Arabidopsis thaliana (thale cress): AT2G29200
Help
Entry
AT2G29200 CDS
T00041
Symbol
PUM1
Name
(RefSeq) pumilio 1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
ath
Arabidopsis thaliana (thale cress)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
817469
NCBI-ProteinID:
NP_001324547
TAIR:
AT2G29200
UniProt:
Q9ZW07
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(12548931..12553711)
Genome browser
AA seq
968 aa
AA seq
DB search
MIPELGRRPMHRGNEDSSFGDDYEKEIGVLLGEQQRRQVEADELERELNLFRSGSAPPTV
DGSVSAAGGLFSGGGGAPFLEFGGVNKGNGFGGDDEEFRKDPAYLSYYYANMKLNPRLPP
PLMSREDLRVAQRLKGSNNVLGGVGDRRKVNDNRSLFSMPPGFEGEKTGASASEWDANGL
IGLPGLGLGGKQKSFADIFQADMGHGHPVAQQPSRPASRNTFDENVDSNNNLSPSASQGI
GAPSPYSYAAVLGSSLSRNGTPDPQAIARVPSPCLTPIGSGRMSSNDKRNTSNQSPFNGV
TSGLNESSDLVNALSGLNLSCSVGLDDRSQAEQDVEKVRNYMFGLQGGHNEVNQHEFPNK
SDQAHKATGSLRNSQLRGPHGSAYNGGVGLANPYQQLDSPNYCLNNYALNPAVASMMANQ
LGNNNFAPMYDNVSALGFSGMDSRHHGRGFVSSGQNLSESRNLGRFSNRMMGGGAGLQSH
MVDPMYNQYADSLDLLNDPSMDRNFMGGSSYMDMLELQRAYLGAQKSQYGVPYKSGSPNS
HSYYGSPTFGSNMSYPGSPLAHHGMPNSLMSPYSPMRRDEVNMRFPSATRNYSGGLMGSW
HMDASFDEGFGSSMLEEFKSNKTRGFELSEIAGHVVEFSSDQYGSRFIQQKLETATTDEK
NMVYEEIMPQALVLMTDVFGNYVIQKFFEHGLPPQRRELAEKLFDHVLPLSLQMYGCRVI
QKAIEVVDLDQKIKMVKELDGHVMRCVRDQNGNHVVQKCIECVPEENIEFIISTFFGHVV
TLSTHPYGCRVIQRVLEHCHDPDTQSKVMEEILSTVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPDE
RTVIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGGPEERELLVNEMLGTTDENEPLQAMMKD
QFANYVVQKVLETCDDQQRELILTRIKVHLTALKKYTYGKHVVARIEKLVAAGERRMALQ
SLTQPQMA
NT seq
2907 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataccggaactagggagaagaccgatgcatagaggtaacgaagattcatcttttggg
gatgattatgagaaagagattggagtattgcttggtgagcagcagagaaggcaagtagaa
gctgatgagcttgagagagagcttaacttgtttagaagtggctctgctccaccgactgtt
gatggttctgttagtgctgccggagggctttttagcggcggaggtggggctccttttttg
gagtttggtggtgttaataagggtaatgggtttggtggtgatgatgaggagtttaggaaa
gatccggcttacttgtcttattactatgctaatatgaagttgaatccgaggttgccaccg
cctttgatgtctagggaggatttgagggttgctcagaggcttaaagggagtaataatgtg
ttaggtggtgttggggataggagaaaagttaatgataatcgatctttgttctctatgcca
ccgggttttgaaggtgagaaaactggtgcttctgcttctgaatgggatgctaatggattg
attggtttaccgggtttgggacttggaggcaagcagaagagttttgctgatatctttcag
gctgatatggggcatggacatcctgtcgcacaacagccctcacgtcctgcaagtcgtaat
acctttgatgaaaatgttgactctaataataatctgtctccgtctgcatcacaaggcatt
ggtgcaccatctccatacagctatgcagctgttctaggctcttctttgtctagaaatgga
actccagatccacaggccattgctagggtgcctagtccctgtcttactcccattgggagt
ggaagaatgagttcaaatgataagaggaacacaagtaaccagagcccattcaatggtgtt
acctctggtctcaacgagtcttctgatcttgtcaatgctttatctggcttgaacctgtca
tgcagtgttgggttagatgatcggagtcaggctgagcaagatgtcgaaaaggtcaggaac
tatatgtttggactgcaaggtgggcataacgaagtcaatcaacatgagttcccaaacaaa
tctgatcaagcccataaggcaactggctcgttgaggaattcacaattgagagggccacac
ggatctgcctataatggtggagttggattagctaatccttaccagcaacttgatagccca
aattattgtctcaacaattacgcattaaatccagctgtagcctctatgatggctaaccaa
cttgggaacaataactttgctccaatgtatgataatgtatccgctttgggattttctgga
atggactctagacatcatggacgaggctttgtatcttctggtcaaaacctctctgaatca
cgtaatcttggcagattcagtaatcgaatgatgggaggaggtgctggtctccagtcacat
atggtagacccaatgtataatcagtatgctgattcacttgatcttctcaatgatccttcc
atggataggaactttatgggtggttcatcatacatggatatgcttgaactccagagggct
tatcttggagctcagaaatcacagtatggtgtcccttacaaatccgggagccctaacagc
catagctattatgggagtccaacatttgggtctaatatgtcatatcctggcagcccattg
gctcatcatggtatgccaaactctcttatgtcaccttatagccctatgagacgggatgaa
gttaatatgcgatttccttctgcaacaagaaattattcgggagggttaatgggttcttgg
cacatggatgctagttttgatgaaggctttggatcttcaatgcttgaagagttcaaaagt
aacaaaacaagaggatttgaactttctgaaatagctggccatgttgtggagttcagttcg
gatcaatatggaagccgctttattcagcagaaactcgagacagcaacaactgatgagaaa
aacatggtctatgaggagatcatgccacaagctcttgtcctgatgactgacgtttttgga
aactatgtgattcagaagttctttgagcatggactcccgccacagaggagagaattggca
gagaaactctttgaccatgttttgcctcttagcttacagatgtatggttgccgtgtcatc
cagaaggcaattgaggtggttgatctagaccagaaaattaaaatggtgaaagaacttgat
ggacatgtaatgcgatgtgtacgtgatcagaatgggaaccatgtggttcaaaagtgtatt
gaatgtgtgcctgaagaaaacatcgagtttattatttcaactttctttggccatgtggtg
accctctccactcacccatatgggtgccgtgttattcagagagtattggaacactgccat
gaccctgatacacagagtaaggttatggaagaaatcctgtccactgttagtatgctggcc
caagatcagtatggaaactatgttgttcagcatgtgctggagcatggaaagcctgatgag
cgcactgtgataatcaaagaattggcggggaagattgttcagatgagccagcagaagttc
gcatcaaacgttgttgagaaatgtttgacttttggaggtcctgaggaacgagaattgctt
gtgaatgagatgctgggaacaactgatgaaaacgagcctcttcaggcgatgatgaaggat
cagttcgcaaactatgtagtgcagaaagttttggagacctgtgatgaccaacaacgtgag
ctgatacttactcgcatcaaagtgcatcttactgctttaaaaaagtacacttatggaaag
catgtcgttgcgcgtattgaaaaactcgttgctgctggagagaggagaatggctttgcag
tccctaacccagccccagatggcttaa
DBGET
integrated database retrieval system