522
BDI: 112269061 112269062 112269063
ATS: 120963681
TDC: 119290362 119296550
TAES: 123088984 123095344 123100909
TUA: 125527250 125555144 125555145
HVG: 123451600
LPER: 127304935 127304937 127304938 127304939 127326687 127326688 127337309 139834249 139834250 139834251 139834252
LRD: 124658540 124658541 124658543 124658544 124658546 124658547 124658549 124658550 124658552 124658553 124668808 124668809 124681706 124681711 124681712 124685523 124685524 124685525 124685526 124693885 124693886
ZMA: 111591047 111591048 111591049 111591050 111591051 111591215 111591216
MFLO: 136478863 136478865 136478866 136478867 136495069 136502409 136512293 136512298 136541074 136547778 136553116 136553118 136553119
SVS: 117841172 117846659 117846660 117846662
PVIR: 120653084 120663180 120663181 120663182 120693675 120696365 120696367 120696368
PHAI: 112878371 112883689 112883690 112883691
PAUA: 133885969 133885970 133898022 133898023 133898024 133902609 133902610 133902612 133902613 133913912 133913913 133917180 133927886 133927887
TANG: 140769415 140769416 140769417 140769418 140769419 140777757 140779989
PDA: 113462692 113462698 113463512 113463514
EGU: 114912771 114912772 114912776 114912777
MUS: 135621360 135621361 135621362 135621363
ZOF: 121974077 121974079 121978981 121978984 122003291 122028427 122033219 122035622
DCT: 114578804 114579123 114579184 114579185 114579755
MSIN: 131235926
ACAK: 137935572 137935573 137935574 137935575 137935576 137935577 137949119 137949163 137965411
NCOL: 116246528 116246529 116246530
CJF: 131035854
 » show all
Reference
PMID:19357091
  Authors
Chen HM, Wu SH
  Title
Mining small RNA sequencing data: a new approach to identify small nucleolar RNAs in Arabidopsis.
  Journal
Nucleic Acids Res 37:e69 (2009)
DOI:10.1093/nar/gkp225
  Sequence
[ath:AT3G02435 AT3G02445 AT5G01195]
LinkDB

DBGET integrated database retrieval system