Aliarcobacter faecis: AFAEC_1802
Help
Entry
AFAEC_1802 CDS
T06664
Name
(GenBank) putative autotransporter secretion outer membrane protein TamA
KO
K07278
translocation and assembly module TamA
Organism
afc
Aliarcobacter faecis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
afc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
afc02000
]
AFAEC_1802
Transporters [BR:
afc02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AFAEC_1802
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Omp85
POTRA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKF73954
LinkDB
All DBs
Position
complement(1789125..1790816)
Genome browser
AA seq
563 aa
AA seq
DB search
MFKIFLIIGILFLNCFAKEIKTIDFSGDIDLVLGDFSKSNLEKVCDISYPSFYKFWKKNP
VFKESDIVICRELLEDYMESLGFYNSLVSYTIDEDKAHFDIKKNEQIKISSIKIDDEFKD
LIELKVDEGFKSSNFTNSKKYIYKYLHEKGYAKAILDAKAYVDIDDYKVDLEYKITKNNL
QYFGETNIQNNANVDNELLQRNIEYKKNQEYSSTLIDKTYENFFNFGIYKYISVEPNLDT
KEDIIPINIKLIEGDYRETTYGIGYDTDTKARFKAQYKNENFLGNLKQFTIGTKINSEGY
NIYNNIYNPYFISDDISLNNDISYEDMNYKSYSQKKIEEKLSFSKDFWNLSHTAGVLLEH
STIKSDLQEYKSGSYLLNSFFYQTIFDRRDDILNPKNGYYLSFYIENGSKLIASEMDYIK
TQSEFRYIKTFDKFTSSFKTTVGTLNKDLPIFKHFFAGGDYSNRGYSYQQVGKKDPDDKP
YGGLSMIDSSLEFEYALNKDLGLVTFFDSTMLSLEENKFNDKFYNSYGVGARYYTPIGPF
RVDFGFPVDNGGFVFHIGIGQVF
NT seq
1692 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtttaaaatatttttaattattggaattttatttttaaattgttttgcaaaagagata
aaaactattgatttctctggagatattgatttagttttaggagatttttctaaatcaaat
cttgaaaaagtttgtgatatctcatatccaagtttttataaattctggaaaaagaatcct
gtatttaaagagagtgatatagtgatttgtagagagttgttagaagattatatggagagt
ttaggtttttataactctttagtctcttatacaatagatgaagataaagcacattttgat
atcaaaaagaatgaacagataaaaatatcttctataaaaattgatgatgaatttaaagat
ttgatagagttaaaagtagatgaaggttttaaatcttcaaattttacaaactctaaaaaa
tatatatataaatatttgcatgaaaaaggttatgcaaaagcaatattagatgcaaaagct
tatgttgatattgatgattacaaagttgatttagagtataaaataactaaaaataatcta
caatattttggtgagacaaatattcaaaataatgcaaatgtagataatgaacttttgcaa
agaaatattgaatataaaaagaatcaagagtatagttctactttaatagataaaacttat
gaaaacttttttaattttggtatttacaaatatatatcagttgagccaaatttagacact
aaagaagatataatccctataaatataaaattaattgaaggtgattatagagagacaact
tatggtattggttatgatacagatacaaaagcaagatttaaagctcaatataaaaatgag
aattttttaggaaatttaaaacaatttacaattggaacaaagataaatagtgaaggttat
aatatttacaacaatatttataacccatattttataagtgatgatatctctttaaataat
gatatctcttatgaagatatgaactataaaagctactcccaaaaaaagattgaagaaaaa
ctatctttttcaaaagatttttggaatttatcacatactgctggagttttacttgaacac
tctacaataaaatcagatttacaagagtataaaagtggtagttatcttttaaattcattt
ttttatcaaacaatttttgatagaagagatgatattttaaatcctaaaaatggttattat
ttatctttttatattgaaaatgggagtaaattaatagctagtgaaatggattatataaaa
actcaaagtgaatttagatatataaaaacttttgataaatttacaagttcatttaaaact
actgttggaacactaaataaagatttacctatatttaaacacttttttgcaggtggagat
tatagtaatagagggtactcatatcagcaagtaggaaagaaagacccagatgacaaacct
tatggtggattatctatgattgatagtagtttggagtttgaatatgctttaaataaagat
ttaggattggtaactttttttgactctacaatgttaagtcttgaagagaataaatttaat
gataaattttataactcttatggagttggagctagatattatactcctattggaccattt
agagttgattttggttttccagttgataatggtggatttgtatttcatataggaatagga
caagtattttga
DBGET
integrated database retrieval system