KEGG   Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit: RATSFB_0123
Entry
RATSFB_0123       CDS       T01624                                 
Symbol
lacZ
Name
(GenBank) beta-galactosidase
  KO
K01190  beta-galactosidase [EC:3.2.1.23]
Organism
asb  Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit
Pathway
asb00052  Galactose metabolism
asb00511  Other glycan degradation
asb01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:asb00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00052 Galactose metabolism
    RATSFB_0123 (lacZ)
  09103 Lipid metabolism
   00600 Sphingolipid metabolism
    RATSFB_0123 (lacZ)
  09107 Glycan biosynthesis and metabolism
   00511 Other glycan degradation
    RATSFB_0123 (lacZ)
Enzymes [BR:asb01000]
 3. Hydrolases
  3.2  Glycosylases
   3.2.1  Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
    3.2.1.23  beta-galactosidase
     RATSFB_0123 (lacZ)
SSDB
Motif
Pfam: Glyco_hydro_2_C Glyco_hydro_2_N Bgal_small_N LacZ_4 Glyco_hydro_2 Laminin_G_3
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAK80685
UniProt: G2IFV7
LinkDB
Position
155563..159429
AA seq 1288 aa
MFKLFILPLGFIIIGISIFVAINREVKGVVSLNSFVKEFPKVYADFNEWDDRVDVFHINR
EIARSFFLPYPNREILLSDVKKDPLNSVKIKDSDNIKVLNGKWKFSLDYAPKYRNLDFYK
QDYDVSNWGDINVPSNWQMEGYDFPIYVNFKYPWTGFENLEFYKAPKKFNPIGNYRRDFF
VDESWLNDKVYISFQGVESCFYLWINGEFVGYSEDSFSPSEFDITDFLVSGKNYISVQVF
RWCDGSFLEDQDFIRLSGIFRDVFLYRTPKIHIADFEVITNADDDLKNFDLILNVNLINY
LNENRNYSISTVLFDEKWNLISSIENMGNFDNSYTYKDAIKGNFNLCLNIKEPKKWSAEE
PNLYNLVISLKNDLLNETQSIHTRVGFRTFEIKGNKMYINGKPILFKGVNRHETHPTKGR
ALSTLDMEFDVKEIKRNNINSVRTSHYPTHPYFISLCNEYGVYVIDEGNIEAHGVEGEIP
GDKEIWRGACFDRINSLVERDKNNPSVLIWSLGNESGGGSIFRDLYNYVNLRDGSRIIHY
EGERDKYYASDVVSKMYVRINDIEKQSKYIPNKPYILCEYAHSMGNSGGSLDKYIEKFES
IDNVQGGFIWDFIDQGVYRETPCIGTFITPCNMFHGEFEGYIEDGYKGNGYKGVILYDNT
KNLKFDEFTIDLKVKPSIYEGEGCVYLKKGNEFGVREITNYNKSNNRVVEFYVRDNSGIF
DTIIFITPEDWVNNFHNVTATYKDNVMRLFIDDNLVGEKIFNYNIAYFKDRIQVGGNNSY
THYEGINGVIDEVKLFSKGMDIEYLRNKNFYNIDATRIIFNDFDNKRNMIKKKVHSQRYL
ATGGDFNDSPNDSAFCANGILLASRKLKPQVTEVKHAYQNIDIRDYDILNGKILIRNKNL
FKNLKDYMLKWNYLVDGKVVQGDMAIVNVEPMSEIVFNIHDIEKINNLNGNEFFLNIGFV
LNEGTNWANRGFEISNNQFKINLDNSLCEVNVNSKKIQNFIVNDLEDKFEVKSEEYYIVF
NKASGNLKHYRYKNDDLINSELLIDFWNPLNDNERLFNIYDKVVFWKNISKINANNNYNV
SYENGCIVIRFYRLIYDLNNSVLITTYRINEYGEISIDLYMELLKYGIPHARSVGFKVFI
PTNFKNIQYYGRGPLENYNDRNKGSNLGEYKSNINNQFTDYMTPQRTGNITDIRWIDFYR
NDGVGIRIENIHEFIQINASSYIDDEFEKKHSYQMSKYSSIIVNVRSKDYGSTFESFEDE
CINYIDKNHIYSFLFKLSPVFINNISIN
NT seq 3867 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttaaactatttatactaccgcttggttttataataatcggtatttctatatttgta
gctataaatagagaagttaaaggagtagttagtttaaatagttttgttaaggagtttcct
aaagtttatgctgattttaatgaatgggatgatagagttgatgtgtttcatataaatagg
gaaattgctaggagtttctttttgccctatcctaatcgtgaaattttgttatcagatgta
aagaaagatccattaaatagtgtgaaaataaaagatagtgacaatattaaagtattaaat
ggaaaatggaaattttcacttgattatgcacctaagtataggaatttggatttttataaa
caggattatgatgtatctaattggggagatataaatgtacctagtaattggcaaatggaa
ggatatgattttcctatatatgtaaattttaagtatccctggactgggtttgaaaatttg
gaattttataaagcccctaagaaatttaatcctattggtaattatagaagagattttttt
gtagatgaatcttggcttaatgataaagtgtatatatcatttcaaggagttgaatcgtgt
ttttatttatggataaatggggaatttgttggatatagtgaagatagtttttctccgagc
gaatttgatatcacagattttttagtaagtggtaaaaattacatatctgttcaagttttt
agatggtgtgatggaagttttcttgaagatcaggattttattcgtttaagtgggattttt
agggacgtatttttgtatagaacacctaagatacatattgctgattttgaagttataact
aatgctgatgatgatttaaagaattttgatttaatattaaatgtaaatttgataaattac
cttaatgagaatagaaattatagcatatctactgttttatttgatgaaaaatggaattta
ataagtagtattgagaatatggggaattttgataatagttatacgtataaggatgcaata
aaaggaaattttaatttatgtttgaatataaaagagcctaagaaatggtctgcagaggaa
cctaatttatataacttagttatttctcttaaaaatgatttacttaatgagacgcaatca
atacatacgagagttggatttagaacttttgagataaaagggaataaaatgtatataaat
ggaaagccgattttgttcaaaggagtaaataggcatgaaacacatccaacaaaaggtagg
gcattatcgactttagatatggaatttgatgtaaaagagattaagagaaataatataaat
tctgtgagaacttctcactatcctacccatccttattttatttctttatgtaatgaatat
ggagtttatgtaattgatgagggaaatatagaagcacacggtgttgagggtgaaatacct
ggagataaggaaatatggagaggggcatgctttgatagaattaattcacttgtagagagg
gataaaaataatcctagtgttttgatatggtctcttggaaatgaaagtggaggtgggagt
atatttagagatttatataattatgtaaatctaagagatggaagtagaattattcattat
gaaggcgagagagataaatattatgcaagtgatgttgtaagtaagatgtatgtaagaata
aatgatattgaaaaacagagtaaatatattccaaataaaccttatattttatgtgaatat
gcccattccatgggaaatagtggtgggagtttagataaatatatcgaaaaatttgaaagc
attgataacgttcaaggaggatttatatgggatttcatagatcaaggtgtttatagggaa
actccatgtataggaacctttattactccttgtaatatgtttcacggtgaatttgaggga
tacatagaagatggatataaggggaacggatataaaggagtaatattatatgataatact
aaaaatttaaagtttgatgaatttactatagatcttaaggtaaaaccgagtatatacgaa
ggggaagggtgtgtttatctaaagaaaggaaatgagtttggagtaagggaaattacgaat
tataataaatctaataatcgagttgttgaattttatgtaagagataattcgggaatattt
gatacaattatatttataacacctgaagattgggttaataattttcataatgtgactgct
acatataaagataatgttatgagattatttatagatgataatttggttggagagaaaatt
tttaattataatatagcgtattttaaagatagaatacaagttggagggaataatagttat
acacattatgagggtattaatggagtgatagatgaagttaaactattttctaagggaatg
gatatagaatatttgagaaataagaatttttataacattgatgctacgagaataatattt
aatgattttgataataaaagaaatatgattaaaaagaaggtacattcacagagatattta
gcaacaggaggagattttaatgattctccaaatgattctgcattttgtgctaatggtata
ttattggcatccaggaaacttaaaccacaagttaccgaggttaagcatgcatatcaaaat
atagatataagagattatgatattttaaatggtaagattctcattagaaataaaaatcta
tttaagaatttaaaggattacatgctgaaatggaattatttagttgatggtaaagtagtg
caaggagatatggctatagttaatgtagaacctatgagtgaaattgtatttaatatacat
gatattgaaaagatcaataatttaaatggtaatgagtttttcttaaatattggatttgta
ttaaatgagggtacaaattgggcgaatagagggtttgaaatatcaaataatcaatttaaa
ataaatttggataattcactttgtgaagtaaatgtaaatagtaagaagattcaaaatttc
atagtaaacgatttagaggataaatttgaagttaaatctgaggaatattatattgttttt
aacaaagcatcaggaaatcttaagcattatagatataaaaacgatgatttaataaattca
gagttattaattgatttttggaatccactaaatgataatgaaagattattcaacatatac
gataaagtagtattttggaaaaatatttctaagataaatgcaaataataattataatgtt
tcatatgaaaatggatgtatagtaataaggttttatagattaatatatgatttaaataat
tcagttcttattacaacatataggataaatgaatatggagaaattagtatagatttgtat
atggagttattaaaatatgggatacctcacgccagatcagttggatttaaggtatttata
ccaactaattttaaaaatatacagtattatggaagaggaccattagaaaattataatgat
aggaataaagggagtaatcttggcgagtataagagtaacataaataatcaatttacggat
tatatgactcctcaaagaactgggaatataacagatattaggtggatagatttctatagg
aatgatggtgtaggaattcggattgaaaatattcatgaatttattcaaatcaatgccagt
tcttatattgatgatgaatttgaaaagaagcattcatatcaaatgagtaaatattcttca
attatagtgaatgttagatcgaaagattatggaagtacatttgagagttttgaggatgaa
tgtattaattatattgataaaaatcatatatatagttttttgtttaaattatcacctgtg
tttattaataatatatcaattaattag

DBGET integrated database retrieval system