Aphidius gifuensis: 122848685
Help
Entry
122848685 CDS
T07796
Name
(RefSeq) CCR4-NOT transcription complex subunit 1
KO
K12604
CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Pathway
agif03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
122848685
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
agif03019
]
122848685
Messenger RNA biogenesis [BR:
agif03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
mRNA cycle factors
P-body specific factors
122848685
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Ccr4-NOT complex
122848685
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Not1
CNOT1_CAF1_bind
NOT1_connector
ARM_Cnot1
CNOT1_TTP_bind
DUF3819
CNOT1_HEAT
CNOT1_1st
TFIIA
HTH_upst_double_PIN
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122848685
NCBI-ProteinID:
XP_044002867
LinkDB
All DBs
Position
LG2:6228027..6237383
Genome browser
AA seq
2556 aa
AA seq
DB search
MNLDSLSFTLSQISYLIANLNKQNYRESSEEITVLVRWKGLEADRHLLRCLFSHVDFSTG
EPPSINAKDYYQVQLLKQECINLLGKPSLVSNITYAIDHPLHQQQTLKPSGKFFNNLRRV
LGLTLVQEVVFAIVLRHSEHSELREFALEEIHKQLPELIKNYLNSDNNSKQEQEEGLHDS
SPEVLHLILSETLADKNTFGLSIESKEKFLKTLRRDFPRGLVPVVLAPLLYPGDGETPHV
NKEFIMASNQMDGGSLVELIMELGYGFTSNVDECRTALANLGAREISPLAAARVLAHMAR
TCSGLDDAGGLQTFWGNNTSANSNNNNTDSNSSNNTNSNNNNNNSNNKEKSNDGNTPATT
WNVEIFIQTLKDIQSTLSWNEVIVKLDHAEFHIKDRQGLNLLITGLRLGLQVQGYPLDMF
PVELFYRHWDNVEGQFSLIQQILQNPDIFCFADYPYHSVTVDALKAAPESDSKEAQTWRS
LNVVELLLHMAERGLYGPVHEIYKWPIQHCPDVLTLALLQINPPITILRQELLTKLMPLF
LGNHPNSTVILHNAWHVNNGKIKGIVMHSMSEWYSRGDHDQTRLSRILDVAQDLKALSPL
LGLQSFSFVIDLACLASRREYLKLEKWLTDKIRDNGEAFITACIKFLQKRCPQIINPNIK
EDSTVPKASQLPQETITTMLACLQSFAGNLTQECSETIMTMVQNCNLMLSKNTITRPLPP
PGVLRHPGLVDPFNSGKLTNPLFTTKTVDTLCNLTTNIGTMNLGSALGPPGSNSAFNLPG
VLGPLVTAPGSPSRIMGQSPNQFPMVPALPSQLHPGGPVGTQGQNVIQSGSTTLTGQLGR
LGAPTNIDKSSRLADTSNLFPDIPQNLSKEMEDEANSYFQLIYNHPPHPTLSIDEVLEML
KKFQDSTIKRERDVFHCMLRNLFEEYKFFPDYPDRELHITAQLFGGIIEKGLVNNYMTLG
LALRFVLDALRKPDNSKMYYFGIAALDRFKTKLKEYQTYCEHVRTIQNFNKFPQHLIDYV
EFGLQSQEPPTRPQGPVLPKNLATMLTPSTNTTTSSSSTTTYKAVTTTSTTITTTSTTQI
KSLTTTSSSSATTVSTRPSIANATNIDTLLVATDKEEKITPPPETLQDKTAFIFNNLSQL
NLQQKCDEIRDIVTEEYWPWMAQYLVMKRASIELNFHVLYSNFLDCLKVPEITRMVTRET
FRNIKVLLRSDKGIANFSDRSLLKNLGHWLGMLTLGRNKPILQIDIDLKSLLVEAYHKGQ
QELLYVVPFVAKVLESCAKSKVFKPPNPWTMAIMNTLAELHQEPDLKLNLKFEIVILCKN
LSIDVADLKPIVYLKDSEKLRNLEYQLSHLNKKSETAVIQQSPQQQQQPQQASIQPSTME
ELVGSQSLVPIVQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQASLSQPASTTPSLPTGPPEPRFNY
LEINVSNIANIAPHISINSQLPLWQSHPHMKQFVRPSIERAIQEWIHPVVDRSIKIALTT
SEQIIRKDFALDHEETRMRIAGRNMVRNLTAGMAMITCRDQILTSISTNLKNAFISSATA
TPQLKDIAEQAANIIAADNMELACTFVQKTAVEKAIPEMDKRLLNDIELRKIAKQEGRRY
YDQLTKYQAERMPEQIRLKTGGITVQQMIVYEEFARNIPGFLPLSERDAQALYLPKTDTS
SVASFPVGNSTTLPIQQTSQQAVYAAAAAAASAVPPPPPPPQPHQQQQQQQQQQQQQQQQ
LQQQVPPPPNSAIAVPPSSTVVASSTAVAPVSVPSAVNNDEIGTMLEKLAGDVDVLLTAM
GPTPQPQQQASLHSILESLMITRRSRDAGAAMALLKKSVECILDLQSLTSGIMESEIALR
IRDLHLRILKCLQDPRAYGMQWTNKHVTRCLTECRDEYRFNFEAVDCLIRSHLISFLQFD
LSLAQSMDTGSAMATAFAMQLVSTYLVDERQTIHVTESDLYNTIEMLARMSHHRSPPEGI
SLFRLTNLIESLRINHDPAVLADRPPVGPTAHIHSGILQARARDFDDPPGLMEKTEFLLR
EWVTLHHSPANARDPTRAFGQFVQQMNIHGILKTDDLITRFFKLSTQMSVDLCYRALADP
AAAPSIIRAKCFHTLDAFVRLVALLVKHSGDATNTHTKINLLNKVLGIVAGVLLQDHEMR
GTDFQQLPYHRIFIMLFLELCAPEPVLEAVNYQVLTAFCHTLHILRPAKASGFCYAWLEL
VSHRVFIGRMLAITPQQKCWGMYAQLLIDLFKYLAPYLRNAELAKPVTLLYKGTLRVLLV
LLHDFPEFLCDYHYGFCDVIPPNCIQMRNLILSAFPRNMRLPDPFTPNLKVDMLQEIAVA
PRVLTNFSSMIVPITFKKELDSYFKARAPVTFLSGIRSYLQVSHDAGMRYDIQLMNALVL
YVGTQAITFIRNKGHTPNMSTIAHSAPMDIFQNLAVDLDTEGRYLFLNAIANQLRYPNSH
THYFSCTLLYLFAEANTEAIQEQITRVLLERLIVNRPHPWGLLITFIELIKNPTYKFWTH
EFVHCAPEIEKLFESVARSCMVQKQVQPTPEPELPE
NT seq
7671 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacctggactcgttatcttttactttgtcacaaataagttatttgattgcaaattta
aataaacaaaattatcgagaaagctcggaggaaataacagttttagtacggtggaaaggt
ctagaggcggacagacacttgctgcgctgtttgttctctcacgttgatttttcaactggt
gaaccaccatcaattaatgccaaggattattatcaagtacagctattaaaacaagagtgt
attaatttattgggaaaaccatcattagtatcaaatataacatacgcaatcgatcatcct
ttgcatcaacaacagacacttaaaccatctggaaaattttttaataatttacgtcgtgta
cttggtttaacacttgttcaagaagttgtatttgcaatagttttacgtcattcagaacac
agtgaattacgtgaatttgcacttgaagaaattcacaaacaattgcctgaattaataaaa
aattatttaaattcagataataatagtaaacaagaacaagaagaaggtttacacgattca
tcaccagaagtattacatttaatattatcagaaacacttgctgataaaaatacatttggt
ttatcaattgaatctaaagaaaaatttttaaaaactttacgtcgtgattttccccgtgga
ctggtaccagtggtgcttgcaccactattatatccaggtgacggggaaacacctcacgtt
aataaagaatttataatggcatcaaatcaaatggatggtggttcgcttgtcgaactcatc
atggaacttggttatggatttacaagtaatgttgatgaatgtagaacagcacttgcaaat
cttggtgctagagaaatatcaccacttgctgctgctcgtgtattagcacatatggcaaga
acatgtagtggtcttgatgatgctggtggtttacaaacattttggggtaataatacatca
gctaatagtaataataataatactgatagtaatagtagtaataatactaatagtaataat
aataataataatagtaataataaagaaaagtcaaatgatggtaatacaccagcaacaact
tggaatgttgaaatttttatacaaacattaaaagatatacaatcaacattatcatggaat
gaagttattgttaaacttgatcatgcagaatttcatataaaagatcgtcaaggtttaaat
ttattaataactggattaagattgggtcttcaagttcaaggttatccacttgatatgttt
ccagttgaattattttatcgtcattgggataatgttgagggacaattttcattaattcaa
caaatattacaaaatccagatatattttgttttgctgattatccatatcattcagtaact
gttgatgcattaaaagcagcaccagaaagtgatagtaaagaagcacaaacatggagatca
cttaatgttgttgaattattattacatatggctgaacgtggtttatatggaccagtacat
gaaatatataaatggccaattcaacattgtccagatgttcttacattagcattattacaa
ataaatccaccaataacaatattacgtcaagaattattaacaaaattaatgccattattt
ttgggtaatcatccaaattcaacagtaatattacataatgcttggcatgttaataatggt
aaaataaaaggtattgttatgcattcaatgagtgaatggtattcacgtggtgatcatgat
caaacaagattatcaagaattttagatgttgcacaagatttaaaagcattatcaccatta
cttggactacaatcattttcatttgttattgatttagcatgtttagcatcaagacgtgaa
tatttaaaacttgaaaaatggctaacagataaaatacgtgataatggtgaagcatttata
acagcatgtattaaatttttacaaaaaagatgtccacaaattattaatccaaatattaaa
gaagattcaacagtgccaaaagcaagtcaattaccacaagaaacaataacaacaatgtta
gcatgtttacaaagttttgctggtaatttaacacaagaatgctcagaaacaattatgaca
atggtacaaaattgtaatttaatgttaagtaaaaatacaataacacgtccattaccacca
ccaggtgtattacgtcatcctggtttagttgatccatttaatagtggtaaattaacaaat
ccattatttacaacaaaaacagttgatacactttgtaatttaacaacaaatattggaaca
atgaatttaggatcagcattaggaccacctggtagtaattcagcatttaatttacctggt
gtacttggtccacttgtaacagcacctggttcaccatcaagaataatgggtcaatcacca
aatcaatttcccatggtaccagcattaccatcacaattacatcctggtggaccagttggt
acacaaggacaaaatgttatacaatctggttcaacaacattaactggacaacttggtcgt
ttaggtgcaccaacaaatattgataaatcatcaagattagctgatacatcaaatttattt
cctgatataccacaaaatttatcaaaagaaatggaagatgaagctaatagttattttcaa
ttaatatataatcatccaccacatccaacattatcaattgatgaagtacttgaaatgtta
aaaaaatttcaagactcaacaataaaacgtgaacgtgatgtatttcattgtatgcttaga
aatttatttgaagaatataaattttttcctgattatccagatagagaacttcatataaca
gcacaattatttggtggtattattgaaaaaggattagttaataattatatgacacttgga
cttgcattaagatttgtattagatgcattaagaaaacctgataatagtaaaatgtattat
tttggtattgctgcattggacagatttaaaactaaattaaaagaatatcaaacttattgt
gaacatgttagaacaatacaaaattttaataaatttccacaacatttaattgattatgtt
gaatttggtttacaatcacaagaaccaccaacaagaccacaaggaccagttttacctaaa
aatttagcaacaatgcttacgccaagcacaaatacaacaacatcatcatcatcaacaaca
acatataaagctgttacaacaacaagtacaacaataacaacaacaagtacaacacaaatt
aaatcattaacaacaacatcatcatcatcagcaacaacagtatcaactagaccatcaatt
gcaaatgcaacaaatattgatacattattagttgctactgataaagaagaaaaaataact
ccaccaccagaaacattacaagataaaacagcatttatatttaataatttaagtcaactt
aatttacaacaaaaatgtgatgaaatacgtgatattgtaactgaagaatattggccttgg
atggcacaatatcttgtcatgaaacgtgcaagtattgagcttaattttcatgtattatat
tcaaattttttggattgtcttaaagtaccagaaataacaagaatggttacacgtgaaact
tttagaaatattaaagttttacttcgtagtgataagggaattgctaatttttctgatcgt
tcattattaaaaaatcttggtcattggctaggtatgttgacattgggaagaaataaacca
atattacaaattgacattgatttaaagagtcttttagttgaggcatatcataaaggacaa
caagaattattatatgttgttccatttgtagcaaaagtacttgaaagttgtgctaaaagt
aaagtttttaaaccaccaaatccttggacaatggctattatgaatacattagctgaactt
catcaagaaccagatttaaaattaaatcttaaatttgaaattgttatattgtgtaaaaat
ttaagtattgatgttgctgatttaaagccaattgtttatttaaaagattcagaaaaattg
agaaatcttgagtatcaattatcacatttaaataaaaaatcagaaacagcagtaattcaa
caatcaccacaacaacaacaacaaccacaacaagcatcaattcaaccatcaacaatggaa
gaacttgttggatcacaatcattagtaccaattgtacaacaacagcagcaacagcaacaa
caacaacagcaacaacaacagcagcagcaacaacaacagcagcaacaagcatcactttca
cagccagcatcaactacaccatcattaccaactggtccaccagaaccacgttttaattat
ctagaaataaatgttagtaatattgcaaatattgctccacacataagcatcaatagtcaa
ttgccactttggcaaagtcatccacatatgaaacaatttgtacgtccttcaattgaacgt
gcaatacaagaatggatacatccagttgttgatcgttcaattaaaatagcattaacaaca
agtgaacaaataatacgtaaagattttgctcttgatcatgaagaaacacgtatgagaatt
gctggtcgtaatatggtccgtaatttaacagctggtatggcaatgataacatgtcgtgat
caaatattaacatcaataagtacaaatttaaaaaatgcatttataagttcagcaacagca
acaccacaattaaaagatattgctgaacaagcagcaaatattattgctgcagataatatg
gaacttgcatgtacatttgtacaaaaaacagctgttgaaaaagctataccagaaatggat
aaacgtttattaaatgatattgaattacgtaaaatagctaaacaagaaggacgtagatat
tatgatcaattaacaaaatatcaagctgaaagaatgcctgaacaaatacgtcttaaaact
ggtggtataactgtacaacaaatgattgtttatgaagaatttgcaagaaatatacctggt
tttttaccattatcagaaagagatgcacaagcattatatttaccaaaaacagatacatca
agtgttgcatcatttccagttggtaattcaacaacactaccaatacaacaaacatcacaa
caagctgtttatgctgctgcagcggcagcagcttcagcagtaccaccacctccaccacca
ccacagccacatcagcagcaacaacaacaacaacagcagcagcaacaacagcaacaacaa
ctacaacaacaagtaccaccaccaccaaattcagcaatagcagtaccaccatcatcaaca
gtagtagcatcatcaacagctgtagcaccagtatcagtaccatcagcagttaataatgat
gaaattggtacaatgttagaaaaattagcaggtgatgttgatgtattattaacggcaatg
ggaccaacaccacaaccacaacaacaagcatcacttcatagtatacttgaatcattaatg
ataacaagacgttcacgtgatgctggtgcagcaatggcattattaaaaaaatcagttgaa
tgtatacttgatttacaatcattaacaagtggtattatggaatcagaaatagcattaaga
atacgtgatttacatttacgaattttaaaatgtttacaagatccacgtgcatatggtatg
caatggacaaataaacatgttacaagatgtttaactgaatgtcgtgatgagtatcgtttt
aattttgaggctgttgattgtttaataagatcacatttaataagctttttacaatttgat
ttatcattagcacaatcaatggatactggtagtgcaatggcaactgcatttgcaatgcaa
cttgttagtacatatttagttgatgaacgtcaaacaatacatgttactgaatctgattta
tataatacaattgaaatgttagctagaatgtcacatcatagatcaccaccagagggtata
tcattatttagattaacaaatttaattgaatcattacgtattaatcatgatccagcagta
cttgctgatcgtccaccagttggaccaacagcacatatacattctggtatattacaagca
agagcacgtgattttgatgatccaccaggtctcatggaaaaaactgaatttttattacgt
gaatgggttactttacatcatagtccagcaaatgcacgtgatccaacaagagcatttggt
caatttgtacaacaaatgaatatacatggtatactaaaaacagatgatttaataacacgt
ttttttaaattaagtacacaaatgagtgttgatttgtgttatcgtgcattagctgatcca
gcagcagcaccatcaataatacgtgcaaaatgttttcatacacttgatgcatttgtacgt
cttgttgcattacttgttaaacattctggtgatgcaacaaatacacatactaaaattaat
ttattaaataaagtattgggtattgttgctggtgtattattacaagatcatgaaatgcgt
ggtactgattttcaacaattaccatatcatcgaatatttattatgttatttttggaatta
tgtgcacctgagccagtacttgaagctgttaattatcaagtattaacagcattttgtcat
acattacatatattacgtccagcaaaagcatctggtttttgttatgcttggcttgaactt
gtatcacatcgtgtatttattggacgtatgttggcaataacaccacaacaaaaatgttgg
ggaatgtatgcacaattattaattgatttatttaaatatttagcaccatatttacgtaat
gctgaacttgctaaaccagtaacattactttataaaggtacattacgtgtgctattggta
ttattacatgattttccagaatttttatgtgattatcattatggtttttgtgatgttata
ccaccaaattgtatacaaatgagaaatttaatattaagtgcatttccaagaaatatgaga
ttaccagatccatttacaccaaatttaaaagttgatatgttacaagaaatagcagttgca
ccacgtgtattaacaaatttttcatcaatgattgtgccaataacatttaaaaaagaactt
gattcatattttaaagcacgtgcacctgttacatttttatctggtatacgtagttattta
caagtatcacatgatgctggtatgcgttatgatatacaattaatgaatgcacttgtactt
tatgttggtacacaagcaataacatttatacgtaacaagggacatacaccaaatatgtca
acaattgcacattcagcaccaatggatatatttcaaaatttagctgttgatcttgatact
gaaggacgttatttatttttaaatgcaattgctaatcaattacgttatccaaatagtcat
acacactattttagttgtacattattgtatttatttgctgaagctaatactgaagcaata
caagaacaaataacacgtgttttgttggaacgtcttattgttaatagaccacatccatgg
ggtttacttattacctttattgaacttattaaaaatccaacatataaattttggacacat
gagtttgttcattgtgcaccagaaattgaaaaactctttgaatcagttgcaagatcctgc
atggttcaaaaacaagtacaaccaacacctgagcctgaattaccagagtga
DBGET
integrated database retrieval system
