Alteromonas sp. Mac2: AV940_00925
Help
Entry
AV940_00925 CDS
T05899
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
alz
Alteromonas sp. Mac2
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
TPR_12
TPR_1
TPR_2
TPR_10
TPR_8
TPR_16
SNAP
TPR_11
TPR_7
GGDEF_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMJ89151
LinkDB
All DBs
Position
complement(224414..226291)
Genome browser
AA seq
625 aa
AA seq
DB search
MLFSLSFSVSAIPETEATAASDTTPGAISENALRDFEESIFLHPQQTYRKLVTLAQANDF
SNEGRVWLLLRKAQSENVLTLYKEMDATLVTVAPLANVMTNEQHALWLYLQGSRMHQTGN
ISGAIDTLKYAVEVAKENTNSTIYVLAIRELGYGFALSGDYYRATLILQDAYKNLVTLNN
PFFNGLLEESLGDTYNYLGNYTKAIEYYEGALTFFESIGYQPHVASTLLGLAMVNRKLES
WDDALSYFNRYEIALSFTDNHSENFYLHYGRAMTMAEKGECNLAIGAIDDALSLSGPIDY
NAELYKKRALCNLTLDNLSAAKQDLSKARTIFNGIEALHNTQWHLELDYIAGLVAFKDNR
FEQAFEYIHMYYKDFLELQRLNNSEYVTQVQATMEAERKDKEIALLKQQTQLQAVTAREQ
SLKVRQKNMMLSGVALIFALLLIFVIFQNKNAKKLLALSIRDELTGLHNRRYFFDYFENN
LVKLNPNHVGLALISFDIDNFKHINDNLGHHVGDEVIKTVAQTAANTLRTNDVIARIGGD
EFIIALPRTTLLQAKEIAKRILENIRSHRFITKEGADFSVTASLGVAYHDQNKFIALDVK
SLMESADTALYQSKRAGKNRFTVAA
NT seq
1878 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgtttagcctttctttttctgtgtctgcaatccctgagactgaagccacagctgct
tctgacactacaccaggtgcaattagcgagaatgcattacgtgattttgaagagtccatt
tttctgcatcctcagcaaacctaccgcaaattagtcacactcgcgcaagcaaatgacttc
agcaatgaaggccgagtttggttactgctacgaaaagcacagtccgaaaatgtattaacc
ctatacaaagaaatggatgccaccctagttactgttgcaccgctcgccaatgtaatgacc
aacgagcagcatgcgctgtggctttatttacaagggagtcggatgcaccaaacaggcaat
atttcaggcgctatcgacactttaaagtatgcagttgaagtcgccaaagaaaacactaac
agtactatttatgtgctcgctattagagaattaggttatgggtttgcactttcaggggac
tactaccgcgccaccctcatactgcaagatgcttataaaaaccttgtcactttaaacaac
cccttttttaatgggttattagaagagagcttaggcgacacctataactatttggggaat
tacacaaaagccattgagtattacgaaggtgctcttaccttcttcgagtcaattggctac
caaccccatgttgccagtaccttgttgggtttagctatggtgaaccggaaactagagagt
tgggatgatgcactttcctattttaaccgttacgaaatagcactcagctttactgacaat
cacagcgaaaatttctatttgcattatggccgcgccatgacgatggcagaaaaaggagag
tgtaaccttgctattggtgctattgatgatgcattgagcttatcggggcccattgattac
aacgcagaactatacaaaaagcgcgccctatgcaatttgacccttgataacttgtctgca
gctaaacaagatttatcgaaagcacgtactatctttaacggcatagaagcattacacaat
acgcagtggcatttagagcttgattacattgcaggtttagtggcatttaaagataatcgc
ttcgagcaagcttttgaatatattcatatgtattacaaagactttcttgaattgcagcga
ttaaacaattcagaatatgtcacacaagtacaggctacgatggaggccgagcgtaaagac
aaagaaatagccctattaaaacaacaaacccaactgcaagcggtaacggcaagggagcaa
tcgctgaaagtacgacagaaaaatatgatgctatcaggagtagcattaatatttgcctta
ttgcttatttttgtgattttccaaaataaaaacgcaaaaaaactactggcgttatctatt
cgagacgagcttactggcctgcacaatcggcgttatttctttgattactttgaaaataac
ttggttaagctgaaccccaaccatgttggattggcactcatttctttcgacatagacaac
ttcaaacacattaacgacaaccttggtcatcacgtgggcgacgaagtcattaaaaccgtg
gcgcaaactgcagcaaatacgctacgtactaatgacgttattgcacgtattgggggagac
gagtttattattgcccttccccgcaccacactgttacaagctaaagaaatagccaaacga
attctcgagaatattagaagtcaccgttttatcacgaaagaaggcgcagattttagtgta
acggctagtttgggcgtggcttatcatgatcaaaataagtttattgctttagacgtaaaa
tcactaatggagtctgccgacacagcgctataccaatctaagcgtgctggcaaaaatcgc
ttcacggttgcagcttag
DBGET
integrated database retrieval system
