KEGG   Arcobacter cloacae: ACLO_2280
Entry
ACLO_2280         CDS       T06845                                 
Symbol
rpoB
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
  KO
K03043  DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:2.7.7.6]
Organism
aclo  Arcobacter cloacae
Pathway
aclo03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:aclo00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    ACLO_2280 (rpoB)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:aclo03021]
    ACLO_2280 (rpoB)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:aclo03400]
    ACLO_2280 (rpoB)
Enzymes [BR:aclo01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     ACLO_2280 (rpoB)
Transcription machinery [BR:aclo03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     ACLO_2280 (rpoB)
DNA repair and recombination proteins [BR:aclo03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      ACLO_2280 (rpoB)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_2 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_7 RNA_pol_Rpb2_45 RNA_pol_Rpb2_1 Peptidase_M23
Other DBs
NCBI-ProteinID: QKF90737
LinkDB
Position
complement(2254713..2258858)
AA seq 1381 aa
MLNSLKSGNRLRVDFAKNPQQIEIPNLLQLQQTSYDTFLMVDQDDRSTAGIEKVFKSIFP
IHDVQNRITLDYLGSEVGKPKYDVRESMVRGLTYSIPLKINIRLTLWDLDEKTGEKIGVK
DMKEQSLFIREIPLMTDRTSFIVNGVERVVVNQLHRSPGVIFKEEESNTADNKLIYTGQI
IPDRGSWLYFEYDAKDVLYVRINKRRKVPVTILFRALGYSKEDIIKLFYPIVNIKIKNNK
FLTEFNPDDFMGRIEFDVKDDKGNLVIGAGKRLTARKAKALVDGGLKLIEYPLELLMDRS
TANTIYDPVSGEVLFDALTNLDEIKLKKLLDLGFESFDIANDLATGIDNSIINAFKADAE
SLKLLKQTEQIDDENDLSAIRIYKVMRPGEPVTKEAAKEFVRKLFFDPERYDLTKVGRMK
MNHKLGVNVPEYVTTLTYEDVIKTVQYLVKVKSGHGHIDDRDHLGNRRIRAIGELLANEL
HAGLIKMQKAIRDKMTTLSGTLEDIMPHDLVNSKMITSTITEFFTSGQLSQFMDQTNPLS
EVTHKRRLSALGEGGLVKERAGFEVRDVHPTHYGRICPVETPEGQNIGLINTLSTFSKVN
ELGFIEAPYKTVVDGVVTDEIKYYTATQEEGLVIAPGSTKVDENGKIVEPLIEVRKDGEI
LLMERSSVDLIDISSQMVMGVAASLIPFLEHDDANRALMGSNMMRQAVPLLRPNAPVVGT
GLEKIVARDAWEAIKAKRAGLVEKADSKNIYVRGEDENGAFIDYYTVNKNVRTNNNTSFG
QRIAVKEGDFVQKGQVIADGPSMDKGELAVGVNAMVAFMPWNGYNYEDAIILSERLIEED
AFTSVHIYEKDVECRELKHGNEEITRDLPGVKEESIVHLDNSGIVKIGTYVKPGMILVGK
VTPKGEIKPTPEERLLRAIFGEKAGHVINKSLVCPTSMEGTVVDVKVFTKKGYEKDERAI
AEIEAEKAELDLKHHDKLLMLDREEILKINDLLSKSVLTKDLELDEVEYKKGDTIPVDVL
MNINRFAMKKVVSSYSKEIEKTYNDIKEHFIKQKAQLREEHEEKLQILEHDDILPSGVIK
QVKVYIATKRKIKVGDKMAGRHGNKGIVSNIVPKVDMPYLVDGSTVDVILNPLGVPSRMN
IGQILEVHLGLVGKKLGAQIQDIFEAKRADFIVELRNKMSEIASVAKLMNGKAFMDSLSD
EELVQYAQDWAKGVRFATPIFDGVKEEEFTKLFELAKIDTDGKSVLYDGKTGEKMKERVN
VGYMYMLKLHHLVDEKVHARSTGPYSLVTQQPVGGKALFGGQRFGEMEVWALEAYGATNV
LKEMLTTKSDDVEGRTRAYRAIANGENVPNSGVPETFFVLTKELKALALDVEIFGEVENN
E
NT seq 4146 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttaaactctttaaaatctggtaatagacttagagttgattttgcaaaaaatccacaa
caaattgaaattccaaacttattacaactacaacaaacttcgtatgatactttcttgatg
gtagatcaagatgacagatcaacagctggaattgaaaaagtatttaaatctatttttcct
atacatgacgttcaaaacagaattacacttgattacttaggtagtgaagttggtaaacct
aaatatgatgttagagaatctatggttagaggattaacttattctatacctcttaaaatc
aatattagactaactttatgggatttagacgagaaaactggtgaaaaaatcggtgttaaa
gatatgaaagaacaatctttattcatcagagaaattcctttaatgacagatagaacatca
tttattgtaaatggagttgaaagagttgttgttaatcagttacatagatctcctggtgta
atttttaaagaagaagaatcaaatacagctgataataaactaatatatactggacaaata
attccagatagaggttcatggttatactttgaatatgatgcaaaagatgtgttatatgta
agaattaataaaagaagaaaagtacctgttactattttatttagagctttaggttattct
aaagaagatataattaaattattttatcctattgttaatattaaaattaaaaacaataaa
ttcttaactgaatttaaccctgatgattttatgggaagaattgaatttgatgttaaagat
gataaaggaaatttagtaatcggtgctggtaagagattaacagcaagaaaagctaaagct
ttagttgacggcggattgaaattaatagagtatccattagaattattaatggatagaagt
acagctaatacaatttatgatccagtatcaggtgaagtattattcgatgcattaactaat
cttgatgaaataaaacttaaaaagcttttagatctaggttttgaatcatttgatatagct
aatgatttagctactggaattgataattctattattaatgcatttaaagcagatgctgag
tctttaaaactattaaaacaaacagaacaaattgatgatgaaaatgatttatcagcaatc
agaatttataaagttatgagaccaggtgagcctgttactaaggaagctgctaaagagttt
gttagaaaattattttttgatccagaaagatatgatttaacaaaagttggaagaatgaaa
atgaatcataagcttggtgttaatgtacctgagtatgttactacattaacttatgaagat
gttatcaaaacagttcagtacctagtaaaagttaagtctggacatgggcatattgatgat
agagatcacttaggtaatagaagaattagagcaattggtgaattgttagcaaatgaatta
catgctggtttaatcaaaatgcaaaaagcaattagagataaaatgactacattatctggt
acattagaagatattatgccacatgatttagttaactctaaaatgattacttcaacaatt
actgagttctttacatctgggcaattatcacaatttatggatcaaacaaatccattatca
gaagttactcacaaaagaagactttctgcacttggagagggtggacttgtaaaagagaga
gctggatttgaggtaagggacgttcatccaacacactatggaagaatttgtccagttgaa
actccagagggacaaaatattggtcttattaatacattatcaactttttcaaaagttaat
gaactagggtttattgaagcaccttataaaacagttgtagatggtgtagtaactgatgaa
atcaaatattatacagcaacacaagaagaaggactagtaatagctccaggttctactaaa
gttgatgaaaatgggaaaattgttgagccattaattgaagttagaaaagatggtgaaatt
ttacttatggagagaagtagcgtagatttaattgatatttcttctcaaatggttatggga
gttgcagcttctttaattccattcttagagcatgatgatgccaacagagcacttatgggt
tcaaatatgatgagacaggctgttccattattaagacctaatgcacctgttgttggaact
ggtttagaaaaaattgtagcacgtgatgcttgggaagctatcaaggctaaaagagctgga
ttagttgagaaagctgattctaaaaacatttacgttagaggtgaagatgaaaatggtgct
ttcattgattactatacagtaaataaaaatgtaagaacaaataacaatacttcatttggt
caaagaattgcagtaaaagagggtgattttgttcaaaaaggacaagtaattgctgatgga
ccttctatggataaaggtgaattagctgttggagtaaatgcaatggttgcatttatgcca
tggaatggatataactatgaggatgctattattctttctgaaagacttattgaggaagat
gcatttacttcagttcatatttatgaaaaagatgttgagtgtagagaattaaaacatggt
aatgaagagataacaagagacttaccaggagttaaagaagaatcaattgttcatttggat
aattcaggaattgtaaaaattggaacttatgtaaaaccaggaatgattttagttggtaaa
gttacaccaaaaggtgaaattaaaccaactcctgaagaaagattactaagagcaattttt
ggtgaaaaagcaggacatgttattaataaatctttagtatgtcctacatcaatggaagga
acagttgttgatgtaaaagtattcactaaaaaagggtatgaaaaagacgaaagagcaatt
gcagaaattgaggctgaaaaagctgaattagatctaaaacatcatgataagttgttaatg
cttgatagagaagaaatcttaaaaataaatgatttgttatcaaaatctgtattgactaaa
gatttagaacttgatgaagtagagtataagaaaggtgatacaattcctgttgatgtattg
atgaatattaatagattcgcaatgaaaaaagttgtatcttcttactctaaagagatagag
aaaacttataatgatattaaagaacattttataaaacaaaaagctcaattaagagaagaa
catgaagaaaaacttcaaattttagagcatgatgacattttaccaagtggtgttattaaa
caagttaaagtttatattgcaactaagagaaagataaaagttggtgataaaatggcagga
cgacatggaaataaaggtattgtttctaatattgttcctaaagttgatatgccatattta
gtagatggttcaacagttgatgttattttaaatcctctaggggttccttctaggatgaat
atcggacaaattcttgaagttcatttagggttagtaggaaaaaaacttggagctcaaatt
caagatatcttcgaagcaaaaagagctgattttattgttgaattaagaaacaaaatgtct
gaaattgcatcagttgctaaattaatgaatggtaaagcttttatggattcattaagtgat
gaagagttagttcaatatgcacaagattgggcaaaaggtgtaagatttgctactccaatt
tttgatggtgtaaaagaagaagagtttacaaagttattcgaattagcaaaaattgataca
gatggtaaatcagttctttatgatggaaaaactggtgaaaaaatgaaagaaagagttaat
gtaggttatatgtatatgcttaaacttcaccacttagttgatgaaaaagtgcatgcaaga
tcaacaggtccttactcgttagttacacaacagccagttggaggaaaagctctatttgga
ggacaaagattcggagagatggaggtttgggcattagaagcttatggtgcaactaatgta
cttaaagagatgcttacaactaagtcagatgatgttgaaggaagaacaagagcttataga
gctattgcaaatggcgaaaatgttccgaactctggagttcctgaaacattctttgtatta
acaaaagagttaaaagctttagccttagacgtagagatttttggagaggtagaaaacaat
gagtaa

DBGET integrated database retrieval system