KEGG   Arcobacter iocasae: LXN10_03715
Entry
LXN10_03715       CDS       T11121                                 
Symbol
rpoB
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta
  KO
K03043  DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:2.7.7.6]
Organism
aie  Arcobacter iocasae
Pathway
aie03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:aie00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    LXN10_03715 (rpoB)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:aie03021]
    LXN10_03715 (rpoB)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:aie03400]
    LXN10_03715 (rpoB)
Enzymes [BR:aie01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     LXN10_03715 (rpoB)
Transcription machinery [BR:aie03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     LXN10_03715 (rpoB)
DNA repair and recombination proteins [BR:aie03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      LXN10_03715 (rpoB)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_2 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_7 RNA_pol_Rpb2_45 RNA_pol_Rpb2_1 BSH_YknX Peptidase_M23
Other DBs
NCBI-ProteinID: XHE62301
LinkDB
Position
complement(741929..746074)
AA seq 1381 aa
MLNSLKSGNRLRVDFAKNPQHIEIPNLLQLQQNSYDNFLMVGKESRTDAGIEKVFKSIFP
IHDAQGRITLDYIESEVGKPKYDVRESMVRGLTYSIPLKIKIRLTLWDLNEKTGEKIGVK
DMKEQSLFVREIPLMTDRTSFIVNGVERVVVNQLHRSPGVIFKEEESNTAGNKLIYTGQI
IPDRGSWLYFEYDAKDVLYVRINKRRKVPVTILFRALGYSKEDIIKMFYPILNIKIKNNK
FLTEFSPEDFTGRVEFDIKDDKGNLVIAAGKRLTARKAKALVDGGLKLVEYPVELLMDRS
TAGTIFDPESGEVLFDSLTHLDELKLKKLLDLGFDSFDIANDLAEGVDDSIINAFAADAE
SLKLLRQTEQLEDENDLAAIRIYKVMRPGEPVTKEAAKDFVKKLFFDPERYDLTKVGRMK
MNHKLGVNVPEYVTTLTYEDVIKTVQYLVKVKSGHGHIDDRDHLGNRRIRAIGELLANEM
HSGLIKMQKAIRDKMTTLSGTLEDIMPHDLVNSKMITSTITEFFTSGQLSQFMDQTNPLS
EVTHKRRLSALGEGGLVKERAGFEVRDVHATHYGRICPVETPEGQNIGLINTLSTFAKVN
ELGFIEAPYKKVHDGIVSNEIIYVTATQEEGLLIAPGSTKVDDNGKIVEPLIEARQDGEI
LIVERGKVNLIDISSQMVMGVAASLIPFLEHDDANRALMGSNMMRQAVPLLRPNAPIVGT
GLEKTVARDAWEAIKADRTGIVEKADAKNIYVRGEDENGAFIDHYSVNKNVRTNNNTSFG
QRIAVKEGDTVQKGQVIADGPSMDKGELAVGVNACVAFMPWNGYNYEDAIVLSQRLIKED
AFTSIHIYEKDVECRELKHGNEEITRDLPGVKDESITHLDESGIVKVGTFIKPGMIMVGK
VTPKGEIKPTPEERLLRAIFGEKAGHVINKSLYCPTSMEGTVVDVKVFTKKGYEKDSRAV
AEIESEKAELDLKHHDKLLMLDREEILKINDLLSKALLVKDVDLDDVVYKKGQVIPLDVL
ANVNRFAMKKVVSSYDKDVEKKYNDIKEYFINQKSRLRTDHEEKLEVLEHDDILQSGVIK
QVKVYIATKRKIKVGDKMAGRHGNKGIVSNIVPQVDMPYLEDGSTVDVILNPLGVPSRMN
IGQILEVHLGLVGKRLGTQIQDIFDAKKTEFVSELRAKMTEIADVAKLMNGKEFLAKLSD
DELVDYAQDWTKGVRFATQVFDGVKEDEFLKLFELAKIDLDGKTNLIDGKTGDKMKERVN
VGYMYMLKLHHLVDEKVHARSTGPYSLVTQQPVGGKALFGGQRFGEMEVWALEAYGATAV
LKEMLTTKSDDVEGRTRAYRAISNGENVPDSGVPETFFVLTKELKALGLDVEIFDEVENN
E
NT seq 4146 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctaaattctttaaaatctggtaataggcttagagtcgattttgctaaaaatccacaa
catattgaaattcctaatttattacaattacaacaaaattcgtatgacaactttttaatg
gtaggaaaagagagcagaacagatgctggaatagaaaaagtatttaaatcaattttccca
atacatgatgctcaaggtagaattactcttgattatatagaaagtgaagtgggtaaacca
aaatacgatgttagagagtctatggttagaggtcttacttactcaatcccattaaaaatc
aaaataagattaactctttgggatcttaacgaaaaaactggtgaaaaaatcggcgttaaa
gatatgaaagaacaatctttattcgttagagaaatacctttaatgacagatagaacttca
tttattgtaaatggtgttgaaagagttgttgttaaccaattacatagatctcctggtgtt
atcttcaaagaagaagaatcaaacactgctggaaataaactaatctacactggacaaatt
attccagatagaggttcttggttatattttgaatatgatgcaaaagatgtattatatgta
agaatcaacaaaagaagaaaagttcctgtaactattctttttagagcattaggatattct
aaagaagatattatcaaaatgttctacccaattttaaatattaaaattaaaaacaataaa
ttcttaactgaatttagtcctgaagacttcacaggaagagttgaatttgatattaaagat
gataaaggtaatttagtaattgctgctggaaaaagattaactgctagaaaagctaaagca
ttagttgatggtggattaaaattagttgaatacccagttgaattattaatggacagaagt
actgctggtacaatttttgatccagaatctggtgaagtattatttgattctttaactcat
ttagatgaattaaaattaaaaaaattacttgacttaggttttgattcttttgatattgca
aatgatttagctgaaggtgttgatgattctattatcaatgcatttgctgcagatgctgag
tctttaaaattattaagacaaactgagcaattagaagatgaaaatgatttagctgctatt
agaatttataaagtaatgagaccaggtgagcctgtaactaaagaagctgctaaagatttc
gttaaaaaattattctttgatccagaaagatatgacttaacaaaagtgggaagaatgaaa
atgaaccacaagttaggtgtaaatgttcctgaatatgttacaacacttacttatgaagat
gttattaaaactgttcaataccttgtaaaagttaaatctggtcatgggcatatcgatgat
agagatcacttaggtaacagaagaattagagctattggtgagttacttgctaatgaaatg
cattctggtttaatcaaaatgcaaaaagcaattagagataaaatgactactttatctggt
acattagaagatataatgccacatgatttagttaactctaaaatgattacatcaacaatt
actgagttctttacatctggtcaattatcacaatttatggaccaaactaacccattatca
gaagttactcataaaagaagactttctgcacttggtgagggtggacttgtaaaagagaga
gctggatttgaagtaagagatgttcacgcaactcactacggaagaatttgtccagttgag
actccagagggacaaaatattggtcttatcaatacactttctacatttgctaaagtaaat
gaattaggatttattgaagcaccatataaaaaagttcatgatggtattgtttcaaatgaa
attatttatgttactgcaactcaagaagagggattattaattgctcctggttctactaaa
gttgatgacaatggtaaaattgttgaacctttaattgaagctagacaagacggtgaaatc
ctaattgttgaaagagggaaagttaatttaattgatatttcttctcaaatggttatgggt
gttgctgcttcattaattccattcttagaacatgatgatgccaatagagcacttatggga
tcgaatatgatgagacaagctgttccattattaagaccaaatgctccaatcgttggaact
ggtttagaaaaaacagttgcaagagatgcttgggaagctattaaagctgatagaactggt
attgttgaaaaagctgatgcaaaaaatatttacgttagaggtgaagatgaaaatggtgca
tttattgaccattatagtgtaaataaaaatgttagaacaaataataatacatcttttggg
caaagaattgcagtaaaagagggtgatacagttcaaaaaggtcaagtaatcgctgatggt
ccttcaatggacaaaggtgaattagcagttggtgttaatgcttgtgttgcctttatgcca
tggaatggatataactacgaagatgcgattgtattatctcaaagattaattaaagaagat
gcatttacttctattcatatttatgaaaaagatgttgagtgtagagagcttaaacatggt
aatgaagagataacaagagatttaccaggtgtaaaagatgaatcaattacacatcttgat
gaatcaggaattgtaaaagttggtacatttatcaagccaggtatgattatggttggaaaa
gttacaccaaaaggtgaaattaaaccaactcctgaagagagactattaagagcaatcttt
ggtgaaaaagcaggtcacgttattaataaatcactttactgtcctacttcaatggaaggt
acagttgttgatgtaaaagttttcactaaaaaaggttatgaaaaagattcaagagcagtt
gctgaaatagaatcagaaaaagctgaacttgatttaaaacatcatgataaactattaatg
cttgatagagaagagattttaaaaatcaatgatttattatcaaaagccctattagttaaa
gatgttgatttagatgatgtagtttataaaaaaggtcaagttattcctttagatgtatta
gcaaatgtaaatagatttgctatgaaaaaagtagtatcttcttatgataaagatgttgag
aaaaaatacaacgatataaaagagtattttattaatcaaaaatctagattaagaactgac
catgaagaaaaacttgaagtattagagcatgatgatattttacaatcaggtgtaatcaaa
caagttaaagtttatatcgcaactaagagaaaaatcaaagttggggataagatggcagga
cgacatggaaacaaaggtattgtttctaacatcgtacctcaagttgatatgccatattta
gaagatggttcaactgttgatgttatattaaatccactaggggttccatcacggatgaat
attggacaaattcttgaagttcacttaggattagtaggtaaaagacttggaactcaaatt
caagatatctttgatgctaagaagactgaatttgtatctgaattaagagctaagatgaca
gaaattgctgatgttgcaaaacttatgaatggtaaagaatttttagctaaattaagtgat
gatgaattagttgattatgcacaagattggacaaaaggtgttagatttgcaactcaagta
tttgatggtgtaaaagaagatgaattcttaaaactatttgaattagcaaaaattgactta
gatggtaaaactaatcttattgatggtaaaactggtgataagatgaaagaaagagtaaat
gtaggttatatgtatatgctaaaactacatcacttagttgatgaaaaagttcacgcaaga
tctactggaccttattcacttgtaacacaacaaccagttggtggtaaagcactatttggt
ggtcaaagatttggagagatggaagtttgggcattggaagcttatggagcaactgctgtt
cttaaagaaatgcttacaacaaaatctgatgacgtagaaggaagaacgagagcttataga
gcaatttcaaatggtgaaaatgttccagattcaggtgttcctgaaactttctttgtatta
acaaaagagttaaaagctttaggtttagatgtagagatttttgacgaggtagaaaataat
gagtaa

DBGET integrated database retrieval system